川上純司 KAWAKAMI Junji

研究者番号	40289012
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 甲南大学, フロンティアサイエンス学部, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2009年度 – 2011年度: 甲南大学, フロンティアサイエンス学部, 教授 2005年度 – 2006年度: 甲南大学, 理工学部, 助教授 2002年度 – 2004年度: 甲南大学, 理工学部, 講師 1998年度 – 1999年度: 甲南大学, 理学部, 講師
審査区分/研究分野	研究代表者生体関連化学 / 生物有機科学研究代表者以外理工系 / 生体関連化学
キーワード	研究代表者インビトロ選択 / モデルペプチド / 速度論的パラメータ / 熱力学的パラメータ / 分子間相互作用 / 速度論的解析 / 局所的相互作用 / ヘアピンループ構造 / 測度論的解析 / 熱力学的解析 … もっと見る / モデル化 / 分子認識 / ナノバイオ / 核酸-蛋白質相互作用 / 核酸-核酸相互作用 / 機能性核酸 / 核酸構造 / 熱力学安定性 / キメラ型核酸 / 鏡像異性体核酸 … もっと見る研究代表者以外金属イオン / 分子クラウディング / リボザイム / 相互作用エネルギー / Interaction energy / Molecular sensor / Artificial nuclease / Artificial nucleoside / Molecular crowding / Ribozyme / RNA cleavage / Functional DNA / RNA切断反応 / 最近接塩基対モデル / 非塩基対部位 / デオキシリボザイム / 熱力学的パラメータ / 二次構造予測 / 核酸高次構造 / 分子認識 / モデル化 / 解析・評価 / 物理化学 / 分子センサー / 人工ヌクレアーゼ / 人工ヌクレオチド / RNA切断 / 機能性DNA / 枝分かれ構造 / ラロメア配列 / DNA / バイオセンサー / PCR / アプタマー / ヒストンペプチド / DNAチップ / 熱力学的安定性 / 四重らせん構造 / ポリエチレングリコール / 四重鎖構造 / 核酸隠す

細胞内分子環境で機能する新規核酸マテリアル創製
- 研究代表者
  
  杉本直己
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  生体関連化学
- 研究機関
  甲南大学
ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価研究代表者
- 研究代表者
  
  川上純司
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2006
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体関連化学
- 研究機関
  甲南大学
核酸の構造予測に基づくRNA切断反応の解析
- 研究代表者
  
  杉本直己
- 研究期間 (年度)
  2001 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  甲南大学
核酸の鏡像異性体合成と、その相互作用の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  川上純司
- 研究期間 (年度)
  1998 – 1999
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  生物有機科学
- 研究機関
  甲南大学

すべて 2011 2010 2009 2006 2005 2004 2001

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Triplet analysis that identifies unpaired regions of functional RNAs2011
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami, Y.Yamaguchi, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  J.Nucleic Acids
  
  巻: 2011 ページ: 1-6
- DOI
  10.4061/2011/471843
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[雑誌論文] Recognition of a flipped nucleobase by small peptides2006
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami
- 雑誌名
  
  Abstracts of The Second International Symposium on Biomolecular Chemistry
  
  ページ: 63-63
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Functional role of the cofactor on activation process of L-histidine dependent ribozyme2006
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Symp. Ser. 50
  
  ページ: 241-242
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] A novel stable RNA pentaloop that interacts specifically with a motif peptide of lambda-N protein2006
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami
- 雑誌名
  
  Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 25
  
  ページ: 397-416
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] A novel stable RNA pentaloop that interacts specifically with a motif peptide of lambda-N protein2006
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami
- 雑誌名
  
  Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 25(in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Thermodynamic analysis of duplex formation of the heterochiral DNA with L-deoxyadenosine2005
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami, K.Tsujita, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  Analytical Sciences 21
  
  ページ: 77-82
- NAID
  10014365265
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Thermodynamic analysis of duplex formation of the heterochiral DNA with L-deoxyadenosine2005
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami
- 雑誌名
  
  Analytical Sciences 21
  
  ページ: 77-82
- NAID
  10014365265
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Specific recognition of the basic N peptide by an RNA2005
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Symp.Ser. 49
  
  ページ: 353-354
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Introduction of Peptide Function into DNA by Nucleic Acid Peptides, NAPs2004
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami et al.
- 雑誌名
  
  Chem Lett. 33
  
  ページ: 1554-1555
- NAID
  10014153065
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[雑誌論文] Introduction of Peptide Function into DNA by Nucleic Acid Peptides, NAPs2004
- 著者名/発表者名
  Junji Kawakami
- 雑誌名
  
  Chemistry Letters 33
  
  ページ: 1554-1555
- NAID
  10014153065
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[雑誌論文] Analysis of the Secondary Structure of a Ribozyme that Requires His as a Cofactor2004
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami, C.Maiya, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research Supplement 48
  
  ページ: 203-204
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Analysis of the secondary structure of a ribozyme that requires His as a cofactor2004
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami et al.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res. Symp. Ser 48
  
  ページ: 203-204
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[雑誌論文] The effect of molecular crowding with nucleotide length and cosolute structure on DNA duplex stability.2004
- 著者名/発表者名
  S.Nakano, H.Karimata, T.Ohmichi, J.Kawakami, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  J.Am.Chem.Soc. 126
  
  ページ: 14330-14331
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[雑誌論文] Introduction of Peptide Function into DNA by Nucleic Acid Peptides, NAPs2004
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami, Z.-M.Wang, H.Fujiki, S.Izumi, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  Chemistry Letters 33
  
  ページ: 1554-1555
- NAID
  10014153065
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Stabilization of a DNA duplex under molecular crowding conditions of PEG2004
- 著者名/発表者名
  H.Karimata, S.Nakano, T.Ohmichi, J.Kawakami, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research Supplement 48
  
  ページ: 107-108
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] Analysis of the Secondary Structure of a Ribozyme that Requires His as a Cofactor2004
- 著者名/発表者名
  Junji Kawakami
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research Supplement 48
  
  ページ: 203-204
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[雑誌論文] The Effect of Molecular Crowding with Nucleotide Length and Cosolute Structure on DNA Duplex Stability2004
- 著者名/発表者名
  S.Nakano, H.Karimata, T.Ohmichi, J.Kawakami, N.Sugimoto
- 雑誌名
  
  Journal of American Chemical Society 126
  
  ページ: 14330-14331
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16750150
[雑誌論文] A stable DNA tetraloop and its structural tolerance for modification2001
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami et al.
- 雑誌名
  
  Chem.Lett.
  
  ページ: 258-259
- NAID
  10006675130
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[雑誌論文] Thermodynamic stability of base pairs between 2-hydroxyadenine and incoming nucleotides as a determinant of nucleotide incorporation specificity during replication.2001
- 著者名/発表者名
  J.Kawakami et al.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res. 29
  
  ページ: 3289-3296
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13132208
[学会発表] 溶媒条件の変化がRNA-タンパク質相互作用へ与える影響2011
- 著者名/発表者名
  田中裕子、石立和也、杉本直己、川上純司
- 学会等名
  日本薬学会第131年会
- 発表場所
  静岡県立大学
- 年月日
  2011-03-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[学会発表] Molecular crowding条件下における分子間相互作用の定量化2011
- 著者名/発表者名
  川上純司、橋本阿弥、塚本隆広、岸本加恵、杉本直己
- 学会等名
  日本薬学会第131年会
- 発表場所
  静岡県立大学
- 年月日
  2011-03-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[学会発表] LNA/methyl phosphonate-DNAキメラオリゴヌクレオチドのmicroRNA阻害剤としての特性評価2010
- 著者名/発表者名
  長濱宏治、伊勢田健太、Wengel Jesper、杉本直己、西方敬人、川上純司
- 学会等名
  第4回バイオ関連化学シンポジウム
- 発表場所
  大阪大学
- 年月日
  2010-09-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[学会発表] 大腸菌内でのRNA-タンパク質相互作用の定量化2010
- 著者名/発表者名
  塚本隆広、橋本阿弥、岸本加恵、杉本直己、川上純司
- 学会等名
  第33回日本分子生物学会、第83回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2010-12-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[学会発表] Comparative thermodynamic analysis of RNA-protein interaction on surface and in solution.2010
- 著者名/発表者名
  Y.Tanaka, K.Ishidate, K.Kishimoto, N.Sugimoto, J.Kawakami
- 学会等名
  The 37th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry 2010
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2010-11-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[学会発表] Thermodynamic parameters for reliable prediction of RNA structures2009
- 著者名/発表者名
  Yuko Tanaka, Kae Kishimoto, Naoki Sugimoto, Junji Kawakami
- 学会等名
  Joint Symposium of the 5th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2009-11-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040
[学会発表] Thermodynamic parameters for reliable prediction of RNA structures2009
- 著者名/発表者名
  Y. Tanaka, K. Kishimoto, N. Sugimoto, and J. Kawakami
- 学会等名
  Joint Symposium of the 5th Annual Meeting of the Oligonucleotide Therapeutics Society and the 19th Antisense Symposium
- 発表場所
  九州大学(福岡)
- 年月日
  2009-11-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21245040

1. 杉本直己 (60206430)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 9件
2. 中野修一 (70340908)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 三好大輔 (50388758)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 松井淳 (10264954)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 藤井政幸 (60199297)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

川上 純司 KAWAKAMI Junji

研究課題

研究成果

共同研究者

細胞内分子環境で機能する新規核酸マテリアル創製

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヘアピンループDNA/RNAを認識するモデルペプチドの速度論的機能評価研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

核酸の構造予測に基づくRNA切断反応の解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

核酸の鏡像異性体合成と、その相互作用の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Triplet analysis that identifies unpaired regions of functional RNAs2011

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Recognition of a flipped nucleobase by small peptides2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Functional role of the cofactor on activation process of L-histidine dependent ribozyme2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A novel stable RNA pentaloop that interacts specifically with a motif peptide of lambda-N protein2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A novel stable RNA pentaloop that interacts specifically with a motif peptide of lambda-N protein2006

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Thermodynamic analysis of duplex formation of the heterochiral DNA with L-deoxyadenosine2005

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Thermodynamic analysis of duplex formation of the heterochiral DNA with L-deoxyadenosine2005

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Specific recognition of the basic N peptide by an RNA2005

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Introduction of Peptide Function into DNA by Nucleic Acid Peptides, NAPs2004

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

説明

データソース

[雑誌論文] Introduction of Peptide Function into DNA by Nucleic Acid Peptides, NAPs2004

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Analysis of the Secondary Structure of a Ribozyme that Requires His as a Cofactor2004

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Analysis of the secondary structure of a ribozyme that requires His as a cofactor2004

著者名/発表者名

川上純司 KAWAKAMI Junji