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荒田 幸信  Arata Yukinobu

研究者番号 40360482
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-8687-4678
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 専任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2018年度 – 2023年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 開拓研究本部, 専任研究員
2015年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 研究員
2012年度 – 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 研究員
2010年度: 独立行政法人理化学研究所, 佐甲細胞情報研究室, 研究員
2008年度 – 2009年度: 独立行政法人理化学研究所, 細胞運命研究チーム, 研究員
審査区分/研究分野
研究代表者
発生生物学 / 超高齢社会研究
キーワード
研究代表者
細胞極性 / 数理モデル / 1分子イメージング / 1分子イメージング / マイクロデバイス / マイクロ流体デバイス / フラクタル / 寿命 / 定量 / 超長時間計測 … もっと見る / Life-log / 高時間分解計測 / 長時間計測 / 力学系 / ライフログ / 時系列解析 / 超長時間撮影 / 老化 / 線虫 / 拡散距離 / アクトミオシン / 拡散解析 / パターン形成 / PAR/aPKCシステム / 細胞骨格 / タンパク質動態 / 精密計測 / 1分子計測 / 数理モデル化 / 1分子計測 / PAR / 定量計測 / PAR/aPKC / 発生生物学 / 細胞生物学 / 分子生物学 / PARタンパク質 / 非対称局在 / タンパク質細胞内動態 / 一分子計測 / 方向制御 / 画像解析プログラム 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (41件)
  • 共同研究者

    (3人)
  •  動物活動の定量計測と非線形時系列解析による、老化を支配する力学系システムの解明研究代表者

    • 研究代表者
      荒田 幸信
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2024
    • 研究種目
      挑戦的研究(開拓)
    • 審査区分
      超高齢社会研究
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  定量計測と数理モデル化による極性タンパク質の局在領域を決める分子・物理機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      荒田 幸信
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  一分子精密定量計測と数理モデル化による細胞極性スケーリング機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      荒田 幸信
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2014
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所
  •  画像解析プログラムおよび数理モデルを用いた、「細胞極性の方向」の制御機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      荒田 幸信
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      発生生物学
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所

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すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Comprehensive identification of potentially functional genes for transposon mobility in the C. elegans genome2023

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata, Peter Jurica, Nicholas Parrish, Yasushi Sako
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: - ページ: 1-1

    • DOI

      10.1101/2023.08.08.552548

    • オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [雑誌論文] Insulin signaling shapes fractal scaling of C. elegans behavior2022

    • 著者名/発表者名
      Arata Yukinobu、Shiga Itsuki、Ikeda Yusaku、Jurica Peter、Kimura Hiroshi、Kiyono Ken、Sako Yasushi
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 10481-10481

    • DOI

      10.1038/s41598-022-13022-6

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321, KAKENHI-PROJECT-19H05647
  • [雑誌論文] Insulin signaling shapes fractal scaling of C. elegans benavior2022

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata, Itsuki Shiga, Yusaku Ikeda, Peter Jurica, Hiroshi Kimura, Ken Kiyono, Yasushi Sako
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: -

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [雑誌論文] NEW FINDING OP50, a bacterial strain conventionally used as food for laboratory maintenance of C. elegans, is a biofilm formation defective mutant2020

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata, Taku Oshima, Yusaku Ikeda, Hiroshi Kimura and Yasushi Sako
    • 雑誌名

      microPublication Biology

      巻: - ページ: 1-5

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [雑誌論文] 動物の老化研究における定量的アプローチ2020

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 雑誌名

      月刊「細胞」

      巻: 52 ページ: 35-40

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [雑誌論文] C. elegans episodic swimming is driven by multifractal kinetics2020

    • 著者名/発表者名
      Yusaku Ikeda, Peter Jurica, Hiroshi Kimura, Hiroaki Takagi, Zbigniew R. Struzik, Ken Kiyono, Yukinobu Arata & Yasushi Sako
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-17

    • DOI

      10.1038/s41598-020-70319-0

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [雑誌論文] OP50, a bacterial strain conventionally used as food for laboratory maintenance of C. elegans, is a biofilm formation defective mutant2020

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata, Taku Oshima, Yusaku Ikeda, Hiroshi Kimura and Yasushi Sako
    • 雑誌名

      microPublication Biology

      巻: 1 ページ: 1-5

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [雑誌論文] Cortical polarity of the RING protein PAR-2 is maintained by exchange rate kinetics at the cortical-cytoplasm boundary2016

    • 著者名/発表者名
      Arata, Y., Hiroshima, M., Pack, C.-G., Ramanujam, R., Motegi, F., Nakazato, K., Wiseman, P. W., Sawa, H., Kobayashi, T. J., Brandao, H. B., Shibata, T., and Sako, Y.
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 16 号: 8 ページ: 2156-2168

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2016.07.047

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H00788, KAKENHI-PROJECT-15H02394, KAKENHI-PROJECT-15KT0087, KAKENHI-PROJECT-15K07090
  • [雑誌論文] Power law relationship between cell cycle duration and cell volume in the early embryonic development of Caenorhabditis elegans2015

    • 著者名/発表者名
      Arata, Y., Takagi, H., Sako, Y., and Sawa. H.
    • 雑誌名

      Frontiers in Physiology

      巻: 28 ページ: 529-529

    • DOI

      10.3389/fphys.2014.00529

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22127005, KAKENHI-PROJECT-24770221, KAKENHI-PROJECT-25600051, KAKENHI-PROJECT-15K14514
  • [雑誌論文] Extracellular control of PAR protein localization during asymmetric cell division in the C.elegans embryo.2010

    • 著者名/発表者名
      Arata Y, Lee JY, Goldstein B, Sawa H.
    • 雑誌名

      Development.

      巻: 137 ページ: 3337-45

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [雑誌論文] Extracellular control of PAR protein localization during asymmetric cell division in the C. elegans embryo2010

    • 著者名/発表者名
      Arata Yukinobu, Lee Jen-Yi, Goldstein Bob, Sawa Hitoshi
    • 雑誌名

      Development

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] Bridging computational modeling and experimental biology: Introducing the new motion tracker for capturing individual C. elegans motions at population scale and at lifespan time-scale2024

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata
    • 学会等名
      7th Nobel Turing Challenge
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [学会発表] 自作!線虫の個体解像度・超多個体・寿命時間スケールのmotion tracker, nemaLifelogger2024

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第11回定量生物の会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [学会発表] 1000匹以上の線虫の行動を一生の間ビデオ撮影するnemaLife-loggerにより同定した老化に伴う行動速度の指数減衰とトランスポゾン駆動老化仮説の実験検証2022

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [学会発表] 動物の老化に伴う活動速度の指数減衰とトランスポゾン駆動老化仮説の検証2022

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [学会発表] Scale-free behaviors of C. elegans is shaped by Insulin signaling2021

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [学会発表] Life-logger, 1000匹の線虫の寿命時間スケールでの行動動態を計測するためのビデオ撮影装置の開発2020

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K20321
  • [学会発表] 高時間分解・長時間撮影による、線虫C.elegansの原腸貫入運動の解析2017

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信、新土優樹、高木拓明、佐甲靖志
    • 学会等名
      生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K07090
  • [学会発表] Multi-time scale cortical dynamics during gastrulation in C. elegans embryos2017

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata, Yuki Shindo, Hiroaki Takagi, and Yasushi Sako
    • 学会等名
      International C. elegans meeting
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K07090
  • [学会発表] ROXSによってmCherryの安定性と明るさが向上する2016

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信、佐甲靖志
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県・つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K07090
  • [学会発表] Polarity Maintenance by the Exchange Rate Control of RING Protein PAR-2 at the Cortical-cytoplasm Boundary2015

    • 著者名/発表者名
      荒田 幸信
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K07090
  • [学会発表] Developmental biology meets single-molecule detection technologies;Measurement-based mathematical modeling of PAR protein localization in C. elegans embryos2013

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      定量生物学の会 第六回
    • 発表場所
      大阪大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] 動物の発生における、細胞極性化機構の1分子定量計測と数理モデル化2013

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理IV」
    • 発表場所
      埼玉県和光市
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] 動物の発生におけるPAR/aPKC細胞極性システムの計測に基づいた数理モデル化2013

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第51回生物物理学会年会
    • 発表場所
      国立京都国際会館
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] C. elegans meets single-molecule detection technologies; The embryonic cell polarity system is driven by state transition of PAR-2 protein molecules.2013

    • 著者名/発表者名
      Yukinobu Arata
    • 学会等名
      19th International C. elegans Meeting
    • 発表場所
      UCLA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] 受精卵から個体へ:発生における細胞分化と細胞極性2012

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      最先端光計測とライフサイエンスの近未来ーバイオラマン2012-
    • 発表場所
      埼玉県和光市
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] Quantitative measurement and mathematical modeling of polarity-protein PAR-2 in C. elegans embryos2012

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      生物物理学会
    • 発表場所
      愛知県名古屋市
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] PARタンパク質依存的な細胞極性の方向制御2010

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      宮城県仙台市(東北大学)
    • 年月日
      2010-09-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] Directional control of PAR-dependent polarization in C.elegans2009

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      17th international C.elegans meeting
    • 発表場所
      University of California, Los Angeles, California
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] Directional control of PAR-dependent polarization in C.elegans2009

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      発生生物学会年会
    • 発表場所
      新潟コンベンションセンター(朱鷺メッセ)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] 細胞単離・操作法を用いてPARタンパク質依存的な細胞極性を細胞外から方向付けする2009

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] 線虫の初期胚において、PAR依存的な細胞の極性化はMES-1/SRCシグナルによって方向付けされる2008

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] PAE-dependent polarization is oriented by an extracellular signal MES-1 in C. elegans2008

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      第60回日本細胞生物学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] PAE-dependent polarization is oriented by an extracellular signal MES-1 in C. elegans2008

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      C. elegans Development and Evolution meeting
    • 発表場所
      ウィスコンシン大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20770187
  • [学会発表] Stable maintenance of the cortical PAR-2 asymmetry by the cytoplasmic diffusion in the one-cell C. elegans embryo

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信、廣島通夫、白燦基、小林徹也、柴田達夫、佐甲靖志
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会(BSJ2014)
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] Measurement-Based Mathematical Modeling of PAR Protein Localization in C. elegans embryos

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      「理論と実験」研究会2013
    • 発表場所
      広島大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] 生細胞内タンパク質動態の計測に基づいた、細胞現象の数理モデル化

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      個別セミナー(東海大学木村研究室)
    • 発表場所
      東海大学木村研究室
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] Measurement-based mathematical modeling of PAR-2 protein localization in C. elegans embryo

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信、廣島通夫、白燦基、小林徹也、柴田達夫、佐甲靖志
    • 学会等名
      C. elegans development, cell biology and gene expression meeting in association with The 6th Asia-Pacific C. elegans meeting
    • 発表場所
      奈良
    • 年月日
      2014-07-15 – 2014-07-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] PAR polarity protein dynamics in the presence of ATP production inhibitor Azide in C. elegans embryos

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      「理論と実験」研究会2014
    • 発表場所
      広島
    • 年月日
      2014-10-09 – 2014-10-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] Developmental biology meets single-molecule detection technologies;Measurement-based mathematical modeling of PAR protein localization in C. elegans embryos

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      個別セミナー(理研CDBセミナー)
    • 発表場所
      理化学研究所神戸研
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • [学会発表] 動物初期胚における 極性タンパク質の局在分布の“Steepness”

    • 著者名/発表者名
      荒田幸信
    • 学会等名
      定量生物学の会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2015-01-11 – 2015-01-12
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24770221
  • 1.  高木 拓明 (10444514)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 2.  澤 斉
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 3.  佐甲 靖志
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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