寺師玄記 Terashi Genki

研究者番号	40383658
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 北里大学, 薬学部, 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2014年度 – 2016年度: 北里大学, 薬学部, 講師 2011年度: 北里大学, 薬学部, 講師 2010年度: 北里大学, 薬学部, 助教 2007年度: 北里大学, 薬学部, 助教 2006年度: 北里大学, 薬学部, 助手
審査区分/研究分野	研究代表者生命・健康・医療情報学 / 生体生命情報学研究代表者以外応用ゲノム科学
キーワード	研究代表者タンパク質間相互作用 / 残基間ネットワーク / 残基幹ネットワーク / アミノ酸残基 / アミノ酸残基間ネットワーク / 構造アライメント / タンパク質三次元構造 / 構造比較 / 立体構造アライメント / タンパク質立体構造 / バイオインフォマティクス / 生体生命情報学 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見る Protein / Mouse / Rat / Database / Critical Assessment / Interaction / Structure Prediction / Complex / CAPRI / CASP / FAMS / マウス / ラット / データベース / タンパク質隠す

アミノ酸残基間ネットワーク比較によるタンパク質構造比較解析研究代表者
- 研究代表者
  
  寺師玄記
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  北里大学
タンパク質相互作用パターン解析と予測法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  寺師玄記
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2011
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  北里大学
実験動物ラット・マウス遺伝子の単体・複合体タンパク質立体構造モデルデータベースの構築
- 研究代表者
  
  梅山秀明
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  北里大学

すべて 2016 2015 2014 2012 2011 2010 2008 2007 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] CAB-Align: A Flexible Protein Structure Alignment Method Based on the Residue-Residue Contact Area2015
- 著者名/発表者名
  Genki Terashi, Mayuko Takeda-Shitaka
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 10 号: 10 ページ: e0141440-e0141440
- DOI
  10.1371/journal.pone.0141440
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26730151
[雑誌論文] A Protein Three-Dimensional Substructure Search Program Based on the Lower Bound of a Root Mean Square Deviation Value2012
- 著者名/発表者名
  Terashi G, Shibuya T, Takeda-Shitaka M
- 雑誌名
  
  Journal of computational biology
  
  巻: 19(5) 号: 5 ページ: 493-503
- DOI
  10.1089/cmb.2011.0230
- URL
  http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/cmb.2011.0230
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700314, KAKENHI-PLANNED-24106007
[雑誌論文] Bioinformatics based ligand-docking and in-silico screening2008
- 著者名/発表者名
  Daisuke Takaya, Mayuko Taked a-Shitaka, Genki Terashi, Kazuhiko Kanou, Mitsuo Iwadate and Hideaki Umeyama
- 雑誌名
  
  Chem.Pharm.Bull 56(5)(In press)
- NAID
  110006664006
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] 計算科学によるタンパク質問相互作用解析2007
- 著者名/発表者名
  竹田-志鷹真由子, 寺師玄記, 梅山秀明
- 雑誌名
  
  生命の科学 58(5)
  
  ページ: 338-341
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] Fams-ace:a combined method to select the best model after remodeling all server models2007
- 著者名/発表者名
  Terashi G, Takeda-Shitaka M
- 雑誌名
  
  Proteins 69
  
  ページ: 98-107
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] Protein Structure Prediction in Structure Based Drug Design2007
- 著者名/発表者名
  Takeda-Shitaka M., Terashi G., Chiba C., Takaya D., Umeyama H.
- 雑誌名
  
  Medicinal Chmistry 2
  
  ページ: 191-201
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] Fams-ace:a combined method to select the best model after remodeling all server models2007
- 著者名/発表者名
  Terashi G, Takeda-Shitaka M, Kanou K, Iwadate M, Takaya D, Hosoi A, Ohta K, Umeyama H
- 雑誌名
  
  Proteins 69
  
  ページ: 98-107
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] The SKE-DOCK server and human teams based on a combined method of shape complementarity and free energy estimation2007
- 著者名/発表者名
  Genki Terashi, Mayuko Takeda-Shitaka, Kazuhiko Kanou, Mitsuo Iwadate, Daisuke Takaya, Hideaki Umeyama.
- 雑誌名
  
  Proteins 69(4)
  
  ページ: 866-872
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] The SKE-DOC K server and human teams based on a combined meth od of shape complementarity and free energy estimatio n2007
- 著者名/発表者名
  Genki, Terashi, Mayuko, Takeda-Shitaka
- 雑誌名
  
  Proteins 69(4)
  
  ページ: 866-872
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] Fams-ace : a co mbined method to select the best model after remodeling all server models2007
- 著者名/発表者名
  Genki, Terashi, Mayuko, Takeda-Shitaka
- 雑誌名
  
  Proteins 69
  
  ページ: 98-107
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[雑誌論文] The SKE-DOCK server and human teams based on a combined method of shape complementarity and free energy estimation2007
- 著者名/発表者名
  Genki Terashi, Mayuko Takeda-Shitaka
- 雑誌名
  
  Proteins 69(4)
  
  ページ: 866-872
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[学会発表] CAB-align: Novel protein structure alignment method based on the residue-residue contact area2016
- 著者名/発表者名
  Genki Terashi, Daisuke Kihara, Mayuko Takeda-Shitaka
- 学会等名
  ISMB2016 satellite meeting, 3DSIG 2016
- 発表場所
  米国フロリダ州オーランド
- 年月日
  2016-07-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26730151
[学会発表] Flexible protein structure alignment method based on the residue-residue interaction2015
- 著者名/発表者名
  Genki Terashi, Mayuko Takeda-Shitaka
- 学会等名
  Great Lakes Bioinformatics Conference 2015
- 発表場所
  Purdue University, West Lafayette, Indiana, U.S
- 年月日
  2015-05-18
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26730151
[学会発表] 残基間相互作用に基づく新たなタンパク質構造アライメント法の開発2014
- 著者名/発表者名
  寺師玄記
- 学会等名
  第42回構造活性相関シンポジウム
- 発表場所
  熊本県熊本市　くまもと森都心プラザ
- 年月日
  2014-11-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26730151
[学会発表] LB3D : Fast protein 3D substructure search program2011
- 著者名/発表者名
  寺師玄記
- 学会等名
  2011年日本バイオインフォマティクス学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2011-12-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700314
[学会発表] LB3D : Fast protein 3D substructure search program2011
- 著者名/発表者名
  寺師玄記
- 学会等名
  日本バイオインフォマティクス学会2011年会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- 年月日
  2011-11-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700314
[学会発表] タンパク質間相互作用予測プログラムの開発と応用2010
- 著者名/発表者名
  寺師玄記
- 学会等名
  第23回北里バイオサイエンスフォーラム
- 発表場所
  青森県十和田
- 年月日
  2010-08-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700314
[学会発表] タンパク質モデリングと生物分子設計2007
- 著者名/発表者名
  岩舘満雄、加納和彦、寺師玄記、高谷大輔、竹田-志鷹真由子、梅山秀明
- 学会等名
  BMB2007第30回日本分子生物学会年会、第80回日本生化学会大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2007-12-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[学会発表]2007
- 著者名/発表者名
  竹田-志鷹真由子、寺師玄記、加納和彦、岩舘満雄、高谷大輔、酒井博子、梅山秀明
- 学会等名
  第35回構造活性相関シンポジウム
- 発表場所
  京都大学百周年記念ホール
- 年月日
  2007-11-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18310139
[学会発表] Novel protein structure alignment method based on the inter-residue contact area
- 著者名/発表者名
  寺師玄記
- 学会等名
  JSBi2014・第3回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  宮城県仙台市　仙台国際センター
- 年月日
  2014-10-02 – 2014-10-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26730151

1. 梅山秀明 (20050619)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
2. 竹田真由子 (70265718)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 11件
3. 岩舘満雄 (10327447)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
4. 加納和彦 (00383654)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件

寺師 玄記 Terashi Genki

研究課題

研究成果

共同研究者

アミノ酸残基間ネットワーク比較によるタンパク質構造比較解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

タンパク質相互作用パターン解析と予測法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

実験動物ラット・マウス遺伝子の単体・複合体タンパク質立体構造モデルデータベースの構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] CAB-Align: A Flexible Protein Structure Alignment Method Based on the Residue-Residue Contact Area2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A Protein Three-Dimensional Substructure Search Program Based on the Lower Bound of a Root Mean Square Deviation Value2012

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

URL

データソース

[雑誌論文] Bioinformatics based ligand-docking and in-silico screening2008

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] 計算科学によるタンパク質問相互作用解析2007

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Fams-ace:a combined method to select the best model after remodeling all server models2007

著者名/発表者名

雑誌名

説明

データソース

[雑誌論文] Protein Structure Prediction in Structure Based Drug Design2007

著者名/発表者名

雑誌名

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[雑誌論文] Fams-ace:a combined method to select the best model after remodeling all server models2007

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] The SKE-DOCK server and human teams based on a combined method of shape complementarity and free energy estimation2007

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] The SKE-DOC K server and human teams based on a combined meth od of shape complementarity and free energy estimatio n2007

著者名/発表者名

雑誌名

説明

データソース

[雑誌論文] Fams-ace : a co mbined method to select the best model after remodeling all server models2007

著者名/発表者名

雑誌名

説明

データソース

[雑誌論文] The SKE-DOCK server and human teams based on a combined method of shape complementarity and free energy estimation2007

著者名/発表者名

雑誌名

説明

データソース

[学会発表] CAB-align: Novel protein structure alignment method based on the residue-residue contact area2016

著者名/発表者名

学会等名

発表場所

年月日

データソース

寺師玄記 Terashi Genki