荒木通啓 Araki Michihiro

研究者番号	40396867
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 立命館大学, 薬学部, 教授 2025年度: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 国立健康・栄養研究所 AI栄養統括研究室, 客員研究員 2025年度: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 AI健康・医薬研究センター, 客員研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 AI健康・医薬研究センター, 副センター長 2016年度: 神戸大学, 科学技術イノベーション研究科, 特命准教授 2013年度 – 2015年度: 神戸大学, 自然科学系先端融合研究環重点研究部, 准教授 2012年度: 京都大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 2008年度 – 2010年度: 京都大学, 先端技術グローバルリーダー養成ユニット, 准教授
審査区分/研究分野	研究代表者複合領域 / システムゲノム科学 / ゲノム情報科学研究代表者以外小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
キーワード	研究代表者バイオインフォマティクス / 合成生物学 / 代謝工学 / バイオラクノロジー / synthetic biology / 生物・生体工学 / ゲノム / 生体生命情報学 / 生合成 / ケモインフォマティクス … もっと見る研究代表者以外 … もっと見る遺伝子発現量解析 / 機械学習 / プラスミドライブラリィ / プラットホーム / プラスミド構成要素 / 遺伝子発現パターン / 大腸菌隠す

代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立
- 研究代表者
  
  野田修平
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
- 研究機関
  神戸大学
人工代謝経路のスコープの拡張研究代表者
- 研究代表者
  
  荒木通啓
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  神戸大学
酵素反応の選択性と多様性の情報解析研究代表者
- 研究代表者
  
  荒木通啓
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  神戸大学
人工代謝経路の設計基盤の構築研究代表者
- 研究代表者
  
  荒木通啓
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2013
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  神戸大学
   京都大学
代謝ネットワークの再構築による天然化合物の設計原理の抽出研究代表者
- 研究代表者
  
  荒木通啓
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2010
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム情報科学
- 研究機関
  京都大学

すべて 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 2008 その他

すべて雑誌論文学会発表図書産業財産権

[図書] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015
- 著者名/発表者名
  石井純、荒木通啓、中津井雅彦、崎濱由梨、柘植陽太、蓮沼誠久、近藤昭彦
- 総ページ数
  5
- 出版者
  生物工学会誌
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[図書] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015
- 著者名/発表者名
  石井純、荒木通啓、中津井雅彦、崎濱由梨、柘植陽太、蓮沼誠久、近藤昭彦
- 総ページ数
  5
- 出版者
  生物工学会誌
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[図書] データベースからの再発見2014
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 総ページ数
  1
- 出版者
  生物工学会誌（バイオミディア）
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[図書] データベースからの再発見2014
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 総ページ数
  1
- 出版者
  生物工学会誌（バイオミディア）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[雑誌論文] A Systematic Approach to Time-series Metabolite Profiling and RNA-seq Analysis of Chinese Hamster Ovary Cell Culture2017
- 著者名/発表者名
  Hsu, HH., Araki, M., Mochizuki, M., Hori, Y., Murata, M., Kahar, P., Yoshida, T., Hasunuma, T. and Kondo A.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 43518-43518
- DOI
  10.1038/srep43518
- NAID
  120006346139
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[雑誌論文] Application of LC-MS/MS analysis for time-lapse amino acid metabolomics analysis in CHO cell culture2017
- 著者名/発表者名
  Hsu, H.H., Hasunuma, T., Araki, M., Yoshida, T., Hori, Y., Murata, M., Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Shimadzu Journal
  
  巻: 5 ページ: 17-17
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[雑誌論文] Targeted nucleotide editing using hybrid prokaryotic and vertebrate adaptive immune systems2016
- 著者名/発表者名
  Nishida, K., Arazoe, T., Yachie, N., Banno, S., Kakimoto, M., Tabata, M., Mochizuki, M., Miyabe, A., Araki, M., Hara, K.Y., Shimatani, Z. and Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 353 号: 6305 ページ: 6305-6305
- DOI
  10.1126/science.aaf8729
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PROJECT-15K18647, KAKENHI-PROJECT-16K14654, KAKENHI-PROJECT-15K18466, KAKENHI-PROJECT-15K14436
[雑誌論文] Evaluation of genes involved in oxidative phosphorylation in yeast by developing a simple and rapid method to measure mitochondrial ATP synthetic activity.2015
- 著者名/発表者名
  Ye X, Morikawa K, Ho SH, Araki M, Nishida K, Hasunuma T, Hara KY, Kondo A.
- 雑誌名
  
  Microbial Cell Factories
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 56-56
- DOI
  10.1186/s12934-015-0239-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119710, KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PUBLICLY-26117715
[雑誌論文] M-path: A Compass for Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- 著者名/発表者名
  Araki, M., Cox III, RS., Makiguchi, H., Ogawa, T., Taniguchi, T., Miyaoku, K., Nakatsui M., Hara, K.Y., Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 31 号: 6 ページ: 905-911
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btu750
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PROJECT-26430198
[雑誌論文] Improvement of oxidized glutathione fermentation by thiol redox metabolism engineering in Saccharomyces cerevisiae2015
- 著者名/発表者名
  Hara, K.Y., Aoki, N., Kobayashi, J., Kiriyama, K., Nishida, K., Araki, M., Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Appl. Microbiol. Biotechnol.
  
  巻: 99 号: 22 ページ: 9771-9778
- DOI
  10.1007/s00253-015-6847-z
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198, KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PUBLICLY-26117715
[雑誌論文] Development of bio-based fine chemical production through synthetic bioengineering2014
- 著者名/発表者名
  Hara, K.Y., Araki, M., Okai, N., Wakai, S., Hasunuma, T., Kondo, A.
- 雑誌名
  
  Microbial Cell Factories
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 173-173
- DOI
  10.1186/s12934-014-0173-5
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711, KAKENHI-PROJECT-26430198
[雑誌論文] An Approach for Dynamical Network Reconstruction of Simple Network Motifs2013
- 著者名/発表者名
  Nakatsui, M., Araki, M., Kondo, A.
- 雑誌名
  
  BMC Systems Biology
  
  巻: 7 (Suppl 6) 号: S6 ページ: 54-54
- DOI
  10.1186/1752-0509-7-s6-s4
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[雑誌論文] Extraction and analysis of chemical modification patterns in drugdevelopment2009
- 著者名/発表者名
  Shigemizu, D., Araki, M., Okuda, S., etal.
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling 49(4)
  
  ページ: 1122-1129
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] Analysis of Chemical Modification Patterns Extracted from KEGG Drug Structure Maps2009
- 著者名/発表者名
  Shigemizu, D., Araki, M., Okuda, S., etal.
- 雑誌名
  
  IBSB2009 Boston
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] A Web Tool for Expression Pattern-Based Data Retrieval and Relevant Network Discovery fromvast Public Microarray Database2009
- 著者名/発表者名
  Feng, C., Araki, M., etal.
- 雑誌名
  
  GIW2009,PosterAbstracts P056
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] Extraction and analysis of chemical modification patterns in drug development.2009
- 著者名/発表者名
  Shigemizu D, Araki M, Okuda S, Goto S, Kanehisa M.
- 雑誌名
  
  J Chem Inf Model. 49(4)
  
  ページ: 1122-1129
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] GEM-TREND : a web tool for gene expression datamining toward relevant network discovery2009
- 著者名/発表者名
  Feng, C., Araki, M., etal.
- 雑誌名
  
  BMCG enomics 10
  
  ページ: 411-411
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] GEM-TREND : a web tool for gene expression data mining toward relevant network discovery.2009
- 著者名/発表者名
  Feng C, Araki M, Kunimoto R, Tamon A, Makiguchi H, Niijima S, Tsujimoto G, Okuno Y.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics 10
  
  ページ: 411-411
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] Prediction of drug-target interaction networks from the integration of chemical and genomic spaces2008
- 著者名/発表者名
  Yamanishi, Y., Araki, M., Gutteridge, A., Honda, W., and Kanehisa, M.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 24
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] KEGG for linking genomes to life and the environment2008
- 著者名/発表者名
  Kanehisa, M., Araki, M., etal.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 36
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[雑誌論文] Predictionof drug-target interaction networks from the integration of chemical and genomic spaces2008
- 著者名/発表者名
  Yamanishi, Y., Araki, M., Gutteridge, A., etal.
- 雑誌名
  
  Bioin for matics(ISMB2008) 24
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[産業財産権] 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラムならびに3‐ヒドロキシプロピオン酸の製造方法2010
- 発明者名
  荒木通啓、宮奥康平、谷口岳志
- 権利者名
  三菱化学株式会社
- 出願年月日
  2010-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[産業財産権] 合成経路作成装置、合成経路作成プログラムならびに3-ヒドロキシプロピオン酸の製造方法2010
- 発明者名
  荒木通啓、宮奥康平、谷口岳志
- 権利者名
  荒木通啓、宮奥康平、谷口岳志
- 産業財産権番号
  2010-281794
- 出願年月日
  2010-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] 代謝経路デザインの限界2017
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- 発表場所
  慶応義塾大学（神奈川県、藤沢市）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] In Silico代謝設計ツールの開発とその展開2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  農芸化学会2016年度大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- 年月日
  2016-03-30
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] Expanding the Scope of Metabolic Pathway In Silico2016
- 著者名/発表者名
  Michihiro Araki
- 学会等名
  The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK)
- 発表場所
  神戸大学（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2016-01-27
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] バイオプロセスデザインプラットフォームの構築2016
- 著者名/発表者名
  牧口大旭、小川哲平、荒木通啓
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県、横浜市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路の構築2016
- 著者名/発表者名
  江口晃一、工藤基徳、荒木通啓、石井純、山本浩明、近藤昭彦
- 学会等名
  農芸化学会2016年度大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- 年月日
  2016-03-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] 代謝デザインの展開2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第1回デザイン生命工学研究会
- 発表場所
  東京工業大学（神奈川県・横浜市）
- 年月日
  2016-03-08
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Development of Design Platform for Metabolic Pathways2016
- 著者名/発表者名
  Ogawa, T., Makiguchi, H. and Araki, M
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会2016年大会
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都）
- 年月日
  2016-09-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] 代謝デザインの展開2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第1回デザイン生命工学研究会
- 発表場所
  東京工業大学（神奈川県・横浜市）
- 年月日
  2016-03-08
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] インシリコ代謝経路設計基盤の展開2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦
- 学会等名
  日本薬学会第136回年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
- 年月日
  2016-03-28
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] スマートセル開発に向けたIT/AI技術の展望2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  産業構造審議会商務流通情報分科会バイオ小委員会（第4回）
- 発表場所
  経済産業省（東京都）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路の構築2016
- 著者名/発表者名
  江口晃一、工藤基徳、荒木通啓、石井純、山本浩明、近藤昭彦
- 学会等名
  農芸化学会2016年度大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- 年月日
  2016-03-30
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] In Silico代謝設計ツールの開発とその展開2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  農芸化学会2016年度大会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（北海道・札幌市）
- 年月日
  2016-03-30
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Expanding the Scope of Metabolic Pathway In Silico2016
- 著者名/発表者名
  Michihiro Araki
- 学会等名
  The 7th International Symposium of Innovative BioProduction Kobe (iBioK)
- 発表場所
  神戸大学（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2016-01-27
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] インシリコ代謝経路設計基盤の展開2016
- 著者名/発表者名
  荒木通啓、牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦
- 学会等名
  日本薬学会第136回年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
- 年月日
  2016-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] New approach for Metabolomics pathway analysis2015
- 著者名/発表者名
  Oshida, T., Ogawa, T., Yokoi, Y., Fukamachi, Y., Araki, M., Makiguchi, H.
- 学会等名
  ASMS2015
- 発表場所
  America's Center【St. Louis（USA）】
- 年月日
  2015-05-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] New approach for Metabolomics pathway analysis2015
- 著者名/発表者名
  Oshida, T., Ogawa, T., Yokoi, Y., Fukamachi, Y., Araki, M., Makiguchi, H.
- 学会等名
  ASMS2015
- 発表場所
  America's Center【St. Louis（USA）】
- 年月日
  2015-05-31
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] M-Path＆PathPod：バイオプロセスデザインプラットフォームと統合型パスウェイデータベースシステム2015
- 著者名/発表者名
  牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  第38回分子生物学会
- 発表場所
  神戸国際会議場（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2015-12-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Development of M-path platform for Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- 著者名/発表者名
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., and Araki, M.
- 学会等名
  ISMB 2015
- 発表場所
  the Convention Centre Dublin【Dublin（Ireland）】
- 年月日
  2015-07-10
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] M-Path＆PathPod：バイオプロセスデザインプラットフォームと統合型パスウェイデータベースシステム2015
- 著者名/発表者名
  牧口大旭、小川哲平、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  第38回分子生物学会
- 発表場所
  神戸国際会議場（兵庫県・神戸市）
- 年月日
  2015-12-02
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- 著者名/発表者名
  小川哲平、牧口大旭、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways
- 発表場所
  京都大学（京都府・宇治市）
- 年月日
  2015-10-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] M-path Database: Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- 著者名/発表者名
  小川哲平、牧口大旭、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会2015年大会
- 発表場所
  京都大学（京都府・宇治市）
- 年月日
  2015-10-29
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] Development of M-path platform for Navigating Potential Metabolic Pathways2015
- 著者名/発表者名
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., and Araki, M.
- 学会等名
  ISMB 2015
- 発表場所
  the Convention Centre Dublin【Dublin（Ireland）】
- 年月日
  2015-07-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] 代謝設計基盤（M-path）によるバイオ合成スコープの拡張2014
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  合成生物工学シンポジウム
- 発表場所
  神戸大学、神戸
- 年月日
  2014-11-25
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Computational platform for designing synthetic metabolic pathways2014
- 著者名/発表者名
  Michihiro Araki
- 学会等名
  7th International Congress on Biocatalysis
- 発表場所
  Hamburg University of Technology, Hamburg, Germany
- 年月日
  2014-09-03
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築2014
- 著者名/発表者名
  牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、谷口岳志、宮奥康平、荒木通啓
- 学会等名
  第37回分子生物学会
- 発表場所
  パシフィコ横浜, 横浜
- 年月日
  2014-11-26
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] 代謝設計基盤（M-path）によるバイオ合成スコープの拡張2014
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  合成生物工学シンポジウム
- 発表場所
  神戸大学, 神戸
- 年月日
  2014-11-25
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築2014
- 著者名/発表者名
  牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、谷口岳志、宮奥康平、荒木通啓
- 学会等名
  第37回分子生物学会
- 発表場所
  パシフィコ横浜、横浜
- 年月日
  2014-11-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Computational platform for designing synthetic metabolic pathways2014
- 著者名/発表者名
  Michihiro Araki
- 学会等名
  7th International Congress on Biocatalysis
- 発表場所
  Hamburg University of Technology, Hamburg, Germany
- 年月日
  2014-09-03
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] 生合成パスウェイの設計基盤構築2013
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  日本薬学会第133回年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県）
- 年月日
  2013-03-30
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] A Computational Platform for Designing Natural Products2012
- 著者名/発表者名
  Michihiro Araki
- 学会等名
  INCOB2012
- 発表場所
  バンコク（タイ）
- 年月日
  2012-10-03
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] 多様な代謝パスウェイの In silico デザイン2012
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第２回代謝工学研究部会
- 発表場所
  大阪大学（大阪府）
- 年月日
  2012-11-29
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] 代謝設計基盤のポテンシャル2012
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  「細胞を創る」研究会5.0
- 発表場所
  東京工業大学（神奈川県）
- 年月日
  2012-11-22
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] 生合成パスウェイ設計のための情報解析技術の開発2012
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第64回日本生物工学会
- 発表場所
  神戸国際会議場（兵庫県）
- 年月日
  2012-10-24
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] 合成生物事始め2011
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 発表場所
  三菱化学科学技術センター横浜
- 年月日
  2011-03-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] 医薬品-臨床知識統合データベースの構築2010
- 著者名/発表者名
  馮春来、荒木通啓、他
- 学会等名
  日本薬学会第130年会
- 発表場所
  岡山
- 年月日
  2010-03-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] retrobiosynthesisに向けた天然化合物のアーキテクチャ解析2010
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第3回医薬品研究会
- 発表場所
  東京大学医科学研究所
- 年月日
  2010-08-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] 医薬品-疾病作用情報データベース2009
- 著者名/発表者名
  荒木通啓、馮春来, 多門啓子, 薮内弘昭, 奥野恭史
- 学会等名
  日本薬学会129年会
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2009-03-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] 医薬品-疾病作用情報データベース2009
- 著者名/発表者名
  荒木通啓、馮春来、他
- 学会等名
  日本薬学会第129年会
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2009-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] 統合型薬学情報ナビゲーションシステムの開発2009
- 著者名/発表者名
  多門啓子、牧口大旭、荒木通啓、他
- 学会等名
  日本薬学会第129年会
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2009-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] ケミカルゲノミクス情報を用いた標的タンパク質の予測法の開発2009
- 著者名/発表者名
  藤田淳人、藪内弘昭、小川哲平、荒木通啓、他
- 学会等名
  日本薬学会第129年会
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2009-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20710156
[学会発表] 代謝パスウェイデータベースからの知識抽出
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  第65回生物工学会大会　シンポジウム
- 発表場所
  広島国際会議場
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] インフォマティクスを糸口とした合成生物工学の展開
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  生物工学会東日本支部　生物工学フォーラム
- 発表場所
  東京農工大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] 代謝パスウェイ情報の抽象化と具体化
- 著者名/発表者名
  荒木通啓
- 学会等名
  酵素工学研究会　第70回講演会
- 発表場所
  東京大学山上会館
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] Bioprocess design platform : Development of the bioprocess database of amino acids
- 著者名/発表者名
  牧口大旭、小川哲平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  第36回分子生物学会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] A Knowledge-Based Approach for Metabolic Pathway Design
- 著者名/発表者名
  Michihiro Araki
- 学会等名
  Enzyme Engineering XXII
- 発表場所
  富山国際会議場
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] M-path: Construction of a Database for Expanded Metabolic Pathways
- 著者名/発表者名
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., Taniguchi, T., Miyaoku, K. and Araki, M.
- 学会等名
  Active Enzyme Molecule 2014
- 発表場所
  Toyama International Conference Center, Toyama
- 年月日
  2014-12-17 – 2014-12-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Meta-synthetic metabolism: in silico design of novel amino acids from all-organism data
- 著者名/発表者名
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- 学会等名
  GIW ISCB-ASIA 2014
- 発表場所
  CBRC, Tokyo
- 年月日
  2014-12-15 – 2014-12-17
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] M-path: Construction of a Database for Expanded Metabolic Pathways
- 著者名/発表者名
  Ogawa, T., Makiguchi, H., Cox III, RS., Nakatsui M., Kondo, A., Taniguchi, T., Miyaoku, K. and Araki, M.
- 学会等名
  Active Enzyme Molecule 2014
- 発表場所
  Toyama International Conference Center, Toyama
- 年月日
  2014-12-17 – 2014-12-19
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] Meta-synthetic metabolism: Identification of critical intermediates for synthetic amino acid derivative production
- 著者名/発表者名
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- 学会等名
  CBI学会 2013年大会
- 発表場所
  船堀タワーホール
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508
[学会発表] Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways
- 著者名/発表者名
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- 学会等名
  SEED2014
- 発表場所
  Manhattan Beach, LA, USA
- 年月日
  2014-07-14 – 2014-07-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築
- 著者名/発表者名
  小川哲平、牧口大旭、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  第３回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  仙台国際センター、仙台
- 年月日
  2014-10-02 – 2014-10-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways
- 著者名/発表者名
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- 学会等名
  SEED2014
- 発表場所
  Manhattan Beach, LA, USA
- 年月日
  2014-07-14 – 2014-07-17
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築
- 著者名/発表者名
  小川哲平、牧口大旭、谷口岳志、宮奥康平、中津井雅彦、Cox III, RS.、近藤昭彦、荒木通啓
- 学会等名
  第３回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  仙台国際センター, 仙台
- 年月日
  2014-10-02 – 2014-10-04
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26119711
[学会発表] Meta-synthetic metabolism: in silico design of novel amino acids from all-organism data
- 著者名/発表者名
  Cox III, RS., Nakatsui M., Makiguchi, H., Ogawa, T., Kondo, A., Araki, M.
- 学会等名
  GIW ISCB-ASIA 2014
- 発表場所
  CBRC, Tokyo
- 年月日
  2014-12-15 – 2014-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26430198
[学会発表] Construction of a computational platform for metabolic pathway design
- 著者名/発表者名
  Araki, M
- 学会等名
  CBI学会 2013年大会
- 発表場所
  船堀タワーホール
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-24119508

1. 野田修平 (30710131)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 白井智量 (00639586)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 西田敬二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

荒木 通啓 Araki Michihiro

研究課題

研究成果

共同研究者

代謝ブラックボックスの可視化から紐解く遺伝子導入パターン最適化手法の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

人工代謝経路のスコープの拡張研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

酵素反応の選択性と多様性の情報解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

人工代謝経路の設計基盤の構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

代謝ネットワークの再構築による天然化合物の設計原理の抽出研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 合成生物工学によるモノづくり微生物のデザインに向けて2015

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] データベースからの再発見2014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] データベースからの再発見2014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] A Systematic Approach to Time-series Metabolite Profiling and RNA-seq Analysis of Chinese Hamster Ovary Cell Culture2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Application of LC-MS/MS analysis for time-lapse amino acid metabolomics analysis in CHO cell culture2017

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Targeted nucleotide editing using hybrid prokaryotic and vertebrate adaptive immune systems2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Evaluation of genes involved in oxidative phosphorylation in yeast by developing a simple and rapid method to measure mitochondrial ATP synthetic activity.2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] M-path: A Compass for Navigating Potential Metabolic Pathways2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Improvement of oxidized glutathione fermentation by thiol redox metabolism engineering in Saccharomyces cerevisiae2015

荒木通啓 Araki Michihiro