白石太郎 Shiraishi Taro

研究者番号	40734603
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-6540-8029
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 理学研究科, 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 2022年度 – 2023年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 助教 2020年度: 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教 2016年度 – 2018年度: 東京大学, 生物生産工学研究センター, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分37020:生物分子化学関連 / 0601:農芸化学およびその関連分野研究代表者以外小区分37010:生体関連化学 / 学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 理工系
キーワード	研究代表者天然物化学 / 輸送体 / 化合物ライブラリー / 放線菌 / 核酸系化合物研究代表者以外ホスホン酸 / ポリケチド / 反応機構 / 生合成 / 酵素 … もっと見る / 代謝 / タンパク質立体構造予測 / 生化学 / 機械学習 / テルペン / 生合成酵素 / 天然物化学 / 天然有機化合物 / 生体分子 / 結晶構造解析 / 生体触媒 / ポリケタイド / テルペノイド / 天然物 / 生合成遺伝子 / reaction mechanism / terpene / carbazole / nucleoside antibiotic / Biosynthesis / ヌクレオシド / 放線菌 / 生合成マシナリー / 電子環状反応 / 遺伝子 / 天然化合物 / 生物活性物質隠す

酵素反応情報と予測立体構造情報を考慮した次世代酵素基質複合体予測手法の開発
- 研究代表者
  
  森脇由隆
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分37010:生体関連化学
- 研究機関
  東京科学大学
天然物BGCにコードされた輸送体の解析手法の確立と機能解明研究代表者
- 研究代表者
  
  白石太郎
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2026
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分37020:生物分子化学関連
- 研究機関
  東京大学
天然物生合成機構の改変による革新的ペプチド－核酸融合化合物ライブラリーの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  白石太郎
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  研究活動スタート支援
- 審査区分
  
  0601:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
構造多様性一挙構築型生体反応の集積・予知・創出
- 研究代表者
  
  葛山智久
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2026
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅱ)
- 研究機関
  東京大学
複雑骨格を創成する革新的生合成マシナリーの開拓と精密機能解析
- 研究代表者
  
  葛山智久
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2020
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2019 2018 2017 2016

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Discovery of type II polyketide synthase-like enzymes for the biosynthesis of cispentacin2023
- 著者名/発表者名
  Hibi Genki、Shiraishi Taro、Umemura Tatsuki、Nemoto Kenji、Ogura Yusuke、Nishiyama Makoto、Kuzuyama Tomohisa
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 8065-8065
- DOI
  10.1038/s41467-023-43731-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[雑誌論文] Complete Biosynthetic Pathway of the Phosphonate Phosphonothrixin: Two Distinct Thiamine Diphosphate-Dependent Enzymes Divide the Work to Form a C-C Bond2022
- 著者名/発表者名
  Zhu Yuxun、Shiraishi Taro、Lin Jianwen、Inaba Keito、Ito Atsuro、Ogura Yusuke、Nishiyama Makoto、Kuzuyama Tomohisa
- 雑誌名
  
  Journal of the American Chemical Society
  
  巻: 144 号: 37 ページ: 16715-16719
- DOI
  10.1021/jacs.2c06546
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[雑誌論文] Biosynthetic pathways and enzymes involved in the production of phosphonic acid natural products2021
- 著者名/発表者名
  Shiraishi T, Kuzuyama T.
- 雑誌名
  
  Biosci Biotechnol Biochem
  
  巻: 85 号: 1 ページ: 42-52
- DOI
  10.1093/bbb/zbaa052
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[雑誌論文] 新奇骨格を創成する革新的生合成マシナリーの開拓2019
- 著者名/発表者名
  白石太郎、葛山智久
- 雑誌名
  
  ファルマシア
  
  巻: 55 号: 7 ページ: 679-683
- DOI
  10.14894/faruawpsj.55.7_679
- NAID
  130007671598
- ISSN
  0014-8601, 2189-7026
- 言語
  日本語
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[雑誌論文] Recent advances in the biosynthesis of nucleoside antibiotics2019
- 著者名/発表者名
  Shiraishi T, Kuzuyama T.
- 雑誌名
  
  J Antibiot
  
  巻: 72 号: 12 ページ: 913-923
- DOI
  10.1038/s41429-019-0236-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[雑誌論文] The Amipurimycin and Miharamycin Biosynthetic Gene Clusters: Unraveling the Origins of 2-Aminopurinyl Peptidyl Nucleoside Antibiotics2019
- 著者名/発表者名
  Romo AJ, Shiraishi T, Ikeuchi H, Lin GM, Geng Y, Lee YH, Liem PH, Ma T, Ogasawara Y, Shin-ya K, Nishiyama M, Kuzuyama T, Liu HW.
- 雑誌名
  
  J Am Chem Soc
  
  巻: 141 号: 36 ページ: 14152-14159
- DOI
  10.1021/jacs.9b03021
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[雑誌論文] Biosynthesis of the uridine-derived nucleoside antibiotic A-94964: Identification and characterization of the biosynthetic gene cluster provide insight into the biosynthetic pathway2019
- 著者名/発表者名
  Shiraishi, T., Nishiyama, M., Kuzuyama T.
- 雑誌名
  
  Org. Biomol. Chem.
  
  巻: 17 号: 3 ページ: 461-466
- DOI
  10.1039/c8ob02765j
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[雑誌論文] Fosfomycin Biosynthesis via Transient Cytidylylation of 2-Hydroxyethylphosphonate by the Bifunctional Fom1 Enzyme2017
- 著者名/発表者名
  Su-Hee Cho, Seung-Young Kim, Takeo Tomita, Taro Shiraishi, Jin-Soo Park, Shusuke Sato, Fumitaka Kudo, Tadashi Eguchi, Nobutaka Funa, Makoto Nishiyama and Tomohisa Kuzuyama
- 雑誌名
  
  ACS Chem. Biol.
  
  巻: 12 ページ: 2209-2215
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] 計算科学を用いた真菌由来テルペン環化酵素の反応機構解析2024
- 著者名/発表者名
  烏野裕作, 佐藤玄, 白石太郎, 葛山智久
- 学会等名
  日本農芸化学会2024年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Studies on terpene synthases from cyanobacteria2024
- 著者名/発表者名
  Jiayi Yu, Taro Shiraishi, Ayako Yoshida, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  日本農芸化学会2024年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] カイトセファリンの生合成研究2024
- 著者名/発表者名
  前野優香理, 齋藤直也, 白石太郎, 小川哲弘, 丸山潤一, 新家一男 , 葛山智久
- 学会等名
  日本農芸化学会2024年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Studies on the biosynthesis of phenazine derivatives from Streptomyces purpeofuscus and S. prunicolor2024
- 著者名/発表者名
  Dan Xia, Qi Luo, Taro Shiraishi, Kazuo Shin-ya, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  日本農芸化学会2024年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthesis of the acyl side chain in the nucleoside antibiotic A-94964 by unusual Type I polyketide synthase of Streptomyces sp. SANK 604042023
- 著者名/発表者名
  Hao Xu, Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  日本農芸化学会2023年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] 放線菌が生産する核酸系抗生物質の生合成遺伝子の同定とその機構解析2023
- 著者名/発表者名
  白石太郎
- 学会等名
  第 37 回(2023 年度)日本放線菌学会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthesis of the non-proteinogenic amino acid cispentacin in actinomycetes2023
- 著者名/発表者名
  Genki Hibi, Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  4th International Conference on Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Discovery of an unprecedented use of thiamine diphosphate in natural product biosynthesis2023
- 著者名/発表者名
  Yuxun ZHU, Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  日本農芸化学会2023年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthesis of the nucleoside antibiotics angustmycins2023
- 著者名/発表者名
  Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  4th International Conference on Natural Product Discovery and Development in the Genomic Era
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthetic Study on the Nucleoside Antibiotic Amipurimycin2023
- 著者名/発表者名
  Taro Shiraishi, Genki Hibi, Tatsuki Umemura, Hideo Ikeuchi, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  2023 The 1st Taiwan-Japan Bilateral Symposium on Natural Products Biosynthesis
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] A C-C bond formation through the transfer of a Breslow intermediate between two distinct thiamine diphosphate-dependent enzymes2023
- 著者名/発表者名
  朱裕勛, 白石太郎, 伊藤篤朗, 小倉由資, 西山真, 葛山智久
- 学会等名
  第65回天然有機化合物討論会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthetic Study on the Nucleoside Antibiotic Amipurimycin2023
- 著者名/発表者名
  Taro Shiraishi, Genki Hibi, Tatsuki Umemura, Hideo Ikeuchi, Makoto Nishiyama and Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  2023 The 1st Taiwan-Japan Bilateral Symposium on Natural Products Biosynthesis
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K20567
[学会発表] Studies on Diterpene Synthases from Cyanobacteria2023
- 著者名/発表者名
  Jiayi Yu, Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  第33回イソプレノイド研究会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] 放線菌が生産する核酸系抗生物質の生合成遺伝子の同定とその機構解析2023
- 著者名/発表者名
  白石太郎
- 学会等名
  2023年度（第37回）日本放線菌学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K20567
[学会発表] 特殊アミノ酸シスペンタシン生合成の再構成を起点とした新規Ⅱ型ポリケチド生合成機構の解明2023
- 著者名/発表者名
  日比玄紀, 白石太郎, 梅村龍槻, 西山真, 葛山智久
- 学会等名
  第65回天然有機化合物討論会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] 特殊アミノ酸シスペンタシンの生産とその生合成機構の解析2022
- 著者名/発表者名
  日比玄紀, 梅村龍槻, 白石太郎, 西山真, 葛山智久
- 学会等名
  日本農芸化学会関東支部2022年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthesis of the acyl side chain of the nucleotide antibiotic A-94964 produced by Streptomyces sp. SANK 604042022
- 著者名/発表者名
  Hao Xu, Taro Shiraishi, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  日本放線菌学会2022年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] 放線菌由来非タンパク質性アミノ酸シスペンタシンの生合成機構2022
- 著者名/発表者名
  日比玄紀、白石太郎、葛山智久
- 学会等名
  日本放線菌学会2022年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05120
[学会発表] Biosynthesis of the nucleoside-derived natural product angustmycin2021
- 著者名/発表者名
  Jiaqi XIA, Taro SHIRAISHI, Tomohisa KUZUYAMA
- 学会等名
  日本農芸化学会2021年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] ペプチジルヌクレオシド系抗生物質Amipurimycinの生合成に関する研究2018
- 著者名/発表者名
  池内　秀雄、白石　太郎、新家　一男、西山　真、葛山　智久
- 学会等名
  日本農芸化学会2018年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] Biosynthesis of the Nucleoside Antibiotic A-949642017
- 著者名/発表者名
  Shiraishi, T., Nishiyama, M., Kuzuyama, T.
- 学会等名
  US-Japan Seminar on the Biosynthesis of Natural Products for Young Researchers
- 発表場所
  東京工業大学（東京都目黒区）
- 年月日
  2017-03-04
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] Biosynthetic studies on the antituberculous agent caprazamycin2017
- 著者名/発表者名
  Taro Shiraishi
- 学会等名
  Directing Biosynthesis V
- 発表場所
  コベントリー（英国）
- 年月日
  2017-03-22
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] Investigating Biosynthetic of the Antituberculous Agent Caprazamycin2017
- 著者名/発表者名
  Taro Shiraishi, Makoto Nishiyama, Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  International Symposium on Biology of Actinomycetes
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] カプラザマイシン生合成における小タンパク質を介したアシル化反応の発見2017
- 著者名/発表者名
  白石太郎、廣昇、五十嵐雅之、西山真、葛山智久
- 学会等名
  日本農芸化学会2017年度大会
- 発表場所
  京都女子大学（京都府東山区）
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] カプラザマイシン生合成に関与する特異なメチル基転移酵素の機能解析2017
- 著者名/発表者名
  白石　太郎、五十嵐　雅之、西山真、葛山　智久
- 学会等名
  日本放線菌学会2017年度大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] Biosynthesis of the antituberculous agent caprazamycin2016
- 著者名/発表者名
  Taro Shiraishi, Makoto Nishiyama and Tomohisa Kuzuyama
- 学会等名
  2016 SIMB Annual Meeting and Exhibition
- 発表場所
  ニューオーリンズ（米国）
- 年月日
  2016-07-24
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453
[学会発表] アシル化反応に関与する新奇キャリアタンパク質の発見2016
- 著者名/発表者名
  白石太郎、廣昇、五十嵐雅之、西山真、葛山智久
- 学会等名
  日本放線菌学会2016年度大会
- 発表場所
  東京大学（東京都文京区）
- 年月日
  2016-09-08
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06453

1. 葛山智久 (30280952)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 30件
2. 吉田彩子 (90633686)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
3. 小川哲弘 (40323480)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
4. 森脇由隆 (70751303)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

白石 太郎 Shiraishi Taro

研究課題

研究成果

共同研究者

酵素反応情報と予測立体構造情報を考慮した次世代酵素基質複合体予測手法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

天然物BGCにコードされた輸送体の解析手法の確立と機能解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

天然物生合成機構の改変による革新的ペプチド－核酸融合化合物ライブラリーの構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

構造多様性一挙構築型生体反応の集積・予知・創出

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

複雑骨格を創成する革新的生合成マシナリーの開拓と精密機能解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Discovery of type II polyketide synthase-like enzymes for the biosynthesis of cispentacin2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Complete Biosynthetic Pathway of the Phosphonate Phosphonothrixin: Two Distinct Thiamine Diphosphate-Dependent Enzymes Divide the Work to Form a C-C Bond2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Biosynthetic pathways and enzymes involved in the production of phosphonic acid natural products2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 新奇骨格を創成する革新的生合成マシナリーの開拓2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] Recent advances in the biosynthesis of nucleoside antibiotics2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The Amipurimycin and Miharamycin Biosynthetic Gene Clusters: Unraveling the Origins of 2-Aminopurinyl Peptidyl Nucleoside Antibiotics2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Biosynthesis of the uridine-derived nucleoside antibiotic A-94964: Identification and characterization of the biosynthetic gene cluster provide insight into the biosynthetic pathway2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Fosfomycin Biosynthesis via Transient Cytidylylation of 2-Hydroxyethylphosphonate by the Bifunctional Fom1 Enzyme2017

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[学会発表] 計算科学を用いた真菌由来テルペン環化酵素の反応機構解析2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

白石太郎 Shiraishi Taro