青木裕一 AOKI YUICHI

研究者番号	40747599
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度 – 2024年度: 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 講師 2019年度 – 2021年度: 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 2016年度 – 2017年度: 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助教 2015年度: 東北大学, 情報科学研究科, 産学官連携研究員
審査区分/研究分野	研究代表者植物分子・生理科学研究代表者以外小区分43060:システムゲノム科学関連 / 中区分40:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野 / 小区分64040:自然共生システム関連 / 小区分37020:生物分子化学関連
キーワード	研究代表者 RNA-Seq / MNase-Seq / 共発現データベース / シロイヌナズナ / ヌクレオソーム / 遺伝子共発現ネットワーク / 遺伝子共発現 / 遺伝子発現制御研究代表者以外腸内細菌 / 全消化管 … もっと見る / メタゲノム / 全消化管細菌叢 / マイクロバイオータ / NGS / 遺伝的地域性 / 遺伝的多様性 / 分子系統解析 / 分子系統地理 / 森林遺伝資源保全 / 集団遺伝 / ゲノムワイドSNP分析 / MIG-seq分析 / 微細藻 / トランスクリプトーム解析 / アポトーシス / トレボウクシア藻 / 藻類 / プラスチックナノ粒子 / クラミドモナス / 遺伝子発現変化 / 樹脂製ナノ粒子 / 樹脂系 / 細胞死誘導 / 細胞増殖阻害 / 薬剤耐性 / 活性酸素種 / 生分解性 / 増殖阻害 / 微細プラスチック / ナノ粒子 / シアノアクリレート / LED / メタボローム / 二次代謝 / 一次代謝 / 機械学習 / メタボロミクス / 量子化学 / UVスペクトル / アントシアニン / 分子軌道計算 / 二次代謝物 / シロイヌナズナ / 植物 / 量子化学計算隠す

日本産針葉樹全種の遺伝的多様性統合解析
- 研究代表者
  
  陶山佳久
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分40:森林圏科学、水圏応用科学およびその関連分野
- 研究機関
  東北大学
メタゲノム解析による人体の全消化管細菌叢の同定と臨床応用へのアプローチ
- 研究代表者
  
  石沢興太
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東北大学
狭波長LED照射に応答する植物メタボロームのデジタルケミカルマッピング
- 研究代表者
  
  草野都
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分37020:生物分子化学関連
- 研究機関
  筑波大学
難分解性nanoプラステック粒子が引き起こす微細藻の生理異常と種スペクトラム解析
- 研究代表者
  
  大濱武
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分64040:自然共生システム関連
- 研究機関
  高知工科大学
ヌクレオソーム配置を介した遺伝子発現制御機構の解明：ゲノム高次構造と遺伝子共発現研究代表者
- 研究代表者
  
  青木裕一
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  植物分子・生理科学
- 研究機関
  東北大学

すべて 2018 2017 2016 2015

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] AI導入によるバイオテクノロジーの発展2018
- 著者名/発表者名
  青木裕一（監修: 植田充美）
- 総ページ数
  234
- 出版者
  シーエムシー出版
- ISBN
  9784781313153
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[雑誌論文] ATTED-II in 2018: A Plant Coexpression Database based on Investigation of Statistical Property of the Mutual Rank Index.2018
- 著者名/発表者名
  Obayashi T, Aoki Y, Tadaka S, Kagaya Y, Kinoshita K.
- 雑誌名
  
  Plant Cell Physiology
  
  巻: 59 号: 1 ページ: e3-e3
- DOI
  10.1093/pcp/pcx191
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18464, KAKENHI-PROJECT-15K20863
[雑誌論文] Root-knot and cyst nematodes activate procambium-associated genes in Arabidopsis roots2017
- 著者名/発表者名
  Yasuka L Yamaguchi, Reira Suzuki, Javier Cabrera, Satoru Nakagami, Tomomi Sagara, Chika Ejima, Ryosuke Sano, Yuichi Aoki, Rocio Olmo Lopez, Tetsuya Kurata, Takeshi Obayashi, Taku Demura, Takashi Ishida, Carolina Escobar, Shinichiro Sawa
- 雑誌名
  
  Frontiers in Plant Science
  
  巻: 8 ページ: 1195-1195
- DOI
  10.3389/fpls.2017.01195
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863, KAKENHI-PROJECT-17H03967
[雑誌論文] ALCOdb: Gene Coexpression Database for Microalgae.2016
- 著者名/発表者名
  Aoki Y, Okamura Y, Ohta H, Kinoshita K, Obayashi T.
- 雑誌名
  
  Plant Cell Physiology
  
  巻: 57 号: 1 ページ: e3-e3
- DOI
  10.1093/pcp/pcv190
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18464, KAKENHI-PROJECT-15K20863, KAKENHI-ORGANIZER-24114001, KAKENHI-PLANNED-24114005
[雑誌論文] ATTED-II in 2016: a plant coexpression database towards lineage-specific coexpression.2016
- 著者名/発表者名
  Aoki Y, Okamura Y, Tadaka S, Kinoshita K, Obayashi T.
- 雑誌名
  
  Plant Cell Physiology
  
  巻: 57 号: 1 ページ: e5-e5
- DOI
  10.1093/pcp/pcv165
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18464, KAKENHI-PROJECT-15K20863, KAKENHI-ORGANIZER-24114001, KAKENHI-PLANNED-24114005
[学会発表] シロイヌナズナの遺伝子共発現ネットワークにおけるタンパク質細胞内局在の影響2018
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  第59回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 遺伝子の機能推定における深層学習技術の活用2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一
- 学会等名
  第4回東北大学人工知能学研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 人工知能技術の分子生物学研究への応用2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一
- 学会等名
  日本農芸化学会中部支部第181回例会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 深層学習を用いた遺伝子の機能推定2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一
- 学会等名
  第35回日本植物細胞分子生物学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 深層学習を用いた植物分子生物学2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一
- 学会等名
  植物科学シンポジウム2017
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Impact of Evolutionary Age on Gene Coexpression and Core Promoter Architecture in A. thaliana2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  第58回日本植物生理学会年会
- 発表場所
  鹿児島大学（鹿児島県・鹿児島市）
- 年月日
  2017-03-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 生物ビッグデータ時代における人工知能の可能性2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一
- 学会等名
  仙台プラズマフォーラム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 植物研究への深層学習の応用2017
- 著者名/発表者名
  青木裕一
- 学会等名
  第11回植物バイオ研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Gene age determines the fundamental structure of the gene coexpression network2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  24th Annual International conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
- 発表場所
  Orlando（USA）
- 年月日
  2016-07-10
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Impact of evolutionary age on gene coexpression network architecture2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  第5回生命医薬情報学連合大会（IIBMP 2016）
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都・江東区）
- 年月日
  2016-09-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Impact of Evolutionary Age on Gene Co-expression Network Architecture in Arabidopsis thaliana2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  The 3rd CWRU-Tohoku Joint workshop Collaboration on Data Science Engineering
- 発表場所
  Tohoku University（Sendai, Miyagi）
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Gene Coexpression Analysis of Chlamydomonas by Using ALCOdb2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  17th International Conference on the Cell and Molecular Biology of Chlamydomonas
- 発表場所
  Kyoto International Conference Center（Kyoto）
- 年月日
  2016-06-26
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 遺伝子共発現による機能モジュール探索手法のラン藻への応用2016
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  平成28年度ラン藻ゲノム交流会
- 発表場所
  東京大学（東京都・目黒区）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Identification of Genomic Features Associated with Gene Coexpression in Arabidopsis thaliana2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  第57回日本植物生理学会年会
- 発表場所
  岩手大学（盛岡市）
- 年月日
  2016-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Effect of Nucleosome Positioning on Gene Co-expression Network in Arabidopsis thaliana2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  第34回日本植物細胞分子生物学会（上田）大会
- 発表場所
  信州大学（長野県・上田市）
- 年月日
  2016-09-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Involvement of evolutionary age in transcription factor mediated gene regulatory network2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  ISMB2016 RegGenSIG
- 発表場所
  Orlando（USA）
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Impact of Evolutionary Age on Gene Coexpression Network and Gene Functional Relationship2016
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県・横浜市）
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 藍藻の遺伝子共発現データベース構築の現状と課題2015
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  藍藻の分子生物学2015
- 発表場所
  かずさアカデミアホール（木更津市）
- 年月日
  2015-11-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] ALCOdb: a gene coexpression database for microalgal species2015
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  ISMB/ECCB2015
- 発表場所
  Convention Centre Dublin, Ireland
- 年月日
  2015-07-12
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] 微細藻類の遺伝子共発現データベースALCOdbの構築と光合成研究への応用2015
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  第6回日本光合成学会年会
- 発表場所
  岡山国際交流センター（岡山市）
- 年月日
  2015-05-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] NGSデータを駆使した非モデル生物の遺伝子共発現解析2015
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  NGS現場の会第四回研究会
- 発表場所
  つくば国際会議場（つくば市）
- 年月日
  2015-07-02
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] ALCOdbを用いたクラミドモナスの遺伝子共発現解析2015
- 著者名/発表者名
  青木裕一, 大林武, 木下賢吾
- 学会等名
  第12回クラミドモナス研究会
- 発表場所
  中央大学（東京都文京区）
- 年月日
  2015-09-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Relationship Analysis between Nucleosome Positioning Dynamics and Gene Coexpression2015
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  BMB2015(第38回日本分子生物学会年会)
- 発表場所
  神戸ポートアイランド（神戸市）
- 年月日
  2015-12-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863
[学会発表] Relationship Analysis between 3D Genome Architecture and Gene Coexpression2015
- 著者名/発表者名
  Yuichi Aoki, Takeshi Obayashi, Kengo Kinoshita
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会2015年大会
- 発表場所
  京都大学（宇治市）
- 年月日
  2015-10-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K20863

1. 草野都 (60415148)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 大濱武 (00194267)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 立川仁典 (00267410)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 福島敦史 (80415281)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 林八寿子 (20228597)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 右手浩一 (30176713)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 陶山佳久 (60282315)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 北村系子 (00343814)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 津村義彦 (20353774)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. Worth James (30770771)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 内山憲太郎 (40501937)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 戸丸信弘 (50241774)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 岩泉正和 (50391701)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 高橋大樹 (50913216)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 逢沢峰昭 (70436294)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 玉城聡 (80370857)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 石沢興太 (60400313)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 菅野武 (30757886)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 高山真 (80579954)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 大林武

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
21. 木下賢吾

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件

青木 裕一 AOKI YUICHI

研究課題

研究成果

共同研究者

日本産針葉樹全種の遺伝的多様性統合解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

メタゲノム解析による人体の全消化管細菌叢の同定と臨床応用へのアプローチ

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

狭波長LED照射に応答する植物メタボロームのデジタルケミカルマッピング

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

難分解性nanoプラステック粒子が引き起こす微細藻の生理異常と種スペクトラム解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ヌクレオソーム配置を介した遺伝子発現制御機構の解明：ゲノム高次構造と遺伝子共発現研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] AI導入によるバイオテクノロジーの発展2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] ATTED-II in 2018: A Plant Coexpression Database based on Investigation of Statistical Property of the Mutual Rank Index.2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Root-knot and cyst nematodes activate procambium-associated genes in Arabidopsis roots2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] ALCOdb: Gene Coexpression Database for Microalgae.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] ATTED-II in 2016: a plant coexpression database towards lineage-specific coexpression.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] シロイヌナズナの遺伝子共発現ネットワークにおけるタンパク質細胞内局在の影響2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 遺伝子の機能推定における深層学習技術の活用2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 人工知能技術の分子生物学研究への応用2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 深層学習を用いた遺伝子の機能推定2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 深層学習を用いた植物分子生物学2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

青木裕一 AOKI YUICHI