渡邉和秀 Watanabe Kazuhide

研究者番号	40749397
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 客員主管研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2023年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 客員主管研究員 2018年度 – 2021年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 上級研究員 2015年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 上級研究員 2016年度: 国立研究開発法人理化学研究所, その他部局等, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者分子生物学 / 小区分43010:分子生物学関連研究代表者以外小区分61010:知覚情報処理関連
キーワード	研究代表者上皮間葉移行 / 細胞多様性 / 間葉上皮移行 / OVOL2 / 転写因子 / ZEB1 / プロテアソーム分解 / 腫瘍組織内多様性 / 転移性乳癌 / ユビキチンプロテアソーム … もっと見る / 転移性乳がん / 組織多様性 / 乳腺上皮細胞 / Perturb-seq / 乳腺 / 上皮幹細胞 / バイオテクノロジー / 再生医学 / in vivo reprogramming / 間葉上皮転換 / 上皮間葉転換 / エピゲノム / 表皮細胞 / 生体内リプログラミング / systems biology / RNA-seq / Systems biology / Epigenomics / Transcriptomics / MET / 遺伝子発現 / クロマチン / epithelial cell / transcription factor / chromatin states / ATAC-seq / CAGE / TGFbeta / EMT … もっと見る研究代表者以外画像情報学 / バイオ医療画像解 / バイオイメージインフォマティクス / バイオ医療画像解析 / 教師なし学習 / 半教師あり学習 / 弱教師学習 / 機械学習隠す

転写因子ZEB1のプロテアソーム制御によるEMT多様性創出の分子メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  渡邉和秀
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43010:分子生物学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
生命科学特有の付加データ及びドメイン知識に着目した弱教師学習手法の開発
- 研究代表者
  
  備瀬竜馬
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分61010:知覚情報処理関連
- 研究機関
  九州大学
EMT/MET制御因子による細胞ダイバーシティー構築の原理を系統的に解析する研究代表者
- 研究代表者
  
  渡邉和秀
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
間葉上皮移行を利用した迅速かつ高効率な生体内リプログラミング法の確立（国際共同研究強化）研究代表者
- 研究代表者
  
  渡邉和秀
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2022
- 研究種目
  
  国際共同研究加速基金（国際共同研究強化）
- 研究分野
  
  分子生物学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
上皮間葉移行（EMT）を制御する転写因子ネットワークとクロマチン修飾機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  渡邉和秀
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  分子生物学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所

すべて 2023 2022 2021 2019 2017 2016 2015

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Coordinate control of basal epithelial cell fate and stem cell maintenance by core EMT transcription factor Zeb12022
- 著者名/発表者名
  Han Yingying、Villarreal-Ponce Alvaro、Gutierrez Guadalupe、Nguyen Quy、Sun Peng、Wu Ting、Sui Benjamin、Berx Geert、Brabletz Thomas、Kessenbrock Kai、Zeng Yi Arial、Watanabe Kazuhide、Dai Xing
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 38 号: 2 ページ: 110240-110240
- DOI
  10.1016/j.celrep.2021.110240
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KK0165
[雑誌論文] Comparative single-cell transcriptomes of dose and time dependent epithelial?mesenchymal spectrums2022
- 著者名/発表者名
  Panchy Nicholas、Watanabe Kazuhide、Takahashi Masataka、Willems Andrew、Hong Tian
- 雑誌名
  
  NAR Genomics and Bioinformatics
  
  巻: 4 号: 3
- DOI
  10.1093/nargab/lqac072
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16KK0165
[雑誌論文] Effective Pseudo-Labeling based on Heatmap for Unsupervised Domain Adaptation in Cell Detection2022
- 著者名/発表者名
  H. Cho, K. Nishimura, K. Watanabe, and R. Bise
- 雑誌名
  
  Medical Image Analysis
  
  巻: 79 ページ: 102436-102449
- DOI
  10.1016/j.media.2022.102436
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H04211, KAKENHI-PROJECT-21K19829, KAKENHI-PROJECT-22KJ2396, KAKENHI-PROJECT-16KK0165
[雑誌論文] Weakly supervised cell instance segmentation under various conditions2021
- 著者名/発表者名
  Nishimura Kazuya、Wang Chenyang、Watanabe Kazuhide、Fei Elmer Ker Dai、Bise Ryoma
- 雑誌名
  
  Medical Image Analysis
  
  巻: 73 ページ: 102182-102182
- DOI
  10.1016/j.media.2021.102182
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H04211, KAKENHI-PROJECT-22KJ2396
[雑誌論文] Cell Detection in Domain Shift Problem Using Pseudo-Cell-Position Heatmap2021
- 著者名/発表者名
  Cho Hyeonwoo、Nishimura Kazuya、Watanabe Kazuhide、Bise Ryoma
- 雑誌名
  
  International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention (MICCAI2021)
  
  巻: 1 ページ: 384-394
- DOI
  10.1007/978-3-030-87237-3_37
- ISBN
  9783030872366, 9783030872373
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H04211, KAKENHI-PROJECT-21K19829, KAKENHI-PROJECT-22KJ2396
[雑誌論文] Integrated single-cell transcriptomics and chromatin accessibility analysis reveals novel regulators of mammary epithelial cell identity2019
- 著者名/発表者名
  Pervolarakis Nicholas、Nguyen Quy H.、Gutierrez Guadalupe、Sun Peng、Jhutty Darisha、Zheng Grace XY、Nemec Corey M、Dai Xing、Watanabe Kazuhide、Kessenbrock Kai
- 雑誌名
  
  BioRxiv
  
  巻: np
- DOI
  10.1101/740746
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05106
[雑誌論文] Combinatorial perturbation analysis reveals divergent regulations of mesenchymal genes during epithelial-to-mesenchymal transition2019
- 著者名/発表者名
  Watanabe Kazuhide、Panchy Nicholas、Noguchi Shuhei、Suzuki Harukazu、Hong Tian
- 雑誌名
  
  BioRxiv
  
  巻: NA
- DOI
  10.1101/627372
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05106
[雑誌論文] OVOL2 induces mesenchymal-to-epithelial transition in fibroblasts and enhances reprogramming to epithelial lineages2019
- 著者名/発表者名
  Watanabe Kazuhide、Liu Ye、Noguchi Shuhei、Murray Madeleine、Chang Jen-Chien、Kishima Mami、Nishimura Hajime、Hashimoto Kosuke、Minoda Aki、Suzuki Harukazu
- 雑誌名
  
  BioRxiv
  
  巻: NA
- DOI
  10.1101/577692
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05106
[雑誌論文] Overexpression of Transcription Factor Ovol2 in Epidermal Progenitor Cells Results in Skin Blistering2017
- 著者名/発表者名
  Lee Briana、Watanabe Kazuhide、Haensel Daniel、Sui Jennifer Y.、Dai Xing
- 雑誌名
  
  Journal of Investigative Dermatology
  
  巻: 137 号: 8 ページ: 1805-1808
- DOI
  10.1016/j.jid.2017.02.985
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06952
[雑誌論文] An Ovol2-Zeb1 mutual inhibitory circuit governs bidirectional an multi-step transition between epithelial and mesenchymal states2015
- 著者名/発表者名
  1.Hong T.*, Watanabe K.*, Ha Ta C., Villarreal-Ponce A., Nie Q., and Dai X
- 雑誌名
  
  PLoS Computational Biology
  
  巻: 11 号: 11 ページ: e1004569-e1004569
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1004569
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06952
[学会発表] 転写因子ZEB1の制御によるEMTの空間多様性創出のメカニズム2023
- 著者名/発表者名
  坂本優太、高橋昌剛、渡邉和秀、鈴木治和
- 学会等名
  第46回日本分子生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06025
[学会発表] Domain Extension in Cell Detection by Pseudo-Cell-Position Heatmap2021
- 著者名/発表者名
  Hyeonwoo Cho, Kazuya Nishimura (Kyushu Univ.), Kazuhide Watanabe (RIKKEN IMS), Ryoma Bise (Kyushu Univ.)
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2021, オンライン開催)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H04211
[学会発表] OVOL2 and tissue-specific reprogramming factors cooperatively induce epithelial phenotype in fibroblasts2019
- 著者名/発表者名
  Kazuhide Watanabe
- 学会等名
  Keystone Symposia
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05106
[学会発表] Integrated single-cell transcriptomics and chromatin accessibility analysis reveals novel regulators of mammary epithelial cell identity2019
- 著者名/発表者名
  Kazuhide Watanabe
- 学会等名
  Gordon Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05106
[学会発表] Differential regulation between velocity and directionality of cellular movement during epithelial-to-mesenchymal transition2017
- 著者名/発表者名
  渡邉和秀
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06952
[学会発表] Identification of ZEB1-dependent and -independent modes of chromatin accessibility regulation by TGF-beta in mammary epithelial cells2017
- 著者名/発表者名
  Kazuhide Watanabe
- 学会等名
  Keystone symposia
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06952
[学会発表] Differential regulation of epithelial and mesenchymal phenotypes during EMT by master transcriptional regulators2016
- 著者名/発表者名
  Kazuhide Watanabe
- 学会等名
  2016 ASCB annual meeting
- 発表場所
  San Francisco (USA)
- 年月日
  2016-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06952
[学会発表] Differential regulation of epithelial and mesenchymal phenotypes during EMT by master transcriptional regulators2016
- 著者名/発表者名
  Kazuhide Watanabe
- 学会等名
  第39回　日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06952

1. 備瀬竜馬 (00644270)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
2. 須田年生 (60118453)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 末廣大貴 (20786967)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 吉澤明彦 (80378645)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. Dai Xing

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件

渡邉 和秀 Watanabe Kazuhide

研究課題

研究成果

共同研究者

転写因子ZEB1のプロテアソーム制御によるEMT多様性創出の分子メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

生命科学特有の付加データ及びドメイン知識に着目した弱教師学習手法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

EMT/MET制御因子による細胞ダイバーシティー構築の原理を系統的に解析する研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

間葉上皮移行を利用した迅速かつ高効率な生体内リプログラミング法の確立（国際共同研究強化）研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

上皮間葉移行（EMT）を制御する転写因子ネットワークとクロマチン修飾機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Coordinate control of basal epithelial cell fate and stem cell maintenance by core EMT transcription factor Zeb12022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Comparative single-cell transcriptomes of dose and time dependent epithelial?mesenchymal spectrums2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Effective Pseudo-Labeling based on Heatmap for Unsupervised Domain Adaptation in Cell Detection2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Weakly supervised cell instance segmentation under various conditions2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Cell Detection in Domain Shift Problem Using Pseudo-Cell-Position Heatmap2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISBN

データソース

[雑誌論文] Integrated single-cell transcriptomics and chromatin accessibility analysis reveals novel regulators of mammary epithelial cell identity2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Combinatorial perturbation analysis reveals divergent regulations of mesenchymal genes during epithelial-to-mesenchymal transition2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] OVOL2 induces mesenchymal-to-epithelial transition in fibroblasts and enhances reprogramming to epithelial lineages2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Overexpression of Transcription Factor Ovol2 in Epidermal Progenitor Cells Results in Skin Blistering2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] An Ovol2-Zeb1 mutual inhibitory circuit governs bidirectional an multi-step transition between epithelial and mesenchymal states2015

渡邉和秀 Watanabe Kazuhide