朴聖俊 Park Sung-Joon

研究者番号	40759411
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-1774-9590
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 医科学研究所, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2024年度: 東京大学, 医科学研究所, 准教授 2017年度 – 2019年度: 東京大学, 医科学研究所, 特任講師
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43060:システムゲノム科学関連 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外小区分57040:口腔再生医学および歯科医用工学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
キーワード	研究代表者バイオインフォマティクス / 染色体高次構造 / 遺伝子転写制御 / ゲノム高次構造 / 遺伝子転写モデル / 網羅的配列解読 / 次世代シークエンシング / コンタミネーション研究代表者以外抗炎症作用 / 創傷治癒作用 … もっと見る / 創傷治癒 / miRNA / 間葉系幹細胞 / 再生医療 / エクソソーム / Brd / Hexim / Aff4 / Brd4 / NKAP / Cbx1 / 転写制御ネットワーク / 転写伸長 / Hi-C / コヒーシンローダー / コヒーシン / 希少疾患隠す

間葉系幹細胞エクソソームによる創傷治癒・抗炎症作用メカニズムの解析
- 研究代表者
  
  岩田隆紀
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分57040:口腔再生医学および歯科医用工学関連
- 研究機関
  東京医科歯科大学
遺伝子転写制御領域の空間構造を定量的に解析する計算手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  朴聖俊
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学
発生・分化のゲノムモダリティと疾患
- 研究代表者
  
  白髭克彦
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  東京大学
染色体構造データベースを利用した転写制御のモデリング研究代表者
- 研究代表者
  
  朴聖俊
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  東京大学
網羅的塩基配列解読データを用いたコンタミネーションの検出と影響解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  朴聖俊
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2021 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] A computational approach for deciphering the interactions between proximal and distal gene regulators in GC B-cell response2024
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park* and Kenta Nakai
- 雑誌名
  
  NAR Genomics and Bioinformatics lqae050
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-20H05940
[雑誌論文] Genome-wide ATAC-see screening identifies TFDP1 as a modulator of global chromatin accessibility2024
- 著者名/発表者名
  Ishii Satoko、Kakizuka Taishi、Park Sung-Joon、Tagawa Ayako、Sanbo Chiaki、Tanabe Hideyuki、Ohkawa Yasuyuki、Nakanishi Mahito、Nakai Kenta、Miyanari Yusuke
- 雑誌名
  
  Nature Genetics
  
  巻: 56 号: 3 ページ: 473-482
- DOI
  10.1038/s41588-024-01658-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19275, KAKENHI-PUBLICLY-22H04676, KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23H00372
[雑誌論文] Anti-inflammatory effects of cold atmospheric plasma irradiation on the THP-1 human acute monocytic leukemia cell line2023
- 著者名/発表者名
  Hirasawa Ito、Odagiri Haruka、Park Giri、Sanghavi Rutvi、Oshita Takaya、Togi Akiko、Yoshikawa Katsunori、Mizutani Koji、Takeuchi Yasuo、Kobayashi Hiroaki、Katagiri Sayaka、Iwata Takanori、Aoki Akira
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 18 号: 10 ページ: 1-15
- DOI
  10.1371/journal.pone.0292267
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K09971, KAKENHI-PROJECT-21K19590, KAKENHI-PROJECT-20H03863, KAKENHI-PROJECT-23K24531
[雑誌論文] A semi-supervised deep learning approach for predicting the functional effects of genomic non-coding variations2021
- 著者名/発表者名
  Hao Jia, Sung-Joon Park, Kenta Nakai
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06606
[雑誌論文] Characterizing promoter and enhancer sequences by a deep learning method2021
- 著者名/発表者名
  Xin Zeng, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 雑誌名
  
  Frontiers in Genetics
  
  巻: 12 ページ: 681259-681259
- DOI
  10.3389/fgene.2021.681259
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-20K06606
[雑誌論文] Existence and possible roles of independent non-CpG methylation in the mammalian brain2020
- 著者名/発表者名
  Lee Jong-Hun、Saito Yutaka、Park Sung-Joon、Nakai Kenta
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 27 号: 4
- DOI
  10.1093/dnares/dsaa020
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K06502, KAKENHI-PROJECT-20K06606, KAKENHI-PROJECT-19K20409, KAKENHI-PLANNED-17H06410
[雑誌論文] Existence and possible roles of independent non-CpG methylation in mammalian brain2020
- 著者名/発表者名
  Lee Jong-Hun, Saito Yutaka, Park Sung-Joon, Nakai Kenta
- 雑誌名
  
  Research Square (preprint)
  
  巻: -
- DOI
  10.21203/rs.2.22195/v1
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[雑誌論文] HHEX promotes myeloid transformation in cooperation with mutant ASXL12020
- 著者名/発表者名
  Reina Takeda, Shuhei Asada, Sung-Joon Park, Akihiko Yokoyama, Hans Becker, Akinori Kanai, Valeria Visconte, Courtney Hershberger, Yasutaka Hayashi, Taishi Yonezawa, Moe Tamura, Tsuyoshi Fukushima, Yosuke Tanaka, Tomofusa Fukuyama, Akiko Matsumoto, Satoshi Yamasaki, Kenta Nakai, Satoshi Yamazaki, Toshiya Inaba et al.
- 雑誌名
  
  Blood
  
  巻: -
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[雑誌論文] Genome-Wide Scanning of Gene Expression2019
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park
- 雑誌名
  
  Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 3 ページ: 452-462
- DOI
  10.1016/b978-0-12-809633-8.20132-5
- ISBN
  9780128114322
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[雑誌論文] Broad Heterochromatic Domains Open in Gonocyte Development Prior to De Novo DNA Methylation2019
- 著者名/発表者名
  Yamanaka Soichiro、Nishihara Hidenori、Toh Hidehiro、Eijy Nagai Luis Augusto、Hashimoto Kosuke、Park Sung-Joon、Shibuya Aoi、Suzuki Ana Maria、Tanaka Yujiro、Nakai Kenta、Carninci Piero、Sasaki Hiroyuki、Siomi Haruhiko
- 雑誌名
  
  Developmental Cell
  
  巻: 51 号: 1 ページ: 21-34
- DOI
  10.1016/j.devcel.2019.07.023
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K06616, KAKENHI-PUBLICLY-18H04710, KAKENHI-PLANNED-19H05753
[雑誌論文] Analyzing the 3D chromatin organization coordinating with gene expression regulation in B-cell lymphoma2019
- 著者名/発表者名
  Luis A. E. Nagai, Sung-Joon Park, and Kenta Nakai
- 雑誌名
  
  BMC Medical Genomics
  
  巻: 11 号: S7 ページ: 127-127
- DOI
  10.1186/s12920-018-0437-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00397, KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[雑誌論文] A systematic sequencing-based approach for microbial contaminant detection and functional inference.2019
- 著者名/発表者名
  Park SJ, Onizuka S, Seki M, Suzuki Y, Iwata T, Nakai K.
- 雑誌名
  
  BMC Biology
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 72-72
- DOI
  10.1186/s12915-019-0690-0
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K19056, KAKENHI-PROJECT-17K00396, KAKENHI-PROJECT-18H02985
[学会発表] Meta co-expression analysis of genetic heterogeneity in GBM using single-cell RNA-seq data2021
- 著者名/発表者名
  Taisuke Hori, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2021)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06606
[学会発表] Analyzing the impact of inter-chromosomal interactions on B cell development by linear regression modeling2020
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2020)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06606
[学会発表] A Semi-supervised Deep Learning Approach for Predicting the Functional Effects of Genomic Non-coding Variations2020
- 著者名/発表者名
  Hao Jia, Sung-Joon Park, Kenta Nakai
- 学会等名
  The 19th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2020)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06606
[学会発表] Characterizing Promoter and Enhancer Sequences by a Deep Learning Method2020
- 著者名/発表者名
  Xin Zeng, Sung-Joon Park, Kenta Nakai
- 学会等名
  The 19th International Conference on Bioinformatics (InCoB 2020)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06606
[学会発表] 歯根膜組織由来間葉系幹細胞シートによる歯周組織再生2020
- 著者名/発表者名
  鬼塚理, 朴聖俊, 貝淵信之, 妻沼有香, 安藤智博, 中井謙太, 岩田隆紀
- 学会等名
  第19回日本再生医療学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[学会発表] Co-expression network analysis of E3 ligase genes in embryonic stem cells and cell fate specification2020
- 著者名/発表者名
  Darina Obukhova, Sung-Joon Park, Kenta Nakai
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2020)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06606
[学会発表] Genome-wide chromatin structural analysis reveals inter-chromosomal translocations in B-cell lymphoma cell line2019
- 著者名/発表者名
  Luis AE Nagai, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  The Biology of Genomes
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] 脂肪由来幹細胞の運命決定と分化制御に関する時空間特異的ヒストン修飾のin-silico特定2019
- 著者名/発表者名
  山谷恭代, 朴聖俊, 中井謙太
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Analyzing the 3D Chromatin Organization Coordinating with Gene Expression Regulation in B-cell Lymphoma2019
- 著者名/発表者名
  Luis Augusto Eijy Nagai, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  第8回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2019）
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] OpenContami: A Web-based Application for Detecting Microbial Contaminants in Next-generation Sequencing2019
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park, Satoru Onizuka, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Takanori Iwata and Kenta Nakai
- 学会等名
  第8回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[学会発表] Profiling microbial contamination by exploiting host-unmapped NGS reads2019
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  Revolutionizing Next-Generation Sequencing 2019 (RNGS19)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[学会発表] Regression-based promoter modeling with local 3D chromatin structure2019
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park
- 学会等名
  CHROMOSOME DYNAMICS (An international symposium on chromatin and chromosome stability)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Host-unmapped NGS reads shape the prevalence of microbial contamination2019
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  The Biology of Genomes
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[学会発表] マウス胎仔期生殖細胞におけるクロマチンリプログラミング2019
- 著者名/発表者名
  山中総一郎, 西原秀典, 藤英博, Luis Augusto Eijy Nagai, 橋本浩介, 朴聖俊, 渋谷あおい, Ana Maria Suzuki, 田中悠二郎, 中井謙太, Piero Carninci, 佐々木裕之, 塩見春彦
- 学会等名
  第21回日本RNA学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] 脂肪由来幹細胞の分化制御に働くエピジェネティック因子のin-silico同定2019
- 著者名/発表者名
  山谷恭代, 朴聖俊, 中井謙太
- 学会等名
  第8回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2019）
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Genome-wide chromatin structural analysis reveals inter-chromosomal translocations in B-cell lymphoma2019
- 著者名/発表者名
  Luis A.E. Nagai, Sung-Joon Park, Kenta Nakai
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] OpenLooper: A web-based platform for managing multi-layered NGS data2018
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2018)
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] DNAヒドロキシメチル化とヒストンH4K8アセチル化によるヒト多能性幹細胞遺伝子発現変動2018
- 著者名/発表者名
  石川靖久, 朴聖俊, 中井謙太
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2018)
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] ゴノサイトでの新規DNAメチル化に付随して起こる多段階のクロマチンの緩み2018
- 著者名/発表者名
  山中総一郎, 西原秀典, 藤英博, 永井映司, 橋本浩介, 朴聖俊, 渋谷あおい, Ana Maria Suzuki, 田中悠二郎, 中井謙太, Piero Carninci, 佐々木裕之, 塩見春彦
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Analyzing the 3D Chromatin Organization Coordinating with Gene Expression Regulation in B-cell Lymphoma2018
- 著者名/発表者名
  Luis A.E. Nagai, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  The 17th International Conference On BioInformatics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Three-Dimensional Chromatin Structures Coordinate with Gene Expression Levels and Reveals Inter-chromosomal Interactions in B-Cell Lymphoma2018
- 著者名/発表者名
  Luis A.E. Nagai, Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2018)
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Profiling of Cell Microbial Contamination by NGS data2018
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park
- 学会等名
  配列解析シンポジウム、日本バイオインフォマティクス学会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[学会発表] 脂肪由来幹細胞（Adipose-derived stem cell）の分化に関与するエピジェネティック因子の探索2018
- 著者名/発表者名
  山谷恭代, 朴聖俊, 中井謙太
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2018)
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04710
[学会発表] Applying Joint Non-Negative Matrix Factorization to Functional Analysis of Microbial Infection2018
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park and Kenta Nakai
- 学会等名
  The 17th International Conference On BioInformatics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396
[学会発表] Development of a Pipeline for Contamination Profiling of Cells with Next Generation Sequencing Data2017
- 著者名/発表者名
  Sung-Joon Park
- 学会等名
  The 28th International Conference on Genome Informatics Workshop (GIW)/BIOINFO 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00396

1. 白髭克彦 (90273854)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 泉幸佑 (40383707)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 岩田隆紀 (60431946)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 丸川恵理子 (40419263)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 水谷幸嗣 (60451910)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
6. 片桐さやか

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 大川恭行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
8. 青木章

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
9. 小林宏明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
10. 竹内康雄

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
11. 齋藤裕

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
12. 山中総一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
13. 中井謙太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
14. 鬼塚理

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

朴 聖俊 Park Sung-Joon

研究課題

研究成果

共同研究者

間葉系幹細胞エクソソームによる創傷治癒・抗炎症作用メカニズムの解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

遺伝子転写制御領域の空間構造を定量的に解析する計算手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

発生・分化のゲノムモダリティと疾患

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

染色体構造データベースを利用した転写制御のモデリング研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

網羅的塩基配列解読データを用いたコンタミネーションの検出と影響解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] A computational approach for deciphering the interactions between proximal and distal gene regulators in GC B-cell response2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Genome-wide ATAC-see screening identifies TFDP1 as a modulator of global chromatin accessibility2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Anti-inflammatory effects of cold atmospheric plasma irradiation on the THP-1 human acute monocytic leukemia cell line2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A semi-supervised deep learning approach for predicting the functional effects of genomic non-coding variations2021

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Characterizing promoter and enhancer sequences by a deep learning method2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Existence and possible roles of independent non-CpG methylation in the mammalian brain2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Existence and possible roles of independent non-CpG methylation in mammalian brain2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] HHEX promotes myeloid transformation in cooperation with mutant ASXL12020

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Genome-Wide Scanning of Gene Expression2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISBN

データソース

[雑誌論文] Broad Heterochromatic Domains Open in Gonocyte Development Prior to De Novo DNA Methylation2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

朴聖俊 Park Sung-Joon