半田哲也 Handa Tetsuya

研究者番号	40772570
その他のID	https://orcid.org/0000-0001-7707-0195
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2017年度 – 2020年度: 東京工業大学, 科学技術創成研究院, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者分子生物学
キーワード	研究代表者 CRISPR/Cas / エピゲノム操作 / RNA Polymerase 2 / エピゲノム編集 / CRISPR/Cas9 / 生細胞イメージング / クロマチン / ヒストン修飾 / 遺伝子発現制御 / エピジェネティクス

特定ゲノム領域の可視化とエピゲノム操作を用いた遺伝子発現制御の動態解析研究代表者
- 研究代表者
  
  半田哲也
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  分子生物学
- 研究機関
  東京工業大学

すべて 2021 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 実験医学別冊 - エピゲノムをもっと見るためのクロマチン解析実践プロトコール (分担執筆)2020
- 著者名/発表者名
  半田哲也
- 総ページ数
  270
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[図書] 遺伝子医学通巻31号 (復刊6号) 「ヒストン修飾解析の最前線」2020
- 著者名/発表者名
  半田哲也、木村宏
- 出版者
  (株)メディカルドゥ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[雑誌論文] Visualizing transcription sites in living cells using a genetically encoded probe specific for the elongating form of RNA polymerase II2021
- 著者名/発表者名
  Uchino Satoshi、Ito Yuma、Sato Yuko、Handa Tetsuya、Ohkawa Yasuyuki、Tokunaga Makio、Kimura Hitoshi
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: - ページ: 441582-441582
- DOI
  10.1101/2021.04.27.441582
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06484, KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PROJECT-17H01417, KAKENHI-PROJECT-19H03192, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PROJECT-17KK0143
[雑誌論文] H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing2021
- 著者名/発表者名
  Tjalsma Sjoerd J D、Hori Mayako、Sato Yuko、Bousard Aurelie、Ohi Akito、Raposo Ana Claudia、Roensch Julia、Le Saux Agnes、Nogami Jumpei、Maehara Kazumitsu、Kujirai Tomoya、Handa Tetsuya、Bages‐Arnal Sandra、Ohkawa Yasuyuki、Kurumizaka Hitoshi、da Rocha Simao Teixeira、Zylicz Jan J、Kimura Hiroshi、Heard Edith
- 雑誌名
  
  EMBO reports
  
  巻: 22 号: 3
- DOI
  10.15252/embr.202051989
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06484, KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PUBLICLY-19H04970, KAKENHI-PUBLICLY-20H05393, KAKENHI-PROJECT-17H01417, KAKENHI-PROJECT-19H03158, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PROJECT-17KK0143
[雑誌論文] Euchromatin factors HULC and Set1C affect heterochromatin organization for mating-type switching in fission yeast Schizosaccharomyces pombe2021
- 著者名/発表者名
  Chavez Alfredo Esquivel、Maki Takahisa、Tsubouchi Hideo、Handa Testuya、Kimura Hiroshi、Haber James E.、Thon Genevieve、Iwasaki Hiroshi
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: -
- DOI
  10.1101/2021.03.23.436714
- オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[雑誌論文] Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input.2020
- 著者名/発表者名
  Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shoko Sato, Masaru Nakao, Naoki Goto, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura.
- 雑誌名
  
  Nat Protoc.
  
  巻: 15 号: 10 ページ: 3334-3360
- DOI
  10.1038/s41596-020-0375-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21398, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PUBLICLY-19H04970, KAKENHI-PUBLICLY-19H05244, KAKENHI-PUBLICLY-19H05425, KAKENHI-PUBLICLY-20H04846, KAKENHI-PUBLICLY-20H05368, KAKENHI-PUBLICLY-20H05393, KAKENHI-PROJECT-17H01417, KAKENHI-PROJECT-20H00456, KAKENHI-PROJECT-19H03158, KAKENHI-PROJECT-19H03211, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PROJECT-19H03424
[雑誌論文] Live-cell imaging reveals the spatiotemporal organization of endogenous RNA polymerase II phosphorylation at a single gene2020
- 著者名/発表者名
  Forero-Quintero Linda S.、Raymond William、Handa Tetsuya、Saxton Matthew、Morisaki Tatsuya、Kimura Hiroshi、Bertrand Edouard、Munsky Brian、Stasevich Timothy J.
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: - ページ: 024414-024414
- DOI
  10.1101/2020.04.03.024414
- オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PROJECT-17K17719
[雑誌論文] Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL-seq with single-thin sections2020
- 著者名/発表者名
  Maehara Kazumitsu、Tomimatsu Kosuke、Harada Akihito、Tanaka Kaori、Sato Shoko、Okada Seiji、Handa Tetsuya、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: - ページ: 423434-423434
- DOI
  10.1101/2020.12.18.423434
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PROJECT-17K17719
[雑誌論文] Signs of biological activities of 28,000-year-old mammoth nuclei in mouse oocytes visualized by live-cell imaging2019
- 著者名/発表者名
  Kazuo Yamagata, Kouhei Nagai, Hiroshi Miyamoto, ...., Tetsuya Handa (17番目), Hiroshi Kimura, Yoshihiko Hosoi, Tasuku Mitani, Kazuya Matsumoto, Akira Iritani
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 9 巻号: 1 ページ: 4050-4050
- DOI
  10.1038/s41598-019-40546-1
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PROJECT-18H02357, KAKENHI-PROJECT-18K05693, KAKENHI-PROJECT-18K06021, KAKENHI-PLANNED-18H05528, KAKENHI-PROJECT-17H05045
[雑誌論文] Detailed protocol ─ Chromatin Integration labeling2019
- 著者名/発表者名
  Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura
- 雑誌名
  
  Protocol Exchange
  
  巻: 122 ページ: 122-122
- DOI
  10.1038/protex.2018.122
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[雑誌論文] A chromatin integration labelling method enables epigenomic profiling with lower input2018
- 著者名/発表者名
  Harada Akihito、Maehara Kazumitsu、Handa Tetsuya、Arimura Yasuhiro、Nogami Jumpei、Hayashi-Takanaka Yoko、Shirahige Katsuhiko、Kurumizaka Hitoshi、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki
- 雑誌名
  
  Nature Cell Biology
  
  巻: 21 号: 2 ページ: 287-296
- DOI
  10.1038/s41556-018-0248-3
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19432, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-INTERNATIONAL-15K21761, KAKENHI-ORGANIZER-15H05970, KAKENHI-PLANNED-15H05976, KAKENHI-PUBLICLY-18H04802, KAKENHI-PUBLICLY-18H04904, KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PROJECT-17H01408, KAKENHI-PROJECT-17H01417, KAKENHI-PROJECT-17H03608, KAKENHI-PROJECT-17K19356
[雑誌論文] Shelterin promotes tethering of late replication origins to telomeres for replication‐timing control2018
- 著者名/発表者名
  Ogawa Shiho、Kido Sayuri、Handa Tetsuya、Ogawa Hidesato、Asakawa Haruhiko、Takahashi Tatsuro S、Nakagawa Takuro、Hiraoka Yasushi、Masukata Hisao
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal
  
  巻: 37 号: 15 ページ: 15-15
- DOI
  10.15252/embj.201898997
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07285, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PUBLICLY-18H04716, KAKENHI-PLANNED-18H05533, KAKENHI-PROJECT-17H01444, KAKENHI-PROJECT-17H01876, KAKENHI-PROJECT-15K14450, KAKENHI-PROJECT-18K06060
[雑誌論文] Targeted DNA methylation in pericentromeres with genome editing-based artificial DNA methyltransferase2017
- 著者名/発表者名
  Yamazaki Taiga、Hatano Yu、Handa Tetsuya、Kato Sakiko、Hoida Kensuke、Yamamura Rui、Fukuyama Takashi、Uematsu Takayuki、Kobayashi Noritada、Kimura Hiroshi、Yamagata Kazuo
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 12 号: 5 ページ: 1-18
- DOI
  10.1371/journal.pone.0177764
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K09585, KAKENHI-PROJECT-17K16578, KAKENHI-PROJECT-17K17719, KAKENHI-PLANNED-25116005, KAKENHI-PROJECT-15K14924
[学会発表] 特定ゲノム領域の生細胞イメージングとエピゲノム操作による遺伝子発現制御2019
- 著者名/発表者名
  半田哲也、木村宏
- 学会等名
  第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] Multi-ChIL法による少数細胞の複数エピゲノムの同時解析2019
- 著者名/発表者名
  半田哲也、原田哲仁、前原一満、大川恭行、木村宏
- 学会等名
  第13回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] A chromatin integration labeling method enables epigenomic profiling with lower input2018
- 著者名/発表者名
  Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yasuhiro Arimura, Jumpei Nogami, Yoko Hayashi-Takanaka, Katsuhiko Shirahige, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura
- 学会等名
  3R&3C Symposium
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] Chromatin integration labeling technology enables low-input epigenomic profiling2018
- 著者名/発表者名
  Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yasuhiro Arimura, Jumpei Nogami, Yoko Hayashi-Takanaka, Katsuhiko Shirahige, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura
- 学会等名
  2018 Cold Spring Harbor meeting: Nuclear Organization & Function
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] 特定ゲノム領域の生細胞イメージングとエピゲノム操作による遺伝子発現制御2018
- 著者名/発表者名
  半田　哲也
- 学会等名
  日本ゲノム編集学会第3回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] Dynamics of Histone Modifications and RNA Polymerase II in Heat Shock Response2017
- 著者名/発表者名
  Tetsuya Handa, Hiroshi Kimura
- 学会等名
  EMBO Conference: Chromatin and Epigenetics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] 熱ショック応答におけるヒストン修飾とRNA Polymerase 2 の動態解析2017
- 著者名/発表者名
  半田哲也、木村宏
- 学会等名
  第２回クロマチン動構造ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719
[学会発表] 熱ショック応答におけるヒストン修飾とRNA Polymerase 2 の動態解析2017
- 著者名/発表者名
  半田哲也、木村宏
- 学会等名
  第11回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K17719

1. 大川恭行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
2. 小川英知

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 伊藤由馬

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
4. 佐藤優子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
5. 植松崇之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
6. 原田哲仁

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 木村宏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

半田 哲也 Handa Tetsuya

研究課題

研究成果

共同研究者

特定ゲノム領域の可視化とエピゲノム操作を用いた遺伝子発現制御の動態解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] 実験医学別冊 - エピゲノムをもっと見るための クロマチン解析実践プロトコール (分担執筆)2020

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 遺伝子医学 通巻31号 (復刊6号) 「ヒストン修飾解析の最前線」2020

著者名/発表者名

出版者

データソース

[雑誌論文] Visualizing transcription sites in living cells using a genetically encoded probe specific for the elongating form of RNA polymerase II2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] H4K20me1 and H3K27me3 are concurrently loaded onto the inactive X chromosome but dispensable for inducing gene silencing2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Euchromatin factors HULC and Set1C affect heterochromatin organization for mating-type switching in fission yeast Schizosaccharomyces pombe2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Chromatin integration labeling for mapping DNA-binding proteins and modifications with low input.2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Live-cell imaging reveals the spatiotemporal organization of endogenous RNA polymerase II phosphorylation at a single gene2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Modeling population size independent tissue epigenomes by ChIL-seq with single-thin sections2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Signs of biological activities of 28,000-year-old mammoth nuclei in mouse oocytes visualized by live-cell imaging2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Detailed protocol ─ Chromatin Integration labeling2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A chromatin integration labelling method enables epigenomic profiling with lower input2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Shelterin promotes tethering of late replication origins to telomeres for replication‐timing control2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Targeted DNA methylation in pericentromeres with genome editing-based artificial DNA methyltransferase2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] 特定ゲノム領域の生細胞イメージングとエピゲノム操作による遺伝子発現制御2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Multi-ChIL法による少数細胞の複数エピゲノムの同時解析2019

著者名/発表者名

半田哲也 Handa Tetsuya

[図書] 実験医学別冊 - エピゲノムをもっと見るためのクロマチン解析実践プロトコール (分担執筆)2020

[図書] 遺伝子医学通巻31号 (復刊6号) 「ヒストン修飾解析の最前線」2020