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坂田 豊典  SAKATA Toyonori

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 40795530
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2025年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教
2022年度 – 2023年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 助教
2018年度 – 2021年度: 東京大学, 定量生命科学研究所, 特任助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43050:ゲノム生物学関連
研究代表者以外
中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
キーワード
研究代表者
染色体高次構造 / コヒーシン / 転写 / エンハンサー / コヒーシンローダー / Micro-C / Hi-C / スーパーエンハンサー / 染色体ループ / SMCタンパク質 … もっと見る / ATPase / NIPBL / super-enhancer / HiChIP / メディエーター / BRD4 / CdLS … もっと見る
研究代表者以外
希少疾患 / RNAクオリティ / 転写 / コヒーシン 隠す
  • 研究課題

    (5件)
  • 研究成果

    (12件)
  • 共同研究者

    (6人)
  •  コヒーシンによる転写伸長反応制御の実態解明に向けて

    • 研究代表者
      白髭 克彦
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  コヒーシンによる遺伝子の転写に伴う染色体高次構造の制御機構とその生理的機能の解明研究代表者

    • 研究代表者
      坂田 豊典
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  semi-in vivo系でのコヒーシンによる染色体機能と高次構造制御機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      坂田 豊典
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  コヒーシンローダーによるスーパーエンハンサーを介した遺伝子発現制御機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      坂田 豊典
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  染色体高次構造の形成におけるコヒーシンの制御メカニズムの解明研究代表者

    • 研究代表者
      坂田 豊典
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2019
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2023 2022 2021 2019 2018

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Context-dependent perturbations in chromatin folding and the transcriptome by cohesin and related factors2023

    • 著者名/発表者名
      Nakato Ryuichiro、Sakata Toyonori、Wang Jiankang、Nagai Luis Augusto Eijy、Nagaoka Yuya、Oba Gina Miku、Bando Masashige、Shirahige Katsuhiko
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 14 号: 1 ページ: 5647-5647

    • DOI

      10.1038/s41467-023-41316-4

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K06177, KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-20H05686, KAKENHI-PROJECT-23K27159
  • [学会発表] Diverse genome-wide analyses in CdLS and CHOPS syndrome reveal defects of enhancer organization mediated by cohesin2022

    • 著者名/発表者名
      Toyonori Sakata
    • 学会等名
      Biochemical society scientific conference
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K06177
  • [学会発表] コヒーシンを原因とする発生疾患の解析で明らかとなってきたコヒーシンによるエンハンサーの組織的制御2022

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K06177
  • [学会発表] 遺伝情報制御ネットワークから見た病態2021

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典、坂東優篤、白髭克彦
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第65回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15768
  • [学会発表] CdLS及びCHOPS症候群患者由来細胞を用いたコヒーシンによる遺伝子 発現制御メカニズムの解析2021

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典、泉幸佑、中戸 隆一郎、鄭盛穎、坂東優 篤、白髭克彦
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15768
  • [学会発表] Analysis of transcription and 3D genome structure in Cornelia de Lange syndrome (CdLS)2019

    • 著者名/発表者名
      Toyonori Sakata
    • 学会等名
      EMBO workshop Vienna 2019 - Organization of bacterial and eukaryotic genomes by SMC complexes
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • [学会発表] Genome-wide Analysis in Cohesin-related Syndromes2019

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • [学会発表] コルネリア・デ・ランゲ症候群(CdLS)患者由来細胞における遺伝子発現制御の解析2019

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • [学会発表] コルネリア・デ・ランゲ症候群(CdLS)患者由来細胞における遺伝子発現制御の解析2019

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典
    • 学会等名
      第37回染色体ワークショップ・ 第18回核ダイナミクス研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • [学会発表] Organization of 3D genome structure in Cornelia de Lange syndrome (CdLS)2018

    • 著者名/発表者名
      Toyonori Sakata
    • 学会等名
      Cornelia de Lange Syndrome Foundation Scientific & Educational Symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • [学会発表] コルネリア・デ・ランゲ症候群(CdLS)患者由来細胞における染色体高次構造の解析2018

    • 著者名/発表者名
      坂田豊典
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • [学会発表] Organization of 3D genome structure in Cornelia de Lange syndrome (CdLS)2018

    • 著者名/発表者名
      Toyonori Sakata
    • 学会等名
      3R3C symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K14673
  • 1.  白髭 克彦 (90273854)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  藤木 克則 (10646730)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  須谷 尚史 (30401524)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  ヤポセン クリスチャン (70985580)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  中川 優里 (80772152)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  坂東 優篤 (90360627)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

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