山下由衣 Yamashita Yui

研究者番号	40803383
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2017年度 – 2022年度: 北海道大学, 農学研究院, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分44030:植物分子および生理科学関連 / 植物分子・生理科学
キーワード	研究代表者 uORF / ショ糖 / 代謝制御 / 翻訳制御 / 転写後遺伝子発現制御 / 翻訳停滞 / 翻訳 / 転写因子 / リボソーム / ショ糖応答 / C/N比 / 上流ORF

複数の上流ORFが奏でる臨機応変なショ糖感知機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  山下由衣
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分44030:植物分子および生理科学関連
- 研究機関
  北海道大学
植物におけるリボソームによるショ糖感知とC/N比の代謝統御機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  山下由衣
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分44030:植物分子および生理科学関連
- 研究機関
  北海道大学
転写因子の翻訳制御によるショ糖センシングの分子機構研究代表者
- 研究代表者
  
  山下由衣
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2018
- 研究種目
  
  研究活動スタート支援
- 研究分野
  
  植物分子・生理科学
- 研究機関
  北海道大学

すべて 2022 2021 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Genome-wide identification of Arabidopsis non-AUG-initiated upstream ORFs with evolutionarily conserved regulatory sequences that control protein expression levels2022
- 著者名/発表者名
  Hiragori Yuta、Takahashi Hiro、Karino Taihei、Kaido Atsushi、Hayashi Noriya、Sasaki Shun、Nakao Kodai、Motomura Taichiro、Yamashita Yui、Naito Satoshi、Onouchi Hitoshi
- 雑誌名
  
  Plant Molecular Biology
  
  巻: 111 号: 1-2 ページ: 37-55
- DOI
  10.1007/s11103-022-01309-1
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-20H05926, KAKENHI-PROJECT-19H02917, KAKENHI-PROJECT-22KJ0031, KAKENHI-PROJECT-19K22299, KAKENHI-PROJECT-21K15114
[雑誌論文] Translational Landscape of a C4 Plant, <i>Sorghum bicolor</i>, Under Normal and Sulfur-Deficient Conditions2022
- 著者名/発表者名
  Sotta Naoyuki、Chiba Yukako、Aoyama Haruka、Takamatsu Seidai、Suzuki Takamasa、Miwa Kyoko、Yamashita Yui、Naito Satoshi、Fujiwara Toru
- 雑誌名
  
  Plant and Cell Physiology
  
  巻: －号: 5 ページ: 592-604
- DOI
  10.1093/pcp/pcac023
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15114, KAKENHI-PLANNED-20H05926
[雑誌論文] Reverse genetics-based biochemical studies of the ribosomal exit tunnel constriction region in eukaryotic ribosome stalling: spatial allocation of the regulatory nascent peptide at the constriction.2020
- 著者名/発表者名
  Seidai Takamatsu, Yubun Ohashi, Noriyuki Onoue, Yoko Tajima, Tomoya Imamichi, Shinya Yonezawa, Kyoko Morimoto, Hitoshi Onouchi, Yui Yamashita, Satoshi Naito
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res.
  
  巻: 48 号: 4 ページ: 1985-1999
- DOI
  10.1093/nar/gkz1190
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159, KAKENHI-PROJECT-19H02917, KAKENHI-PROJECT-17J00982, KAKENHI-PROJECT-18H03330
[学会発表] Mechanistic specificity of ribosome stalling involved in ER-stress response in plants2022
- 著者名/発表者名
  Tomoya Imamichi, Nao Kusumoto, Seidai Takamatsu, Yugo Honda, Shiori Muraoka, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito, Yui Yamashita
- 学会等名
  第63回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15114
[学会発表] Sucrose-induced post-transcriptional control of S1 bZIP family genes in Arabidopsis thaliana2022
- 著者名/発表者名
  Yugo Honda, Shugo Sugawara, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito, Yui Yamashita
- 学会等名
  第63回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15114
[学会発表] シロイヌナズナにおけるショ糖濃度に応答した翻訳停滞とmRNA分解2021
- 著者名/発表者名
  Shugo Sugawara, Tomoya Imamichi, Yugo Honda, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito and Yui Yamashita
- 学会等名
  第62回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159
[学会発表] シロイヌナズナにおけるショ糖濃度に応答した翻訳停滞とmRNA分解の解析2020
- 著者名/発表者名
  Shugo Sugawara, Tomoya Imamichi, Yugo Honda, Hitoshi Onouchi, Satoshi Naito and Yui Yamashita
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159
[学会発表] シロイヌナズナS1グループbZIP遺伝子のショ糖に応答した転写後発現制御2020
- 著者名/発表者名
  菅原収吾，尾之内均，内藤哲，山下由衣
- 学会等名
  第61回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159
[学会発表] Nascent peptide-mediated ribosome stalling in eukaryotes: What we see from pulse-chase experiments2020
- 著者名/発表者名
  Tomoya Imamichi, Shugo Sugawara, Seidai Takamatsu, Hitoshi Onouchi, Yui, Yamashita and Satoshi Naito
- 学会等名
  第61回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159
[学会発表] In vivo status of S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest on Arabidopsis CGS1 mRNA2019
- 著者名/発表者名
  Miku Fujita, Seidai Takamatsu, Tomoya Imamichi, Yukako Chiba, Satoshi Naito and Yui Yamashita
- 学会等名
  EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159
[学会発表] Reverse genetics-based biochemical strudies of the ribosomal exit tunnel constriction region on eukaryotic programed ribosome stalling systems2019
- 著者名/発表者名
  Seidai Takamatsu, Yubun Ohashi, Noriyuki Onoue, Yoko Tajima, Tomoya Imamichi, Kyoko Morimoto, Shinya Yonezawa, Hitoshi Onouchi, Yui Yamashita, and Satoshi Naito
- 学会等名
  EMBO Conference: Protein Synthesis and Translational Control
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16159
[学会発表] Conserved sucrose sensing through nascent peptide-meditated ribosome stalling in Arabidopsis S1 bZIP family uORFs2018
- 著者名/発表者名
  Yui Yamashita, Seidai Takamatsu, Shugo Sugawara, Michael Glasbrenner, Thomas Becker, Satoshi Naito and Roland Beckmann
- 学会等名
  Proteins: From the Cradle to the Grave
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H06485
[学会発表] Sucrose-induced ribosome stalling of Arabidopsis bZIP11 uORF2017
- 著者名/発表者名
  Yui Yamashita, Seidai Takamatsu, Michael Glasbrenner, Thomas Becker, Satoshi Naito and Roland Beckmann
- 学会等名
  EMBO Conference on Protein Synthesis and Translational Control
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H06485
[学会発表] Sucrose sensing through nascent peptide-meditated ribosome stalling in Arabidopsis bZIP11 uORF22017
- 著者名/発表者名
  Yui Yamashita, Seidai Takamatsu, Michael Glasbrenner, Thomas Becker, Satoshi Naito and Roland Beckmann
- 学会等名
  第59回日本植物生理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H06485

1. 平井優美

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 内藤哲

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

山下 由衣 Yamashita Yui

研究課題

研究成果

共同研究者

複数の上流ORFが奏でる臨機応変なショ糖感知機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

植物におけるリボソームによるショ糖感知とC/N比の代謝統御機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

転写因子の翻訳制御によるショ糖センシングの分子機構研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Genome-wide identification of Arabidopsis non-AUG-initiated upstream ORFs with evolutionarily conserved regulatory sequences that control protein expression levels2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Translational Landscape of a C4 Plant, <i>Sorghum bicolor</i>, Under Normal and Sulfur-Deficient Conditions2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Reverse genetics-based biochemical studies of the ribosomal exit tunnel constriction region in eukaryotic ribosome stalling: spatial allocation of the regulatory nascent peptide at the constriction.2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Mechanistic specificity of ribosome stalling involved in ER-stress response in plants2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Sucrose-induced post-transcriptional control of S1 bZIP family genes in Arabidopsis thaliana2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] シロイヌナズナにおけるショ糖濃度に応答した翻訳停滞とmRNA分解2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] シロイヌナズナにおけるショ糖濃度に応答した翻訳停滞とmRNA分解の解析2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] シロイヌナズナS1グループbZIP遺伝子のショ糖に応答した転写後発現制御2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Nascent peptide-mediated ribosome stalling in eukaryotes: What we see from pulse-chase experiments2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] In vivo status of S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest on Arabidopsis CGS1 mRNA2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Reverse genetics-based biochemical strudies of the ribosomal exit tunnel constriction region on eukaryotic programed ribosome stalling systems2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Conserved sucrose sensing through nascent peptide-meditated ribosome stalling in Arabidopsis S1 bZIP family uORFs2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Sucrose-induced ribosome stalling of Arabidopsis bZIP11 uORF2017

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Sucrose sensing through nascent peptide-meditated ribosome stalling in Arabidopsis bZIP11 uORF22017

著者名/発表者名

学会等名

山下由衣 Yamashita Yui