GHOSH SAPTARSHI ゴシュサプタルシ

研究者番号	40840781
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度: 甲南大学, 先端生命工学研究所, 特任研究助教 2018年度 – 2022年度: 甲南大学, 先端生命工学研究所, 博士研究員
審査区分/研究分野	研究代表者以外中区分37:生体分子化学およびその関連分野
キーワード	研究代表者以外構造解析 / 遺伝子発現 / 熱力学的解析 / 非二重らせん構造 / 核酸 / 非標準構造 / 植物 / NMR / 結晶構造解析 / 熱力学 / 非標準核酸構造

細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御
- 研究代表者
  
  杉本直己
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2023
- 研究種目
  
  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
- 審査区分
  
  中区分37:生体分子化学およびその関連分野
- 研究機関
  甲南大学

すべて 2023 2022 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Nearest-neighbor parameters for the prediction of RNA duplex stability in diverse in vitro and cellular-like crowding conditions2022
- 著者名/発表者名
  S. Ghosh, S. Takahashi, D. Banerjee, T. Ohyama, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res.,
  
  巻: 51 号: 9 ページ: 4101-4111
- DOI
  10.1093/nar/gkad020
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02864, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-ORGANIZER-21H05107, KAKENHI-PLANNED-21H05108, KAKENHI-PLANNED-21H05109, KAKENHI-PROJECT-22H04975
[雑誌論文] Dielectricity of a molecularly crowded solution accelerates NTP misincorporation during RNA-dependent RNA polymerization by T7 RNA polymerase2022
- 著者名/発表者名
  S. Takahashi, S. Matsumoto, P. Chilka, S. Ghosh, H. Okura, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Sci. Rep.
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 1149-1149
- DOI
  10.1038/s41598-022-05136-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21258, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-19F19337, KAKENHI-PROJECT-21K05283, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-PROJECT-21K14742
[雑誌論文] Preferential targeting cancer-related i-motif DNAs by the plant flavonol fisetin for theranostics applications2020
- 著者名/発表者名
  Takahashi Shuntaro、Bhattacharjee Snehasish、Ghosh Saptarshi、Sugimoto Naoki、Bhowmik Sudipta
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 2504-2504
- DOI
  10.1038/s41598-020-59343-2
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K01968, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-19F19337, KAKENHI-PROJECT-18K19152
[雑誌論文] Improved nearest-neighbor parameters for the stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition2020
- 著者名/発表者名
  D. Banerjee, H. Tateishi-Karimata, T. Ohyama, S. Ghosh, T. Endoh, S. Takahashi, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res.
  
  巻: 48 号: 21 ページ: 12042-12054
- DOI
  10.1093/nar/gkaa572
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05723, KAKENHI-PROJECT-20K21258, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-20H02864, KAKENHI-PROJECT-19F19337, KAKENHI-PROJECT-17K01968
[雑誌論文] Nearest-neighbor parameters for predicting DNA duplex stability in diverse molecular crowding conditions2020
- 著者名/発表者名
  S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Tateishi-Karimata, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  Proc. Natl. Acad. Sci. USA.
  
  巻: 117 号: 25 ページ: 14194-14201
- DOI
  10.1073/pnas.1920886117
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05723, KAKENHI-PROJECT-20K21258, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-20H02864, KAKENHI-PROJECT-19F19337, KAKENHI-PROJECT-17K01968
[雑誌論文] Molecular crowding induces primer extension by RNA polymerase through base stacking beyond Watson-Crick rules2020
- 著者名/発表者名
  S. Takahashi, H. Okura, P. Chilika, S. Ghosh, and N. Sugimoto
- 雑誌名
  
  RSC Adv.
  
  巻: 10 号: 55 ページ: 33052-33058
- DOI
  10.1039/d0ra06502a
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21258, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-19F19337, KAKENHI-PROJECT-17K01968
[雑誌論文] Validation of the nearest-neighbor model for Watson?Crick self-complementary DNA duplexes in molecular crowding condition2019
- 著者名/発表者名
  Ghosh Saptarshi、Takahashi Shuntaro、Endoh Tamaki、Tateishi-Karimata Hisae、Hazra Soumitra、Sugimoto Naoki
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 47 号: 7 ページ: 0-0
- DOI
  10.1093/nar/gkz071
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06351, KAKENHI-PROJECT-19K05723, KAKENHI-PROJECT-18KK0164, KAKENHI-PROJECT-19H00928, KAKENHI-PROJECT-17K05941, KAKENHI-PROJECT-18K19152
[学会発表] Twisting of i-motif DNA induced by diverse molecular crowdings2023
- 著者名/発表者名
  S. Takahashi, S. Ghosh, M. Trajkovski, P. Chilka, T. Ohyama, J. Plavec, N. Sugimoto
- 学会等名
  第50回国際核酸化学シンポジウム (ISNAC2023)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KK0164
[学会発表] Physical Chemistry of Nucleic Acids: “To B or not to B”2023
- 著者名/発表者名
  S. Takahashi, S. Ghosh, H. Tateishi-Karimata, D. Banerjee, T. Endoh, T. Ohyama, N. Sugimoto
- 学会等名
  Advances in Noncanonical Nucleic Acids “ANNA2023”
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KK0164
[学会発表] Development of the prediction method for stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition2020
- 著者名/発表者名
  BANERJEE Dipanwita, 建石寿枝, 大山達也, GHOSH Saptarshi, 遠藤玉樹, 高橋俊太郎, 杉本直己
- 学会等名
  第14回バイオ関連化学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KK0164
[学会発表] Stability prediction of DNA duplexes available under diverse molecular crowding conditions2020
- 著者名/発表者名
  GHOSH Saptarshi, 高橋俊太郎, 大山達也, 遠藤玉樹, 建石寿枝, 杉本直己
- 学会等名
  第14回バイオ関連化学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KK0164
[学会発表] Prediction method for DNA duplex stability in molecular crowding conditions2019
- 著者名/発表者名
  S. Ghosh, S. Takahashi, T. Ohyama, T. Endoh, H. Kateishi-Karimata, N. Sugimoto
- 学会等名
  第46回国際核酸化学シンポジウム
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KK0164

1. 杉本直己 (60206430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
2. TENG Ye (00830621)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 建石寿枝 (20593495)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
4. 高橋俊太郎 (40456257)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
5. 遠藤玉樹 (90550236)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
6. 松本咲 (50850822)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

GHOSH SAPTARSHI ゴシュ サプタルシ

研究課題

研究成果

共同研究者

細胞内環境で変化する非二重らせん構造の定量的機能解析と遺伝子発現制御

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Nearest-neighbor parameters for the prediction of RNA duplex stability in diverse in vitro and cellular-like crowding conditions2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Dielectricity of a molecularly crowded solution accelerates NTP misincorporation during RNA-dependent RNA polymerization by T7 RNA polymerase2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Preferential targeting cancer-related i-motif DNAs by the plant flavonol fisetin for theranostics applications2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Improved nearest-neighbor parameters for the stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Nearest-neighbor parameters for predicting DNA duplex stability in diverse molecular crowding conditions2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Molecular crowding induces primer extension by RNA polymerase through base stacking beyond Watson-Crick rules2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Validation of the nearest-neighbor model for Watson?Crick self-complementary DNA duplexes in molecular crowding condition2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Twisting of i-motif DNA induced by diverse molecular crowdings2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Physical Chemistry of Nucleic Acids: “To B or not to B”2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of the prediction method for stability of RNA/DNA hybrids under a physiological condition2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Stability prediction of DNA duplexes available under diverse molecular crowding conditions2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Prediction method for DNA duplex stability in molecular crowding conditions2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

GHOSH SAPTARSHI ゴシュサプタルシ