川島秀一 Kawashima Shuichi

研究者番号	50314274
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2023年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授 2017年度 – 2018年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任助教 2016年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイエンス統合データベースセンター), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任助教 2015年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイ, ライフサイエンス統合データベースセンター, 助教 2014年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(新領域融合研究センター及びライフサイ, 大学共同利用機関等の部局等, 助教 … もっと見る 2011年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教 2004年度: 東京大学, 医科学研究所, 助手 2003年度: 京都大学, 化学研究所, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者以外小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生物系 / 生命・健康・医療情報学 / 応用ゲノム科学
キーワード	研究代表者以外システム生物 / 生命情報 / 疾患アトラクター / 深層学習 / 機械学習 / アルツハイマー病 / 遺伝子・環境相互作用 / 多因子疾患の発症機序 / 情報統合 / データベース … もっと見る / セマンティック・ウェブ / データ統合 / オントロジー / コホート / ゲノムグラフ / 日本人ゲノム / Pathway analysis / Comparative genome analysis / Microarray analysis / Systems biology / Bioinformatics / Genome database / 機能予測 / オーソログ解析 / マイクロアレイ / パスウェイ解析 / 比較ゲノム解析 / マイクロアレイ解析 / システム生物学 / バイオインフォマティクス / ゲノムデータベース / バクテリア / NER / ゲノム / 微生物 / 文献全文 / オープンアクセス / 論文全文 / マニュアルアノテーション / セマンティックウェブ / 微生物ゲノム / テキストマイニング / 完全長cDNA / ワクチン / ダニアレルギー隠す

多因子疾患の環境曝露の発症機序への影響の深層学習によるシステム的解明
- 研究代表者
  
  荻島創一
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東北大学
日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発
- 研究代表者
  
  片山俊明
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等)
文献全文からの網羅的な生物メタ情報抽出技術の開発
- 研究代表者
  
  山本泰智
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等)
完全長cDNAライブラリを利用したダニアレルギーワクチンの開発
- 研究代表者
  
  二瓶秋子 (渋井秋子)
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2011
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
微生物ゲノムと細胞機能の統合データベースの開発
- 研究代表者
  
  金久實
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  京都大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] 医薬品関連文書の利活用に向けたインタビューフォームの構造化の提案2023
- 著者名/発表者名
  長尾知生子、鎌田真由美、中津井雅彦、深川明子、片山俊明、川島秀一、水口賢司、安倍理加
- 雑誌名
  
  医薬品情報学
  
  巻: 24 号: 4 ページ: 187-195
- DOI
  10.11256/jjdi.24.187
- ISSN
  1345-1464, 1883-423X
- 年月日
  2023-02-28
- 言語
  日本語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H03537
[雑誌論文] TogoID: an exploratory ID converter to bridge biological datasets2022
- 著者名/発表者名
  Ikeda Shuya、Ono Hiromasa、Ohta Tazro、Chiba Hirokazu、Naito Yuki、Moriya Yuki、Kawashima Shuichi、Yamamoto Yasunori、Okamoto Shinobu、Goto Susumu、Katayama Toshiaki
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 38 号: 17 ページ: 4194-4199
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btac491
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H03537
[雑誌論文] TogoVar: A comprehensive Japanese genetic variation database2022
- 著者名/発表者名
  Mitsuhashi Nobutaka、Toyo-oka Licht、Katayama Toshiaki、Kawashima Minae、Kawashima Shuichi、Miyazaki Kazunori、Takagi Toshihisa
- 雑誌名
  
  Human Genome Variation
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 44-44
- DOI
  10.1038/s41439-022-00222-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H03537
[雑誌論文] The Lethal(2)-Essential-for-Life [L(2)EFL] Gene Family Modulates Dengue Virus Infection in Aedes aegypti2020
- 著者名/発表者名
  Runtuwene Lucky R., Kawashima Shuichi et al.
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 21 号: 20 ページ: 7520-7520
- DOI
  10.3390/ijms21207520
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545, KAKENHI-PROJECT-20K21298, KAKENHI-PROJECT-17H04649
[雑誌論文] TogoGenome/TogoStanza: modularized Semantic Web genome database2019
- 著者名/発表者名
  Katayama Toshiaki、Kawashima Shuichi、Okamoto Shinobu、Moriya Yuki、Chiba Hirokazu、Naito Yuki、Fujisawa Takatomo、Mori Hiroshi、Takagi Toshihisa
- 雑誌名
  
  Database
  
  巻: 2019 ページ: 1-11
- DOI
  10.1093/database/bay132
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[雑誌論文] BioHackathon series in 2013 and 2014: improvements of semantic interoperability in life science data and services2019
- 著者名/発表者名
  Toshiaki, Katayama, et. al.
- 雑誌名
  
  F1000Research
  
  巻: 8 ページ: 1-25
- DOI
  10.12688/f1000research.18238.1
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11522, KAKENHI-PROJECT-18K11545
[雑誌論文] NBDC RDF portal: a comprehensive repository for semantic data in life sciences2018
- 著者名/発表者名
  Kawashima Shuichi、Katayama Toshiaki、Hatanaka Hideki、Kushida Tatsuya、Takagi Toshihisa
- 雑誌名
  
  Database
  
  巻: 2018 ページ: 1-11
- DOI
  10.1093/database/bay123
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] セマンティックウェブ技術による医薬品関連情報の統合利用2021
- 著者名/発表者名
  川島秀一
- 学会等名
  第18回 DIA 日本年会2021
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] TogoVar: providing integrated genomic information of Japanese population2021
- 著者名/発表者名
  L. Toyo-oka, N. Mitsuhashi, M. Kawashima, T. Katayama, S. Kawashima, T. Takagi
- 学会等名
  Annual meeting of American Society of Human Genetics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス2021
- 著者名/発表者名
  池田秀也、千葉啓和、藤原豊史、原薗陛正、井手隆広、片山俊明、川島秀一、箕輪真理、三橋信孝、守屋勇樹、内藤雄樹、仲里猛留、信定知江、大田達郎、小野浩雅、申在紋、鈴木拓真、高月照江、建石由佳、豊岡理人、山本泰智、八塚茂
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] TogoVarによるバリアント頻度情報統合とNBDCヒトデータベースによるデータ共有推進2021
- 著者名/発表者名
  豊岡理人、三橋信孝、川嶋実苗、片山俊明、川島秀一、秦千比呂、福田亜沙美、児玉悠一、藤澤貴智、高木利久
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第66回大会・第28回日本遺伝子診療学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] NANDO and NanbyoData: a disease ontology for Japanese rare and intractable diseases (Nanbyo) and a portal website for providing centralized access to the latest and diverse knowledge of Nanbyo2021
- 著者名/発表者名
  Ninomiya K, Kikuchi A, Takatsuki T, Kushida T, Yamamoto Y, Katayama T, Kawashima S, Soichi O, Fujiwara T
- 学会等名
  GA4GH 9th Plenary Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] Development of semantic APIs for biomedical databases standardized in Med2RDF2019
- 著者名/発表者名
  Katayama T, Kamada M, Kawashima S, Nakatsui M, Kojima R, Okuno Y
- 学会等名
  The American Society of Human Genetics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] TogoVar: integrated database among Japanese genomic variation databases2019
- 著者名/発表者名
  Licht Toyo-oka, Nobutaka Mitsuhashi, Minae Kawashima, Toyofumi Fujiwara, Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Yuka Tateisi, and Toshihisa Takagi
- 学会等名
  The American Society of Human Genetics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] データ共有を推進のためのNBDCヒトデータベースおよび日本人集団におけるアリル頻度情報統合データベース: TogoVar2019
- 著者名/発表者名
  豊岡理人、三橋信孝、川嶋実苗、建石由佳、藤原豊史、片山俊明、川島秀一、福田亜沙美、児玉悠一、高木利久
- 学会等名
  日本人類遺伝学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] Integrated Growth Media Database by Standardizing Ingredient Information.2019
- 著者名/発表者名
  Shuichi Kawashima, Toshiaki Katayama, Yuki Moriya, Shinobu Okamoto, Yasunori Yamamoto and Susumu Goto
- 学会等名
  12th International Semantic Web Applications and Tools for Health Care and Life Science Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] Med2RDF: Semantic Biomedical Knowledge-base and APIs for the Clinical Genome Medicine.2019
- 著者名/発表者名
  Mayumi Kamada, Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Ryosuke Kojima, Masahiko Nakatsui and Yasushi Okuno
- 学会等名
  12th International Semantic Web Applications and Tools for Health Care and Life Science Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] Towards Making Knowledge in Literature LOD2018
- 著者名/発表者名
  Yasunori Yamamoto, Shinobu Okamoto, Shuichi Kawashima, Toshiaki Katayama
- 学会等名
  Biocuration 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26330343

1. 片山俊明 (60396869)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 14件
2. 荻島創一 (40447496)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
3. 二瓶秋子 (50313846)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 菅野純夫 (60162848)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 中江進 (60450409)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 野上貞雄 (90172767)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 山本泰智 (50470076)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
8. 金久實 (70183275)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 岡本忍 (90623893)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
10. 藤原豊史 (80815176)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
11. 宮下哲典 (60323995)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 鎌田真由美 (70749077)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 小島諒介 (70807651)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 水野聖士 (80646795)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

川島 秀一 Kawashima Shuichi

研究課題

研究成果

共同研究者

多因子疾患の環境曝露の発症機序への影響の深層学習によるシステム的解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

文献全文からの網羅的な生物メタ情報抽出技術の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

完全長cDNAライブラリを利用したダニアレルギーワクチンの開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

微生物ゲノムと細胞機能の統合データベースの開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] 医薬品関連文書の利活用に向けたインタビューフォームの構造化の提案2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] TogoID: an exploratory ID converter to bridge biological datasets2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] TogoVar: A comprehensive Japanese genetic variation database2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The Lethal(2)-Essential-for-Life [L(2)EFL] Gene Family Modulates Dengue Virus Infection in Aedes aegypti2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] TogoGenome/TogoStanza: modularized Semantic Web genome database2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] BioHackathon series in 2013 and 2014: improvements of semantic interoperability in life science data and services2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] NBDC RDF portal: a comprehensive repository for semantic data in life sciences2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] セマンティックウェブ技術による医薬品関連情報の統合利用2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] TogoVar: providing integrated genomic information of Japanese population2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

川島秀一 Kawashima Shuichi