関根俊一 Sekine Shunichi

研究者番号	50321774
その他のID	https://orcid.org/0000-0001-8174-8704
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームディレクター 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 上級研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2024年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー 2015年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, チームリーダー 2013年度 – 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, チームリーダー 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, システム研究チーム, 上級研究員 2011年度: 東京大学, 大学院・理学系研究科, 講師 … もっと見る 2010年度 – 2011年度: 東京大学, 大学院・理学系研究科, 特任准教授 2008年度 – 2009年度: 東京大学, 大学院・理学系研究科, 講師 2006年度: 東京大学, 大学院理学系研究科, 講師 2005年度: 東京大学, 大学院・理学系研究科, 講師 2003年度: 独立行政法人理化学研究所, 細胞情報伝達研究室, 研究員 2002年度: 理化学研究所, 細胞情報伝達研究室, 研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者構造生物化学 / 大区分G / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 生物物理学 / 構造生物化学研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 構造生物化学
キーワード	研究代表者 RNAポリメラーゼ / 転写因子 / クライオ電子顕微鏡 / ヌクレオソーム / 転写 / X線結晶構造解析 / リボソーム / クライオ電顕 / 構造機能相関 / 酵素 … もっと見る / バクテリオファージ / Ｘ線結晶構造解析 / Rho / 転写終結 / tRNA / クロマチン / ncRNA / 転写終結因子 / ヒストンシャペロン / 転写伸長因子 / 電子顕微鏡 / 構造解析 / Pol II / 転写伸長 / X線結晶構造解 / クロスリンク / 校正 / 翻訳伸長因子 / オパール / セレノリン酸 / 翻訳延長因子 / サプレッサー / 翻訳 / セレン / セレノシステイン / 立体構造 / X-ray crystallography / crystallization / aminoacyl-tRNA synthetase / aminoacylation … もっと見る研究代表者以外不均一光環境 / 環境応答 / 植物 / 転写開始点制御 / X線結晶構造解析 / 翻訳開始因子 / リボソーム / 翻訳 / 転写因子 / RNAポリメラーゼ / 転写隠す

クロマチンを背景とした転写の構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2028
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 審査区分
  
  大区分G
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
植物の不均一環境変動へのレジリエンスを支える転写開始点制御機構
- 研究代表者
  
  松下智直
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  京都大学
転写と中核的な生命機能を結びつける高次複合体の構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 審査区分
  
  大区分G
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
RNAポリメラーゼを中心に形成される中核的複合体の構造基盤研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2020
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
転写因子によるRNAポリメラーゼの構造変化と転写制御のメカニズム研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
転写においてＲＮＡポリメラーゼが形成する過渡的な複合体の構造機能解析研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
   東京大学
転写・翻訳を担う超分子複合体RNAポリメラーゼおよびリボソームの結晶構造解析
- 研究代表者
  
  横山茂之
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
   東京大学
   東京学芸大学
セレノシステイン生合成システムの構造生物学研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  東京大学
転写終結複合体のX線結晶構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2006
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  東京大学
ヒト由来グルタミルプロリルtRNA合成酵素のX線結晶構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  関根俊一
- 研究期間 (年度)
  2002 – 2003
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所

[図書] RNA Polymerases as Molecular Motors: On the Road2021
- 著者名/発表者名
  Sekine, S., Uejima, T., Ehara, H. (ed. Robert Landick, Terence Strick, Jue Wang)
- 総ページ数
  252
- 出版者
  Royal Society of Chemistry
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[雑誌論文] Structural perspectives on transcription in chromatin2024
- 著者名/発表者名
  Sekine Shun-ichi、Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Trends in Cell Biology
  
  巻: 34 号: 3 ページ: 211-224
- DOI
  10.1016/j.tcb.2023.07.011
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-23H05475
[雑誌論文] Structural basis of the transcription termination factor Rho engagement with transcribing RNA polymerase from <i>Thermus thermophilus</i>2023
- 著者名/発表者名
  Murayama Yuko、Ehara Haruhiko、Aoki Mari、Goto Mie、Yokoyama Takeshi、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Science Advances
  
  巻: 9 号: 6
- DOI
  10.1126/sciadv.ade7093
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-17K15082
[雑誌論文] Cryo-EM structures of RNA polymerase II-nucleosome complexes rewrapping transcribed DNA2023
- 著者名/発表者名
  Akatsu Munetaka、Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Fujita Risa、Ito Tomoko、Osumi Ken、Ogasawara Mitsuo、Takizawa Yoshimasa、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 299 号: 12 ページ: 105477-105477
- DOI
  10.1016/j.jbc.2023.105477
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15033, KAKENHI-PROJECT-22K06098, KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-23H05475, KAKENHI-PROJECT-23K20300
[雑誌論文] Structural Transition of the Nucleosome during Transcription Elongation2023
- 著者名/発表者名
  Kujirai Tomoya、Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Cells
  
  巻: 12 号: 10 ページ: 1388-1388
- DOI
  10.3390/cells12101388
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15033, KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-23H05475
[雑誌論文] Contributions of histone tail clipping and acetylation in nucleosome transcription by RNA polymerase II2023
- 著者名/発表者名
  Oishi Takumi、Hatazawa Suguru、Kujirai Tomoya、Kato Junko、Kobayashi Yuki、Ogasawara Mitsuo、Akatsu Munetaka、Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi、Hayashi Gosuke、Takizawa Yoshimasa、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 51 号: 19 ページ: 10364-10374
- DOI
  10.1093/nar/gkad754
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06098, KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-23H05475, KAKENHI-PROJECT-23K20300
[雑誌論文] Cryo-EM and biochemical analyses of the nucleosome containing the human histone H3 variant H3.82023
- 著者名/発表者名
  Hirai Seiya、Kujirai Tomoya、Akatsu Munetaka、Ogasawara Mitsuo、Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi、Ohkawa Yasuyuki、Takizawa Yoshimasa、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  The Journal of Biochemistry
  
  巻: 174 号: 6 ページ: 549-559
- DOI
  10.1093/jb/mvad069
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15033, KAKENHI-PROJECT-22K06098, KAKENHI-PROJECT-22K19275, KAKENHI-PROJECT-22KJ0858, KAKENHI-PUBLICLY-22H04676, KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-23H05475, KAKENHI-PROJECT-23H00372, KAKENHI-PROJECT-23K20300
[雑誌論文] Structural Basis of Damaged Nucleotide Recognition by Transcribing RNA Polymerase II in the Nucleosome2023
- 著者名/発表者名
  Osumi Ken、Kujirai Tomoya、Ehara Haruhiko、Ogasawara Mitsuo、Kinoshita Chiaki、Saotome Mika、Kagawa Wataru、Sekine Shun-ichi、Takizawa Yoshimasa、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Biology
  
  巻: 435 号: 13 ページ: 168130-168130
- DOI
  10.1016/j.jmb.2023.168130
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15033, KAKENHI-PROJECT-22K06098, KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-23H05475, KAKENHI-PROJECT-23K20300, KAKENHI-PROJECT-23K24997
[雑誌論文] Structures of dengue virus RNA replicase complexes2023
- 著者名/発表者名
  Osawa Takuo、Aoki Mari、Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Molecular Cell
  
  巻: 83 号: 15 ページ: 2781-2791.e4
- DOI
  10.1016/j.molcel.2023.06.023
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05662, KAKENHI-PROJECT-20H05690
[雑誌論文] ERK2-topoisomerase II regulatory axis is important for gene activation in immediate early genes2023
- 著者名/発表者名
  Bunch Heeyoun、Kim Deukyeong、Naganuma Masahiro、Nakagawa Reiko、Cong Anh、Jeong Jaehyeon、Ehara Haruhiko、Vu Hongha、Chang Jeong Ho、Schellenberg Matthew J.、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 14 号: 1
- DOI
  10.1038/s41467-023-44089-y
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[雑誌論文] Structural basis of nucleosome disassembly and reassembly by RNAPII elongation complex with FACT2022
- 著者名/発表者名
  Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Shirouzu Mikako、Kurumizaka Hitoshi、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 377 号: 6611
- DOI
  10.1126/science.abp9466
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-20H00449, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PROJECT-23K20300
[雑誌論文] Structural basis of RNA polymerase II transcription on the chromatosome containing linker histone H12022
- 著者名/発表者名
  Hirano Rina、Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Uejima Tamami、Takizawa Yoshimasa、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 7287-7287
- DOI
  10.1038/s41467-022-35003-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K06098, KAKENHI-PROJECT-20H05690, KAKENHI-PROJECT-20H00449, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PROJECT-23K20300
[雑誌論文] Overview of the “1SBA: Integrative approaches towards understanding of gene expression” session at the 57th BSJ meeting2020
- 著者名/発表者名
  Takaharu Mori and Shun-ichi Sekine
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: - 号: 2 ページ: 253-254
- DOI
  10.1007/s12551-020-00644-1
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K06532, KAKENHI-PROJECT-15H04344
[雑誌論文] Structural insight into nucleosome transcription by RNA polymerase II with elongation factors2019
- 著者名/発表者名
  Ehara Haruhiko、Kujirai Tomoya、Fujino Yuka、Shirouzu Mikako、Kurumizaka Hitoshi、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 363 号: 6428 ページ: 744-747
- DOI
  10.1126/science.aav8912
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14643, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PROJECT-15H04344, KAKENHI-PROJECT-19K21177
[雑誌論文] Architecture of the RNA polymerase II elongation complex: new insights into Spt4/5 and Elf12018
- 著者名/発表者名
  Ehara Haruhiko、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Transcription
  
  巻: 9 号: 5 ページ: 286-291
- DOI
  10.1080/21541264.2018.1454817
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[雑誌論文] Structural basis of the nucleosome transition during RNA polymerase II passage2018
- 著者名/発表者名
  Kujirai Tomoya、Ehara Haruhiko、Fujino Yuka、Shirouzu Mikako、Sekine Shun-ichi、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 362 号: 6414 ページ: 595-598
- DOI
  10.1126/science.aau9904
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14643, KAKENHI-PLANNED-18H05534, KAKENHI-PROJECT-15H04344, KAKENHI-PROJECT-19K21177
[雑誌論文] Crystal structure of RNA polymerase II from Komagataella pastoris2017
- 著者名/発表者名
  Ehara Haruhiko、Umehara Takashi、Sekine Shun-ichi、Yokoyama Shigeyuki
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 487 号: 2 ページ: 230-235
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2017.04.039
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344, KAKENHI-PROJECT-16H05089
[雑誌論文] A Thermus phage protein inhibits host RNA polymerase by preventing template DNA strand loading during open promoter complex formation2017
- 著者名/発表者名
  Ooi Wei-Yang、Murayama Yuko、Mekler Vladimir、Minakhin Leonid、Severinov Konstantin、Yokoyama Shigeyuki、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 46 号: 1 ページ: 431-441
- DOI
  10.1093/nar/gkx1162
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15082, KAKENHI-PROJECT-15H04344
[雑誌論文] Structure of the complete elongation complex of RNA polymerase II with basal factors2017
- 著者名/発表者名
  Ehara Haruhiko、Yokoyama Takeshi、Shigematsu Hideki、Yokoyama Shigeyuki、Shirouzu Mikako、Sekine Shun-ichi
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 357 号: 6354 ページ: 921-924
- DOI
  10.1126/science.aan8552
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05897, KAKENHI-PROJECT-15H04344
[雑誌論文] The ratcheted and ratchetable structural States of RNA polymerase underlie multiple transcriptional functions.2015
- 著者名/発表者名
  Sekine, S., Murayama, Y., Svetlov, V., Nudler, E., Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Mol. Cell
  
  巻: 57 号: 3 ページ: 408-421
- DOI
  10.1016/j.molcel.2014.12.014
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[雑誌論文] Ratcheting of RNA polymerase toward structural principles of RNA polymerase operations.2015
- 著者名/発表者名
  Sekine, S., Murayama, Y., Svetlov, V., Nudler, E. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Transcription
  
  巻: 6 号: 3 ページ: 56-60
- DOI
  10.1080/21541264.2015.1059922
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[雑誌論文] Time-resolved Raman and polyacrylamide gel electrophoresis observations of nucleotide incorporation and misincorporation in RNA within a bacterial RNA polymerase crystal.2015
- 著者名/発表者名
  Antonopoulos, I.H., Murayama, Y., Warner, B.A., Sekine, S., Yokoyama, S., Carey, P.R.
- 雑誌名
  
  Biochemistry
  
  巻: 54 号: 3 ページ: 652-665
- DOI
  10.1021/bi501166r
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[雑誌論文] Molecular basis of RNA polymerase promoter specificity switch revealed through studies of Thermus bacteriophage transcription regulator.2014
- 著者名/発表者名
  Severinov, K,. Minakhin, L., Sekine, S., Lopatina, A., Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Bacteriophage
  
  巻: 4
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[雑誌論文] Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor2014
- 著者名/発表者名
  Tagami, S., Sekine, S., Minakhin, L., Esyunina, D., Akasaka, R., Shirouzu, M., Kulbachinskiy, A., Severinov, K. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Genes & Development
  
  巻: 28 号: 5 ページ: 521-531
- DOI
  10.1101/gad.233916.113
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[雑誌論文] Development of a hexahistidine-3× FLAG-tandem affinity purification method for endogenous protein complexes in Pichia pastoris2014
- 著者名/発表者名
  Toshiaki Higo, Noriyuki Suka, Haruhiko Ehara, Masatoshi Wakamori, Shin Sato, Hideaki Maeda, Shun-ichi Sekine, Takashi Umehara, and Shigeyuki Yokoyama
- 雑誌名
  
  J Struct Funct Genomics
  
  巻: 15 号: 4 ページ: 191-199
- DOI
  10.1007/s10969-014-9190-1
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23114005, KAKENHI-PROJECT-23370048, KAKENHI-PROJECT-24613007
[雑誌論文] Structural basis of transcription by bacterial and eukaryotic RNA polymerases2012
- 著者名/発表者名
  Sekine, S., Tagami, S. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Curr. Opin. Struct. Biol.
  
  巻: 22 ページ: 110-118
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Structural basis of transcription by bacterial and eukaryotic RNA polymerases.2012
- 著者名/発表者名
  Sekine, S., et al.
- 雑誌名
  
  Curr Opin Struct Biol.
  
  巻: 22 号: 1 ページ: 110-118
- DOI
  10.1016/j.sbi.2011.11.006
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048, KAKENHI-PROJECT-23770130
[雑誌論文] 転写因子によるRNAポリメラーゼの制御のメカニズム-細菌の転写を阻害する新たな仕組みの解明2011
- 著者名/発表者名
  関根俊一, et al.
- 雑誌名
  
  化学と生物
  
  巻: 49 ページ: 732-734
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[雑誌論文] Crystal structure of the C17/25 subcomplex from Schizosaccharomyces pombe RNA Polymerase III2011
- 著者名/発表者名
  Ehara, H., Sekine, S. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Protein Sci
  
  巻: 20 ページ: 1558-1565
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] セレンをタンパク質に正確に取り込む:セレノシステインtRNA認識の構造基盤2011
- 著者名/発表者名
  関根俊一, 横山茂之
- 雑誌名
  
  生物物理
  
  巻: 51(6) ページ: 272-273
- NAID
  10030038012
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[雑誌論文] A novel conformation of RNA polymerase sheds light on the mechanism of transcription2011
- 著者名/発表者名
  Tagami, S., Sekine, S. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Transcription
  
  巻: 2 ページ: 162-167
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Thermus thermophilus transcription elongation complex bound to Gfh1.2010
- 著者名/発表者名
  Tagami S, Sekine S, Kumarevel T, Yamamoto M, Yokoyama S.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr.Sect F. 66
  
  ページ: 64-68
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Structural basis for the major role of O-phosphoseryl-tRNA kinase in the UGA-specific encoding of selenocysteine2010
- 著者名/発表者名
  Chiba, S., Itoh, Y., Sekine, S. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Mol. Cell
  
  巻: 39 ページ: 410-420
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystal structure of Methanocaldococcus jannaschii Trm4 complexed with sinefungin2010
- 著者名/発表者名
  Kuratani, M., Hirano, M., Goto-Ito, S., Itoh, Y., Hikida, Y., Nishimoto, M., Sekine, SI., Bessho, Y., Ito, T., Grosjean, H. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol
  
  巻: 401(3) ページ: 323-333
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Structural basis for the major role of O-phosphoseryl-tRNA kinase in the UGA-specific encoding of selenocysteine.2010
- 著者名/発表者名
  Chiba, S., Itoh, Y., Sekine, S., Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Mol.Cell 39
  
  ページ: 410-420
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystal structure of bacterial RNA polymerase bound with a transcription inhibitor protein.2010
- 著者名/発表者名
  Tagami, S., Sekine, S., Kumarevel, T., Hino, N., Murayama, Y., Kamegamori, S., Yamamoto, M., Sakamoto, K., Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Nature 468
  
  ページ: 978-982
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Structural basis for the major role of O-phosphoseryl-tRNA kinase in the UGA-specific encoding of selenocysteine.2010
- 著者名/発表者名
  Chiba, S., Itoh, Y., Sekine, S. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Mol. Cell
  
  巻: 39 ページ: 410-420
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[雑誌論文] Crystal structure of bacterial RNA polymerase bound with a transcription inhibitor protein2010
- 著者名/発表者名
  Tagami, S., Sekine, S., Kumarevel, T., Hino, N., Murayama, Y., Kamegamori, S., Yamamoto, M., Sakamoto, K. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Nature
  
  巻: 468 ページ: 978-982
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Structure of an archaeal homologue of the bacterial Fmu/RsmB/RrmB rRNA cytosine 5-methyltransferase2010
- 著者名/発表者名
  Hikida, Y., Kuratani, M., Bessho, Y., Sekine, SI. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr
  
  巻: 66(12) ページ: 1301-1307
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Thermus thermophilus transcription elongation complex bound to Gfh12010
- 著者名/発表者名
  Tagami, S., Sekine, SI., Kumarevel, T., Yamamoto, M. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun
  
  巻: 66(1) ページ: 64-68
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Structure of selenophosphate synthetase essential for selenium incorporation into proteins and RNAs.2009
- 著者名/発表者名
  Itoh, Y., Sekine, S., Matsumoto, E., Akasaka, R., Takemoto, C., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol
  
  巻: 385 ページ: 1456-1469
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[雑誌論文] Unique protein architecture of alanyl-tRNA synthetase for aminoacylation, editing, and dimerization.2009
- 著者名/発表者名
  Naganuma, M., Sekine, S., Fukunaga, R., Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A. 106
  
  ページ: 8489-8494
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Unique protein architecture of alanyl-tRNA synthetase for aminoacylation, editing, and dimerization2009
- 著者名/発表者名
  Naganuma, M., Sekine, SI., Fukunaga, R. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Proc. Natl. Acad. Sci. USA
  
  巻: 106 ページ: 8489-8494
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystal structure of human selenocysteine tRNA.2009
- 著者名/発表者名
  Itoh Y, Chiba S, Sekine S, Yokoyama S.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research 37
  
  ページ: 6259-6268
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[雑誌論文] Crystal structure of human selenocysteine tRNA.2009
- 著者名/発表者名
  Itoh, Y., Chiba, S., Sekine, S. and Yokoyama S.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res
  
  巻: 37 ページ: 6259-6268
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[雑誌論文] Structure of selenophosphate synthetase essential for selenium incorporation into proteins and RNAs2009
- 著者名/発表者名
  Itoh, Y., Sekine, SI., Matsumoto, E., Akasaka, R., Takemoto, C., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol
  
  巻: 385 ページ: 1456-1469
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystal structure of human selenocysteine tRNA2009
- 著者名/発表者名
  Itoh, Y., Chiba, S., Sekine, SI. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res
  
  巻: 37 ページ: 6259-6268
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[雑誌論文] Crystallographic and mutational studies of seryl-tRNA synthetase from the archaeon Pyrococcus horikoshii.2008
- 著者名/発表者名
  Itoh, Y., Sekine, S., Kuroishi, C., Terada, T., Shirouzu, M., Kuramitsu, S. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  RNA Biol
  
  巻: 5 ページ: 169-177
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[雑誌論文] Structure of an N-terminally truncated selenophosphate synthetase from Aquifex aeolicus.2008
- 著者名/発表者名
  Matsumoto, E., Sekine, S., Akasaka, R., Otta, Y., Katsura, K., Inoue, M., Kaminishi, T., Terada, T., Shirouzu, M. and Yokoyama, S.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr
  
  巻: F64 ページ: 453-458
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] RNAポリメラーゼによる転写伸長と終結のメカニズム2023
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  よこはまNMR研究会　第70回ワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] 転写におけるヌクレオソームの崩壊と再構築の構造解析2023
- 著者名/発表者名
  鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
- 学会等名
  第16回日本エピジェネティクス研究会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] Cryo-EM analysis on the nucleosome disassembly and reassembly during transcription elongation2023
- 著者名/発表者名
  Ehara H, Kujirai Y, Shirouzu M, Kurumizaka H, Sekine S
- 学会等名
  CSHL MECHANISMS OF EUKARYOTIC TRANSCRIPTION
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] デングウイルスのゲノム複製複合体のクライオ電子顕微鏡解析2023
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第70回日本ウイルス学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] クロマチン転写の構造生物学2023
- 著者名/発表者名
  江原晴彦、鯨井智也、白水美香子、胡桃坂仁志、関根俊一
- 学会等名
  第23回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] Structural basis of nucleosome transcription by the RNAPII elongation complex2023
- 著者名/発表者名
  Sekine S, Ehara H, Kujirai Y, Kurumizaka H
- 学会等名
  CSHL MECHANISMS OF EUKARYOTIC TRANSCRIPTION
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] 転写伸長におけるヌクレオソームの崩壊と再構築機構の構造生物学的解析2022
- 著者名/発表者名
  鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
- 学会等名
  第40 回染色体ワークショップ・第21 回核ダイナミクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] Structural basis of nucleosome transcription by the RNAPII elongation complex2022
- 著者名/発表者名
  Sekine Shun-ichi
- 学会等名
  SBDR Webinar
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] 転写におけるヌクレオソーム構造のダイナミクス2022
- 著者名/発表者名
  鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
- 学会等名
  第15回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] 転写におけるヌクレオソーム構造変換のクライオEM構造解析2022
- 著者名/発表者名
  鯨井智也、江原晴彦、白水美香子、関根俊一、胡桃坂仁志
- 学会等名
  生理研研究会「新世代のクライオ電子顕微鏡」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] Structural basis of RNA polymerase II transcription on nucleosomal DNA2021
- 著者名/発表者名
  Shun-ichi Sekine
- 学会等名
  RIKEN BDR symposium 2021
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] クライオ電子顕微鏡による核内での転写の構造基盤2021
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  よこはまNMR研究会　第66回ワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] 理研横浜クライオ電子顕微鏡施設2021
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  日本分子生物学会第44回年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] Structural Basis of Nucleosome Transcription by RNA Polymerase II2020
- 著者名/発表者名
  Shun-ichi Sekine
- 学会等名
  3rd HKUST IAS Focused Program on Mechanisms of Gene Transcription and Its Regulations
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05690
[学会発表] RNA ポリメラーゼ II によるクロマチン転写の構造基盤2019
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  日本植物学会第83回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Structural basis of cellular transcription by RNA polymerase II2019
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会年会合同年次大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Structural basis of chromatin transcription by RNA polymerase II2019
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  Gordon Research Conference Mechanisms of Microbial Transcription
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Structural basis of the RNA polymerase II elongation complex with basal factors2019
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  CSHL Meeting Mechanisms of Eukaryotic Transcription
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Structural basis of nucleosome transcription by RNA polymerase II2019
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  日本生物物理学会第57回年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Architecture of the RNA polymerase II elongation complex with basal elongation factors2018
- 著者名/発表者名
  Shun-ichi Sekine
- 学会等名
  IAS Focused Program on Mechanisms of Gene Transcription and its Regulations
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] RNAポリメラーゼIIによるクロマチン転写のメカニズム2018
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] RNAポリメラーゼIIによるクロマチン転写のメカニズム2018
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  蛋白質研究所セミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Structural basis of host RNA polymerase inhibition by a Thermus phage protein gp762017
- 著者名/発表者名
  Shun-ichi Sekine
- 学会等名
  FASEB SRC “Mechanisms and Regulation of Prokaryotic Transcription"
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] バクテリオファージによる宿主RNAポリメラーゼ調節の構造基盤2016
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] Ratcheting of RNA polymerase for the multiple transcription functions2015
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  FASEB SRC Mechanism and Regulation of Prokaryotic Transcription
- 発表場所
  Saxtons River, USA
- 年月日
  2015-06-24
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04344
[学会発表] SMART: an S-S based method to detect RNA polymerase conformational change2013
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  The 65th Fujihara Seminar International Symposium on Synthetic Biology of Unnatural Base Pairs and Amino Acids
- 発表場所
  苫小牧グランドホテルニュー王子
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[学会発表] Structural basis for promoter switching of RNA polymerase by a phage-encoded protein2013
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  The 7th International Conference on Structural Genomics 2013 - Structural Life Science (ICSG2013-SLS)
- 発表場所
  札幌京王プラザホテル
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[学会発表] R/T conformational switching of RNA polymerase for the multiple transcription functions.2013
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  FASEB Science Research Conference, Mechanism & Regulation of Prokaryotic Transcription
- 発表場所
  Saxtons River, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[学会発表] Structural basis for promoter switching of RNA polymerase by a phage-encoded factor2013
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  FASEB Science Research Conference, Mechanism & Regulation of Prokaryotic Transcription
- 発表場所
  Saxtons River, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[学会発表] 転写の校正反応においてRNAポリメラーゼの構造と活性を切りかえるメカニズム2012
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[学会発表] 転写校正においてRNAポリメラーゼの構造と活性を切りかえるメカニズム2012
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第12回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  名古屋国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048
[学会発表] Crystallographic Studies of Aminoacyl-tRNA Synthesis and tRNA Modification2010
- 著者名/発表者名
  Itoh, Y., Chiba, S., Naganuma, M., Goto-ito, S., Fukunaga, R., Kuratani, M., Bessho, Y., Ito, T., Sekine, SI., Yokoyama, S.
- 学会等名
  23rd tRNA Workshop
- 発表場所
  Aveiro, Portugal
- 年月日
  2010-01-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[学会発表] ヒトのセレノシステインtRNAの結晶構造解析2009
- 著者名/発表者名
  伊藤弓弦、千葉志穂、関根俊一、横山茂之
- 学会等名
  第82回日本生化学会大会
- 発表場所
  神戸
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] セレノシステイン合成酵素の結晶構造解析2009
- 著者名/発表者名
  伊藤弓弦、関根俊一、横山茂之
- 学会等名
  第11回RNAミーティング
- 発表場所
  新潟
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] Structural basis of transcription regulation revealed by the crystal structure of Thermus thermophilus RNA polymerase elongation complex bound with a transcriptional regulator Gfh12009
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[学会発表] Structural basis of transcription regulation revealed by the crystal structure of Thermus thermophilus RNA polymerase elongation complex bound with a transcriptional regulator Gfh1.2009
- 著者名/発表者名
  関根俊一、田上俊輔、Thirumananseri Kumarevel、横山茂之
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[学会発表] セレノシステイン合成酵素の結晶構造解析2009
- 著者名/発表者名
  伊藤弓弦、関根俊一、横山茂之
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] Crystal structure of an RNA polymerase translocation intermediate.2009
- 著者名/発表者名
  田上俊輔、関根俊一、Thirumananseri Kumarevel、横山茂之
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20247008
[学会発表] Implications for selenophosphate generation by crystal structure of selenophosphate synthetase2008
- 著者名/発表者名
  Sekine, S., et al.
- 学会等名
  IUCR 2008
- 発表場所
  Osaka
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] セレノリン酸合成酵素SPSの結晶構造2008
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- 年月日
  2008-12-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] Implications for selenophosphate generation by crystal structure of selenophosphate synthetase2008
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  XXI Congress of the international Union of Crystallography (IUCr2008)
- 発表場所
  大阪国際会議場
- 年月日
  2008-08-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20570148
[学会発表] 新生RNAによるRNAポリメラーゼの構造変化と機能との相関
- 著者名/発表者名
  関根俊一
- 学会等名
  第37回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2014-11-25 – 2014-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370048

1. 鯨井智也 (70823566)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 13件
2. 伊藤拓宏 (70401164)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
3. 藤井佳史 (30392096)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
4. 横山茂之 (00159229)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 18件
5. 松下智直 (20464399)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 多田安臣 (40552740)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 花田耕介 (50462718)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 鈴木孝征 (50535797)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 関真秀 (90749326)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 江原晴彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
11. 森貴治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
12. 村山祐子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
13. 滝沢由政

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
14. 大澤拓生

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
15. 重松秀樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
16. 須賀則之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

関根 俊一 Sekine Shunichi

研究課題

研究成果

共同研究者

クロマチンを背景とした転写の構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

植物の不均一環境変動へのレジリエンスを支える転写開始点制御機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

転写と中核的な生命機能を結びつける高次複合体の構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

RNAポリメラーゼを中心に形成される中核的複合体の構造基盤研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

転写因子によるRNAポリメラーゼの構造変化と転写制御のメカニズム研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写においてＲＮＡポリメラーゼが形成する過渡的な複合体の構造機能解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写・翻訳を担う超分子複合体RNAポリメラーゼおよびリボソームの結晶構造解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

セレノシステイン生合成システムの構造生物学研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写終結複合体のX線結晶構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヒト由来グルタミルプロリルtRNA合成酵素のX線結晶構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] RNA Polymerases as Molecular Motors: On the Road2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Structural perspectives on transcription in chromatin2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural basis of the transcription termination factor Rho engagement with transcribing RNA polymerase from <i>Thermus thermophilus</i>2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Cryo-EM structures of RNA polymerase II-nucleosome complexes rewrapping transcribed DNA2023

関根俊一 Sekine Shunichi