加藤由紀 KATOU Yuki

… 別表記

加藤由起 KATOU Yuki

研究者番号	50391917
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2011年度 – 2016年度: 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教 2011年度: 東京大学, 分子生物学研究所, 助教 2010年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, その他 2009年度: 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者基礎ゲノム科学研究代表者以外実験動物学 / 生物系
キーワード	研究代表者 ChIP-chip解析 / ChIP-seq解析 / アセチル化 / コヒーシン / 細胞周期 / ゲノム機能 / 染色体研究代表者以外 keratin-18 / interleukin-11 / 自己免疫応答 … もっと見る / T細胞 / Interleukin / 非自己 / 免疫細胞 / 再生 / pentraxin / 脊索 / Interleukin 11 / 増殖細胞 / 再生芽 / T細胞活性化 / Phyhd1 / PhyH-like / ゲノム編集 / インターロイキン-11 / 未分化増殖細胞 / 器官再生 / アフリカツメガエル / 減数分裂 / 遺伝情報 / ncDNA / 偽遺伝子 / 非コードDNA / 遺伝 / エピゲノム / クロマチン / 転写 / 組換え / 非コード領域 / ゲノム / DNA 隠す

再生芽「自己抗原」の同定とそのマスキングによる再生能賦活化に関する研究
- 研究代表者
  
  久保健雄
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  実験動物学
- 研究機関
  東京大学
非コードＤＮＡ領域によるゲノムＤＮＡ再編成制御機構
- 研究代表者
  
  太田邦史
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2015
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学
コヒーシンサブユニットSMC3のアセチル化修飾動態の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  加藤由起
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2012
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  基礎ゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
   東京工業大学

すべて 2015 2014 2012 2011 2010 2009 その他

すべて雑誌論文学会発表その他

[雑誌論文] Germline gain-of-function mutations in AFF4 cause a developmental syndrome functionally linking the super elongation complex and cohesin.2015
- 著者名/発表者名
  Izumi K, Nakato R, Zhang Z, Edmondson AC, Noon S, Dulik MC, Rajagopalan R, Venditti CP, Gripp K, Samanich J, Zackai EH, Deardorff MA, Clark D, Allen JL, Dorsett D, Misulovin Z, Komata M, Bando M, Kaur M, Katou Y, Shirahige K*, Krantz ID*.
- 雑誌名
  
  Nature Genetics
  
  巻: 47 号: 4 ページ: 338-338
- DOI
  10.1038/ng.3229
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-22125001, KAKENHI-PROJECT-22221009, KAKENHI-PROJECT-25290065, KAKENHI-PLANNED-23114003, KAKENHI-PUBLICLY-15H01347
[雑誌論文] Unique gene expression profile of the proliferating Xenopus tadpole tail blastema cells deciphered by RNA-sequencing analysis.2015
- 著者名/発表者名
  Hiroshi Tsujioka, Takekazu kunieda, Yuki Katou, Katsuhiko Shirahige, Takeo Kubo
- 雑誌名
  
  PLOS ONE
  
  巻: 10(3) 号: 3 ページ: e0111655-e0111655
- DOI
  10.1371/journal.pone.0111655
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051, KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] The chromosomal association of the Smc5/6 complex depends on cohesion and predicts the level of sister chromatid entanglement.2015
- 著者名/発表者名
  Jeppsson K, Carlborg KK, Nakato R, Berta DG, Lilienthal I, Kanno T, Lindqvist A, Brink MC, Dantuma NP, Katou Y, Shirahige K, Sjögren C.
- 雑誌名
  
  PLoS Genet.
  
  巻: 10 号: 10 ページ: e1004680-e1004680
- DOI
  10.1371/journal.pgen.1004680
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] Exome Sequencing Identification of EP300 Mutation in a Proband with Coloboma and Imperforate Anus: Possible Expansion of the Phenotypic Spectrum of Rubinstein-Taybi Syndrome2015
- 著者名/発表者名
  Koji Masuda, Kazuhiro Akiyama, Michiko Arakawa, Eriko Nishi, Noritaka Kitazawa, Tsukasa Higuchi, Yuki Katou, Katsuhiko Shirahige, Kosuke Izumi
- 雑誌名
  
  Molecular Syndromology
  
  巻: 6 号: 2 ページ: 99-103
- DOI
  10.1159/000375542
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15J10948, KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] Quantitative Dynamics of Chromatin Remodeling during Germ Cell Specification from Mouse Embryonic Stem Cells2015
- 著者名/発表者名
  Kurimoto, K., Yabuta, Y., Hayashi, K., Ohta, H., Kiyonari, H., Mitani, T., Moritoki, Y., Kohri, K., Kimura, H., Yamamoto, T., Katou, Y., Shirahige, K., Saitou, M.
- 雑誌名
  
  Cell Stem Cell
  
  巻: 16 号: 5 ページ: 517-532
- DOI
  10.1016/j.stem.2015.03.002
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24681039, KAKENHI-PROJECT-25650065, KAKENHI-PLANNED-23114003, KAKENHI-PLANNED-25114006, KAKENHI-PROJECT-25290033
[雑誌論文] Replication-Coupled PCNA Unloading by the Elg1 Complex Occurs Genome-wide and Requires Okazaki Fragment Ligation2015
- 著者名/発表者名
  Takashi Kubota, Yuki Katou, Ryuichiro Nakato, Katsuhiko Shirahige, Anne D. Donaldson
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 12 号: 5 ページ: 774-787
- DOI
  10.1016/j.celrep.2015.06.066
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K18465, KAKENHI-ORGANIZER-15H05970, KAKENHI-PLANNED-15H05976, KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] BRCA2 coordinates the activities of cell-cycle kinases to promote genome stability.2014
- 著者名/発表者名
  Yata K, Bleuyard JY, Nakato R, Ralf C, Katou Y, Schwab RA, Niedzwiedz W, Shirahige K, Esashi F.
- 雑誌名
  
  Cell Rep.
  
  巻: 7 号: 5 ページ: 1547-1559
- DOI
  10.1016/j.celrep.2014.04.023
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] Dimeric combinations of MafB, cFos and cJun control the apoptosis-survival balance in limb morphogenesis2014
- 著者名/発表者名
  N. suda, T. Itoh, R. Nakato et. al.
- 雑誌名
  
  Development
  
  巻: 141 号: 14 ページ: 2885-2894
- DOI
  10.1242/dev.099150
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22125008, KAKENHI-PUBLICLY-25111720, KAKENHI-PROJECT-25291086, KAKENHI-PROJECT-25461353, KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] EndogenousDNA replication stress results inexpansion of dNTP pools and a mutator phenotype2012
- 著者名/発表者名
  Davidson MB, KatouY , Keszthelyi A,Sing TL, Xia T, Ou J, Vaisica JA,Thevakumaran N, Marjavaara L, Myers CL,Chabes A, Shirahige K, Brown GW
- 雑誌名
  
  EMBO J
  
  巻: 31(4) ページ: 895-907
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Shirahige K, Labib K.Replisome stability at defective DNA replication forks is independent of S phase checkpoint kinases2012
- 著者名/発表者名
  De Piccoli G, Katou Y , Itoh T, Nakato
- 雑誌名
  
  Mol Cell
  
  巻: 45(5) ページ: 696-704
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Endogenous DNA replication stress results in expansion of dNTP pools and a mutator phenotype2012
- 著者名/発表者名
  Davidson MB, Katou Y, Keszthelyi A, Sing TL, Xia T, Ou J, Vaisica JA, Thevakumaran N, Marjavaara L, Myers CL, Chabes A, Shirahige K, Brown GW
- 雑誌名
  
  EMBO J.
  
  巻: 31(4) 号: 4 ページ: 895-907
- DOI
  10.1038/emboj.2011.485
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025, KAKENHI-ORGANIZER-23114001, KAKENHI-PLANNED-23114003
[雑誌論文] Chromosome length influences replication-induced topological stress2011
- 著者名/発表者名
  Kegel A, Betts-Lindroos H, Kanno T, Jeppsson K, Strom L, Katou Y, Itoh T, Shirahige K, Sjogren C
- 雑誌名
  
  Nature
  
  巻: 471(7338 ページ: 392-396
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Origin association of Sld3, Sld7, and Cdc45 proteins is a key step for determination of origin-firing timing2011
- 著者名/発表者名
  Tanaka S, Nakato R, Katou Y, Shirahige K, Araki H
- 雑誌名
  
  Curr Biol
  
  巻: 21(24) ページ: 2055-2063
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] The replication checkpoint protects fork stability by releasing transcribed genes from nuclear pores2011
- 著者名/発表者名
  Bermejo R, Capra T, Jossen R, Colosio A, Frattini C, Carotenuto W, Cocito A, Doksani Y, Klein H, Gomez-Gonzalez B, Aguilera A, Katou Y, Shirahige K, Foiani M
- 雑誌名
  
  Cell
  
  巻: 146(2) ページ: 233-246
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Shirahige K, Araki H.Origin association of Sld3,Sld7, and Cdc45 proteins is a key step for determination of origin-firing timing.2011
- 著者名/発表者名
  Tanaka S, Nakato R, Katou Y
- 雑誌名
  
  Curr Biol
  
  巻: 21(24) ページ: 2055-63
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Both interaction surfaces within cohesin's hinge domain are essential for its stable chromosomal association2010
- 著者名/発表者名
  Mishra A, Hu B, Kurze A, Beckouet F, Farcas AM, Dixon SE, Katou Y, Khalid S, Shirahige K, Nasmyth K
- 雑誌名
  
  Curr Biol 20
  
  ページ: 279-289
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Tof1,and Mrc1 form a heterotrimeric mediator complex that associates with DNA replication forks2009
- 著者名/発表者名
  Bando M*, Katou Y *, Komata M, Tanaka H,Itoh T, Sutani T, Shirahige K. Csm3
- 雑誌名
  
  J Biol Chem
  
  巻: 284(49) ページ: 34355-65
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Ctf4 coordinates the progression of helicase and DNA polymerase alpha. Genes2009
- 著者名/発表者名
  Tanaka H*, Katou Y * , Yagura M, Saitoh K, Itoh T, Araki H, Bando M, Shirahige K.
- 雑誌名
  
  Cells
  
  巻: 14(7) ページ: 807-20
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Involvement of a chromatin remodeling complex in damage tolerance during DNA replication2009
- 著者名/発表者名
  Falbo KB, Alabert C, Katou Y, Wu S, Han J, Wehr T, Xiao J, He X, Zhang Z, Shi Y, Shirahige K, Pasero P, Shen X.
- 雑誌名
  
  Nat Struct Mol Biol. 16
  
  ページ: 1167-1172
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[雑誌論文] Csm3, Tof1, and Mrc1 form a heterotrimeric mediator complex that associates with DNA replication forks2009
- 著者名/発表者名
  Bando M, Katou Y, Komata M, Tanaka H, Itoh T, Sutani T, Shirahige K.
- 雑誌名
  
  J Biol Chem. 284
  
  ページ: 34355-34365
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[学会発表] The role of interleukin 11-signaling in tail regeneration of Xenopus laevis tadpoles.2015
- 著者名/発表者名
  Tsujioka H, Kunieda T, Katou Y, Shirahige K, Kubo T
- 学会等名
  Society for Developmental Biology 74th annual meeting
- 発表場所
  Snowbird, Utah USA
- 年月日
  2015-07-09
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051
[学会発表] Analysis of the role of interleukin 11 in tail regeneration of Xenopus laevis tadpoles2015
- 著者名/発表者名
  辻岡洋、國枝武和、加藤由紀、白髭克彦、久保健雄
- 学会等名
  第48回日本発生生物学会大会
- 発表場所
  つくば国際会議場　（茨城県つくば市）
- 年月日
  2015-06-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051
[学会発表] Mec1 is required for efficient progression of replication forks at cohesin localization sites2012
- 著者名/発表者名
  Yuki KATOU
- 学会等名
  The 13th International Conference on Systems Biology
- 発表場所
  Toront,Canada
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[学会発表] Genome-wide Dynamic change of Cohesin and replication in yeast.2012
- 著者名/発表者名
  Yuki Katou, Ryuichiro Nakato,Katsuhiko Shirahige
- 学会等名
  The 13th International Conference on Systems Biology
- 発表場所
  in Toronto
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[学会発表] 発表タイトル:次世代シーケンサーを使用した姉妹染色分体間の接着形成に必要な因子の解析2010
- 著者名/発表者名
  加藤由起、伊藤武彦、白髭克彦
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- 発表場所
  in Kobe Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[学会発表] Csm3, Tof1, and Mrc1 form a heterotrimeric mediator complex that associates with DNA replication forks2009
- 著者名/発表者名
  加藤由起、坂東優篤、白髭克彦
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2009-12-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[学会発表] Csm3,Tof1,and Mrc1 form a Heterotrimeric Mediator Complex that Associates with DNA Replication Forks2009
- 著者名/発表者名
  加藤由起、田中宏和,白髭克彦
- 学会等名
  日本分子生物学会年会
- 発表場所
  in
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21681025
[学会発表] アフリカツメガエル幼生尾の再生芽増殖細胞に選択的に発現する遺伝子の網羅的検索と解析
- 著者名/発表者名
  辻岡洋、國枝武和、加藤由起、白髭克彦、久保健雄
- 学会等名
  日本動物学会　第85回　仙台大会
- 発表場所
  宮城県仙台市　東北大学川内北キャンパス
- 年月日
  2014-09-11 – 2014-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051
[学会発表] アフリカツメガエル幼生尾の再生芽増殖細胞に選択的に発現する遺伝子の網羅的検索と解析
- 著者名/発表者名
  辻岡洋、國枝武和、加藤由起、白髭克彦、久保健雄
- 学会等名
  第66回　日本細胞生物学会大会
- 発表場所
  奈良県奈良市　新公会堂　東大寺総合文化センター
- 年月日
  2014-06-11 – 2014-06-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051
[学会発表] Comprehensive screening and identification of genes expressed preferentially in the proliferating blastema cells of the Xenopus laevis tadpole tails
- 著者名/発表者名
  Hiroshi Tsujioka, Takekazu Kunieda, Yuki Katou, Katsuhiko Shirahige, Takeo Kubo
- 学会等名
  47th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
- 発表場所
  愛知県名古屋市　WINC AICHI
- 年月日
  2014-05-27 – 2014-05-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051
[学会発表] アフリカツメガエル幼生尾の再生芽増殖細胞に選択的に発現する遺伝子の解析
- 著者名/発表者名
  辻岡洋、國枝武和、加藤由起、白髭克彦、久保健雄
- 学会等名
  第37回　日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神奈川県横浜市　パシフィコ横浜
- 年月日
  2014-11-25 – 2014-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26640051
[]

1. 太田邦史 (90211789)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 山田貴富 (30451850)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 久保健雄 (10201469)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
4. 白髭克彦 (90273854)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
5. 伊藤武彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
6. 中戸隆一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 栗本一基

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

加藤 由紀 KATOU Yuki

加藤 由起 KATOU Yuki

研究課題

研究成果

共同研究者

再生芽「自己抗原」の同定とそのマスキングによる再生能賦活化に関する研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

非コードＤＮＡ領域によるゲノムＤＮＡ再編成制御機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

コヒーシンサブユニットSMC3のアセチル化修飾動態の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Germline gain-of-function mutations in AFF4 cause a developmental syndrome functionally linking the super elongation complex and cohesin.2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Unique gene expression profile of the proliferating Xenopus tadpole tail blastema cells deciphered by RNA-sequencing analysis.2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The chromosomal association of the Smc5/6 complex depends on cohesion and predicts the level of sister chromatid entanglement.2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Exome Sequencing Identification of EP300 Mutation in a Proband with Coloboma and Imperforate Anus: Possible Expansion of the Phenotypic Spectrum of Rubinstein-Taybi Syndrome2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Quantitative Dynamics of Chromatin Remodeling during Germ Cell Specification from Mouse Embryonic Stem Cells2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Replication-Coupled PCNA Unloading by the Elg1 Complex Occurs Genome-wide and Requires Okazaki Fragment Ligation2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] BRCA2 coordinates the activities of cell-cycle kinases to promote genome stability.2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Dimeric combinations of MafB, cFos and cJun control the apoptosis-survival balance in limb morphogenesis2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] EndogenousDNA replication stress results inexpansion of dNTP pools and a mutator phenotype2012

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Shirahige K, Labib K.Replisome stability at defective DNA replication forks is independent of S phase checkpoint kinases2012

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Endogenous DNA replication stress results in expansion of dNTP pools and a mutator phenotype2012

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Chromosome length influences replication-induced topological stress2011

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

加藤由紀 KATOU Yuki

加藤由起 KATOU Yuki