大滝大樹 OTAKI Hiroki

研究者番号	50632858
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2019年度 – 2022年度: 長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43020:構造生物化学関連
キーワード	研究代表者量子化学計算 / 水素結合 / βシート / 分子動力学シミュレーション / プリオン / 疎水性相互作用 / 分子動力学計算 / αシヌクレイン / アミロイド

αシヌクレインのアミロイド凝集性における種間差異の要因を計算化学的に解明する研究代表者
- 研究代表者
  
  大滝大樹
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  長崎大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Molecular Spectroscopy: A Quantum Chemistry Approach (Chapter 5)2019
- 著者名/発表者名
  Kiyoshi Yagi, Hiroki Otaki, Pai-chi Li, Bo Thomsen, Yuji Sugita (Yukihiro Ozaki (Ed.), Marek Januz Wojcik (Ed.), Jurgen Popp (Ed.))
- 総ページ数
  640
- 出版者
  Wiley-VCH
- ISBN
  9783527344611
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] Singlet-oxygen photosensitizers with a tetrad structure and a single BODIPY chromophore: An evidence for transition state stabilization of intersystem crossing2023
- 著者名/発表者名
  Maki Toshihide、Zhou Zheyang、Irie Yukari、Matsunaga Takahide、Onodera Takae、Imamichi Shoji、Sasaki Yuka、Masutani Mitsuko、Otaki Hiroki、Sakuda Eri、Tanaka Yoshimasa、Murota Hiroyuki
- 雑誌名
  
  Dyes and Pigments
  
  巻: 210 ページ: 110963-110963
- DOI
  10.1016/j.dyepig.2022.110963
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-20H05834, KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2022
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 雑誌名
  
  スーパーコンピューティングニュース
  
  巻: 24 ページ: 81-87
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] Conformation-Dependent Influences of Hydrophobic Amino Acids in Two In-Register Parallel β-Sheet Amyloids, an α-Synuclein Amyloid and a Local Structural Model of PrPSc2022
- 著者名/発表者名
  Otaki Hiroki、Taguchi Yuzuru、Nishida Noriyuki
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 7 号: 35 ページ: 31271-31288
- DOI
  10.1021/acsomega.2c03523
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058, KAKENHI-PROJECT-23K21396
[雑誌論文] Systemic lupus erythematosus overlapping dermatomyositis owing to a heterozygous TREX1 Asp130Asn missense mutation2021
- 著者名/発表者名
  Endo Yushiro、Koga Tomohiro、Otaki Hiroki、Furukawa Kaori、Kawakami Atsushi
- 雑誌名
  
  Clinical Immunology
  
  巻: 227 ページ: 108732-108732
- DOI
  10.1016/j.clim.2021.108732
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058, KAKENHI-PROJECT-19K17888
[雑誌論文] Lead Optimization of Influenza Virus RNA Polymerase Inhibitors Targeting PA-PB1 Interaction2021
- 著者名/発表者名
  Mizuta Satoshi、Otaki Hiroki、Ishikawa Takeshi、Makau Juliann Nzembi、Yamaguchi Tomoko、Fujimoto Takuya、Takakura Nobuyuki、Sakauchi Nobuki、Kitamura Shuji、Nono Hikaru、Nishi Ryota、Tanaka Yoshimasa、Takeda Kohsuke、Nishida Noriyuki、Watanabe Ken
- 雑誌名
  
  Journal of Medicinal Chemistry
  
  巻: 65 号: 1 ページ: 369-385
- DOI
  10.1021/acs.jmedchem.1c01527
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22600, KAKENHI-PROJECT-19K11769, KAKENHI-PROJECT-20K07032, KAKENHI-PROJECT-21K07704, KAKENHI-PROJECT-21K12129, KAKENHI-PROJECT-19K16058, KAKENHI-PROJECT-20H04285, KAKENHI-PROJECT-23K21396
[雑誌論文] 分子動力学シミュレーションによる自己炎症性疾患に関わるタンパク質の研究2021
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 雑誌名
  
  スーパーコンピューティングニュース
  
  巻: 23 ページ: 28-34
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] A Quinolinone Compound Inhibiting the Oligomerization of Nucleoprotein of Influenza A Virus Prevents the Selection of Escape Mutants2020
- 著者名/発表者名
  Makau Juliann Nzembi, Watanabe Ken, Otaki Hiroki, Mizuta Satoshi, Ishikawa Takeshi, Kamatari Yuji O., Nishida Noriyuki
- 雑誌名
  
  Viruses
  
  巻: 12 号: 3 ページ: 337-337
- DOI
  10.3390/v12030337
- NAID
  120006988247
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11536, KAKENHI-PROJECT-19K11769, KAKENHI-PROJECT-19K16058, KAKENHI-PROJECT-16K00853
[雑誌論文] Idiopathic multicentric Castleman disease with novel heterozygous Ile729Met mutation in exon 10 of familial Mediterranean fever gene2020
- 著者名/発表者名
  Endo Yushiro、Koga Tomohiro、Otaki Hiroki、Sasaki Daisuke、Sumiyoshi Remi、Furukawa Kaori、Tanaka Yoshimasa、Katsunori Yanagihara、Kawakami Atsushi
- 雑誌名
  
  Rheumatology
  
  巻: 60 号: 1 ページ: 445-450
- DOI
  10.1093/rheumatology/keaa269
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] In silico evidence of unique behaviors of methionine in an in-register parallel beta-sheet amyloid, suggestive of its possible contribution to strain diversity of amyloids2019
- 著者名/発表者名
  Otaki Hiroki、Taguchi Yuzuru、Nishida Noriyuki
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: 596742
- DOI
  10.1101/596742
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] Molecular dynamics simulation of local structural models of PrPSc reveals how codon 129 polymorphism affects propagation of PrPSc2019
- 著者名/発表者名
  Otaki Hiroki、Taguchi Yuzuru、Nishida Noriyuki
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: 2019.12.25.888289
- DOI
  10.1101/2019.12.25.888289
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] Conformation-dependent influences of hydrophobic amino acids in two in-register parallel β-sheet amyloids, an α-synuclein amyloid and a local structural model of PrPSc2019
- 著者名/発表者名
  Otaki Hiroki、Taguchi Yuzuru、Nishida Noriyuki
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: 758938
- DOI
  10.1101/758938
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[雑誌論文] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2019
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 雑誌名
  
  スーパーコンピューティングニュース
  
  巻: 21 ページ: 47-53
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学シミュレーションと残基間相互作用ネットワークによるDNA分解酵素変異体の相互作用解析2023
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  日本化学会第103春季年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算とネットワークグラフを用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析2022
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  第36回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算とネットワーク解析を用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析2022
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  第128回日本物理学会九州支部例会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算を用いたDNA分解酵素の失活メカニズムの解明2022
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  JHPCN：学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点　第14回シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算を用いたDNA分解酵素の失活メカニズムの解明2022
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  東京大学情報基盤センター　2021年度「若手・女性利用者推薦」成果報告会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] Analysis of the effects of mutations on the three prime repair exonuclease 1 using molecular dynamics simulation and network analysis2022
- 著者名/発表者名
  Hiroki Otaki
- 学会等名
  2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2022）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] Molecular dynamics study of the three prime repair exonuclease 1 and its mutants2022
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算を用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析2021
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  第35回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] インフルエンザRNAポリメラーゼを阻害するキノリノン誘導体の開発研究2021
- 著者名/発表者名
  水田賢志，大滝大樹，渡邊健
- 学会等名
  日本薬学会　第141年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算とネットワーク解析を用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析2021
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  第127回日本物理学会九州支部例会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] Molecular Dynamics Simulations of DNA Exonuclease2021
- 著者名/発表者名
  Hiroki Otaki
- 学会等名
  CBI学会2021年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] インフルエンザRNAポリメラーゼPA-PB1蛋白質間相互作用阻害剤の開発研究2020
- 著者名/発表者名
  水田賢志，大滝大樹，渡邊健
- 学会等名
  日本薬学会　第140年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 先回り創薬のための薬剤耐性変異予測とin vitro評価系の構築2020
- 著者名/発表者名
  鎌足雄司，小林美穂，石川岳志，大滝大樹，J. N. Makau，渡邊健，西田教行
- 学会等名
  第9回岐阜構造生物学・医学・論理的創薬シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2020
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  東京大学情報基盤センター　2019年度（後期）「若手・女性利用者推薦」成果報告会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 計算化学を利用した薬剤耐性変異予測法の開発とオセルタミビル耐性インフルエンザウイルスでの検証2019
- 著者名/発表者名
  石川岳志，大滝大樹，J. N. Makau，渡邊健，水田賢志，鎌足雄司，田中義正，西田教行
- 学会等名
  第72回日本細菌学会九州支部総会・第56回日本ウイルス学会九州支部総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2019
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  JHPCN：学際大規模情報基盤共同利用・共同研究拠点　第11回シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 全原子分子動力学シミュレーションによるαシヌクレインアミロイドの構造解析2019
- 著者名/発表者名
  大滝大樹，田口謙，西田教行
- 学会等名
  第7回日本アミロイドーシス学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] Computational study of the interaction and structural properties of α-synuclein amyloids2019
- 著者名/発表者名
  Hiroki Otaki, Yuzuru Taguchi, Noriyuki Nishida
- 学会等名
  Asia Pacific Prion Symposium 2019 (APPS2019)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学シミュレーションを用いたαシヌクレインアミロイドの構造解析2019
- 著者名/発表者名
  大滝大樹，田口謙，西田教行
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2019
- 著者名/発表者名
  大滝大樹
- 学会等名
  東京大学情報基盤センター「若手・女性利用者推薦」制度　平成30年度インターン・後期採択課題　成果報告会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] 薬剤耐性RNAウイルス出現予測法の確立と迅速制御のためのインシリコ創薬2019
- 著者名/発表者名
  西田教行，田中義正，石川岳志，水田賢志，大滝大樹，鎌足雄司，渡邊健
- 学会等名
  J-PRIDE研究成果発表会，重症・難治性感染症の理解と予防・治療法の開発に向けて～若手研究者たちの挑戦～
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058
[学会発表] Molecular dynamics simulation for investigation of strain diversity of prions2019
- 著者名/発表者名
  Yuzuru Taguchi, Hiroki Otaki, Noriyuki Nishida
- 学会等名
  Asia Pacific Prion Symposium 2019 (APPS2019)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16058

1. 作田絵里

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 石川岳志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 西田教行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

大滝 大樹 OTAKI Hiroki

研究課題

研究成果

共同研究者

αシヌクレインのアミロイド凝集性における種間差異の要因を計算化学的に解明する研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] Molecular Spectroscopy: A Quantum Chemistry Approach (Chapter 5)2019

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] Singlet-oxygen photosensitizers with a tetrad structure and a single BODIPY chromophore: An evidence for transition state stabilization of intersystem crossing2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2022

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Conformation-Dependent Influences of Hydrophobic Amino Acids in Two In-Register Parallel β-Sheet Amyloids, an α-Synuclein Amyloid and a Local Structural Model of PrPSc2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Systemic lupus erythematosus overlapping dermatomyositis owing to a heterozygous TREX1 Asp130Asn missense mutation2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Lead Optimization of Influenza Virus RNA Polymerase Inhibitors Targeting PA-PB1 Interaction2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 分子動力学シミュレーションによる自己炎症性疾患に関わるタンパク質の研究2021

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A Quinolinone Compound Inhibiting the Oligomerization of Nucleoprotein of Influenza A Virus Prevents the Selection of Escape Mutants2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Idiopathic multicentric Castleman disease with novel heterozygous Ile729Met mutation in exon 10 of familial Mediterranean fever gene2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] In silico evidence of unique behaviors of methionine in an in-register parallel beta-sheet amyloid, suggestive of its possible contribution to strain diversity of amyloids2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Molecular dynamics simulation of local structural models of PrPSc reveals how codon 129 polymorphism affects propagation of PrPSc2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Conformation-dependent influences of hydrophobic amino acids in two in-register parallel β-sheet amyloids, an α-synuclein amyloid and a local structural model of PrPSc2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 分子動力学計算によるアミロイド凝集様態の理論的解析2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[学会発表] 分子動力学シミュレーションと残基間相互作用ネットワークによるDNA分解酵素変異体の相互作用解析2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 分子動力学計算とネットワークグラフを用いたDNA分解酵素における変異の影響の解析2022

著者名/発表者名

大滝大樹 OTAKI Hiroki