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石井 公太郎  Ishii Kotaro

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 50632965
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 放射線医学研究所 計測・線量評価部, 主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2022年度 – 2023年度: 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 放射線医学研究所 計測・線量評価部, 主任研究員
2021年度: 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 量子生命・医学部門 放射線医学研究所 計測・線量評価部, 主任研究員
2019年度 – 2020年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 仁科加速器科学研究センター, 協力研究員
2015年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 仁科加速器研究センター, 特別研究員
2012年度: 独立行政法人理化学研究所, 生物照射チーム, 特別研究員
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43050:ゲノム生物学関連
研究代表者以外
遺伝育種科学 / 形態・構造
キーワード
研究代表者
変異創成 / 植物 / 線エネルギー付与 / DNA修復 / 重イオンビーム
研究代表者以外
植物 / 重イオンビーム / 欠失マッピング / 生殖システム / 組換え抑制領域 … もっと見る / 育種学 / 性決定遺伝子 / 性染色体 / 加速器 / 突然変異 / ヒロハノマンテマ / 雌雄異株植物 隠す
  • 研究課題

    (3件)
  • 研究成果

    (41件)
  • 共同研究者

    (8人)
  •  重イオンビームによる高頻度変異誘発の分子基盤の解明研究代表者

    • 研究代表者
      石井 公太郎
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  重イオンビーム欠失変異マッピングによる組換え抑制領域からの有用遺伝子同定

    • 研究代表者
      風間 裕介
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      遺伝育種科学
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  Y染色体微細加工と顕微発現プロファイリングを用いた植物性決定遺伝子の完全解明

    • 研究代表者
      風間 裕介
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      形態・構造
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2016 2015 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Genomic view of heavy-ion-induced deletions associated with distribution of essential genes in Arabidopsis thaliana2024

    • 著者名/発表者名
      Ishii Kotaro、Kazama Yusuke、Hirano Tomonari、Fawcett Jeffrey A.、Sato Muneo、Hirai Masami Yokota、Sakai Fujiko、Shirakawa Yuki、Ohbu Sumie、Abe Tomoko
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 15

    • DOI

      10.3389/fpls.2024.1352564

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [雑誌論文] An Argon-Ion-Induced Pale Green Mutant of Arabidopsis Exhibiting Rapid Disassembly of Mesophyll Chloroplast Grana2021

    • 著者名/発表者名
      Sanjaya Alvin、Kazama Yusuke、Ishii Kotaro、Muramatsu Ryohsuke、Kanamaru Kengo、Ohbu Sumie、Abe Tomoko、Fujiwara Makoto T.
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 10 号: 5 ページ: 848-848

    • DOI

      10.3390/plants10050848

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622, KAKENHI-PROJECT-20K21449, KAKENHI-PROJECT-20H03297, KAKENHI-PROJECT-19K05831
  • [雑誌論文] Double Mutant Analysis with the Large Flower Mutant, ohbana1, to Explore the Regulatory Network Controlling the Flower and Seed Sizes in Arabidopsis thaliana2021

    • 著者名/発表者名
      Nhat Vuong Quoc、Kazama Yusuke、Ishii Kotaro、Ohbu Sumie、Kunitake Hisato、Abe Tomoko、Hirano Tomonari
    • 雑誌名

      Plants

      巻: 10 号: 9 ページ: 1881-1881

    • DOI

      10.3390/plants10091881

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H03297, KAKENHI-PROJECT-19K06622, KAKENHI-PROJECT-20K21449
  • [雑誌論文] AMAP: A pipeline for whole-genome mutation detection in Arabidopsis thaliana2016

    • 著者名/発表者名
      Ishii K, Kazama Y, Hirano T, Hamada M, Ono Y, Abe T
    • 雑誌名

      Genes Genet Syst

      巻: 印刷中

    • NAID

      130005450121

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [雑誌論文] A new physical mapping approach refines the sex-determining gene positions on the Silene latifolia Y-chromosome2016

    • 著者名/発表者名
      Kazama Y, Ishii K, Aonuma W, Ikeda T, Kawamoto H, Koizumi A, Filatov DA, Chibalina M, Bergero R, Charlesworth D, Abe T, Kawano S
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 6 号: 1 ページ: 18917-18917

    • DOI

      10.1038/srep18917

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [雑誌論文] Comprehensive identification of mutations induced by heavy-ion beam irradiation in Arabidopsis thaliana.2015

    • 著者名/発表者名
      Tomonari Hirano, Yusuke Kazama, Kotaro Ishii, Sumie Ohbu, Yuki Shirakawa, Tomoko Abe
    • 雑誌名

      The Plant Journal

      巻: 82 号: 1 ページ: 93-104

    • DOI

      10.1111/tpj.12793

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [雑誌論文] Rapid degeneration of noncoding DNA regions surrounding SlAP3X/Y after recombination suppression in a dioecious plant, Silene latifolia.2013

    • 著者名/発表者名
      Ishii, K., Nishiyama, R., Shibata, F., Kazama, Y., Abe, T., and Kawano, S.
    • 雑誌名

      G3

      巻: 3 号: 12 ページ: 2121-2130

    • DOI

      10.1534/g3.113.008599

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24657046, KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [雑誌論文] Narrowing Down the Mapping of Plant Sex-Determination Regions Using New Y Chromosome-Specific Markers and Heavy-Ion-Beam Irradiation-Induced Y Deletion Mutants in Silene latifolia2011

    • 著者名/発表者名
      Fujita, N., Torii, C., Ishii, K., Aonuma, W., Shimizu, Y., Kazama, Y., Abe, T., Kawano, S.
    • 雑誌名

      G3

      巻: 2 号: 2 ページ: 271-278

    • DOI

      10.1534/g3.111.001420

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22112506, KAKENHI-PROJECT-22370024, KAKENHI-PROJECT-23770070, KAKENHI-PROJECT-24657046
  • [雑誌論文] Production of bisexual flofwer-producing mutants of the dioecious plant, Silene latifolia, by using γ-ray and the heavy-ion.2011

    • 著者名/発表者名
      Aonuma W, Ishii K, Torii C, Fujita N, Shimizu Y, Nishihara K, Kazama Y, Abe T, Kawano S
    • 雑誌名

      RIKEN Prog Rep

      巻: 44 ページ: 271-271

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770070
  • [学会発表] 全ゲノム変異解析による重イオンビーム誘発変異のLET・線量依存性2023

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 風間裕介, 平野智也, Jeffrey A. Fawcett, 白川侑希, 大部澄江, 阿部知子
    • 学会等名
      理研シンポジウム「重イオンビーム育種による持続可能な社会や特産品生産の実現」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [学会発表] 重イオンビームで誘発される欠失変異と必須遺伝子のシロイヌナズナゲノム上での 分布に関する俯瞰的解析2023

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 風間裕介, 平野智也, Jeffrey A. Fawcett, 酒井富士子, 白川侑希, 大部澄江, 阿部知子
    • 学会等名
      日本遺伝学会第95回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [学会発表] 重イオンビームで誘発される欠失変異と必須遺伝子のシロイヌナズナゲノム上での分布に関する俯瞰的解析2022

    • 著者名/発表者名
      石井 公太郎, 風間 裕介, 平野 智也, Jeffrey A. Fawcett, 酒井 富士子, 白川 侑希, 大部 澄江, 阿部 知子
    • 学会等名
      日本育種学会第141回講演会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [学会発表] クロレラゲノム配列の更新と重イオンビーム誘導変異体の染色体再編成の解析2022

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 浅野円花, 阿部知子, 河野重行
    • 学会等名
      日本植物学会第86回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [学会発表] クロレラの内部倍数性とAr・Feイオンビーム照 射による染色体の分断化と再構成2021

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎、風間裕介、浅野円花、竹下毅、阿部知子、河野重行.
    • 学会等名
      日本藻類学会第45回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [学会発表] Ar・Feイオンビーム照射によって生じるクロレラ染色体の断片化と染色体再編成2020

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎、風間裕介、浅野円花、阿部知子、河野重行.
    • 学会等名
      日本育種学会第138回講演会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K06622
  • [学会発表] 重イオンビーム照射による巨大欠失を利用して組換え抑制領域をマッピングする2015

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 風間裕介, 池田時浩, 川元寛章, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      SIP新しい育種技術2系/3系突然変異グループ合同ワークショップ
    • 発表場所
      富士屋(新潟)
    • 年月日
      2015-09-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] シロイヌナズナで明らかにした重イオンビームのLET効果~変異率と変異スペクトラムについて2015

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 平野智也, 石井公太郎, 大部澄江, 白川侑希, 阿部知子
    • 学会等名
      SIP新しい育種技術2系/3系突然変異グループ合同ワークショップ
    • 発表場所
      富士屋(新潟)
    • 年月日
      2015-09-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 巡回セールスマン問題を用いた植物型巨大Y染色体のマッピング2015

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 石井公太郎, 阿部知子, 河野重行
    • 学会等名
      日本遺伝学会第87回大会
    • 発表場所
      東北大学河内北キャンパス(仙台)
    • 年月日
      2015-09-25
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] ヒロハノマンテマY染色体の構造解析と組換え抑制領域の欠失マッピングプログラムDelMapperの開発2015

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 石井公太郎, 池田時浩, Dmitry Filatov, Margarita Chibalina, Roberta Bergero, Deborah Charlesworth, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      日本植物学会第79回大会
    • 発表場所
      朱鷺メッセ(新潟)
    • 年月日
      2015-09-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 重イオンビーム誘発欠失変異体集団を用いたシロイヌナズナ必須染色体領域のマッピング2015

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 風間裕介, 平野智也, 白川侑希, 大部澄江, 山田美恵子, 若菜妙子, 阿部知子
    • 学会等名
      日本育種学会第128回講演会
    • 発表場所
      新潟大学五十嵐キャンパス(新潟)
    • 年月日
      2015-09-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] Pipeline for whole-genome analysis of heavy-ion-induced mutants in Arabidopsis thaliana2015

    • 著者名/発表者名
      Ishii K, Kazama Y, Hirano T, Hamada M, Ono Y, Abe T
    • 学会等名
      The 26th International Conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      Paris
    • 年月日
      2015-07-07
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] Comprehensive characterization of genomic rearrangement in heavy-ion induced Arabidopsis mutants by whole genome resequencing2015

    • 著者名/発表者名
      Kazama Y, Hirano T, Ishii K, Ohbu S, Shirakawa Y, Abe T
    • 学会等名
      The 26th International Conference on Arabidopsis Research
    • 発表場所
      Paris
    • 年月日
      2015-07-07
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] ヒロハノマンテマへの黒穂菌を感染によって生じる葯にY染色体の関与はあるか2014

    • 著者名/発表者名
      川元寬章, 石井公太郎, 風間裕介, 阿部知子, 河野重行,
    • 学会等名
      日本植物形態学会第26回総会
    • 発表場所
      明治大学(川崎市)
    • 年月日
      2014-09-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 巡回セールスマン問題を応用した重イオンビーム欠失マッピング2014

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 石井公太郎, 池田時浩, 川元寛章, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      第10回イオンビーム育種研究会
    • 発表場所
      三の丸ホテル (水戸市)
    • 年月日
      2014-07-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 重イオンビーム誘発巨大欠失を用いた植物ゲノム研究ルネサンス2014

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 平野智也, 石井公太郎, 青沼航, 川元寛章, 池田時浩, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      理研シンポジウムーゲノム新時代の重イオンビーム育種―MutagenesisからMutagenomicsへ
    • 発表場所
      理化学研究所(和光)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 巡回セールスマン問題を応用したヒロハノマンテマY染色体欠失マッピング2013

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 石井公太郎, 青沼航, 川元寛章, 池田時浩, 松永杏樹, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      日本育種学会第124回講演会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] ヒロハノマンテマXY性染色体にあるBクラス遺伝子S1AP3X/Yの欠失変異2013

    • 著者名/発表者名
      青沼航, 川元寛章, 石井公太郎, 風間裕介, 阿部知子, 河野重行
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 川本法を利用したヒロハノマンテマ蕾のレーザーマイクロダイセクション2013

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 風間裕介, 阿部知子
    • 学会等名
      日本植物形態学会第25回大会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 雌雄異株植物ヒロハノマンテマの両性花突然変異体における開花同調性と雌雄離熟の出現2013

    • 著者名/発表者名
      青沼航, 川元寛章, 石井公太郎, 風間裕介, 阿部知子, 河野重行
    • 学会等名
      日本植物形態学会第25回大会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける重イオンビーム誘発突然変異の全ゲノム解析2013

    • 著者名/発表者名
      平野智也, 風間裕介, 石井公太郎, 大部澄江, 白川侑希, 阿部知子
    • 学会等名
      第31回日本植物細胞分子生物学会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 高LET重イオンビームの変異誘発作用とそれを利用したタンデム重複遺伝子の破壊2013

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 平野智也, 石井公太郎, 大部澄江, 白川侑希, 阿部知子
    • 学会等名
      日本植物学会第77回大会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 高LET精密制御照射によるシロイヌナズナのタンデム重複遺伝子破壊技術の確立2013

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 平野智也, 石井公太郎, 大部澄江, 白川侑希, 林祐子, 阿部知子
    • 学会等名
      第52回ガンマーフィールドシンポジウム
    • 発表場所
      水戸三の丸ホテル(茨城県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 雌雄異株植物ヒロハノマンテマの効率的な染色体標本の作製2012

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎
    • 学会等名
      日本植物形態学会第24回総会・大会
    • 発表場所
      姫路
    • 年月日
      2012-09-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770070
  • [学会発表] ヒロハノマンテマ性染色体の組換え抑制によって生じたSlAP3X/Y周辺の構造変化2012

    • 著者名/発表者名
      石井 公太郎
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770070
  • [学会発表] ヒロハノマンテマ性染色体の組換え抑制によって生じたSlAP3X/Y 周辺の構造変化2012

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      姫路
    • 年月日
      2012-09-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23770070
  • [学会発表] Y染色体遺伝子アレイを用いたヒロハノマンテマ性分化ステージの発現プロファイリング

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎, 風間裕介, 川元寛章, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      日本植物学会第78回大会
    • 発表場所
      明治大学(川崎市)
    • 年月日
      2014-09-12 – 2014-09-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 全ゲノ ム変異解析のためのパイプラインの構築

    • 著者名/発表者名
      石井公太郎、平野智也、風間裕介、浜田道昭、小野幸輝、阿部知子
    • 学会等名
      日本育種学会第127回講演会
    • 発表場所
      玉川大学 (町田市)
    • 年月日
      2015-03-21 – 2015-03-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 雌蕊も雄蕊もないヒロハノマンテマの無性花変異体に黒穂菌を感染させると起きる変化

    • 著者名/発表者名
      川元寛章, 石井公太郎, 風間裕介, 阿部知子, 河野重行
    • 学会等名
      日本植物学会第78回大会
    • 発表場所
      明治大学(川崎市)
    • 年月日
      2014-09-12 – 2014-09-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 巡回セールスマン問題を応用したヒロハノマンテマ雄性決定領域の欠失マッピング

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 石井公太郎, 池田時浩, 川元寛章, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      日本植物学会第78回大会
    • 発表場所
      明治大学(川崎市)
    • 年月日
      2014-09-12 – 2014-09-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] 巨大Y染色体との格闘~ヒロハノマンテマの性決定遺伝子の探索

    • 著者名/発表者名
      風間裕介, 石井公太郎, 池田時浩, 川元寛章, 河野重行, 阿部知子
    • 学会等名
      日本育種学会第126回講演会
    • 発表場所
      南九州大学(都城市)
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • [学会発表] Pipeline for whole-genome analysis of heavy-ion-induced mutants

    • 著者名/発表者名
      Kotaro Ishii, Tomonari Hirano, Yusuke Kazama, Michiaki Hamada, Yukiteru Ono, Tomoko Abe
    • 学会等名
      International Symposium on Genome Science 2015
    • 発表場所
      一ツ橋ホール (千代田区)
    • 年月日
      2015-01-20 – 2015-01-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25292009
  • 1.  風間 裕介 (80442945)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 39件
  • 2.  河野 重行 (70161338)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 3.  安井 康夫 (70293917)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  高原 学 (90355123)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  阿部 知子 (70201895)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 26件
  • 6.  CHARLESWORTH Deborah
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  FILATOV Dimitry
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  平野 智也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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