町田晋一 Machida Shinichi

研究者番号	50732195
外部サイト
所属 (現在)	2025年度: 国立健康危機管理研究機構, 国立国際医療研究所, テニュアトラック部長
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 国立研究開発法人国立国際医療研究センター, 研究所, テニュアトラック部長 2017年度: 早稲田大学, 理工学術院, 次席研究員(研究院助教) 2014年度 – 2017年度: 早稲田大学, 理工学術院, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者ゲノム生物学 / 小区分49060:ウイルス学関連
キーワード	研究代表者ヒストン / ヒストン修飾 / クロマチン / H3K9me3 / ヌクレオソーム / HP1 / ヘテロクロマチン / エピジェネティクス / ユビキチン / RAD54 / RAD51 / リンカーヒストン / 相同組換え

B型肝炎ウイルスの転写メカニズムに関する包括的解析研究代表者
- 研究代表者
  
  町田晋一
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分49060:ウイルス学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人国立国際医療研究センター
ヘテロクロマチンの基盤構造の構造生物学的解析研究代表者
- 研究代表者
  
  町田晋一
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  早稲田大学
高次クロマチンにおける相同組換え反応の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  町田晋一
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  研究活動スタート支援
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  早稲田大学

すべて 2018 2017 2016 2015 2014 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] HP1との結合により形成される構成的なヘテロクロマチンの基盤となる構造2018
- 著者名/発表者名
  町田晋一, 滝沢由政, Matthias Wolf, 胡桃坂仁志
- 雑誌名
  
  新着論文レビュー
  
  巻: . ページ: 014
- DOI
  10.7875/first.author.2018.014
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Structural Basis of Heterochromatin Formation by Human HP12018
- 著者名/発表者名
  Machida Shinichi、Takizawa Yoshimasa、Ishimaru Masakazu、Sugita Yukihiko、Sekine Satoshi、Nakayama Jun-ichi、Wolf Matthias、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Molecular Cell
  
  巻: 69 号: 3 ページ: 385-397
- DOI
  10.1016/j.molcel.2017.12.011
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15080, KAKENHI-PROJECT-17K15704, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-17H01408, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Cryo-EM structure of the nucleosome containing the ALB1 enhancer DNA sequence2018
- 著者名/発表者名
  Takizawa Yoshimasa、Tanaka Hiroki、Machida Shinichi、Koyama Masako、Maehara Kazumitsu、Ohkawa Yasuyuki、Wade Paul A.、Wolf Matthias、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Open Biology
  
  巻: 8 号: 3 ページ: 170255-170255
- DOI
  10.1098/rsob.170255
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15080, KAKENHI-PUBLICLY-16H01550, KAKENHI-PUBLICLY-16H01577, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PLANNED-25116010, KAKENHI-PROJECT-17H01408, KAKENHI-PROJECT-16K18473, KAKENHI-PROJECT-16K18479, KAKENHI-PUBLICLY-18H04802, KAKENHI-PROJECT-17H03608, KAKENHI-PROJECT-17K19356
[雑誌論文] Histone H3 Methylated at Arginine 17 Is Essential for Reprogramming the Paternal Genome in Zygotes.2017
- 著者名/発表者名
  Hatanaka Y, Tsusaka T, Shimizu N, Morita K, Suzuki T, Machida S, Satoh M, Honda A, Hirose M, Kamimura S, Ogonuki N, Nakamura T, Inoue K, Hosoi Y, Dohmae N, Nakano T, Kurumizaka H, Matsumoto K, Shinkai Y, Ogura A.
- 雑誌名
  
  Cell Rep
  
  巻: 20(12) 号: 12 ページ: 2756-2765
- DOI
  10.1016/j.celrep.2017.08.088
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-25112001, KAKENHI-PLANNED-25112006, KAKENHI-PLANNED-25112009, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-16H04687, KAKENHI-PROJECT-17H03939, KAKENHI-PROJECT-17J00058, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] SYCP3 regulates strand invasion activities of RAD51 and DMC12017
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Wataru、Hosoya Noriko、Machida Shinichi、Miyagawa Kiyoshi、Kurumizaka Hitoshi
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: 22 号: 9 ページ: 799-809
- DOI
  10.1111/gtc.12513
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K10471, KAKENHI-PUBLICLY-16H01298, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-17H01408, KAKENHI-PROJECT-16H07295, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Phosphorylation of CBX2 controls its nucleosome-binding specificity2017
- 著者名/発表者名
  Takayuki Kawaguchi, Shinichi Machida, Hitoshi Kurumizaka, Hideaki Tagami, Jun-ichi Nakayama
- 雑誌名
  
  The Journal of Biochemistry
  
  巻: 162 号: 5 ページ: 343-355
- DOI
  10.1093/jb/mvx040
- NAID
  40021394855
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H01315, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Testis-Specific Histone Variant H3t Gene Is Essential for Entry into Spermatogenesis2017
- 著者名/発表者名
  Ueda J., Harada A., Urahama T., Machida S., Maehara K., Hada M., Makino Y., Nogami J., Horikoshi N., Osakabe A., Taguchi H., Tanaka H., Tachiwana H., Yao T., Yamada M., Iwamoto T., Isotani A., Ikawa M., Tachibana T., Okada Y., Kimura H., Ohkawa Y., Kurumizaka H., Yamagata K.
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 18(3) 号: 3 ページ: 593-600
- DOI
  10.1016/j.celrep.2016.12.065
- NAID
  120006957416
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05976, KAKENHI-PUBLICLY-16H01219, KAKENHI-PUBLICLY-16H01550, KAKENHI-PUBLICLY-16H01577, KAKENHI-PLANNED-25112007, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PLANNED-25116005, KAKENHI-PLANNED-25116010, KAKENHI-PROJECT-25250014, KAKENHI-PROJECT-15J06922, KAKENHI-PROJECT-16J09361, KAKENHI-PROJECT-25712035, KAKENHI-PROJECT-15K18457, KAKENHI-PROJECT-16K08748, KAKENHI-PROJECT-16K18473, KAKENHI-PROJECT-16K18479, KAKENHI-ORGANIZER-25112001, KAKENHI-PROJECT-16K07099, KAKENHI-PUBLICLY-16H01319, KAKENHI-PROJECT-17J06605
[雑誌論文] Xeroderma pigmentosum group C protein interacts with histones: regulation by acetylated states of histone H3.2017
- 著者名/発表者名
  Kakumu E
- 雑誌名
  
  Genes Cells.
  
  巻: 3 号: 3 ページ: 310-327
- DOI
  10.1111/gtc.12479
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H01307, KAKENHI-PUBLICLY-16H01311, KAKENHI-WRAPUP-16H01688, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PLANNED-25116005, KAKENHI-PROJECT-25250023, KAKENHI-PROJECT-16H07295, KAKENHI-PROJECT-26281020, KAKENHI-PROJECT-26281026, KAKENHI-PROJECT-15K12203, KAKENHI-PROJECT-15K18988, KAKENHI-PROJECT-16H06307, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Influence of polynucleosome preparation methods on sedimentation velocity analysis of chromatin.2017
- 著者名/発表者名
  Kujirai T, Machida S, Osakabe A, Kurumizaka H.
- 雑誌名
  
  J. Biochem.
  
  巻: 161 号: 4 ページ: 381-388
- DOI
  10.1093/jb/mvw081
- NAID
  40021219908
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-15J06807, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing2016
- 著者名/発表者名
  Kobayashi W., Takaku M., Machida S., Tachiwana H., Maehara K., Ohkawa Y. and Kurumizaka H
- 雑誌名
  
  Scientific reports
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 24428-24428
- DOI
  10.1038/srep24228
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13J03652, KAKENHI-PUBLICLY-16H01550, KAKENHI-PUBLICLY-16H01577, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PLANNED-25116010, KAKENHI-PROJECT-25250023, KAKENHI-PROJECT-16H07295, KAKENHI-PROJECT-26290064, KAKENHI-PROJECT-16K18473, KAKENHI-PROJECT-16K18479
[雑誌論文] Bivalent interaction of the PZP domain of BRPF1 with the nucleosome impacts chromatin dynamics and acetylation.2016
- 著者名/発表者名
  Klein BJ, Muthurajan UM, Lalonde ME, Gibson MD, Andrews FH, Hepler M, Machida S, Yan K, Kurumizaka H, Poirier MG, Cote J, Luger K, Kutateladze TG.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res.
  
  巻: 44 号: 1 ページ: 472-484
- DOI
  10.1093/nar/gkv1321
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-26890023
[雑誌論文] Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing2016
- 著者名/発表者名
  Kobayashi, W., Takaku, M., Machida, S., Tachiwana, H., Maehara, K., Ohkawa, Y., and Kurumizaka, H.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 印刷中
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023
[雑誌論文] GATA3-dependent cellular reprogramming requires activation-domain dependent recruitment of a chromatin remodeler.2016
- 著者名/発表者名
  Takaku M, Grimm SA, Shimbo T, Perera L, Menafra R, Stunnenberg HG, Archer TK, Machida S, Kurumizaka H, Wade P.
- 雑誌名
  
  Genome Biol.
  
  巻: 17 号: 1 ページ: 36-36
- DOI
  10.1186/s13059-016-0897-0
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-26890023
[雑誌論文] Structure and function of human histone H3.Y nucleosome.2016
- 著者名/発表者名
  Kujirai, T., Horikoshi, N., Sato, K., Maehara, K., Machida, S., Osakabe, A., Kimura, H., Ohkawa, Y. and Kurumizaka, H.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 1 号: 13 ページ: 1-15
- DOI
  10.1093/nar/gkw202
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023, KAKENHI-PROJECT-15J06807, KAKENHI-PROJECT-26840025, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PLANNED-25116005
[雑誌論文] Structural and biochemical analyses of monoubiquitinated human histones H2B and H42016
- 著者名/発表者名
  Machida S, Sekine S, Nishiyama Y, Horikoshi N, Kurumizaka H.
- 雑誌名
  
  Open Biol.
  
  巻: 6 号: 6 ページ: 160090-160090
- DOI
  10.1098/rsob.160090
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-25250023, KAKENHI-PROJECT-16K18473
[雑誌論文] Relaxed Chromatin Formation and Weak Suppression of Homologous Pairing by the Testis-Specific Linker Histone H1T.2016
- 著者名/発表者名
  Machida S, Hayashida R, Takaku M, Fukuto A, Sun J, Kinomura A, Tashiro S, Kurumizaka H.
- 雑誌名
  
  Biochemistry.
  
  巻: 55 号: 4 ページ: 637-646
- DOI
  10.1021/acs.biochem.5b01126
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PUBLICLY-26116514, KAKENHI-PROJECT-25250023, KAKENHI-PROJECT-15H02821, KAKENHI-PROJECT-26890023
[雑誌論文] Green fluorescent protein fused to the C terminus of RAD51 specifically interferes with secondary DNA binding by the RAD51-ssDNA complex2014
- 著者名/発表者名
  Kobayashi, W., Sekine, S., Machida, S., and Kurumizaka, H.
- 雑誌名
  
  Genes & Genetic Systems
  
  巻: 89 号: 4 ページ: 169-179
- DOI
  10.1266/ggs.89.169
- NAID
  130004750050
- ISSN
  1341-7568, 1880-5779
- 言語
  英語
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-13J03652, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-25250023, KAKENHI-PROJECT-26890023
[雑誌論文] N-terminal phosphorylation of HP1α increases its nucleosome-binding specificity.2014
- 著者名/発表者名
  Nishibuchi G, Machida S, Osakabe A, Murakoshi H, Hiragami-Hamada K, Nakagawa R, Fischle W, Nishimura Y, Kurumizaka H, Tagami H, Nakayama JI.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res.
  
  巻: 42 号: 20 ページ: 12498-12511
- DOI
  10.1093/nar/gku995
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-23114001, KAKENHI-PLANNED-23114005, KAKENHI-PLANNED-25116002, KAKENHI-PROJECT-26840025, KAKENHI-PROJECT-26890023
[学会発表] ヘテロクロマチンの立体構造解析2017
- 著者名/発表者名
  町田晋一、滝沢由政、石丸雅一、関根慧、中山潤一、Matthias Wolf、胡桃坂仁志
- 学会等名
  第11回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K18473
[学会発表] The biochemical analyses of the chromatin containing mono-ubiquitinated nucleosomes2015
- 著者名/発表者名
  Shinichi Machida, Yuki Nishiyama and Hitoshi Kurumizaka
- 学会等名
  International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics,and Function
- 発表場所
  淡路島
- 年月日
  2015-08-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023
[学会発表] Nap1は高次クロマチンでの相同組換えを促進する
- 著者名/発表者名
  町田晋一、高久誉大、井倉正枝、孫継英、鈴木秀和、小林航、木野村愛子、越阪部晃永、立和名博昭、堀越保則、福戸敦彦、松田諒、浦聖恵、田代聡、井倉毅、胡桃坂仁志
- 学会等名
  第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会合
- 発表場所
  安芸グランドホテル(広島県)
- 年月日
  2014-12-15 – 2014-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023
[学会発表] Nap1 is required for the homologous recombination reaction in higher-order chromatin containing histone H1.
- 著者名/発表者名
  Machida S., Takaku M., Ikura M., Sun J., Suzuki H., Kobayashi W., Kinomura A., Osakabe A., Tachiwana H., Horikoshi Y., Fukuto A., Matsuda R., Ura K., Tashiro S., Ikura T., and Kurumizaka H.
- 学会等名
  The 4D Nucleome
- 発表場所
  安芸グランドホテル(広島県)
- 年月日
  2014-12-17 – 2014-12-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023
[学会発表] リンカーヒストンバリアントH1Tの相同組換えにおける機能
- 著者名/発表者名
  町田晋一、林田亮太、加藤大貴、越阪部晃永、小林航、胡桃坂仁志
- 学会等名
  第87回日本生化学会大会
- 発表場所
  国立京都国際会館(京都府)
- 年月日
  2014-10-15 – 2014-10-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023
[学会発表] Biochemical analyses of the RAD51-mediated homologous pairing in chromatin containing the linker histone variant, H1T.
- 著者名/発表者名
  Shinichi Machida, Ryota Hayashida, and Hitoshi Kurumizaka
- 学会等名
  3R Symposium
- 発表場所
  御殿場高原ホテル(静岡県)
- 年月日
  2014-11-17 – 2014-11-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26890023

1. 中村肇伸

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 胡桃坂仁志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 7件
3. 岡田由紀

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
4. ウォルフマティアス

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
5. 堀哲也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
6. 小倉淳郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 細谷紀子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
8. 中山潤一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
9. 滝沢由政

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

町田 晋一 Machida Shinichi

研究課題

研究成果

共同研究者

B型肝炎ウイルスの転写メカニズムに関する包括的解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ヘテロクロマチンの基盤構造の構造生物学的解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

高次クロマチンにおける相同組換え反応の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] HP1との結合により形成される構成的なヘテロクロマチンの基盤となる構造2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural Basis of Heterochromatin Formation by Human HP12018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Cryo-EM structure of the nucleosome containing the ALB1 enhancer DNA sequence2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Histone H3 Methylated at Arginine 17 Is Essential for Reprogramming the Paternal Genome in Zygotes.2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] SYCP3 regulates strand invasion activities of RAD51 and DMC12017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Phosphorylation of CBX2 controls its nucleosome-binding specificity2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Testis-Specific Histone Variant H3t Gene Is Essential for Entry into Spermatogenesis2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Xeroderma pigmentosum group C protein interacts with histones: regulation by acetylated states of histone H3.2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Influence of polynucleosome preparation methods on sedimentation velocity analysis of chromatin.2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Chromatin architecture may dictate the target site for DMC1, but not for RAD51, during homologous pairing2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Bivalent interaction of the PZP domain of BRPF1 with the nucleosome impacts chromatin dynamics and acetylation.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

町田晋一 Machida Shinichi