川田健太郎 Kawata Kentaro

研究者番号	50825007
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-6481-0497
所属 (現在)	2024年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 2019年度 – 2021年度: 東京大学, アイソトープ総合センター, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 小区分49050:細菌学関連
キーワード	研究代表者 RNAダイナミクス / RNA分解制御 / 転写制御 / 代謝標識 / 遺伝子制御ネットワーク / 細胞分化 / 情報理論 / 転写速度推定 / single-cell RNA-seq / 薬剤耐性 / 遺伝子発現制御ネットワーク / 情報量 / サルモネラ菌

一細胞転写計測を用いた遺伝子制御ネットワークの動的特性の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  川田健太郎
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
遺伝子制御ネットワークの構築によるサルモネラ菌の薬剤耐性獲得メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  川田健太郎
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分49050:細菌学関連
- 研究機関
  東京大学

すべて 2021 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Epitranscriptomics（Regulation of RNA Stability Through RNA Modification）2021
- 著者名/発表者名
  Kawata Kentaro、Akimitsu Nobuyoshi
- 総ページ数
  632
- 出版者
  Springer
- ISBN
  9783030716127
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[雑誌論文] Metabolic labeling of RNA using multiple ribonucleoside analogs enables the simultaneous evaluation of RNA synthesis and degradation rates2020
- 著者名/発表者名
  Kawata Kentaro、Wakida Hiroyasu、Yamada Toshimichi、Taniue Kenzui、Han Han、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  Genome Research
  
  巻: 30 号: 10 ページ: 1481-1491
- DOI
  10.1101/gr.264408.120
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Stability of RNA sequences derived from the coronavirus genome in human cells2020
- 著者名/発表者名
  Wakida Hiroyasu、Kawata Kentaro、Yamaji Yuta、Hattori Emi、Tsuchiya Takaho、Wada Youichiro、Ozaki Haruka、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 527 号: 4 ページ: 993-999
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2020.05.008
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-19K22679, KAKENHI-PROJECT-19K24361
[雑誌論文] Exploration of <i>Salmonella</i> effector mutant strains on MTR4 and RRP6 degradation2020
- 著者名/発表者名
  Sun Xiaoning、Kawata Kentaro、Miki Atsuko、Wada Youichiro、Nagahama Masami、Takaya Akiko、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  BioScience Trends
  
  巻: 14 号: 4 ページ: 255-262
- DOI
  10.5582/bst.2020.03085
- NAID
  130007906511
- ISSN
  1881-7815, 1881-7823
- 年月日
  2020-08-31
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-18K06640, KAKENHI-PROJECT-18K07102, KAKENHI-PROJECT-18H02570
[雑誌論文] Long noncoding RNA U90926 is crucial for herpes simplex virus type 1 proliferation in murine retinal photoreceptor cells2020
- 著者名/発表者名
  Shirahama Shintaro、Onoguchi-Mizutani Rena、Kawata Kentaro、Taniue Kenzui、Miki Atsuko、Kato Akihisa、Kawaguchi Yasushi、Tanaka Rie、Kaburaki Toshikatsu、Kawashima Hidetoshi、Urade Yoshihiro、Aihara Makoto、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 19406-19406
- DOI
  10.1038/s41598-020-76450-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K09986, KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-17H05069, KAKENHI-PUBLICLY-20H04899, KAKENHI-PROJECT-18K09398
[雑誌論文] Trans-omic Analysis Reveals ROS-Dependent Pentose Phosphate Pathway Activation after High-Frequency Electrical Stimulation in C2C12 Myotubes2020
- 著者名/発表者名
  Hoshino Daisuke、Kawata Kentaro、Kunida Katsuyuki、Hatano Atsushi、Yugi Katsuyuki、Wada Takumi、Fujii Masashi、Sano Takanori、Ito Yuki、Furuichi Yasuro、Manabe Yasuko、Suzuki Yutaka、Fujii Nobuharu L.、Soga Tomoyoshi、Kuroda Shinya
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 23 号: 10 ページ: 101558-101558
- DOI
  10.1016/j.isci.2020.101558
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-17H02159, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-PROJECT-20H04079, KAKENHI-PROJECT-18K19751
[学会発表] Quantification of RNA-binding Proteins’ effect on target RNA in chronic hypoxia2021
- 著者名/発表者名
  Xiaoning Sun, Kentaro Kawata, Yoko Ogura, Nobuhito Goda, Koh Nakayama, Yoichiro Wada and Nobuyoshi Akimitsu
- 学会等名
  第10回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2021）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[学会発表] ベイズ推定を用いた細胞内RNA分解速度の高精度な推定手法の開発2021
- 著者名/発表者名
  Kentaro Kawata and Nobuyoshi Akimitsu
- 学会等名
  第10回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2021）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[学会発表] Development of a system for simultaneous measurement of RNA synthesis and degradation rates using modified nucleic acids2020
- 著者名/発表者名
  Kentaro Kawata and Nobuyoshi Akimitsu
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[学会発表] 修飾核酸を用いた転写およびRNA分解の同時測定手法の開発2019
- 著者名/発表者名
  川田健太郎、脇田寛泰、関真秀、鈴木穣、秋光信佳
- 学会等名
  第22回日本RNA学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[学会発表] Development of simultaneous measurement system for transcription and RNA degradation rates using modified nucleic acids2019
- 著者名/発表者名
  Kentaro Kawata, Hiroyasu Wakida, Masahide Seki, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu
- 学会等名
  EMBO|EMBL symposia Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[学会発表] Development of simultaneous measurement system for transcription and RNA degradation rates using modified nucleic acid2019
- 著者名/発表者名
  Kentaro Kawata, Hiroyasu Wakida, Yutaka Suzuki, Nobuyoshi Akimitsu
- 学会等名
  The 20th International Conference on Systems Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635
[学会発表] 修飾核酸を用いた転写およびRNA 分解の同時測定手法の開発2019
- 著者名/発表者名
  川田健太郎, 脇田寛泰, 鈴木穣, 秋光信佳
- 学会等名
  第19回東京大学生命科学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635

1. 蕪城俊克

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 秋光信佳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 田中理恵

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

川田 健太郎 Kawata Kentaro

研究課題

研究成果

共同研究者

一細胞転写計測を用いた遺伝子制御ネットワークの動的特性の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

遺伝子制御ネットワークの構築によるサルモネラ菌の薬剤耐性獲得メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] Epitranscriptomics（Regulation of RNA Stability Through RNA Modification）2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] Metabolic labeling of RNA using multiple ribonucleoside analogs enables the simultaneous evaluation of RNA synthesis and degradation rates2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Stability of RNA sequences derived from the coronavirus genome in human cells2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Exploration of <i>Salmonella</i> effector mutant strains on MTR4 and RRP6 degradation2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] Long noncoding RNA U90926 is crucial for herpes simplex virus type 1 proliferation in murine retinal photoreceptor cells2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Trans-omic Analysis Reveals ROS-Dependent Pentose Phosphate Pathway Activation after High-Frequency Electrical Stimulation in C2C12 Myotubes2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Quantification of RNA-binding Proteins’ effect on target RNA in chronic hypoxia2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] ベイズ推定を用いた細胞内RNA分解速度の高精度な推定手法の開発2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of a system for simultaneous measurement of RNA synthesis and degradation rates using modified nucleic acids2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 修飾核酸を用いた転写およびRNA分解の同時測定手法の開発2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of simultaneous measurement system for transcription and RNA degradation rates using modified nucleic acids2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Development of simultaneous measurement system for transcription and RNA degradation rates using modified nucleic acid2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 修飾核酸を用いた転写およびRNA 分解の同時測定手法の開発2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

川田健太郎 Kawata Kentaro