久保直樹 Kubo Naoki

研究者番号	50914280
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, チームディレクター
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2024年度: 大阪大学, 微生物病研究所, 特任講師(常勤) 2022年度 – 2023年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 特任講師 2022年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43050:ゲノム生物学関連 / 生物系 / 小区分43010:分子生物学関連
キーワード	研究代表者 DNAメチル化 / エンハンサー・プロモーター相互作用 / ゲノム３次元構造 / エピゲノム / 生殖細胞 / 初期胚 / 転写制御 / 精子形成 / 細胞分化

研究課題
(3件)
研究成果
(38件)

精子形成過程のDNAメチル化と３Dゲノム変化が織りなす遺伝子制御ネットワークの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  久保直樹
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  大阪大学
CTCFが制御する初期胚発生のゲノム３次元構造変化と遺伝子制御機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  久保直樹
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43010:分子生物学関連
- 研究機関
  九州大学
初期胚の全能性獲得と消失で起こるエンハンサー・プロモーター相互作用のダイナミクス研究代表者
- 研究代表者
  
  久保直樹
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2023
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  九州大学

すべて 2024 2023 2022

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 月間『細胞』、 Vol 56 (3) 2024、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2024
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 総ページ数
  2
- 出版者
  ニューサイエンス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[図書] 月間『細胞』, Vol 56 (3)、2024、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2024
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 総ページ数
  2
- 出版者
  ニューサイエンス社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[図書] Medical Science Digest、Vol 49 (2)、2023、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2024
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 総ページ数
  2
- 出版者
  ニューサイエンス社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[図書] Medical Science Digest、Vol 49 (2)、2023、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 総ページ数
  2
- 出版者
  ニューサイエンス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[雑誌論文] Combined and differential roles of ADD domains of DNMT3A and DNMT3L on DNA methylation landscapes in mouse germ cells2024
- 著者名/発表者名
  Naoki Kubo、Ryuji Uehara、Shuhei Uemura、Hiroaki Ohishi、Kenjiro Shirane、Hiroyuki Sasaki
- 雑誌名
  
  Nature Communications（暫定受理、2024年3月時点）
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[雑誌論文] H3K4me1 facilitates promoter-enhancer interactions and gene activation during embryonic stem cell differentiation2024
- 著者名/発表者名
  Kubo Naoki、Chen Poshen B.、Hu Rong、Ye Zhen、Sasaki Hiroyuki、Ren Bing
- 雑誌名
  
  Molecular Cell
  
  巻: - 号: 9 ページ: 1742-1752.e5
- DOI
  10.1016/j.molcel.2024.02.030
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037, KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[雑誌論文] Combined and differential roles of ADD domains of DNMT3A and DNMT3L on DNA methylation landscapes in mouse germ cells2024
- 著者名/発表者名
  Naoki Kubo、Ryuji Uehara、Shuhei Uemura、Hiroaki Ohishi、Kenjiro Shirane、Hiroyuki Sasaki
- 雑誌名
  
  Nature Communications (暫定受理、2024年3月時点)
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[雑誌論文] ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 雑誌名
  
  Medical Science Digest
  
  巻: 49 ページ: 40-41
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[雑誌論文] The DNMT3A ADD domain is required for efficient de novo DNA methylation and maternal imprinting in mouse oocytes2023
- 著者名/発表者名
  Uehara Ryuji、Au Yeung Wan Kin、Toriyama Keisuke、Ohishi Hiroaki、Kubo Naoki、Toh Hidehiro、Suetake Isao、Shirane Kenjiro、Sasaki Hiroyuki
- 雑誌名
  
  PLOS Genetics
  
  巻: 19 号: 8 ページ: e1010855-e1010855
- DOI
  10.1371/journal.pgen.1010855
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037, KAKENHI-PROJECT-22K15084, KAKENHI-PROJECT-22K06174, KAKENHI-PROJECT-18K06095, KAKENHI-PROJECT-22K15125, KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[雑誌論文] ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 雑誌名
  
  Medical Science Digest
  
  巻: 49 ページ: 40-41
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] Fine-tuned Gene Expression Dynamics Regulated by Non-coding Regions2024
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  Young Scientists Networking Symposium 2024
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] Fine-tuned Gene Expression Dynamics Regulated by Non-coding Regions2024
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  Young Scientists Networking Symposium 2024
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] Dynamics of chromatin organization at distal enhancers during cell differentiation2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  Human Genetics Asia 2023
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] 卵子・精子のDNAメチル化修飾におけるDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム第5回公開シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) のヒストンメチル化活性依存的または非依存的なエンハンサーによる、細胞分化過程におけるクロマチン構造変化と遺伝子制御の仕組み2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第46回　分子生物学会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2ファミリータンパク質によるES細胞の分化過程におけるエンハンサー活性とクロマチン構造変化2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム第5回公開シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] 生殖細胞のDNAメチル化へのDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム若手勉強会 2023
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] 細胞分化における遠位エンハンサーとクロマチン構造変化の役割2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第21回ゲノム医科学とバイオインフォマティクスの接点と集学研究
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] Dynamics of chromatin organization at distal enhancers during cell differentiation2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  Human Genetics Asia 2023
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) histone methyltranferase activity dependent chromatin organization at enhancers during embryonic stem cell differentiation2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第16回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] 細胞分化における遠位エンハンサーとクロマチン構造変化の役割2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第21回ゲノム医科学とバイオインフォマティクスの接点と集学研究
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) のヒストンメチル化活性によるES 細胞分化過程におけるクロマチン構造制御と転写制御2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム若手勉強会 2023
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] "KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) のヒストンメチル化活性によるES 細胞分化過程におけるクロマチン構造制御と転写制御"2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム若手勉強会 2023
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2ファミリータンパク質によるES細胞の分化過程におけるエンハンサー活性とクロマチン構造変化2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム第5回公開シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] "生殖細胞のDNAメチル化へのDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割"2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム若手勉強会 2023
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) のヒストンメチル化活性依存的または非依存的なエンハンサーによる、細胞分化過程におけるクロマチン構造変化と遺伝子制御の仕組み2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第46回　分子生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) histone methyltranferase activity dependent chromatin organization at enhancers during embryonic stem cell differentiation2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第16回日本エピジェネティクス研究会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] 卵子・精子のDNAメチル化修飾におけるDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割2023
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  全能性プログラム第5回公開シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) histone methyltranferase activity dependent chromatin organization at enhancers during embryonic stem cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  The International Symposium on Totipotency and Germ Cell Development
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) histone methyltranferase activity dependent chromatin organization at enhancers during embryonic stem cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  The International Symposium on Totipotency and Germ Cell Development
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) histone methyltranferase activity dependent chromatin organization at enhancers during embryonic stem cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  Cold Spring Habor Laboratory Meetings（epigenetics & chromatin)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] 細胞分化におけるエンハンサー・プロモーター相互作用のダイナミクス2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第67回日本人類遺伝学会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] Dynamics of enhancer-promoter contacts during cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第95回日本生化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] Dynamics of CTCF-dependent and -independent enhancer-promoter contacts during cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  The 29th Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists Conference & the 2022 Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology Conference
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] 細胞分化におけるエンハンサー・プロモーター相互作用のダイナミクス2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第67回日本人類遺伝学会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] Dynamics of CTCF-dependent and -independent enhancer-promoter contacts during cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  The 29th Federation of Asian and Oceanian Biochemists and Molecular Biologists Conference & the 2022 Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology Conference
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04675
[学会発表] KMT2C/KMT2D (MLL3/MLL4) histone methyltranferase activity dependent chromatin organization at enhancers during embryonic stem cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  Cold Spring Habor Laboratory Meetings（epigenetics & chromatin)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037
[学会発表] Dynamics of enhancer-promoter contacts during cell differentiation2022
- 著者名/発表者名
  久保直樹
- 学会等名
  第95回日本生化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K15037

久保 直樹 Kubo Naoki

研究課題

研究成果

精子形成過程のDNAメチル化と３Dゲノム変化が織りなす遺伝子制御ネットワークの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

CTCFが制御する初期胚発生のゲノム３次元構造変化と遺伝子制御機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

初期胚の全能性獲得と消失で起こるエンハンサー・プロモーター相互作用のダイナミクス研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 月間『細胞』、 Vol 56 (3) 2024、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2024

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 月間『細胞』, Vol 56 (3)、2024、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2024

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Medical Science Digest、Vol 49 (2)、2023、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2024

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] Medical Science Digest、Vol 49 (2)、2023、ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2023

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Combined and differential roles of ADD domains of DNMT3A and DNMT3L on DNA methylation landscapes in mouse germ cells2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] H3K4me1 facilitates promoter-enhancer interactions and gene activation during embryonic stem cell differentiation2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Combined and differential roles of ADD domains of DNMT3A and DNMT3L on DNA methylation landscapes in mouse germ cells2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2023

著者名/発表者名

雑誌名

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[雑誌論文] The DNMT3A ADD domain is required for efficient de novo DNA methylation and maternal imprinting in mouse oocytes2023

著者名/発表者名

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[雑誌論文] ゲノム３次元構造が司る遺伝子制御2023

著者名/発表者名

雑誌名

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[学会発表] Fine-tuned Gene Expression Dynamics Regulated by Non-coding Regions2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Fine-tuned Gene Expression Dynamics Regulated by Non-coding Regions2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Dynamics of chromatin organization at distal enhancers during cell differentiation2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 卵子・精子のDNAメチル化修飾におけるDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割2023

久保直樹 Kubo Naoki

[学会発表] 生殖細胞のDNAメチル化へのDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割2023

[学会発表] "生殖細胞のDNAメチル化へのDNMT3AとDNMT3LのADDドメインの協調的役割"2023