斎藤稔 SAITO Minoru

… 別表記

齋藤稔 SAITO Minoru

斉藤稔サイトウミノル

研究者番号	60196011
外部サイト
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2011年度 – 2013年度: 弘前大学, 理工学研究科, 教授 2007年度 – 2010年度: 弘前大学, 大学院・理工学研究科, 教授 2009年度: 弘前大学, 理工学部, 教授 2008年度: 弘前大学, 理工学研究科, 教授 2005年度 – 2007年度: 弘前大学, 理工学部, 教授 1999年度 – 2003年度: 弘前大学, 理工学部, 教授
審査区分/研究分野	研究代表者理工系 / 生体生命情報学 / 生物系 / 基礎ゲノム科学 / ポストゲノムのナノサイエンス / 生物物理学研究代表者以外生物生産化学・生物有機化学 / 構造生物化学 / 生物分子科学
キーワード	研究代表者分子動力学シミュレーション / 蛋白質 / アミノ酸置換 / 自由エネルギー計算 / 熱安定性 / 変性状態 / 天然状態 / protein / molecular dynamics simulation / 並列計算機 … もっと見る / シミュレーション / 結合自由エネルギー / 予測 / 酵素反応 / force field parameter / quasi canonical orbital / localized orbital / ab initio all electron calculation / atomic charge / 力場パラメタ / 疑似カノニカル分子軌道 / 局在化軌道 / 非経験的全電子計算 / 原子電荷 / molecular substitution / MD simulation / free energy calculation / binding affinity / DNA binding protein / computer experiment / 塩基配列の認識 / 塩基置換 / 塩基配列 / DNA / 分子置換 / 結合親和力 / DNA結合蛋白質 / 計算機実験 / parallelization / parallel computer / amino acid substitution / prediction / thermal stability / 並列化 / スーパーコンピュータ / 変性構造 / 立体構造 / 変異体蛋白質 / 超好熱菌 / サブユニット / 四次構造変化 / ヘモグロビン / 生体生命情報学 / 回転拡散係数 / 構造変化 / パッキング / ラクトアルブミン / フォールディング / 拡散係数 / 内部空洞 / シャペロニン / 反応場 / 分子シミュレーション / 化学物理 / ハイパフォーマンスコンピューティング / 自由エネルギー摂動法 / タンパク質 … もっと見る研究代表者以外水和水 / 水素原子 / NMR / 動力学計算 / 熱化学実験 / 安定誘導体の合成 / 多糖 / 酵素反応遷移状態配座 / エンド型グリコシダーゼ / 化学合成 / 遷移状態アナログ / 硫黄置換誘導体 / 基質アナログ / エンドポリガラクツロナーゼ / セルラーゼ / エンドグリコシダーゼ / 複合体形成 / 基質ミミック / 反応機構 / endo型グリコシダーゼ / 創薬標的タンパク質 / 結晶構造 / 中性子解析 / タンパク質 / 創薬標的分子 / 薬物設計 / シミュレーション / 脱水和 / 熱測定 / 中性子回折隠す

熱安定性計算による超好熱菌蛋白質の変性状態構造と耐熱化機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  斎藤稔
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  弘前大学
大規模分子シミュレーションによるヘモグロビンの新たな四次構造変化の提唱と実証研究代表者
- 研究代表者
  
  斎藤稔
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2010
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  弘前大学
蛋白質の中性子構造解析を推進するための技術的基盤の確立
- 研究代表者
  
  黒木良太
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2009
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  独立行政法人日本原子力研究会発機構
多糖-endo型グリコシダーゼ複合体解析に基づく反応機構解明研究
- 研究代表者
  
  橋本勝
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物生産化学・生物有機化学
- 研究機関
  弘前大学
制限空間内水溶液の特殊な物理化学的性質が蛋白質の折れ畳に及ぼす影響研究代表者
- 研究代表者
  
  斎藤稔
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  弘前大学
生体高分子の機能発現における水素・水和水の静的・動的な役割の実証
- 研究代表者
  
  黒木良太
- 研究期間 (年度)
  2005
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物分子科学
- 研究機関
  独立行政法人日本原子力研究開発機構
蛋白質の全電子計算手法を統合した高精度分子動力学シミュレーション法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  斎藤稔
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2006
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  基礎ゲノム科学
- 研究機関
  弘前大学
熱安定性計算に基づいた蛋白質の変性状態の構造予測研究代表者
- 研究代表者
  
  齋藤稔
- 研究期間 (年度)
  2003
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  弘前大学
熱安定性計算に基づいた蛋白質の変性状態の構造予測研究代表者
- 研究代表者
  
  齋藤稔
- 研究期間 (年度)
  2002
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  弘前大学
計算機実験による核酸結合蛋白質の塩基配列認識能力の予測と制御研究代表者
- 研究代表者
  
  齋藤稔
- 研究期間 (年度)
  2002 – 2003
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ポストゲノムのナノサイエンス
- 研究機関
  弘前大学
アミノ酸置換による蛋白質中の化学反応場の制御研究代表者
- 研究代表者
  
  斉藤稔 (斎藤稔)
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2001
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  弘前大学
計算機実験による蛋白質の熱安定性の予測と制御研究代表者
- 研究代表者
  
  齋藤稔 (斎藤稔)
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2001
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  弘前大学
アミノ酸置換による蛋白質中の化学反応場の制御研究代表者
- 研究代表者
  
  斎藤稔
- 研究期間 (年度)
  1999
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  弘前大学

すべて 2013 2010 2009 2008 2007 2005

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] シミュレーション2013
- 著者名/発表者名
  佐藤文明、斎藤稔、石原進、渡辺尚
- 総ページ数
  243
- 出版者
  共立出版
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23500366
[雑誌論文] Force-Field Parameters of the C and F Around Glycosidic Bonds to Oxveen and Sulfur Atoms2009
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito, Isao Okazaki
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem 30(Articles online in advance of print)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19380064
[雑誌論文] Force-field parameters of the Ψ and Φ aroud glycosidic bonds to oxygen and sulfur atoms2009
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito, Isao Okazaki
- 雑誌名
  
  J.Comput.Chem. 30
  
  ページ: 2656-2665
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20500268
[雑誌論文] Force- Field Parameters of the C and F Around Glycosidic Bonds to Oxygen and Sulfur Atoms2009
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito, Isao Okazaki
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19380064
[雑誌論文] Large Scale MD Simulations of Proteins on the Earth Simulator : Quaternary Structural Changes of Hemoglobin2009
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito
- 雑誌名
  
  Annual Report of the Earth Simulator Cent er, April 2008-March 2009 (印刷中)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20500268
[雑誌論文] Large Scale MD Simulations of Proteins on the Earth Simulator : Quaternary Structural Changes of Hemoglobin2008
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito
- 雑誌名
  
  Annual Report of the Earth Simulator Center
  
  ページ: 261-265
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20500268
[雑誌論文] A 45-ns molecular dynamics simulation of hemoglobin in water by vectorizing and parallelizing COSMOS90 on the Earth Simulator : dynamics of tertiary and quaternary structures2007
- 著者名/発表者名
  M.Saito, I.Okazaki
- 雑誌名
  
  J.Comput.Chem. 28
  
  ページ: 1129-1136
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17510156
[雑誌論文] A 45-ns molecular dynamics simulation of hemoglobin in water by vectorizing and parallelizing COSMOS90 on the Earth Simulator : dynamics of tertiary and quaternary structures2007
- 著者名/発表者名
  M.Saito, I.Okazaki
- 雑誌名
  
  J. Comput. Chem. 28
  
  ページ: 1129-1136
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17510156
[雑誌論文] ns molecular dynamics simulation of hemoglobin in water by vectorizing and parallelizing COSMOS90 on the Earth Simulator : dynamics of tertiary and quaternary structures2007
- 著者名/発表者名
  M.Saito, I.Okazaki A 45
- 雑誌名
  
  J.Comput.Chem. 28
  
  ページ: 1129-1136
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18031003
[雑誌論文] 地球シミコ-レータによる蛋白質の大規模シミュレーション : ベクトル化と並列化による加速性能2005
- 著者名/発表者名
  斎藤稔
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌 46, No. SIG7 (ACS10)
  
  ページ: 9-17
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17510156
[雑誌論文] Large Scale Simulations of Proteins on the Earth Simulator : Acceleration Performance by Vectorization and Parallelization2005
- 著者名/発表者名
  M.Saito
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Advanced Computing Systems 10
  
  ページ: 9-17
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17510156
[雑誌論文] 地球シミュレータによる蛋白質の大規模シミュレーション:ベクトル化と並列化による加速性能2005
- 著者名/発表者名
  斎藤稔
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌 46,No.SIG7(ACS10)
  
  ページ: 9-17
- NAID
  110002768762
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17510156
[学会発表] MD simulations of hemoglobin in water with all degrees of freedom for different oxygen binding states and quaternary structures2010
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito
- 学会等名
  The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
- 発表場所
  Tohoku University (Sendai, Japan)
- 年月日
  2010-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20500268
[学会発表] MD simulations of hemoglobin in water with all degrees of freedom for different oxygen binding states and quaternary structures2010
- 著者名/発表者名
  Minoru Saito
- 学会等名
  The 48^<th> Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
- 発表場所
  Tohoku University (Sendai, Japan)
- 年月日
  2010-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20500268
[学会発表] endo-PG反応機構解明を目指した二環性遷移状態基質アナログの合成研究2008
- 著者名/発表者名
  山本和範、工藤慎士、斎藤稔、橋本勝
- 学会等名
  日本農芸化学会東北支部143大会
- 発表場所
  弘前
- 年月日
  2008-10-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19380064
[学会発表] 水中のヘモグロビンの四次構造変化のシミュレーション2008
- 著者名/発表者名
  斎藤稔
- 学会等名
  第46回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-06-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20500268
[学会発表] 水中のシャペロニンの全自由度分子動力学シミュレーション2007
- 著者名/発表者名
  斎藤稔, 岡崎功
- 学会等名
  日本蛋白質科学会
- 発表場所
  仙台国際センター
- 年月日
  2007-05-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18031003

1. 岡崎功 (60332491)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 5件
2. 城所俊一 (80195320)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
3. 黒木良太 (30391246)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
4. 玉田太郎 (50391248)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
5. 安達基泰 (60293958)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 海野久雄 (20399421)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 大原高志 (60391249)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 岡崎伸生 (60391900)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 栗原和男 (50354890)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 橋本勝 (40212138)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 宮入一夫 (10003526)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 清水弘樹 (30344716)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 清水哲哉 (80435651)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 長井雅子 (60019578)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 森元聡 (60191045)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 米本照代 (30265714)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

斎藤 稔 SAITO Minoru

齋藤 稔 SAITO Minoru

斉藤 稔 サイトウ ミノル

研究課題

研究成果

共同研究者

熱安定性計算による超好熱菌蛋白質の変性状態構造と耐熱化機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

大規模分子シミュレーションによるヘモグロビンの新たな四次構造変化の提唱と実証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

蛋白質の中性子構造解析を推進するための技術的基盤の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

多糖-endo型グリコシダーゼ複合体解析に基づく反応機構解明研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

制限空間内水溶液の特殊な物理化学的性質が蛋白質の折れ畳に及ぼす影響研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

生体高分子の機能発現における水素・水和水の静的・動的な役割の実証

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

蛋白質の全電子計算手法を統合した高精度分子動力学シミュレーション法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

熱安定性計算に基づいた蛋白質の変性状態の構造予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

熱安定性計算に基づいた蛋白質の変性状態の構造予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

計算機実験による核酸結合蛋白質の塩基配列認識能力の予測と制御研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

アミノ酸置換による蛋白質中の化学反応場の制御研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

計算機実験による蛋白質の熱安定性の予測と制御研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

アミノ酸置換による蛋白質中の化学反応場の制御研究代表者

研究代表者

斎藤稔 SAITO Minoru

齋藤稔 SAITO Minoru

斉藤稔サイトウミノル