徐泰健 SEO Tae-kun

研究者番号	60401189
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2011年度: 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 特任助教 2008年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任助教 2007年度 – 2008年度: 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 特任助教 2006年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任助手 2005年度 – 2006年度: 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 特任助手
審査区分/研究分野	研究代表者生物多様性・分類 / 進化生物学研究代表者以外統計科学
キーワード	研究代表者分子進化 / 刺胞動物 / ベイズ推定 / 進化速度 / 分岐年代 / 集団遺伝 / ブートストラップ確率 / 距離行列法 / 分子系統樹研究代表者以外 convergent evolution … もっと見る / Bayesian hierarchical model / recombination / population structure and history / sequence and structure / adaptation to the host / viral evolution / quasispecies / 収斂進化 / 階層ベイズ / ゲノムの組換え / 集団構造と履歴 / 配列進化と構造進化 / 宿主適応 / ウイルス分子進化隠す

ゲノム情報を用いた生物種判別と集団遺伝解析に対する統計的手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  徐泰健
- 研究期間 (年度)
  2011
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物多様性・分類
- 研究機関
  東京大学
複数の遺伝子を用いる系統樹推定の統計的手法開発研究代表者
- 研究代表者
  
  徐泰健
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  進化生物学
- 研究機関
  東京大学
極限状態下微小生物の遺伝的変異と適応進化の階層モデルおよび解析手法の開発
- 研究代表者
  
  岸野洋久
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2006
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  統計科学
- 研究機関
  東京大学

すべて 2012 2011 2009 2008 2007 2006 2005 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Estimation of divergence times in cnidarian evolution based on mitochondrial protein-coding genes and the fossil record2012
- 著者名/発表者名
  Eunji Park, Dae-Sik Hwang, Jae-Seong Lee, Jun-Im Song, Tae-Kun Seo, Yong-Jin Won
- 雑誌名
  
  Molecular Phylogenetics and Evolution
  
  巻: 62 号: 1 ページ: 329-345
- DOI
  10.1016/j.ympev.2011.10.008
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570108
[雑誌論文] Statistical comparison of nucleotide-, amino-acid-, and codon-substit ution models for evolutionary analysis of protein-coding sequences2009
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo and Hirohisa Kishino
- 雑誌名
  
  Systematic Biology (未定)(in press)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Classification of nucleotide sequences using Support Vector Machines2009
- 著者名/発表者名
  Seo T-K
- 雑誌名
  
  (submitted)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Rates of nucleotide substitution in Cornaceae (Cornales)-correlation between molecular variation and morphological change2008
- 著者名/発表者名
  Xiang, Q-Y, Thorne, J, Seo, T-K, Zhang, W., Thomas, D.,Ricklefs, R.
- 雑誌名
  
  Molecular Phylogenetics and Evolution 49
  
  ページ: 327-342
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Rates of nucleotide substitution in Cornaceae (Cornales)-correlation between molecular variation and morphological change, Mol2008
- 著者名/発表者名
  Xiang, Q-Y, Thorne, J, Seo, T-K, Zhang, W., Thomas, D.,Ricklefs, R
- 雑誌名
  
  Phylogenet. Evol. 49
  
  ページ: 327-342
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] コドンモデルを用いた分岐年代のベイズ推定 (掲載決定)2008
- 著者名/発表者名
  徐泰健、岸野洋久、Jeffrey Thorne
- 雑誌名
  
  統計数理 (未定)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] コドンモデルを用いた分岐年代のベイズ推定2008
- 著者名/発表者名
  徐泰健、岸野洋久、Jeffrey Thorne
- 雑誌名
  
  統計数理 56
  
  ページ: 37-54
- NAID
  120006019013
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] 遺伝子型の分子進化と表現型の適応進化(掲載決定)2008
- 著者名/発表者名
  渡部輝明、徐泰健、岸野洋久
- 雑誌名
  
  統計数理 (未定)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] コドンモデルを用いた分岐年代のベイズ推定2008
- 著者名/発表者名
  徐泰健, 岸野洋久, Jeffrey L. Thorne
- 雑誌名
  
  統計数理 56
  
  ページ: 37-54
- NAID
  120006019013
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Calculating Bootstrap Probabilities of Phylogeny Using Multilocus Sequence Data2008
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo
- 雑誌名
  
  Molecular Biology and Evolution 25
  
  ページ: 960-971
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2008
- 著者名/発表者名
  Seo T-K, Kishino H
- 雑誌名
  
  Syst. Biol. 57
  
  ページ: 367-377
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2008
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo and Hirohisa Kishino
- 雑誌名
  
  Systematic Biology (未定)(in press)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Calculating bootstrap probabilities of phylogeny using multilocus sequence data2008
- 著者名/発表者名
  Seo T-K
- 雑誌名
  
  Mol. Biol. Evol. 25
  
  ページ: 960-971
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2008
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo and Hirohisa Kishino
- 雑誌名
  
  Systematic Biology 57
  
  ページ: 367-377
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] 遺伝子型の分子進化と表現型の適応進化2008
- 著者名/発表者名
  渡部輝明、徐泰健、岸野洋久
- 雑誌名
  
  統計数理 56
  
  ページ: 55-66
- NAID
  120006019009
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] 遺伝子型の分子進化と表現型の適応進化2008
- 著者名/発表者名
  渡部輝明, 徐泰健, 岸野洋久
- 雑誌名
  
  統計数理 56
  
  ページ: 55-66
- NAID
  120006019009
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[雑誌論文] Incorporating gene-specific variation when inferring and evaluating optimal evolutionary tree topologies from multilocus sequence data.2005
- 著者名/発表者名
  Seo, T.-K., Kishino.H., Thorne, J.L.
- 雑誌名
  
  Proceedings of National Academy of Sciences, USA. 102
  
  ページ: 4436-4441
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300086
[雑誌論文] Incorporating gene-specific variation when inferring and evaluating optimal evolutionary tree topologies from multilocus sequence data.2005
- 著者名/発表者名
  Seo, T.-K., Kishino, H., Thorne, J.L
- 雑誌名
  
  Proceedings of National Academy of Sciences, USA. 102
  
  ページ: 4436-4441
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300086
[雑誌論文] Incorporating gene-specific variation when inferring and evaluating optimal evolutionary tree topologies from multilocus sequence data.2005
- 著者名/発表者名
  Seo T-K, H Kishino, JL Thorne
- 雑誌名
  
  Proceedings of National Academy of Sciences, USA. 102
  
  ページ: 4436-4441
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16300086
[雑誌論文] Statistical comparison of nucleotide, amino acid, and codon substitution models for evolutionary analysis of protein-coding sequences
- 著者名/発表者名
  Seo T-K, Kishino H
- 雑誌名
  
  Syst. Biol. (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Statistical analysis of molecular sequences for phylogenetics and population genetics(韓国語訳)2011
- 著者名/発表者名
  徐泰健
- 学会等名
  韓国海洋生物科学研究者協議会
- 発表場所
  韓国海洋研究院(招待セミナー)
- 年月日
  2011-11-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570108
[学会発表] Statistical Comparison of Nucleotide-, Amino-Acid-, and Codon-Substitution Models for Evolutionary Analysis of Protein-Coding Sequences2008
- 著者名/発表者名
  Seo, T-K, Kishino, H
- 学会等名
  SMBE meeting
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Statistical Comparison of Nucleotide-, Amino-Acid-, and Codon-Substitution Models for Evolutionary Analysis of Protein-Coding Sequences2008
- 著者名/発表者名
  Seo, T-K, Kishino, H
- 学会等名
  日本進化学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Statistical comparison of nucleotide-, amino-acid-, and codon-substit ution models for evolutionary analysis of protein-coding sequences2008
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo and Hirohisa Kishino
- 学会等名
  Annual Meeting of SMBE 2008
- 発表場所
  Barcelona, Spain
- 年月日
  2008-06-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Statistical comparison of nucleotide-, amino-acid-, and codon-substit ution models for evolutionary analysis of protein-coding sequences2008
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo and Hirohisa Kishino
- 学会等名
  日本進化学会
- 発表場所
  東京
- 年月日
  2008-08-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Bayesian Divergence Time Estimation Using Codon Models2007
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo
- 学会等名
  Annual meeting of the Korean Society of Biological Sciences
- 発表場所
  Seoul, Korea
- 年月日
  2007-08-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2007
- 著者名/発表者名
  徐泰健
- 学会等名
  第九回日本進化学会
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2007-09-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Synonymous substitution substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2007
- 著者名/発表者名
  Seo, T-K., Kishino, H
- 学会等名
  SMBE meeting
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2007
- 著者名/発表者名
  Tae-Kun Seo
- 学会等名
  Annual meeting of the Society of Molecular Biology and Evolution
- 発表場所
  Halifax, Canada
- 年月日
  2007-06-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Synonymous substitution substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2007
- 著者名/発表者名
  Seo, T-K, Kishino, H
- 学会等名
  日本進化学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Calculating bootstrap probabilities of phylogeny using multilocus sequence data2006
- 著者名/発表者名
  Seo, T-K
- 学会等名
  SMBE meeting
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216
[学会発表] Thorne Estimating absolute rates of synonymous and nonsynonymous nucleotide substitution in order to characterize natural selection and date species divergences2006
- 著者名/発表者名
  Seo T-K, Kishino H. Jeffrey L
- 学会等名
  日本進化学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18770216

1. 岸野洋久 (00141987)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
2. 北添康弘 (90112010)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 渡部輝明 (90325415)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

徐 泰健 SEO Tae-kun

研究課題

研究成果

共同研究者

ゲノム情報を用いた生物種判別と集団遺伝解析に対する統計的手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

複数の遺伝子を用いる系統樹推定の統計的手法開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

極限状態下微小生物の遺伝的変異と適応進化の階層モデルおよび解析手法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Estimation of divergence times in cnidarian evolution based on mitochondrial protein-coding genes and the fossil record2012

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Statistical comparison of nucleotide-, amino-acid-, and codon-substit ution models for evolutionary analysis of protein-coding sequences2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Classification of nucleotide sequences using Support Vector Machines2009

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Rates of nucleotide substitution in Cornaceae (Cornales)-correlation between molecular variation and morphological change2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Rates of nucleotide substitution in Cornaceae (Cornales)-correlation between molecular variation and morphological change, Mol2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] コドンモデルを用いた分岐年代のベイズ推定 (掲載決定)2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] コドンモデルを用いた分岐年代のベイズ推定2008

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] 遺伝子型の分子進化と表現型の適応進化(掲載決定)2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] コドンモデルを用いた分岐年代のベイズ推定2008

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] Calculating Bootstrap Probabilities of Phylogeny Using Multilocus Sequence Data2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Calculating bootstrap probabilities of phylogeny using multilocus sequence data2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Synonymous substitutions substantially improve evolutionary inference from highly diverged proteins2008

著者名/発表者名

雑誌名

徐泰健 SEO Tae-kun