奥田昌彦 Okuda Masahiko

研究者番号	60448686
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 特任准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 特任准教授 2016年度 – 2019年度: 横浜市立大学, 生命医科学研究科, 特任准教授 2009年度 – 2013年度: 横浜市立大学, 生命ナノシステム科学研究科, 特任助教 2008年度: 横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 特任助教 2007年度: 横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 客員研究員
審査区分/研究分野	研究代表者構造生物化学 / 小区分43020:構造生物化学関連研究代表者以外小区分43020:構造生物化学関連
キーワード	研究代表者 NMR / 立体構造 / 基本転写因子 / RNAポリメラーゼ / タンパク質 / 転写 / 構造生物学 / タンパク複合体 / 遺伝子発現 / タンパク質間相互作用 … もっと見る / RNAポリメラーゼII / 複合体 / 溶液構造 / 天然変性領域 / 転写開始 / TFIIH / TFIIE / 基本転写 / 遣伝子発現 / 蛋白質 / 核磁気共鳴法 … もっと見る研究代表者以外 NMR / ヘテロクロマチン / ユークロマチン / 構造生物学 / ＮＭＲ / クロマチン構造隠す

RNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHの特異的相互作用の普遍性と特異性研究代表者
- 研究代表者
  
  奥田昌彦
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  横浜市立大学
クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析
- 研究代表者
  
  西村善文
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  横浜市立大学
ヒトRNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHとの複合体の構造モデルの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  奥田昌彦
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43020:構造生物化学関連
- 研究機関
  横浜市立大学
ヒトRNAポリメラーゼIIと基本転写因子TFIIHのNMR法による複合体構造解明研究代表者
- 研究代表者
  
  奥田昌彦
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  横浜市立大学
ヒト基本転写因子ＴＦＩＩＥのＮＭＲ法による全長構造の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  奥田昌彦
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  横浜市立大学
ヒト基本転写因子TFIIEの完全長複合体のNMR法による立体構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  奥田昌彦
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2010
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  横浜市立大学
ヒト基本転写因子TFIIEの全体構造解明に向けたNMRによるドメイン構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  奥田昌彦
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  横浜市立大学

すべて 2023 2022 2021 2011 2010 2009 2008 2007

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Structural polymorphism of the PH domain in TFIIH2023
- 著者名/発表者名
  Okuda Masahiko、Nishimura Yoshifumi
- 雑誌名
  
  Bioscience Reports
  
  巻: 43 号: 7
- DOI
  10.1042/bsr20230846
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06035
[雑誌論文] Dynamic structures of intrinsically disordered proteins related to the general transcription factor TFIIH, nucleosomes, and histone chaperones2022
- 著者名/発表者名
  Okuda Masahiko、Tsunaka Yasuo、Nishimura Yoshifumi
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: 14 号: 6 ページ: 1449-1472
- DOI
  10.1007/s12551-022-01014-9
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06021, KAKENHI-PROJECT-21K06035, KAKENHI-PROJECT-18K06064
[雑誌論文] Structural insight into the TFUE/THIE1 interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH2008
- 著者名/発表者名
  Okuda, M., Tanaka, A, Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal 27
  
  ページ: 1161-1171
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esal presumed chromodomain2008
- 著者名/発表者名
  Shimojo, H., Sano, N., Moriwaki, Y., Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Biology 378
  
  ページ: 987-1001
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esa1 presumed chromodomain.2008
- 著者名/発表者名
  Shimojo, H., Sano, N., Moriwaki, Y., Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
- 雑誌名
  
  J. Mol. Biol. 378
  
  ページ: 987-1001
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution2008
- 著者名/発表者名
  Akashi, S., Nagakura, S., Yamamoto, S., Okuda, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
- 雑誌名
  
  Protein Science 17
  
  ページ: 389-400
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Structural insight into the TFIIE-TFIIH interaction: TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH.2008
- 著者名/発表者名
  Okuda M., Tanaka A., Satoh M., Mizuta S., Takazawa M., Ohkuma Y., Nishimura Y.
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal 27
  
  ページ: 1161-1171
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Structural insight into the TFIIE/TFIIH interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH.2008
- 著者名/発表者名
  Okuda, M., Tanaka, A., Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
- 雑誌名
  
  EMBO J. 27
  
  ページ: 1161-1171
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] 基本転写因子TmEの構造とTFIIHとの相互作用2008
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、西村善文
- 雑誌名
  
  生化学 80
  
  ページ: 501-510
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] 基本転写因子TFIIEの構造とTFIIHとの相互作用2008
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、西村善文
- 雑誌名
  
  生化学特集号 80
  
  ページ: 501-510
- NAID
  10021192114
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution.2008
- 著者名/発表者名
  Akashi, S., Nagakura, S., Yamamoto, S., Okuda, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.,
- 雑誌名
  
  Protein Sci. 17
  
  ページ: 389-400
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[雑誌論文] Structural polymorphism of chromodomains in Chd1.2007
- 著者名/発表者名
  Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
- 雑誌名
  
  J Mol Biol. 365
  
  ページ: 1047-1062
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[学会発表] ヒトRNAポリメラーゼと基本転写/修復因子TFIIHの新たな相互作用の構造生物学的研究2022
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦, 諏訪哲史, 鈴木秀文, 山口雄輝, 西村善文
- 学会等名
  日本分子生物学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06035
[学会発表] RNAポリメラーゼと基本転写/修復因子TFIIHの新たな相互作用2021
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、諏訪哲史、鈴木秀文、山口雄輝、西村善文
- 学会等名
  第39回染色体ワークショップ・第19回核ダイナミクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06035
[学会発表] 本転写因子TFIIEαのイオンモビリティ質量分析2011
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、廣瀬賢治、川瀬泰司、押方基二、西村善文基
- 学会等名
  日本生化学学会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- 年月日
  2011-09-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570144
[学会発表] 基本転写因子TFIIEαのイオンモビリティ質量分析2011
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、廣瀬賢治、川瀬泰司、押方基二、西村善文
- 学会等名
  日本生化学学会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570144
[学会発表] Structural analysis for 85 kDa protein complex, general transcription factor TFIIE by NMR spectroscopy2011
- 著者名/発表者名
  Okuda M, Moriwaki Y, Kataoka M, Nagadoi A, Tanaka A, OhkumaY, Nishimura Y.
- 学会等名
  The International Symposium on Nuclear Magnetic Resonance
- 発表場所
  Osanbashi Hall (Yokohama, Japan)
- 年月日
  2011-11-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23570144
[学会発表] NMR STRUCTURE OF A GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE2010
- 著者名/発表者名
  西村善文, 奥田昌彦
- 学会等名
  XXIVth ICMRBS(International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems)
- 発表場所
  ケアンズ、ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析2010
- 著者名/発表者名
  田中亜紀, 水田翔子, 奥田昌彦, 西村善文, 大熊芳明
- 学会等名
  ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
- 発表場所
  東京国際フォーラム(東京都)
- 年月日
  2010-03-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] 転写制御因子、ヒストン修飾因子の構造生物学2010
- 著者名/発表者名
  長土居有隆, 奥田昌彦, 明石知子, 西村善文
- 学会等名
  ターゲットタンパク研究プログラム研究交流会
- 発表場所
  東京国際フォーラム(東京都)
- 年月日
  2010-03-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] NMR STRUCTURE OF A GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIE2010
- 著者名/発表者名
  Y.Nishimura, M.Okuda
- 学会等名
  XXIVth ICMRBS (International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems)
- 発表場所
  ケアンズコンベンションセンター(オーストラリア・ケアンズ)
- 年月日
  2010-08-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] 基本転写因子TFIIEとそれと相互作用するタンパク質群の機能解析2010
- 著者名/発表者名
  田中亜紀, 水田翔子, 奥田昌彦, 西村善文, 大熊芳明
- 学会等名
  ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
- 発表場所
  新神戸(兵庫県)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] 転写制御因子、ピストン修飾因子の構造生物学2010
- 著者名/発表者名
  長土居有隆, 奥田昌彦, 明石知子, 西村善文
- 学会等名
  ターゲットタンパク研究プログラム基本生命WG班会議
- 発表場所
  新神戸(兵庫県)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] ヒト基本転写因子TFIIE alpha 酸性ドメインの動的構造解析2009
- 著者名/発表者名
  小松正史, 奥田昌彦, 長土居有隆, 菅瀬謙治, 西村善文
- 学会等名
  第48回NMR討論会
- 発表場所
  九州大学医学部百年講堂(福岡県)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] Intrinsically Disordered Transcription related Proteins2009
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦, 長土居有隆, 小松正史, 西村善文
- 学会等名
  第3回アジア-太平洋NMRシンポジウム(APNMR)
- 発表場所
  Ramada Plaza Jeju Hotel(韓国)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21770121
[学会発表] ヒト基本転写因子TFIIEαの酸性ドメインとヒト基本転写因子TFIIHp62のPHドメインとの複合体の溶液構造2008
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、田中亜紀、佐藤真奈美、水田翔子、高澤学、大熊芳明、西村善文
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  兵庫県神戸市、神戸ポートアイランド
- 年月日
  2008-12-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[学会発表] ヒト基本転写因子TFIIEαの酸性ドメインとヒト基本転写因子TFIIH p62のPHドメインとの複合体の溶液構造2008
- 著者名/発表者名
  奥田昌彦、田中亜紀、佐藤真奈美、水田翔子、高澤学、大熊芳明、西村善文
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  兵庫県神戸市、神戸ポートアイランド
- 年月日
  2008-12-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[学会発表] NMR Studies on the Interaction between the General Transcription Factors2008
- 著者名/発表者名
  Okuda, M., Tanaka, A., Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
- 学会等名
  TFIIE and TFIIH XXIIIrd ICMRBS Conference
- 発表場所
  米国、カリフォルニア州、サンディエゴ、シェラトンホテル
- 年月日
  2008-08-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090
[学会発表] NMR Studies on the Interaction between the General Transcription Factors, TFIIE and TFIIH2008
- 著者名/発表者名
  Okuda, M., Tanaka, k, Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
- 学会等名
  XXIIIrd ICMRBS Conference
- 発表場所
  米国、カリフォルニア州、サンディエゴ、シェラトンホテル
- 年月日
  2008-08-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19770090

1. 西村善文 (70107390)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 栗田順一 (90752452)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 下條優佳 (10728231)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 津中康央

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

奥田 昌彦 Okuda Masahiko

研究課題

研究成果

共同研究者

RNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHの特異的相互作用の普遍性と特異性研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

クロマチン中の揺らいでいる領域の機能構造解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ヒトRNAポリメラーゼと基本転写因子TFIIHとの複合体の構造モデルの構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ヒトRNAポリメラーゼIIと基本転写因子TFIIHのNMR法による複合体構造解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヒト基本転写因子ＴＦＩＩＥのＮＭＲ法による全長構造の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヒト基本転写因子TFIIEの完全長複合体のNMR法による立体構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヒト基本転写因子TFIIEの全体構造解明に向けたNMRによるドメイン構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Structural polymorphism of the PH domain in TFIIH2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Dynamic structures of intrinsically disordered proteins related to the general transcription factor TFIIH, nucleosomes, and histone chaperones2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural insight into the TFUE/THIE1 interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esal presumed chromodomain2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esa1 presumed chromodomain.2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Structural insight into the TFIIE-TFIIH interaction: TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH.2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Structural insight into the TFIIE/TFIIH interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH.2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

奥田昌彦 Okuda Masahiko