井上詞貴 INOUE FUMITAKA

研究者番号	60525369
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 高等研究院, 特定准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 京都大学, 高等研究院, 特定准教授
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43050:ゲノム生物学関連研究代表者以外小区分43050:ゲノム生物学関連
キーワード	研究代表者遺伝子発現制御 / ゲノム進化 / MPRA / エンハンサー / ヒト進化 / 神経前駆細胞 / iPS細胞 / エピゲノム / 転移因子研究代表者以外レポーターアッセイ … もっと見る / iPS細胞 / CRISPR-Cas9 / ヒトiPS細胞 / DNAリピート / ゲノム解析 / ゲノム編集隠す

ヒト特性に関わるノンコーディング変異の網羅的同定研究代表者
- 研究代表者
  
  井上詞貴
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  京都大学
大規模並列レポーターアッセイ法による転移因子進化メカニズムの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  井上詞貴
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  京都大学
Evaluating the role of cis-regulatory tandem DNA repeats in human disease and evolution
- 研究代表者
  
  ウォルツェンクヌート
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  京都大学

すべて 2024 2023 2022

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Characterization of enhancer activity in early human neurodevelopment using Massively Parallel Reporter Assay (MPRA) and forebrain organoids2024
- 著者名/発表者名
  Capauto Davide、Wang Yifan、Wu Feinan、Norton Scott、Mariani Jessica、Inoue Fumitaka、Crawford Gregory E.、Ahituv Nadav、Abyzov Alexej、Vaccarino Flora M.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 14 号: 1
- DOI
  10.1038/s41598-024-54302-7
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Optimizing sequence design strategies for perturbation MPRAs: a computational evaluation framework2024
- 著者名/発表者名
  Liu Jiayi、Ashuach Tal、Inoue Fumitaka、Ahituv Nadav、Yosef Nir、Kreimer Anat
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 52 号: 4 ページ: 1613-1627
- DOI
  10.1093/nar/gkae012
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Integrative functional genomic analyses identify genetic variants influencing skin pigmentation in Africans2024
- 著者名/発表者名
  Feng Yuanqing、Xie Ning、Inoue Fumitaka、Fan Shaohua、Saskin Joshua、Zhang Chao、Zhang Fang、Hansen Matthew E. B.、Nyambo Thomas、Mpoloka Sununguko Wata、Mokone Gaonyadiwe George、Fokunang Charles、Belay Gurja、Njamnshi Alfred K.、Marks Michael S.、Oancea Elena、Ahituv Nadav、Tishkoff Sarah A.
- 雑誌名
  
  Nature Genetics
  
  巻: 56 号: 2 ページ: 258-272
- DOI
  10.1038/s41588-023-01626-1
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Characterization of De Novo Promoter Variants in Autism Spectrum Disorder with Massively Parallel Reporter Assays2023
- 著者名/発表者名
  Koesterich Justin、An Joon-Yong、Inoue Fumitaka、Sohota Ajuni、Ahituv Nadav、Sanders Stephan J.、Kreimer Anat
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 24 号: 4 ページ: 3509-3509
- DOI
  10.3390/ijms24043509
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Three-dimensional genome rewiring in loci with human accelerated regions2023
- 著者名/発表者名
  Keough Kathleen C.、Whalen Sean、Inoue Fumitaka、et al.
- 雑誌名
  
  Science
  
  巻: 380 号: 6643
- DOI
  10.1126/science.abm1696
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Transcription factor binding site orientation and order are major drivers of gene regulatory activity2023
- 著者名/発表者名
  Ilias Georgakopoulos-Soares, Chengyu Deng, Vikram Agarwal, Candace S. Y. Chan, Jingjing Zhao, Fumitaka Inoue & Nadav Ahituv
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 2333-2333
- DOI
  10.1038/s41467-023-37960-5
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Cryptic endogenous retrovirus subfamilies in the primate lineage2023
- 著者名/発表者名
  Chen Xun、Zhang Zicong、Yan Yizhi、Goubert Clement、Bourque Guillaume、Inoue Fumitaka
- 雑誌名
  
  Biorxiv
  
  巻: NA ページ: 0-0
- DOI
  10.1101/2023.12.07.570592
- オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119, KAKENHI-PROJECT-21K15066
[雑誌論文] Machine learning dissection of human accelerated regions in primate neurodevelopment2023
- 著者名/発表者名
  Whalen Sean, Inoue Fumitaka, Ryu Hane, et. al.
- 雑誌名
  
  Neuron
  
  巻: 111 号: 6 ページ: 857-873.e8
- DOI
  10.1016/j.neuron.2022.12.026
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] Massively parallel reporter perturbation assays uncover temporal regulatory architecture during neural differentiation2022
- 著者名/発表者名
  Kreimer Anat、Ashuach Tal、Inoue Fumitaka、Khodaverdian Alex、Deng Chengyu、Yosef Nir、Ahituv Nadav
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 1504-1504
- DOI
  10.1038/s41467-022-28659-0
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[雑誌論文] High-throughput characterization of the role of non-B DNA motifs on promoter function2022
- 著者名/発表者名
  Georgakopoulos-Soares Ilias、Victorino Jesus、Parada Guillermo E.、Agarwal Vikram、Zhao Jingjing、Wong Hei Yuen、Umar Mubarak Ishaq、Elor Orry、Muhwezi Allan、An Joon-Yong、Sanders Stephan J.、Kwok Chun Kit、Inoue Fumitaka、Hemberg Martin、Ahituv Nadav
- 雑誌名
  
  Cell Genomics
  
  巻: 2 号: 4 ページ: 100111-100111
- DOI
  10.1016/j.xgen.2022.100111
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[学会発表] Massively parallel dissection of regulatory code underlying neural differentiation2023
- 著者名/発表者名
  Fumitaka Inoue
- 学会等名
  The 56th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[学会発表] 大規模並列レポーターアッセイ(MPRA)による転移因子エンハンサーの機能解析2023
- 著者名/発表者名
  井上詞貴
- 学会等名
  第6回転移因子研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[学会発表] Decoding human regulome using Massively Parallel Reporter Assays2022
- 著者名/発表者名
  井上詞貴
- 学会等名
  iCeMS-ASHBi exchange gathering
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[学会発表] 大規模並列レポーターアッセイによるノンコーディングゲノム解読2022
- 著者名/発表者名
  井上詞貴
- 学会等名
  NGS EXPO
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119
[学会発表] 転移因子エンハンサーバリアントの大規模機能解析2022
- 著者名/発表者名
  井上詞貴
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06119

1. BOURQUE GUILLAUME (80890566)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
2. ウォルツェンクヌート (50589489)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 川路英哉 (20525406)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 依馬正次 (60359578)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 大貫茉里 (40983606)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

井上 詞貴 INOUE FUMITAKA

研究課題

研究成果

共同研究者

ヒト特性に関わるノンコーディング変異の網羅的同定研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模並列レポーターアッセイ法による転移因子進化メカニズムの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

Evaluating the role of cis-regulatory tandem DNA repeats in human disease and evolution

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Characterization of enhancer activity in early human neurodevelopment using Massively Parallel Reporter Assay (MPRA) and forebrain organoids2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Optimizing sequence design strategies for perturbation MPRAs: a computational evaluation framework2024

著者名/発表者名

雑誌名

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[雑誌論文] Integrative functional genomic analyses identify genetic variants influencing skin pigmentation in Africans2024

著者名/発表者名

雑誌名

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データソース

[雑誌論文] Characterization of De Novo Promoter Variants in Autism Spectrum Disorder with Massively Parallel Reporter Assays2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Three-dimensional genome rewiring in loci with human accelerated regions2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Transcription factor binding site orientation and order are major drivers of gene regulatory activity2023

著者名/発表者名

雑誌名

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データソース

[雑誌論文] Cryptic endogenous retrovirus subfamilies in the primate lineage2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Machine learning dissection of human accelerated regions in primate neurodevelopment2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Massively parallel reporter perturbation assays uncover temporal regulatory architecture during neural differentiation2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] High-throughput characterization of the role of non-B DNA motifs on promoter function2022

著者名/発表者名

雑誌名

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データソース

[学会発表] Massively parallel dissection of regulatory code underlying neural differentiation2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 大規模並列レポーターアッセイ(MPRA)による転移因子エンハンサーの機能解析2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

井上詞貴 INOUE FUMITAKA