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渡邉 千鶴  WATANABE Chiduru

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 60549187
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2023年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
2018年度 – 2020年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 研究員
審査区分/研究分野
研究代表者
中区分47:薬学およびその関連分野
研究代表者以外
小区分47020:薬系分析および物理化学関連
キーワード
研究代表者
フラグメント分子軌道(FMO)法 / IFIE / FMO / 機械学習 / 相互作用エネルギー / タンパク質-タンパク質相互作用(PPI) / 抗原-抗体 / フラグメント分子軌道法
研究代表者以外
相互作用エネルギー / 活性値予測 … もっと見る / タンパク質リガンド間相互作用 / フラグメント分子軌道(FMO)法 / 創薬研究 / ドッキング / 活性予測 / 機械学習 / タンパク質-リガンド相互作用 / 量子化学計算 / データベース / フラグメント分子軌道法 隠す
  • 研究課題

    (2件)
  • 研究成果

    (9件)
  • 共同研究者

    (4人)
  •  FMOデータベースを用いた抗原-抗体のPPI相互作用エネルギー予測モデルの構築研究代表者

    • 研究代表者
      渡邉 千鶴
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分47:薬学およびその関連分野
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  フラグメント分子軌道法による分子間相互作用データベース構築と創薬研究への普及

    • 研究代表者
      高谷 大輔
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分47020:薬系分析および物理化学関連
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所

すべて 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] FMODB: The World’s First Database of Quantum Mechanical Calculations for Biomacromolecules Based on the Fragment Molecular Orbital Method2021

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Hirotomo Moriwaki, Hitomi Yuki, Tomohiro Sato, Noriyuki Kurita, Yoichiro Yagi, Tatsuya Takagi, Norihito Kawashita, Kenichiro Takaba, Tomonaga Ozawa, Midori Takimoto-Kamimura, Shigenori Tanaka, Kaori Fukuzawa, and Teruki Honma
    • 雑誌名

      J. Chem. Inf. Model.

      巻: 61 号: 2 ページ: 777-794

    • DOI

      10.1021/acs.jcim.0c01062

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06615, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PROJECT-18K06619, KAKENHI-PLANNED-17H06353
  • [雑誌論文] <b>Development of an automated fragment molecular orbital (FMO) calculation protocol toward construction of quantum mechanical </b><b>calculation database for large biomolecules </b>2019

    • 著者名/発表者名
      Watanabe Chiduru、Watanabe Hirofumi、Okiyama Yoshio、Takaya Daisuke、Fukuzawa Kaori、Tanaka Shigenori、Honma Teruki
    • 雑誌名

      CBIジャーナル

      巻: 19 号: 0 ページ: 5-18

    • DOI

      10.1273/cbij.19.5

    • NAID

      130007618360

    • ISSN
      1347-0442, 1347-6297
    • 年月日
      2019-03-22
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619, KAKENHI-PROJECT-18K03825, KAKENHI-PLANNED-17H06353
  • [学会発表] 新型コロナウイルスによるパンデミックに対する FMODB の取り組み2020

    • 著者名/発表者名
      渡邉千鶴、神坂紀久子、大山達也、高谷大輔、加藤幸一郎、川嶋裕介、半田佑磨、山本亜美、渡邉一樹、福澤薫、本間光貴
    • 学会等名
      第48回構造活性相関シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [学会発表] FMO法に基づく相互作用記述子を用いた p38 MAPキナーゼの阻害活性予測2020

    • 著者名/発表者名
      神坂 紀久子, 渡邉 千鶴, 髙谷 大輔, 原田 俊幸, 佐藤 朋広, 幸 瞳, 本間 光貴
    • 学会等名
      第48回構造活性相関シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [学会発表] フラグメント分子軌道法と機械学習を用いた Aurora キナーゼ阻害剤活性予測モデル構築2019

    • 著者名/発表者名
      原田俊幸,渡邉千鶴,森脇寛智,神坂紀久子,原田祐希,佐藤朋広,高谷大輔,本間光貴
    • 学会等名
      第47回構造活性相関シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [学会発表] FMODBの開発と相互作用データの適用に関する研究2019

    • 著者名/発表者名
      高谷大輔、渡邉千鶴、神坂紀久子、本間光貴
    • 学会等名
      第47回構造活性相関シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [学会発表] FMOデータベースにおける相互作用の統計解析と創薬分子設計への応用2019

    • 著者名/発表者名
      渡邉千鶴
    • 学会等名
      日本薬学会第139年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [学会発表] Development of FMO database and its recent updates, 20182018

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Takaya, Chiduru Watanabe, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Teruki Honma
    • 学会等名
      CBI学会2018年大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • [学会発表] Statistical analysis of inter- and intramolecular interactions for drug design based on FMO database2018

    • 著者名/発表者名
      Chiduru Watanabe, Daisuke Takaya, Shunpei Nagase, Kikuko Kamisaka, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma
    • 学会等名
      CBI学会2018年大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06619
  • 1.  高谷 大輔 (50571395)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 5件
  • 2.  佐藤 朋広 (00595358)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  沖山 佳生 (80536384)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  川下 理日人
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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