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藤本 優  fujimoto masaru

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 60554475
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2017年度 – 2025年度: 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授
2016年度: 東京大学, 大学院農学生命研究科, 准教授
審査区分/研究分野
研究代表者
中区分39:生産環境農学およびその関連分野 / 遺伝育種科学
研究代表者以外
小区分39020:作物生産科学関連 / 次世代の農資源利用 / 生物系
キーワード
研究代表者
耐湿性 / イネ / プログラム細胞死 / 空隙形成 / 根 / 作物 / メタゲノム / オミクスデータ / QTL解析 / 根圏微生物 … もっと見る / 根圏微生物叢 / 収量性 / 育種学 / 細胞死 / 柔組織 / 転写因子 / イネ科 / マスター転写因子 / 茎柔組織 / ソルガム / イネ科作物 … もっと見る
研究代表者以外
地質 / 地質的要因 / 放射性セシウム / 作物 / 作物遺伝資源 / トマト / 土壌微生物 / アダプター複合体 / 超解像イメージング / クラスリン / ダイナミン / ライブイメージング / セルロース合成酵素 / 植物 / バイオイメージング / SNARE / Rab GTPase / 液胞 / エンドサイトーシス / イノシトールリン脂質 / セルロース合成酵素複合体 / 細胞壁 / 膜交通 隠す
  • 研究課題

    (7件)
  • 研究成果

    (22件)
  • 共同研究者

    (11人)
  •  根圏生命活動のオミクスデータから紐解くイネ通気組織の形成メカニズムと多面的役割研究代表者

    • 研究代表者
      藤本 優
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分39:生産環境農学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  根圏微生物に関わる作物遺伝子ネットワークの探索ー染色体地図上でのオミクス情報統合研究代表者

    • 研究代表者
      藤本 優
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分39:生産環境農学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  なぜプログラム細胞死はイネの生産性に重要か?-その生態的役割と制御機構研究代表者

    • 研究代表者
      藤本 優
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分39:生産環境農学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  豊かな土壌微生物群をはぐくむ野生トマトに学ぶ新たな作物遺伝資源の開発

    • 研究代表者
      橋本 将典
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      次世代の農資源利用
    • 研究機関
      東京大学
  •  作物の放射性セシウム吸収に関わる地質学的要因の解明

    • 研究代表者
      根本 圭介
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分39020:作物生産科学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  イネ科作物の柔組織における大規模なプログラム細胞死の制御機構と生理的役割の解明研究代表者

    • 研究代表者
      藤本 優
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      遺伝育種科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  細胞壁の構築と生理機能発現における膜交通の役割と分子機構の解析

    • 研究代表者
      上田 貴志
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2016
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      基礎生物学研究所
      東京大学

すべて 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2014 2012

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 植物細胞壁実験法2016

    • 著者名/発表者名
      伊藤瑛海,藤本優,石井みどり,上田貴志(分担執筆)
    • 総ページ数
      403
    • 出版者
      弘前大学出版会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003
  • [雑誌論文] FMT, a protein that affects mitochondrial distribution, interacts with translation-related proteins in Arabidopsis thaliana2021

    • 著者名/発表者名
      Ayabe Hiroki、Kawai Narumi、Shibamura Mitsuhiro、Fukao Yoichiro、Fujimoto Masaru、Tsutsumi Nobuhiro、Arimura Shin-ichi
    • 雑誌名

      Plant Cell Reports

      巻: 40 号: 2 ページ: 327-337

    • DOI

      10.1007/s00299-020-02634-9

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K19202, KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PROJECT-19H02927, KAKENHI-PROJECT-20H05680, KAKENHI-PROJECT-19KK0391
  • [雑誌論文] Spatial kernel models capturing field heterogeneity for accurate estimation of genetic potential2021

    • 著者名/発表者名
      Ishimori M, Takanashi H, Fujimoto M, Kajiya-Kanegae H, Yoneda J, Tokunaga T, Tsutsumi N, Iwata H.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 71 号: 4 ページ: 444-455

    • DOI

      10.1270/jsbbs.20060

    • NAID

      130008095970

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H00418
  • [雑誌論文] Impacts of dominance effects on genomic prediction of sorghum hybrid performance2020

    • 著者名/発表者名
      Ishimori M, Hattori T, Yamazaki K, Takanashi H, Fujimoto M, Kajiya-Kanegae H, Yoneda J, Tokunaga T, Fujiwara T, Tsutsumi N, Iwata H.
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 70 号: 5 ページ: 605-616

    • DOI

      10.1270/jsbbs.20042

    • NAID

      130007962583

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 言語
      英語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PROJECT-20H05680, KAKENHI-PROJECT-20H00418
  • [雑誌論文] RAD-seq-Based High-Density Linkage Map Construction and QTL Mapping of Biomass-Related Traits in Sorghum using the Japanese Landrace Takakibi NOG.2020

    • 著者名/発表者名
      Kajiya-Kanegae H, Takanashi H, Fujimoto M, Ishimori M, Ohnishi N, Wacera W F, Omollo EA, Kobayashi M, Yano K, Nakano M, Kozuka T, Kusaba M, Iwata H, Tsutsumi N, Sakamoto W
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 61 号: 7 ページ: 1262-1272

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa056

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PUBLICLY-19H04870, KAKENHI-PROJECT-17H03699, KAKENHI-PROJECT-18K05570, KAKENHI-PROJECT-20H00418
  • [雑誌論文] Dissecting the Genetic Architecture of Biofuel-related Traits in a Sorghum Breeding Population2020

    • 著者名/発表者名
      Ishimori M, Takanashi H, Hamazaki K, Atagi Y, Kajiya-Kanegae H, Fujimoto M, Yoneda J, Tokunaga T, Tsutsumi N, Iwata H
    • 雑誌名

      G3

      巻: 10 号: 12 ページ: 4565-4577

    • DOI

      10.1534/g3.120.401582

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PROJECT-20J21231, KAKENHI-PROJECT-20H00418
  • [雑誌論文] Effect of salt tolerance on biomass production in a large population of sorghum accessions2020

    • 著者名/発表者名
      Yamazaki Kiyoshi、Ishimori Motoyuki、Kajiya-Kanegae Hiromi、Takanashi Hideki、Fujimoto Masaru、Yoneda Jun-ichi、Yano Kentaro、Koshiba Taichi、Tanaka Ryokei、Iwata Hiroyoshi、Tokunaga Tsuyoshi、Tsutsumi Nobuhiro、Fujiwara Toru
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 70 号: 2 ページ: 167-175

    • DOI

      10.1270/jsbbs.19009

    • NAID

      130007833812

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-18H05490, KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PROJECT-18K05570, KAKENHI-PROJECT-20H00418
  • [雑誌論文] Longin R-SNARE is retrieved from the plasma membrane by ANTH domain-containing proteins in Arabidopsis2020

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto Masaru、Ebine Kazuo、Nishimura Kohji、Tsutsumi Nobuhiro、Ueda Takashi
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 117 号: 40 ページ: 25150-25158

    • DOI

      10.1073/pnas.2011152117

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06303, KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PUBLICLY-19H04872, KAKENHI-PROJECT-18H02470, KAKENHI-ORGANIZER-19H05670, KAKENHI-PLANNED-19H05675, KAKENHI-PROJECT-18H03941, KAKENHI-PROJECT-20H00418
  • [雑誌論文] ソルガムの茎糖液含量を規定する遺伝子2019

    • 著者名/発表者名
      藤本 優,佐塚隆志,米丸淳一,堤 伸浩
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 77 ページ: 112-115

    • NAID

      40021840498

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H05019
  • [雑誌論文] ソルガムにおける茎柔組織髄化の分子メカニズム2019

    • 著者名/発表者名
      藤本 優, 米丸 淳一, 堤 伸浩
    • 雑誌名

      植物の生長調節

      巻: 54 号: 1 ページ: 66-70

    • DOI

      10.18978/jscrp.54.1_66

    • NAID

      130007668424

    • ISSN
      1346-5406, 2189-6305
    • 言語
      日本語
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019
  • [雑誌論文] Enrichment of Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate in the Extra-Invasive Hyphal Membrane Promotes Colletotrichum Infection of Arabidopsis thaliana2019

    • 著者名/発表者名
      Shimada Takashi L、Betsuyaku Shigeyuki、Inada Noriko、Ebine Kazuo、Fujimoto Masaru、Uemura Tomohiro、Takano Yoshitaka、Fukuda Hiroo、Nakano Akihiko、Ueda Takashi
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 60 号: 7 ページ: 1514-1524

    • DOI

      10.1093/pcp/pcz058

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06420, KAKENHI-PUBLICLY-18H04857, KAKENHI-PROJECT-18H05275, KAKENHI-PROJECT-18H02470, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-ORGANIZER-19H05670, KAKENHI-PLANNED-19H05675, KAKENHI-PROJECT-16H06377
  • [雑誌論文] Transcriptional switch for programmed cell death in pith parenchyma of sorghum stems.2018

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto M, Sazuka T, Oda Y, Kawahigashi H, Wu J, Takanashi H, Ohnishi T, Yoneda JI, Ishimori M, Kajiya-Kanegae H, Hibara KI, Ishizuna F, Ebine K, Ueda T, Tokunaga T, Iwata H, Matsumoto T, Kasuga S, Yonemaru JI, Tsutsumi N
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      巻: 115 号: 37

    • DOI

      10.1073/pnas.1807501115

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H03746, KAKENHI-PROJECT-17K19412, KAKENHI-PROJECT-17H01457, KAKENHI-PROJECT-17H05019, KAKENHI-PROJECT-18H02469, KAKENHI-PROJECT-18H02470
  • [雑誌論文] The trans-Golgi network and the Golgi stacks behave independently during regeneration after Brefeldin A treatment in tobacco BY-2 cells2017

    • 著者名/発表者名
      Ito, Y., Toyooka, K., Fujimoto, M., Ueda, T., Uemura, T. and Nakano A.
    • 雑誌名

      Plant Cell Phys.

      巻: 印刷中 号: 4 ページ: 811-821

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx028

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003, KAKENHI-PROJECT-25221103, KAKENHI-PROJECT-15H04382, KAKENHI-PROJECT-17K19412, KAKENHI-PROJECT-15H04627, KAKENHI-PLANNED-17H06420, KAKENHI-PROJECT-15K14538
  • [雑誌論文] DRP1-dependent Endocytosis Is Essential for Polar Localization and Boron-induced Degradation of the Borate Transporter BOR1 in Arabidopsis thaliana2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshinari, A., Fujimoto, M., Ueda, T., Inada, N., Naito, S. and Takano, J.
    • 雑誌名

      Plant Cell Phys.

      巻: 57 号: 9 ページ: 1985-2000

    • DOI

      10.1093/pcp/pcw121

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003, KAKENHI-PROJECT-25221103, KAKENHI-PROJECT-15H04382, KAKENHI-PROJECT-26712007, KAKENHI-PROJECT-16K07415
  • [雑誌論文] SNARE Molecules in Marchantia polymorpha: Unique and Conserved Features of the Membrane Fusion Machinery.2016

    • 著者名/発表者名
      Kanazawa, T., Era, A., Minamino, N., Shikano, Y., Fujimoto, M., Uemura, T., Nishihama, R., Yamato, KT., Ishizaki, K., Nishiyama, T., Kohchi, T., Nakano, A., Ueda, T.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 57 号: 2 ページ: 307-24

    • DOI

      10.1093/pcp/pcv076

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K14538, KAKENHI-PUBLICLY-15H01233, KAKENHI-PLANNED-24114003, KAKENHI-PROJECT-15H04382, KAKENHI-PROJECT-14J09224, KAKENHI-PROJECT-25840100, KAKENHI-PROJECT-25221103, KAKENHI-PROJECT-15H04627, KAKENHI-PROJECT-16J05301
  • [雑誌論文] Phosphoinositides have distinct roles in intracellular trafficking of the cellulose synthase complex in Arabidopsis thaliana2014

    • 著者名/発表者名
      Fujimoto, M., Suda, Y., Vernhettes, S., Nakano, A. and Ueda, T.
    • 雑誌名

      Plant Cell Phys.

      巻: 56 号: 2 ページ: 287-298

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu195

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003, KAKENHI-PROJECT-24370019, KAKENHI-PROJECT-25221103, KAKENHI-PROJECT-26870854
  • [雑誌論文] 膜交通経路の多様性獲得機構から見た植物のポストゴルジ輸送網2014

    • 著者名/発表者名
      藤本優,上田貴志
    • 雑誌名

      植物科学の最前線(BSJ-Review)

      巻: 未定

    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003
  • [雑誌論文] 細胞壁資材の細胞内輸送-植物の膜交通と細胞壁-2012

    • 著者名/発表者名
      藤本優
    • 雑誌名

      遺伝

      巻: 66 ページ: 47-52

    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003
  • [学会発表] トマト栽培種および野生種における根圏微生物叢の比較解析2020

    • 著者名/発表者名
      橋本将典・藤本優・阿部淳・根本圭介
    • 学会等名
      日本作物学会第249回講演会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19KT0033
  • [学会発表] 遺伝子型×環境交互作用モデルによるソルガムのゲノミック予測2020

    • 著者名/発表者名
      石森元幸, 山﨑清志, 高梨秀樹, 鐘ヶ江弘 美, 藤本優, 米田淳一, 徳永毅, 藤原徹, 堤伸浩, 岩田洋佳
    • 学会等名
      日本育種学会・第137回講演会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H05019
  • [学会発表] 陸上植物固有のR-SNAREに存在する挿入配列の機能とその起源2016

    • 著者名/発表者名
      藤本優,海老根一生,石崎公庸,大和勝幸,深尾陽一朗,植村知博,丸山桃子,井坂奈々子,河内孝之,中野明彦,上田貴志
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県,横浜市)
    • 年月日
      2016-12-01
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003
  • [学会発表] Cell type-specific reorientation of a trafficking pathway led to acquisition of new organelles during land plant evolution2016

    • 著者名/発表者名
      Takehiko Kanazawa, Hatsune Morinaka, Takuya Norizuki, Atsuko Era, Naoki Minamino, Yu Shikano, Masaru Fujimoto, Tomohiro Uemura, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato, Kimitsune Ishizaki, Tomoaki Nishiyama, Takayuki Kohchi, Akihiko Nakano, Takashi Ueda
    • 学会等名
      EMBO Workshop New model system for early land plant evolution
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 年月日
      2016-06-22
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24114003
  • 1.  根本 圭介 (40211461)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  橋本 将典 (20615273)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 3.  上田 貴志 (10311333)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 7件
  • 4.  植村 知博 (90415092)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 5.  海老根 一生 (90590399)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 6.  廣瀬 農 (90708372)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  大西 利幸
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 8.  有村 慎一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 9.  堤 伸浩
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 10.  桧原 健一郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 11.  中野 明彦
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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