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山中 優  Yamanaka Masaru

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 60632825
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 研究推進機構, URA
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度 – 2023年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 研究推進機構, URA
2018年度 – 2021年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教
2016年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分28040:ナノバイオサイエンス関連
研究代表者以外
生体関連化学
キーワード
研究代表者
タンパク質超分子 / 構成分子間連携 / 構造領域シャッフリング / 人工タンパク質設計 / バイオナノマシン / 構造領域交換 / タンパク質デザイン / ビルディングブロック / 駆動型超分子 / 四次構造変化 … もっと見る / 四次構造変 / ドメインスワッピング / タンパク質設計 / ナノマシン / センサータンパク質 … もっと見る
研究代表者以外
超分子 / 蛋白質 / ドメインスワッピング / 立体構造 / 多量体 / 超分子化学 / ナノバイオ / 生体分子 / タンパク質 隠す
  • 研究課題

    (3件)
  • 研究成果

    (45件)
  • 共同研究者

    (6人)
  •  タンパク質の動きが連携して機能発現するバイオナノマシンの構築研究代表者

    • 研究代表者
      山中 優
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分28040:ナノバイオサイエンス関連
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  センサータンパク質を駆動系とする人工タンパク質超分子マシンの構築研究代表者

    • 研究代表者
      山中 優
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分28040:ナノバイオサイエンス関連
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  ドメインスワッピングを利用したタンパク質の超分子化技術の開発と機能化

    • 研究代表者
      廣田 俊
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2016
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体関連化学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Conferment of CO-Controlled Dimer-Monomer Transition Property to Thermostable Cytochrome c′ by Mutation in the Subunit-Subunit Interface2019

    • 著者名/発表者名
      Yamanaka Masaru、Nakayama Ryoko、Fujii Sotaro、Wakai Satoshi、Sambongi Yoshihiro、Hirota Shun
    • 雑誌名

      Bulletin of the Chemical Society of Japan

      巻: 92 号: 3 ページ: 702-709

    • DOI

      10.1246/bcsj.20180311

    • NAID

      130007614161

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906, KAKENHI-PROJECT-16K07692, KAKENHI-PROJECT-18H02088
  • [雑誌論文] Formation and Carbon Monoxide-Dependent Dissociation of Allochromatium vinosum Cytochrome c' Oligomers Using Domain-Swapped Dimers2017

    • 著者名/発表者名
      M. Yamanaka, M. Hoshizumi, S. Nagao, R. Nakayama, N. Shibata, Y. Higuchi, and S. Hirota
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 26 号: 3 ページ: 464-474

    • DOI

      10.1002/pro.3090

    • NAID

      120006334944

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H00839, KAKENHI-PROJECT-26288080, KAKENHI-PROJECT-15K13744
  • [雑誌論文] Domain swapping oligomerization of thermostable c-type cytochrome in E. coli cells2016

    • 著者名/発表者名
      Yugo Hayashi, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
    • 雑誌名

      Scientific reports

      巻: 6 号: 1 ページ: 19334-19334

    • DOI

      10.1038/srep19334

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J10305, KAKENHI-PROJECT-25291038, KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [雑誌論文] Oligomerization Enhancement and Two Domain Swapping Mode Detection for Thermostable Cytochrome c-552 via the Elongation of the Major Hinge Loop2015

    • 著者名/発表者名
      C. Ren, S. Nagao, M. Yamanaka, H. Komori, Y. Shomura, Y. Higuchi and S. Hirota
    • 雑誌名

      Mol. Biosyst.

      巻: 11(12) 号: 12 ページ: 218-221

    • DOI

      10.1039/c5mb00545k

    • NAID

      120006334941

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291038, KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [雑誌論文] DNA Cleavage by Oxymyoglobin and Cysteine-Introduced Metmyoglobin2014

    • 著者名/発表者名
      M. S. Deshpande, S. Junedi, H. Prakash, S. Nagao, M. Yamanaka, S. Hirota
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 50 号: 95 ページ: 15034-15036

    • DOI

      10.1039/c4cc06617k

    • NAID

      120005716862

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [雑誌論文] Formation of Domain-Swapped Oligomer of Cytochrome c from Its Molten Globule State Oligomer2014

    • 著者名/発表者名
      Megha Deshpande, Partha Parui, Hironari Kamikubo, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Mikio Kataoka, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 53(28) 号: 28 ページ: 4696-4703

    • DOI

      10.1021/bi500497s

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24247030, KAKENHI-PLANNED-25102003, KAKENHI-PROJECT-25291038, KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [雑誌論文] Change in Structure and Ligand Binding Properties of Hyperstable Cytochrome c555 from Aquifex aeolicus by Domain Swapping2014

    • 著者名/発表者名
      M. Yamanaka, S. Nagao, H. Komori, Y. Higuchi and S. Hirota
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 24 号: 3 ページ: 366-375

    • DOI

      10.1002/pro.2627

    • NAID

      120005716876

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25291038, KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] シトクロム c 2量体の形成と安定性に対するイオンの影響2024

    • 著者名/発表者名
      藤原綱大、龍﨑美智子、山中優、真島剛史、小林直也、廣田俊、
    • 学会等名
      日本化学会第104春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] 円順列変異とαへリックス挿入を用いた3ユニット環状ヘムタンパク質の構築と構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      藤原綱大、真島剛史、小林直也、山中優、米澤健人、上久保裕生、内橋貴之、廣田俊
    • 学会等名
      第23回日本蛋白質科学会科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] αヘリックスで連結した3ユニット環状ヘムタンパク質の構築と構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      藤原綱大、大西遥喜、真島剛史、小林直也、山中優、米澤健人、上久保裕生、内橋貴之、廣田俊
    • 学会等名
      第48回生体分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] Conversion of a Monomeric Protein into a Domain-swapped Dimer by Utilizing a Tight Hydrogen Bond Network at the Hinge Region for Myoglobin2022

    • 著者名/発表者名
      Cheng Xie, Hiromitsu Shimoyama, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, Yasuteru Shigeta, Shun Hirota
    • 学会等名
      10th Asian Biological Inorganic Chemistry
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] 循環置換とαへリックス挿入を用いた3ユニット環状ヘムタンパク質の構築と構造解析2022

    • 著者名/発表者名
      藤原綱大、大西遥喜、真島剛史、小林直也、山中優、米澤健人、上久保裕生、内橋貴之、廣田俊
    • 学会等名
      第16回バイオ関連化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] αヘリックスで連結した3ユニット環状ヘムタンパク質の溶液構造の評価2021

    • 著者名/発表者名
      藤原綱大、大西遥喜、真島剛史、小林直也、山中優、米澤健人、上久保裕生、内橋貴之、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第102春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] 循環置換とαへリックス挿入を用いた3ユニット環状ヘムタンパク質の設計と構築2021

    • 著者名/発表者名
      藤原綱大、山中優、真島剛史、小林直也、大西遥喜、内橋貴之、廣田俊、
    • 学会等名
      第15回バイオ関連化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] センサータンパク質を駆動系として組み込んだビルディングブロックタンパク質の二量体の性質と挙動2021

    • 著者名/発表者名
      山中優、内橋貴之、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] αヘリックスで連結した3ユニット環状ヘムタンパク質の設計と構築2021

    • 著者名/発表者名
      大西遥喜、藤原綱大、真島剛史、小林直也、山中優、緒方英明、廣田俊、
    • 学会等名
      日本化学会第102春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K04850
  • [学会発表] センサータンパク質を駆動系として組み込んだビルディングブロックタンパク質の超分子化2021

    • 著者名/発表者名
      吉田充希、山中優、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第101春季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] Construction of Structure-Switchable Protein Supramolecules using Fusion Proteins Designed Based on 3D Domain Swapping2020

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Takayuki Uchihashi, Shun Hirota
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] ドメインスワップ構造を基に設計した融合タンパク質による可動型超分子の構築2020

    • 著者名/発表者名
      山中優、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第100春季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] The Design of Artificial Domain-Swapped Dimers by Polyproline Rod Insertion2020

    • 著者名/発表者名
      Shota Shiga, Masaru Yamanaka, Wataru Fujiwara, Shun Hirota, Shuichiro Goda, Koki Makabe
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] Construction of Protein Supramolecules Based on Domain Swapping2019

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Chunguang Ren, Mohan Zhang, Akiya Oda, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
    • 学会等名
      第19回蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] 耐熱性シトクロムcのサブユニット界面変異によるCO応答性2量体-単量体変換特性の付与2019

    • 著者名/発表者名
      山中優、中山諒子、若井暁、藤井創太郎、三本木至宏、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第99春季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] Conferment of CO-Controlled Dimer-Monomer Transition Property to Thermostable Cytochrome c′ by Mutation in the Subunit Interface2019

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Ryoko Nakayama, Sotaro Fujii, Satoshi Wakai, Yoshihiro Sambongi, Shun Hirota
    • 学会等名
      15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry (ISABC15)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] Formation of Cytochrome c' tetramer Using Domain-Swapping and Carbon Monoxide-Dependent Control of Oligomer Association/Dissociation2019

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Shun Hirota
    • 学会等名
      15th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] Construction of Protein Supramolecules Based on Domain-Swapping Mechanism2019

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Chunguang Ren, Mohan Zhang, Akiya Oda, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
    • 学会等名
      33rd Annual Symposium of the Protein Society
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] ドメインスワップ機構を利用した駆動型人工タンパク質超分子の構築2019

    • 著者名/発表者名
      山中優
    • 学会等名
      農芸化学会関西支部ミニシンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] サブユニット界面変異による耐熱性シトクロムc′へのCO依存的2量体-単量体遷移特性の付与2018

    • 著者名/発表者名
      山中優、中山諒子、藤井創太郎、岩井暁、三本木至宏、廣田俊
    • 学会等名
      第12回バイオ関連化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K04906
  • [学会発表] Construction of a Triangle-shaped Structure with a Unit Protein Based on Cytochrome c5552017

    • 著者名/発表者名
      Akiya Oda, Ikki Ueda, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, and Shun Hirota
    • 学会等名
      97th Chemical Society of Japan Annual Meeting
    • 発表場所
      慶応義塾大学(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Formation of Cytochrome c Oligomers Using Domain-Swapped Dimers and Carbon Monoxide-Dependent Control of Oligomer Association/Dissociation2017

    • 著者名/発表者名
      Masaru Yamanaka, Ryoko Nakayama, Satoshi Nagao, Makoto Hoshizumi, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, and Shun Hirota
    • 学会等名
      97th Chemical Society of Japan Annual Meeting
    • 発表場所
      慶応義塾大学(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Cytochrome c: Domain Swapping, Self-Modification, and Molecular Recognition2017

    • 著者名/発表者名
      Shun Hirota, Satoshi Nagao, Masaru Yamanaka, and Yoshiki Higuchi
    • 学会等名
      5th Symposium on Advanced Biological Inorganic Chemistry
    • 発表場所
      Kolkata, India
    • 年月日
      2017-01-07
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Effect of Rare Codons on Hydrogenobacter thermophiles cyt c552 Oligomerization in E. coli Cells2017

    • 著者名/発表者名
      Hongxu Yang, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, and Shun Hirota
    • 学会等名
      97th Chemical Society of Japan Annual Meeting
    • 発表場所
      慶応義塾大学(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] 二次元蛍光寿命相関分光法によるウマシトクロムcのフォールディング機構の研究2016

    • 著者名/発表者名
      坂口美幸、山中優、廣田俊、石井邦彦、田原太平
    • 学会等名
      第10回分子科学討論会
    • 発表場所
      神戸ファッションマート(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2016-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Construction of Heme Protein Supramolecules by Domain Swapping2016

    • 著者名/発表者名
      Shun Hirota, Satoshi Nagao, Masaru Yamanaka, and Yoshiki Higuchi
    • 学会等名
      5th Symposium on Advanced Biological Inorganic Chemistry
    • 発表場所
      Auckland, New Zealand
    • 年月日
      2016-12-04
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] 過酸との反応によるシトクロムcのMet80の酸化修飾2016

    • 著者名/発表者名
      松本順文、REN Chunguang、山中優、長尾聡、廣田俊
    • 学会等名
      第10回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      石川県立音楽堂・もてなしドーム地下イベント広場(石川県金沢市)
    • 年月日
      2016-09-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Analysis of Environment Dependent Dynamics of Cytochrome c on a Lipid Membrane by 2D Fluorescence Lifetime Correlation Spectroscopy2016

    • 著者名/発表者名
      Miyuki Sakaguchi,Masaru Yamanaka,Shun Hirota,Kunihiko Ishii,and Tahei Tahara
    • 学会等名
      第54回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Construction of Cytochrome c' Tetramer and Its Size Control by CO Binding2016

    • 著者名/発表者名
      山中優、星住誠人、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • 年月日
      2016-03-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] 四量体シトクロムc’の作製とCO分子結合・解離によるサイズ制御2016

    • 著者名/発表者名
      山中優、星住誠人、長尾聡、廣田俊
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県福岡市)
    • 年月日
      2016-06-07
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Formation of domain-swapped oligomer of Hydrogenobacter thermophiles cytochrome c552 in an expression system2015

    • 著者名/発表者名
      Yugo Hayashi, Satoshi Nagao, Masaru Yamanaka, Hirofumi Komori, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota
    • 学会等名
      95th Spring Conference of the Chemical Society of Japan
    • 発表場所
      Nihon University (Funabashi)
    • 年月日
      2015-03-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] ドメインスワッピングを利用したシトクロムcおよびミオグロビンの多量体形成2015

    • 著者名/発表者名
      長尾聡、山中優、Ying-Wu Lin、Megha Subhash Deshpande、小森博文、庄村康人、樋口芳樹、廣田俊
    • 学会等名
      第25回金属の関与する生体関連反応シンポジウム
    • 発表場所
      長崎大学(長崎県長崎市)
    • 年月日
      2015-05-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Domain Swapping of c-Type Cytochromes and Myoglobin2015

    • 著者名/発表者名
      Shun Hirota, Satoshi Nagao, Masaru Yamanaka, Hirofumi Komori, Yasuhito Shomura, Yoshiki Higuchi
    • 学会等名
      "Metals in Biology" in Wako
    • 発表場所
      Riken Wako Campus (Wako, Saitama)
    • 年月日
      2015-06-16
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Change in Structure and Ligand Binding Properties of Cytochrome c555 from Hyperthermophile by Domain Swapping2015

    • 著者名/発表者名
      山中優、長尾聡、小森博文、樋口芳樹、廣田俊
    • 学会等名
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] 緑膿菌由来シトクロムc551と好熱性水素細菌由来シトクロムc552のキメラタンパク質を用いたヘテロダイマーの構築2015

    • 著者名/発表者名
      中西司、山中優、廣田俊
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      日本大学(船橋)
    • 年月日
      2015-03-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] Construction of high-order domain-swapped oligomers of Hydrogenobacter thermophilus cytochrome c552 by hinge loop mutation2015

    • 著者名/発表者名
      Chunguang Ren, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Shun Hirota
    • 学会等名
      95th Spring Conference of the Chemical Society of Japan
    • 発表場所
      Nihon University (Funabashi)
    • 年月日
      2015-03-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] 好熱菌シトクロムc552のドメインスワップ多量体形成2015

    • 著者名/発表者名
      林有吾、山中優、長尾聡、小森博文、樋口芳樹、廣田俊
    • 学会等名
      日本生物高分子学会2015年度大会
    • 発表場所
      香川大学(香川県高松市)
    • 年月日
      2015-09-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • [学会発表] 生理的条件下でのシトクロムc多量体形成2014

    • 著者名/発表者名
      林有吾、中山璃子、長尾聡、山中優、小森博文、樋口芳樹、廣田俊
    • 学会等名
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      岡山大学(岡山市)
    • 年月日
      2014-09-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26288080
  • 1.  廣田 俊 (90283457)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 28件
  • 2.  樋口 芳樹 (90183574)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 12件
  • 3.  長尾 聡 (30452535)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 15件
  • 4.  松尾 貴史 (50432521)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  上久保 裕生
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 6.  片岡 幹雄
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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