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水内 良  mizuuchi ryo

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 60845535
所属 (現在) 2025年度: 早稲田大学, 理工学術院, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2025年度: 早稲田大学, 理工学術院, 准教授
2023年度 – 2024年度: 早稲田大学, 理工学術院, 専任講師
2019年度 – 2022年度: 東京大学, 大学院総合文化研究科, 特任助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43040:生物物理学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅳ) / 0703:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
キーワード
研究代表者
RNA / 人工細胞 / 再構成 / 生命の起源 / 進化 / 自己複製 / 液―液相分離 / 分子通信 / 無細胞翻訳系 / ゲノム複製 … もっと見る / 多細胞 / 進化分子工学 / 自己触媒 / 前生物化学 / 分子ビーコン / 翻訳システム / 実験進化 / 複雑化 / 生命の初期進化 隠す
  • 研究課題

    (5件)
  • 研究成果

    (60件)
  • 共同研究者

    (1人)
  •  進化する最小自己複製RNAの開発研究代表者

    • 研究代表者
      水内 良
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2029
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分43040:生物物理学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  人工多細胞におけるゲノム複製の時空間制御研究代表者

    • 研究代表者
      水内 良
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2024
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅳ)
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  最小自己複製RNAの構築研究代表者

    • 研究代表者
      水内 良
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2024
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分43040:生物物理学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  人工多細胞型ゲノム複製システムの構築研究代表者

    • 研究代表者
      水内 良
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2022
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅳ)
    • 研究機関
      東京大学
  •  原始複製体モデルを用いた複雑化仮説の実験的検証研究代表者

    • 研究代表者
      水内 良
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2020
    • 研究種目
      研究活動スタート支援
    • 審査区分
      0703:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Constraint on an RNA world on montmorillonite clay2024

    • 著者名/発表者名
      Mizuuchi Ryo
    • 雑誌名

      Biophysical Journal

      巻: 123 号: 4 ページ: 421-423

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2024.01.020

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153, KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [雑誌論文] Emergence of linkage between cooperative RNA replicators encoding replication and metabolic enzymes through experimental evolution2023

    • 著者名/発表者名
      Ueda Kensuke、Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      PLOS Genetics

      巻: 19 号: 8 ページ: e1010471-e1010471

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1010471

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153, KAKENHI-PROJECT-22K21344, KAKENHI-PUBLICLY-22H05402, KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [雑誌論文] How prebiotic complexity increases through Darwinian evolution2023

    • 著者名/発表者名
      Yukawa Kohtoh、Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      Current Opinion in Systems Biology

      巻: 34 ページ: 100456-100456

    • DOI

      10.1016/j.coisb.2023.100456

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153, KAKENHI-PROJECT-22K21344, KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [雑誌論文] Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers2023

    • 著者名/発表者名
      Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      Chemical Science

      巻: 14 号: 28 ページ: 7656-7664

    • DOI

      10.1039/d3sc01940c

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153, KAKENHI-PROJECT-22K21344, KAKENHI-PUBLICLY-22H05402, KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [雑誌論文] Cell-free expression of RuBisCO for ATP production in the synthetic cells2023

    • 著者名/発表者名
      Sugii Shugo、Hagino Katsumi、Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      Synthetic Biology

      巻: 8 号: 1

    • DOI

      10.1093/synbio/ysad016

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153, KAKENHI-PROJECT-23KJ0558, KAKENHI-PROJECT-22K21344, KAKENHI-PUBLICLY-22H05402, KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [雑誌論文] Evolutionary transition from a single RNA replicator to a multiple replicator network2022

    • 著者名/発表者名
      Mizuuchi, R., Furubayashi, T., Ichihashi, N
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1 ページ: 1460-1460

    • DOI

      10.1038/s41467-022-29113-x

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04859, KAKENHI-PUBLICLY-21H05867, KAKENHI-PROJECT-22K14794, KAKENHI-PROJECT-22KJ0540, KAKENHI-PUBLICLY-22H05402
  • [雑誌論文] Plausible pathway for a host-parasite molecular replication network to increase its complexity through Darwinian evolution2022

    • 著者名/発表者名
      Kamiura Rikuto、Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      PLOS Computational Biology

      巻: 18 号: 12 ページ: e1010709-e1010709

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1010709

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867, KAKENHI-PROJECT-20J21802
  • [雑誌論文] Experimental evidence for the correlation between RNA structural fluctuations and the frequency of beneficial mutations2022

    • 著者名/発表者名
      Maeda Yutaro、Mizuuchi Ryo、Shigenobu Shuji、Shibai Atsushi、Kotani Hazuki、Furusawa Chikara、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 28 ページ: 1659-1667

    • DOI

      10.1261/rna.079291.122

    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [雑誌論文] Relaxed Substrate Specificity in Qβ Replicase through Long-Term In Vitro Evolution2021

    • 著者名/発表者名
      Yukawa, K., Mizuuchi, R., Ichihashi, N
    • 雑誌名

      Life

      巻: 12 号: 1 ページ: 32-32

    • DOI

      10.3390/life12010032

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04859, KAKENHI-PUBLICLY-21H05867, KAKENHI-PUBLICLY-22H05402
  • [雑誌論文] Primitive Compartmentalization for the Sustainable Replication of Genetic Molecules2021

    • 著者名/発表者名
      Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      Life

      巻: 11 号: 3 ページ: 1-17

    • DOI

      10.3390/life11030191

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [雑誌論文] 原始生命を模した分子複製システムの進化と改良2021

    • 著者名/発表者名
      水内 良
    • 雑誌名

      Viva Origino

      巻: 49 号: 3 ページ: 10

    • DOI

      10.50968/vivaorigino.49_10

    • NAID

      130008130254

    • ISSN
      0910-4003, 1346-6933
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [雑誌論文] Emergence and diversification of a host-parasite RNA ecosystem through Darwinian evolution2020

    • 著者名/発表者名
      Furubayashi Taro、Ueda Kensuke、Bansho Yohsuke、Motooka Daisuke、Nakamura Shota、Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      eLife

      巻: 9 ページ: 1-15

    • DOI

      10.7554/elife.56038

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763, KAKENHI-PUBLICLY-20H04859
  • [雑誌論文] Translation-coupled RNA replication and parasitic replicators in membrane-free compartments2020

    • 著者名/発表者名
      Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      Chemical Communications

      巻: 56 号: 87 ページ: 13453-13456

    • DOI

      10.1039/d0cc06606k

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [雑誌論文] In vitro evolution of phi29 DNA polymerases through compartmentalized gene expression and rolling-circle replication2020

    • 著者名/発表者名
      Sakatani Yoshihiro、Mizuuchi Ryo、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Selection

      巻: 32 号: 11 ページ: 481-487

    • DOI

      10.1093/protein/gzaa011

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [雑誌論文] Structural transition of replicable RNAs during in vitro evolution with Qβ replicase2019

    • 著者名/発表者名
      Mizuuchi Ryo、Usui Kimihito、Ichihashi Norikazu
    • 雑誌名

      RNA

      巻: 26 号: 1 ページ: 83-90

    • DOI

      10.1261/rna.073106.119

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763, KAKENHI-PUBLICLY-18H04820, KAKENHI-PROJECT-15KT0080
  • [学会発表] 生命の起源を追体験する2024

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      定量生物学の会 第十一回年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 原始的なRNA 集団と自己複製体の探究2024

    • 著者名/発表者名
      水内良、柿崎二郎、佐藤颯、市橋伯一
    • 学会等名
      第48回 生命の起原および進化学会学術講演会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 生命の起源を追体験する2024

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      定量生物学の会 第十一回年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] 原始的なRNA 集団と自己複製体の探究2024

    • 著者名/発表者名
      水内良、柿崎二郎、佐藤颯、市橋伯一
    • 学会等名
      第48回 生命の起原および進化学会学術講演会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] 原始生命モデルの実験進化で観測不能な生命の起源に迫る2023

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      日本進化学会第25回大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi
    • 学会等名
      Molecular Origins of Life
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] Emergence and evolution of host-parasite ecosystems in a molecular replication system2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      Confect Symposium 2023 “Marine Microbial Virus Ecology and Evolution”
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] 原始的なRNA集団の調査から見つかった自己複製する最小のRNA2023

    • 著者名/発表者名
      水内良、市橋伯一
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会 16.0
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] RNA replication systems and evolution: for understanding the origins of life2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      SPEED × Bottom-up Biotech × ELSI joint workshop
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi, Norikazu Ichihashi
    • 学会等名
      Molecular Origins of Life
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] Emergence and evolution of host-parasite ecosystems in a molecular replication system2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      Confect Symposium 2023 “Marine Microbial Virus Ecology and Evolution
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 原始生命モデルの実験進化で観測不能な生命の起源に迫る2023

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      日本進化学会第25回大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 分子から生命が生まれる道筋を解き明かすために2023

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      生命の分子システムの理解に向けて何を創れば良いか?
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] Evolution of complexity in an artificial RNA replication system2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      STATPHYS28 Satellite Meeting, Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] Experimental evolution of artificial RNA replication systems: for understanding the origins of life2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      International Workshop for Bridging Synthetic, Computational & Evolutionary Biology
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 再構成実験で探る生命の起源:原始生命モデルと実験室内進化2023

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      CHEMINAS 47
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] Minimal RNA self-reproduction discovered from a random pool of oligomers2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      第61回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] RNA replication systems and evolution: for understanding the origins of life2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      SPEED × Bottom-up Biotech × ELSI joint workshop
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 原始的なRNA集団の調査から見つかった自己複製する最小のRNA2023

    • 著者名/発表者名
      水内良、市橋伯一
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会 16.0
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] Evolution of complexity in an artificial RNA replication system2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      STATPHYS28 Satellite Meeting, Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] 分子から生命が生まれる道筋を解き明かすために2023

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      生命の分子システムの理解に向けて何を創れば良いか?
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] 再構成実験で探る生命の起源:原始生命モデルと実験室内進化2023

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      CHEMINAS 47
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23H04403
  • [学会発表] Experimental evolution of artificial RNA replication systems: for understanding the origins of life2023

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      International Workshop for Bridging Synthetic, Computational & Evolutionary Biology
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K14153
  • [学会発表] 人工RNA複製システムと生命の起源2022

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      学術変革領域(A)分子サイバネティクス 第10回領域セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] Compartmentalization for RNA replication and evolution2022

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      第60回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] From emergence to Darwinian evolution of RNA replicators2022

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      NASA Center for the Origin of Life meeting
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] Emergence and Darwinian evolution of RNA replicators2022

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      Interdisciplinary Origin of Life Meeting for Early Career Researchers (IOoL2022)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] 人工RNA複製体のダーウィン進化による複雑化2022

    • 著者名/発表者名
      水内良、古林太郎、市橋伯一
    • 学会等名
      第46回 生命の起原および進化学会学術講演会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] Mineral surfaces select for longer RNA molecules: implication for prebiotic evolution2022

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      Japan Geoscience Union Meeting
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] 安定化した液滴での翻訳とRNA自己複製:人工多細胞の構築に向けて2022

    • 著者名/発表者名
      水内良、市橋伯一
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会 15.0
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] 人工RNA自己複製体と寄生体の長期共進化2021

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第34回大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] 原始生命を模した分子複製システムの進化と改良2021

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      生命の起原および進化学会 2021年シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] Evolutionary complexification of an artificial RNA replication system2021

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi, Taro Furubayashi, Norikazu Ichihashi
    • 学会等名
      第59回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] 人工RNA複製体の進化と人工細胞と生命の起源2021

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      人工細胞モデル&分子ロボティクス 第2回研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] 原始生命を模した分子複製システムの構築と進化2021

    • 著者名/発表者名
      水内良
    • 学会等名
      第1回分子サイバネティクス定例研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] 無細胞翻訳系を用いた液滴内でのRNAの自己複製2021

    • 著者名/発表者名
      水内良、市橋伯一
    • 学会等名
      第15回無細胞生命科学研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] Evolutionary complexification of a replicase-encoding RNA replicator2021

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      The XIXth International Conference on the Origin of Life
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] Evolutionary complexification of an artificial RNA replication system in a cell-like compartment2021

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi、Taro Furubayashi、Norikazu Ichihashi
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会 14.0
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-21H05867
  • [学会発表] Emergence of cooperative RNA replicators in an artificial cell-like system2020

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      8th ELSI Symposium
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] Translation-coupled RNA replication in membrane-free droplets2020

    • 著者名/発表者名
      水内良、市橋伯一
    • 学会等名
      第58回日本生物物理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] 液滴での翻訳を介したRNAの自己複製2020

    • 著者名/発表者名
      水内良、市橋伯一
    • 学会等名
      「細胞を創る」研究会 13.0
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] RNA自己複製体のダーウィン進化による複雑化2020

    • 著者名/発表者名
      水内良、古林太郎、市橋伯一
    • 学会等名
      日本進化学会 第22回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] Autocatalytic sets, Mineral surfaces, and the evolution of RNA2019

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      Ribonucleoprotein reconstruction/evolution mini-workshop
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • [学会発表] Compartmentalization for the evolution of cooperation in RNA replicators2019

    • 著者名/発表者名
      Ryo Mizuuchi
    • 学会等名
      Primitive Compartmentalization Symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23763
  • 1.  市橋 伯一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件

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