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坂下 陽彦  Sakashita Akihiko

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 60893873
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, チームディレクター
2025年度: 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2025年度: 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, チームディレクター
2021年度 – 2024年度: 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分44020:発生生物学関連 / 生物系
研究代表者以外
中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 生物系 / 小区分44020:発生生物学関連
キーワード
研究代表者
内在性レトロウイルス / レトロトランスポゾン / 種間トランスクリプトーム比較 / ハムスターモデル / 初期発生制御 / MERVL / クロマチン / 細胞分化 / クロマチンポテンシャル / エピゲノム制御 … もっと見る / トランスクリプトーム / クロマチン構造変化 / 初期発生 / 全能性制御 / 生殖細胞形成 / KRAB-ZFP / 生殖系列 / 転写制御 / エンハンサー / A-MYB / KRAB-Zincフィンガー / 精子形成 / エピゲノム … もっと見る
研究代表者以外
トランスポゾン / 着床 / 胚発生 / 培養系 / マウスモデル / 不妊症 / 転写制御 / 初期発生 / 配偶子形成 / 生殖サイクル / 多能性 / 全能性 / クラスター遺伝子 / リピドーム / トランスクリプトーム / 子宮内膜 隠す
  • 研究課題

    (7件)
  • 研究成果

    (20件)
  • 共同研究者

    (15人)
  •  多コピー遺伝因子による初期胚制御機構

    • 研究代表者
      塩見 春彦
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2029
    • 研究種目
      特別推進研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      千葉大学
  •  機動性DNAエレメントが駆動する生殖サイクル

    • 研究代表者
      岩崎 由香
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2029
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  胚・子宮間の相互作用の機構解明に基づく生体外胚着床システム開発

    • 研究代表者
      廣田 泰
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2028
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京大学
  •  個体発生において種間の多様性をもたらす内在性レトロウイルスの機能解析研究代表者

    • 研究代表者
      坂下 陽彦
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2025
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分44020:発生生物学関連
    • 研究機関
      慶應義塾大学
  •  胚発生活性化を担保する着床期胚・子宮内膜間相互作用の解明

    • 研究代表者
      藍川 志津
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分44020:発生生物学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  内在性レトロウイルスによる宿主ゲノムのクロマチン再構築機構研究代表者

    • 研究代表者
      坂下 陽彦
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      慶應義塾大学
  •  生殖系列における内在性レトロウイルス由来エンハンサーの確立機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      坂下 陽彦
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2022
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分44020:発生生物学関連
    • 研究機関
      慶應義塾大学

すべて 2023 2022

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] in vitroにおける個体発生の再構成をめざして2023

    • 著者名/発表者名
      坂下陽彦
    • 総ページ数
      1
    • 出版者
      ファルマシア 2023 年 59 巻 6 号
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [図書] 実験医学2023年9月号2023

    • 著者名/発表者名
      坂下陽彦、石津大嗣
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758125710
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [雑誌論文] Polycomb protein SCML2 mediates paternal epigenetic inheritance through sperm chromatin2023

    • 著者名/発表者名
      Sakashita Akihiko、Ooga Masatoshi、Otsuka Kai、Maezawa So、Takeuchi Chikara、Wakayama Sayaka、Wakayama Teruhiko、Namekawa Satoshi?H
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 51 号: 13 ページ: 6668-6683

    • DOI

      10.1093/nar/gkad479

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18084, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PROJECT-21H02383
  • [雑誌論文] KRAB-zinc-finger proteins regulate endogenous retroviruses to sculpt germline transcriptomes and genome evolution2023

    • 著者名/発表者名
      Otsuka Kai、Sakashita Akihiko、Maezawa So、Schultz Richard M.、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2023.06.24.546405

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18084, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PROJECT-21H02383
  • [雑誌論文] Mouse embryonic development requires transposable element expression2023

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Sakashita、Haruhiko Siomi
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 55 号: 3 ページ: 367-368

    • DOI

      10.1038/s41588-023-01326-w

    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [雑誌論文] The EZH2?PRC2?H3K27me3 axis governs the endometrial cell cycle and differentiation for blastocyst invasion2023

    • 著者名/発表者名
      Fukui Yamato、Hirota Yasushi、Aikawa Shizu、Sakashita Akihiko、Shimizu-Hirota Ryoko、Takeda Norihiko、Ishizawa Chihiro、Iida Rei、Kaku Tetsuaki、Hirata Tomoyuki、Hiraoka Takehiro、Akaeda Shun、Matsuo Mitsunori、Osuga Yutaka
    • 雑誌名

      Cell Death & Disease

      巻: 14 号: 5 ページ: 320-320

    • DOI

      10.1038/s41419-023-05832-x

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K15814, KAKENHI-PROJECT-23K15827, KAKENHI-PROJECT-22K19596, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PROJECT-23K23803
  • [雑誌論文] PRC1 suppresses a female gene regulatory network to ensure testicular differentiation2023

    • 著者名/発表者名
      Maezawa So、Yukawa Masashi、Hasegawa Kazuteru、Sugiyama Ryo、Iizuka Mizuho、Hu Mengwen、Sakashita Akihiko、Vidal Miguel、Koseki Haruhiko、Barski Artem、DeFalco Tony、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      Cell Death & Disease

      巻: 14 号: 8

    • DOI

      10.1038/s41419-023-05996-6

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18084, KAKENHI-PLANNED-19H05745, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PROJECT-21H02383
  • [雑誌論文] Transcription of MERVL retrotransposons is required for preimplantation embryo development2023

    • 著者名/発表者名
      Sakashita Akihiko、Kitano Tomohiro、Ishizu Hirotsugu、Guo Youjia、Masuda Harumi、Ariura Masaru、Murano Kensaku、Siomi Haruhiko
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 55 号: 3 ページ: 484-495

    • DOI

      10.1038/s41588-023-01324-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K06091, KAKENHI-ORGANIZER-19H05749, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PLANNED-19H05753, KAKENHI-PROJECT-23K27370
  • [雑誌論文] CTCF-mediated 3D chromatin predetermines the gene expression program in the male germline2023

    • 著者名/発表者名
      Kitamura Yuka、Takahashi Kazuki、Maezawa So、Munakata Yasuhisa、Sakashita Akihiko、Kaplan Noam、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2023.11.30.569508

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18084, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PROJECT-21H02383
  • [雑誌論文] Bioinformatics pipelines for identification of super-enhancers and 3D chromatin contacts2022

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Sakashita、Chikara Takeuchi、So Maezawa、Satoshi H. Namekawa
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: -

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K15108
  • [雑誌論文] PRC1-mediated epigenetic programming is required to generate the ovarian reserve2022

    • 著者名/発表者名
      Hu Mengwen、Yeh Yu-Han、Munakata Yasuhisa、Abe Hironori、Sakashita Akihiko、Maezawa So、Vidal Miguel、Koseki Haruhiko、Hunter Neil、Schultz Richard M.、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31759-6

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02383, KAKENHI-PROJECT-21K15108, KAKENHI-PLANNED-19H05745, KAKENHI-PUBLICLY-21H00233, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [雑誌論文] Suppression of endogenous retroviral enhancers in mouse embryos derived from somatic cell nuclear transfer2022

    • 著者名/発表者名
      Shikata Daiki、Matoba Shogo、Hada Masashi、Sakashita Akihiko、Inoue Kimiko、Ogura Atsuo
    • 雑誌名

      Frontiers in Genetics

      巻: 13 ページ: 1032760-1032760

    • DOI

      10.3389/fgene.2022.1032760

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15705, KAKENHI-PROJECT-21K15108, KAKENHI-PLANNED-19H05758, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700, KAKENHI-PROJECT-23K20298
  • [雑誌論文] Bioinformatics Pipelines for Identification of Super-Enhancers and 3D Chromatin Contacts2022

    • 著者名/発表者名
      Sakashita Akihiko、Takeuchi Chikara、Maezawa So、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      Methods Mol. Biol.

      巻: 2577 ページ: 123-146

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2724-2_9

    • ISBN
      9781071627235, 9781071627242
    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H02383, KAKENHI-PROJECT-22KJ2696, KAKENHI-PUBLICLY-21H00233, KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [雑誌論文] Retrotransposons in the Mammalian Male Germline2022

    • 著者名/発表者名
      Zhou Shumin、Sakashita Akihiko、Yuan Shuiqiao、Namekawa Satoshi H.
    • 雑誌名

      Sexual Development

      巻: - 号: 5-6 ページ: 1-19

    • DOI

      10.1159/000520683

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K15108
  • [雑誌論文] CRISPR-mediated activation of transposable elements in embryonic stem cells2022

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Sakashita、 Masaru Ariura、 Satoshi H. Namekawa
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol.

      巻: -

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K15108
  • [雑誌論文] Highly rigid H3.1/H3.2-H3K9me3 domains set a barrier for cell fate reprogramming in trophoblast stem cells2022

    • 著者名/発表者名
      Hada M, Miura H, Tanigawa A, Matoba S, Inoue K, Ogonuki N, Hirose M, Watanabe N, Nakato R, Fujiki K, Hasegawa A, Sakashita A, Okae H, Miura K, Shikata D, Arima T, Shirahige K, Hiratani I, Ogura A.
    • 雑誌名

      Genes Dev

      巻: 36 号: 1-2 ページ: 84-102

    • DOI

      10.1101/gad.348782.121

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21384, KAKENHI-PLANNED-18H05530, KAKENHI-PLANNED-19H05758, KAKENHI-PUBLICLY-20H04934, KAKENHI-PLANNED-20H05940, KAKENHI-PROJECT-20K20582, KAKENHI-PROJECT-19K16017, KAKENHI-PROJECT-20K15705, KAKENHI-PROJECT-21K15108, KAKENHI-PROJECT-20H05686, KAKENHI-PROJECT-21H04834, KAKENHI-PROJECT-21K19546, KAKENHI-PROJECT-23K20298
  • [学会発表] 転移因子が駆動する哺乳動物の個体発生2023

    • 著者名/発表者名
      坂下 陽彦
    • 学会等名
      東海医学会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [学会発表] 種固有の個体発生制御を担う内在性レトロウイルス機能の探索2023

    • 著者名/発表者名
      坂下陽彦
    • 学会等名
      第46回 分子生物学会年会
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [学会発表] Regulation of host gene expression and cell fate by endogenous retrovirus during early stage of embryonic development2022

    • 著者名/発表者名
      Akihiko Sakashita
    • 学会等名
      The 1st international symposium of Non-Genome Replication
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • [学会発表] マウス初期発生胚における内在性レトロウイルスを介した宿主ゲノム制御機構2022

    • 著者名/発表者名
      坂下 陽彦
    • 学会等名
      第94回 日本遺伝学会大会シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04700
  • 1.  藍川 志津 (80884577)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  可野 邦行 (50636404)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  塩見 春彦 (60202107)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  小嶋 将平 (30851703)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  蓮輪 英毅 (50343249)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  岩崎 由香 (80612647)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  廣田 泰 (40598653)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  松尾 光徳 (00823618)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  伊川 正人 (20304066)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  平岡 毅大 (20836762)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 11.  清水 良子 (30348643)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  前澤 創
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 6件
  • 13.  羽田 政司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 14.  藤木 克則
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 15.  石津 大嗣
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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