曽根原究人 Sonehara Kyuto

研究者番号	60975358
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 客員研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教 2023年度: 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分48040:医化学関連
キーワード	研究代表者全ゲノムシーケンス / 構造多型 / ゲノムワイド関連解析 / ロングリードシーケンス / 遺伝統計学

ロングリード技術を用いたMHC領域の構造多様性・機能的意義解明研究代表者
- 研究代表者
  
  曽根原究人
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2026
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分48040:医化学関連
- 研究機関
  東京大学
ショート＆ロングリード技術を駆使したゲノムワイドな疾患感受性構造多型の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  曽根原究人
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2024
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分48040:医化学関連
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Genetic drivers of heterogeneity in type 2 diabetes pathophysiology2024
- 著者名/発表者名
  Suzuki Ken、Hatzikotoulas Konstantinos、Southam Lorraine、Taylor Henry J.、Yin Xianyong、Lorenz Kim M.、Mandla Ravi、Huerta-Chagoya Alicia、Melloni Giorgio E. M.、Kanoni Stavroula、Rayner Nigel W.、Bocher Ozvan、Arruda Ana Luiza、Sonehara Kyuto et al.
- 雑誌名
  
  Nature
  
  巻: 627 号: 8003 ページ: 347-357
- DOI
  10.1038/s41586-024-07019-6
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-21H04850, KAKENHI-PROJECT-21H03206
[雑誌論文] Genome-wide association study identifies risk loci within the major histocompatibility complex region for Hunner-type interstitial cystitis2023
- 著者名/発表者名
  Akiyama Y、Sonehara K、Maeda D、Katoh H、Naito T、Yamamoto K、Morisaki T、Ishikawa S、Ushiku T、Kume H、Homma Y、Okada Y
- 雑誌名
  
  Cell Reports Medicine
  
  巻: 4 号: 7 ページ: 101114-101114
- DOI
  10.1016/j.xcrm.2023.101114
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K16788, KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-22K07538, KAKENHI-PROJECT-22H00476
[雑誌論文] Extracting immunological and clinical heterogeneity across autoimmune rheumatic diseases by cohort-wide immunophenotyping2023
- 著者名/発表者名
  Tanaka Hiroaki、Okada Yukinori、Nakayamada Shingo、Miyazaki Yusuke、Sonehara Kyuto et al.
- 雑誌名
  
  Annals of the Rheumatic Diseases
  
  巻: 83 号: 2 ページ: 242-252
- DOI
  10.1136/ard-2023-224537
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-22H00476, KAKENHI-PROJECT-23K24465
[雑誌論文] Pan-cancer and cross-population genome-wide association studies dissect shared genetic backgrounds underlying carcinogenesis2023
- 著者名/発表者名
  Sato Go、Shirai Yuya、Namba Shinichi、Edahiro Ryuya、Sonehara Kyuto et al.
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 3671-3671
- DOI
  10.1038/s41467-023-39136-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-22K07538, KAKENHI-PROJECT-23K08128, KAKENHI-PROJECT-22H00476
[雑誌論文] Reconstruction of the personal information from human genome reads in gut metagenome sequencing data2023
- 著者名/発表者名
  Tomofuji Yoshihiko、Sonehara Kyuto et al.
- 雑誌名
  
  Nature Microbiology
  
  巻: 8 号: 6 ページ: 1079-1094
- DOI
  10.1038/s41564-023-01381-3
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-22H00476
[雑誌論文] Estimating gene-level false discovery probability improves eQTL statistical fine-mapping precision2023
- 著者名/発表者名
  Wang Qingbo S、Edahiro Ryuya、Namkoong Ho、Hasegawa Takanori、Shirai Yuya、Sonehara Kyuto et al.
- 雑誌名
  
  NAR Genomics and Bioinformatics
  
  巻: 5 号: 4
- DOI
  10.1093/nargab/lqad090
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451
[雑誌論文] Single-cell analyses and host genetics highlight the role of innate immune cells in COVID-19 severity2023
- 著者名/発表者名
  Japan COVID-19 Task Force
- 雑誌名
  
  Nature Genetics
  
  巻: 55 号: 5 ページ: 753-767
- DOI
  10.1038/s41588-023-01375-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K16624, KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-22K08283, KAKENHI-PROJECT-23K11300, KAKENHI-PROJECT-21K09068, KAKENHI-PROJECT-22K15493, KAKENHI-PROJECT-22H00476, KAKENHI-PROJECT-23K27671
[雑誌論文] Analysis of gut microbiome, host genetics, and plasma metabolites reveals gut microbiome-host interactions in the Japanese population2023
- 著者名/発表者名
  Tomofuji Yoshihiko、Kishikawa Toshihiro、Sonehara Kyuto et al.
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 42 号: 11 ページ: 113324-113324
- DOI
  10.1016/j.celrep.2023.113324
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451, KAKENHI-PROJECT-21K08344, KAKENHI-PROJECT-22H00476
[学会発表] Genome-wide association and HLA fine-mapping analysis of Hunner-type interstitial cystitis identify predisposing class II HLA variants.2023
- 著者名/発表者名
  Kyuto Sonehara, Yoshiyuki Akiyama, Daichi Maeda, Hiroto Katoh, Tatsuhiko Naito, Kenichi Yamamoto, Biobank Japan Project, Takayuki Morisaki, Shumpei Ishikawa, Tetsuo Ushiku, Haruki Kume, Yukio Homma, Yukinori Okada
- 学会等名
  The 14th International Workshop on Advanced Genomics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451
[学会発表] 頭蓋内胚細胞腫瘍のゲノムワイド関連解析は遺伝的背景の解明を通じ、病因と疫学の理解に貢献する2023
- 著者名/発表者名
  曽根原究人, 木村由依, 中野嘉子, 小澤達也, 藤井隆司, 富山新太, 鈴木智成, 山口秀, 三輪点, 大江直行, 深井順也, 河村淳史, 市村幸一, 西川亮, 岡田随象, 寺島慶太
- 学会等名
  第82回日本癌学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451
[学会発表] Genome-wide association and HLA fine-mapping analysis of Hunner-type interstitial cystitis identify predisposing class II HLA variants.2023
- 著者名/発表者名
  Kyuto Sonehara, Yoshiyuki Akiyama, Daichi Maeda, Hiroto Katoh, Tatsuhiko Naito, Kenichi Yamamoto, Biobank Japan Project, Takayuki Morisaki, Shumpei Ishikawa, Tetsuo Ushiku, Haruki Kume, Yukio Homma, Yukinori Okada
- 学会等名
  The American Society of Human Genetics Annual Meeting 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451
[学会発表] Genome-wide association and HLA fine-mapping analysis of Hunner-type interstitial cystitis identify risk HLA variants.2023
- 著者名/発表者名
  Kyuto Sonehara, Yoshiyuki Akiyama, Daichi Maeda, Hiroto Katoh, Tatsuhiko Naito, Kenichi Yamamoto, Biobank Japan Project, Takayuki Morisaki, Shumpei Ishikawa, Tetsuo Ushiku, Haruki Kume, Yukio Homma, Yukinori Okada
- 学会等名
  Human Genetics Asia 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14451

1. 秋山佳之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

曽根原 究人 Sonehara Kyuto

研究課題

研究成果

共同研究者

ロングリード技術を用いたMHC領域の構造多様性・機能的意義解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ショート＆ロングリード技術を駆使したゲノムワイドな疾患感受性構造多型の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Genetic drivers of heterogeneity in type 2 diabetes pathophysiology2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Genome-wide association study identifies risk loci within the major histocompatibility complex region for Hunner-type interstitial cystitis2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Extracting immunological and clinical heterogeneity across autoimmune rheumatic diseases by cohort-wide immunophenotyping2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Pan-cancer and cross-population genome-wide association studies dissect shared genetic backgrounds underlying carcinogenesis2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Reconstruction of the personal information from human genome reads in gut metagenome sequencing data2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Estimating gene-level false discovery probability improves eQTL statistical fine-mapping precision2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Single-cell analyses and host genetics highlight the role of innate immune cells in COVID-19 severity2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Analysis of gut microbiome, host genetics, and plasma metabolites reveals gut microbiome-host interactions in the Japanese population2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Genome-wide association and HLA fine-mapping analysis of Hunner-type interstitial cystitis identify predisposing class II HLA variants.2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 頭蓋内胚細胞腫瘍のゲノムワイド関連解析は遺伝的背景の解明を通じ 、病因と疫学の理解に貢献する2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Genome-wide association and HLA fine-mapping analysis of Hunner-type interstitial cystitis identify predisposing class II HLA variants.2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Genome-wide association and HLA fine-mapping analysis of Hunner-type interstitial cystitis identify risk HLA variants.2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

曽根原究人 Sonehara Kyuto

[学会発表] 頭蓋内胚細胞腫瘍のゲノムワイド関連解析は遺伝的背景の解明を通じ、病因と疫学の理解に貢献する2023