山登一郎 YAMATO Ichiro

研究者番号	70111458
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所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2016年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 教授 2011年度 – 2013年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 教授 2007年度 – 2008年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 教授 1997年度 – 2004年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 教授 1995年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 教授 … もっと見る 1992年度 – 1994年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 助教授 1989年度 – 1990年度: 東京理科大学, 基礎工学部, 助教授 1986年度: 東京大学, 理学部, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者機能生物化学 / 代謝生物化学研究代表者以外構造生物化学 / 生物系 / 代謝生物化学
キーワード	研究代表者大腸菌 / エネルギー共役 / 二次性能動輸送 / 逐次結合モデル / Na^+結合部位 / osmotolerance / energy coupling mechanism / NaィイD1+ィエD1 binding / purification & reconstitution / Enterococcus hirae … もっと見る / NaィイD1+ィエD1-translocating ATPase / V-type ATPase / 耐塩性 / 反応機構モデル / Na^+結合反応 / 精製と再構成 / 腸内連鎖球菌 / Na^+輸送性ATPアーゼ / 液胞型ATPアーゼ / Co-transport / Sugar & amino acid transport / Site specific mutagenesis / Affinity model / Energy coupling / Carrier / Secondary active transport / Escherichi coli / 基質結合反応 / 共輸送 / 糖・アミノ酸輸送系 / 部位特異的変異導入 / 親和性モデル / エネルギ-共役 / 輸送タンパク質 / 自由エネルギー摂動計算 / 分子動力学シミュレーション / ポリン / チャンネルタンパク質 / Na^+共役系 / 能動輸送 / Na^+結合モチーフ / 遂次結合モデル … もっと見る研究代表者以外 X線結晶構造解析 / V-ATPase / 分子モーター / 膜タンパク質 / 構造解析 / 回転分子モーター / Saccharomyces / Yeast / <H^+> -ATPase / Vacuole / 輸送蛋白質 / プロトンポンプ / ATPase / 液胞 / 酵母 / proteome / genome / molecular dynamics / simulation / prediction / protein function / protein structure / membrane protein / バイオインフォマティックス / 立体構造予測 / 構造・機能分類 / 構造・機能予測 / 受容体 / 輸送体 / 分子シミュレーション / 構造予測 / バイオインフォマティクス / チャネル / バクテリオロドプシン / ドッキング / 膜タンパク質予測 / 物理的予測 / タンパク質分類 / ポリンチャネル / 光受容膜タンパク質 / 計算機シミュレーション / シグナルペプチド / 分子認識 / 膜組み込み装置 / アミノ酸配列 / プロテオーム / ゲノム / 分子動力学 / シミュレーション / 予測 / 機能 / 構造 / 膜タンパク / ATP / 酵素反応 / Enterococcus hirae / 複合体 / モーター / ナトリウム / ポンプ / 情報構造 / Hyperbolic Tree / WebMap / 視覚化 / WWW 隠す

Ｖ１モーターの構造形成と機能制御の分子機構
- 研究代表者
  
  村田武士
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  千葉大学
Ｖ１―ＡＴＰａｓｅモーターにおけるＡＴＰ加水分解機構の立体構造基盤
- 研究代表者
  
  村田武士
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  千葉大学
腸内連鎖球菌ナトリウム輸送性V型ATPアーゼの分子機構の解明
- 研究代表者
  
  村田武士
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  京都大学
膜タンパク質の構造と機能の予測・解析
- 研究代表者
  
  美宅成樹
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  名古屋大学
   東京農工大学
エージェント型データマイニングに基づく知識発見法の開発と応用
- 研究代表者
  
  溝口文雄
- 研究期間 (年度)
  1998
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 研究機関
  東京理科大学
Na^+輸送性液胞型ATPアーゼの構造と機能研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1997 – 1999
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  機能生物化学
- 研究機関
  東京理科大学
二次性能動輸送タンパク質の共役イオン結合部位の構造研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  東京理科大学
チャンネルタンパク質内イオン透過機構の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1994
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  機能生物化学
- 研究機関
  東京理科大学
二次性能動輸送タンパク質の共役イオン結合部位の構造の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1993
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  東京理科大学
能動輸送タンパク質のエネルギー共役機構研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1993
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  機能生物化学
- 研究機関
  東京理科大学
二次性能動輸送系の遂次結合型エネルギー共役機構の熱力学研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1992
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  東京理科大学
二次性能動輸送蛋白の反応機構の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  山登一郎
- 研究期間 (年度)
  1989 – 1990
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  代謝生物化学
- 研究機関
  東京理科大学
酵田液胞膜のH^+-輸送性ATPaseとCa^<2+>/H^+異方共役輸送蛋白の遺伝生化学
- 研究代表者
  
  安楽泰宏
- 研究期間 (年度)
  1985 – 1986
- 研究種目
  
  一般研究(B)
- 研究分野
  
  代謝生物化学
- 研究機関
  東京大学

すべて 2016 2014 2013 2011 2005 2004 2003 2000

すべて雑誌論文図書産業財産権

[図書] Function and Regulation of Mammalian V-ATPase Isoforms, Regulation of Ca2+-ATPase, V-ATPases and F-ATPases, Advances in Biochemistry in Health and Disease 142016
- 著者名/発表者名
  Suhaila Rahman, Ichiro Yamato, Takeshi Murata
- 総ページ数
  17
- 出版者
  Springer International Publishing
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26291009
[雑誌論文] Operating principles of rotary molecular motors: differences between F<sub>1</sub> and V<sub>1</sub> motors2016
- 著者名/発表者名
  Ichiro Yamato, Yoshimi Kakinuma, Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 13 号: 0 ページ: 37-44
- DOI
  10.2142/biophysico.13.0_37
- NAID
  130005129245
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26291009
[雑誌論文] Crystal structures of the ATP-binding and ADP-release dwells of the V1 rotary motor.2016
- 著者名/発表者名
  Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Shintaro Maruyama, Kazumi Shimono, Fabiana L. Imai, Eiro Muneyuki, Yoshimi Kakinuma, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 13235-13235
- DOI
  10.1038/ncomms13235
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H00811, KAKENHI-PROJECT-26291009
[雑誌論文] Torque generation of Enterococcus hirae V-ATPase2014
- 著者名/発表者名
  Ueno H, Minagawa Y, Hara M, Rahman S, Yamato I, Muneyuki E, Murata T, and Iino R
- 雑誌名
  
  The Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 289 号: 45 ページ: 31212-31223
- DOI
  10.1074/jbc.m114.598177
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-14J10948, KAKENHI-PLANNED-23115002, KAKENHI-PROJECT-24370062, KAKENHI-PROJECT-24570187, KAKENHI-PROJECT-25251016, KAKENHI-PROJECT-25840053, KAKENHI-PUBLICLY-26103528, KAKENHI-PROJECT-26291009
[雑誌論文] Basic properties of rotary dynamics of the molecular motor Enterococcus hirae V1-ATPase2013
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Minagawa, Hiroshi Ueno, Mayu Hara, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa,Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, Ichiro Yamato, Eiro Muneyuki, Hiroyuki Noji, Takeshi Murata, and Ryota Iino
- 雑誌名
  
  J.Biol.Chem
  
  巻: 288 号: 45 ページ: 32700-32707
- DOI
  10.1074/jbc.m113.506329
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23115002, KAKENHI-PROJECT-23370047, KAKENHI-PROJECT-24570187, KAKENHI-PROJECT-24651167, KAKENHI-PROJECT-25251016, KAKENHI-PROJECT-25840053
[雑誌論文] Rotation mechanism of Enterococcus hirae V 1-ATPase based on asymmetric crystal structures2013
- 著者名/発表者名
  Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshimi Kakinuma, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru, Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Ichiro Yamato and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  Nature
  
  巻: 493 号: 7434 ページ: 703-707
- DOI
  10.1038/nature11778
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370047, KAKENHI-PROJECT-24570162, KAKENHI-PUBLICLY-23118705
[雑誌論文] Mutant LV476-7AA of A-subunit of Enterococcus hirae V1-ATPase: High affinity of A3B3 complex to DF axis and low ATPase activity2013
- 著者名/発表者名
  Md. Jahangir Alam, Ichiro Yamato, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Yoshimi Kakinuma and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  SpringerPlus
  
  巻: 2 ページ: 689-689
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370047
[雑誌論文] Mutant LV476-7AA of A-subunit of Enterococcus hirae V 1-ATPase : High affinity of A3B3 complex to DF axis and low ATPase activity2013
- 著者名/発表者名
  Md. Jahangir Alam, Ichiro Yamato, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Yoshimi Kakinuma and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  SpringerPlus
  
  巻: 2 ページ: 689-689
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370047
[雑誌論文] Biochemical and biophysical properties of interactions between subunits of the peripheral stalk region of human V-ATPase2013
- 著者名/発表者名
  Suhaila Rahman, Ichiro Yamato, Shinya Saijo, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 8 号: 2 ページ: e55704-e55704
- DOI
  10.1371/journal.pone.0055704
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370047, KAKENHI-PUBLICLY-23118705
[雑誌論文] Loose Binding of the DF Axis with the A 3B3 Complex Stimulates the Initial Activity of Enterococcus hirae V 1-ATPase2013
- 著者名/発表者名
  Md. Jahangir Alam, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Kano Suzuki, Kenji Mizutani, Yoshiko Ishizuka-Katsura, Noboru Ohsawa, Takaho Terada, Mikako Shirouzu, Shigeyuki Yokoyama, So Iwata, Yoshimi Kakinuma, Ichiro Yamato and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 8 号: 9 ページ: e74291-e74291
- DOI
  10.1371/journal.pone.0074291
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370047, KAKENHI-PROJECT-24570162
[雑誌論文] Crystal structure of the central axis DF complex of the prokaryotic V-ATPase2011
- 著者名/発表者名
  Saijo, S.
- 雑誌名
  
  Pioc Natl Acad Sci USA
  
  巻: 108 号: 50 ページ: 19955-19960
- DOI
  10.1073/pnas.1108810108
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570144, KAKENHI-PUBLICLY-23118705, KAKENHI-PROJECT-23370047
[雑誌論文] Sarkosyl is a good regeneration reagent for studies on vacuolar-type ATPase subunit interactions in Biacore experiments2011
- 著者名/発表者名
  Suhaila Rahman, Satoshi Arai, Shinya Saijo, Ichiro Yamato, and Takeshi Murata
- 雑誌名
  
  Anali. Biochem
  
  巻: 418 号: 2 ページ: 301-303
- DOI
  10.1016/j.ab.2011.07.009
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23370047
[雑誌論文] Interference, fluctuation, and alternation of electron tunneling in protein media. 1.2005
- 著者名/発表者名
  Nishioka H, Kimura A, Yamato T, Kawatsu T, Kakitani T
- 雑誌名
  
  JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 109(5)
  
  ページ: 1978-1987
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[雑誌論文] Torsion potential works in rhodopsin2004
- 著者名/発表者名
  A.Yamada, T.Yamato, T.Kakitani, S.Yamamoto
- 雑誌名
  
  PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY 79(5)
  
  ページ: 476-486
- NAID
  110001158378
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[雑誌論文] A new implicit solvent model for Brownian dynamics simulation : Solvent-accessible surface area dependent effective charge model2004
- 著者名/発表者名
  Tadashi Ando, Toshiyuki Meguro, Ichiro Yamato
- 雑誌名
  
  J.Comput.Chem., Jpn. 3
  
  ページ: 129-136
- NAID
  130000056836
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[雑誌論文] Identification of nucleotide binding sites in V-type Na^<+-> ATPase from Enterococcus hirae2004
- 著者名/発表者名
  Toshiaki Hosaka, Takeshi Murata, Yoshimi Kakinuma, Ichiro Yamato
- 雑誌名
  
  Biosci.Biotechnol.Biochem. 68
  
  ページ: 293-299
- NAID
  130000030837
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[雑誌論文] Role of protein in the primary step of the photoreaction of yellow protein2004
- 著者名/発表者名
  A.Yamada, T.Ishikura, T.Yamato
- 雑誌名
  
  PROTEINS : Structure, Function and Bioinformatics 55(4)
  
  ページ: 1063-1069
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[雑誌論文] Enzymatic hydrolysis of α-and β-oligo(L-aspartic acid)s by poly(aspartic acid) hydrolases-1 and 2 from Sphingomonas sp.KT-12004
- 著者名/発表者名
  Tomohiro Hiraishi, Mariko Kajiyama, Ichiro Yamato, Yoshiharu Doi
- 雑誌名
  
  Macromolecular Bioscience 4
  
  ページ: 330-339
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[雑誌論文] Direct measure of functional importance visualized atom-by-atom for photoactive yellow protein.2004
- 著者名/発表者名
  A.Yamada, T.Ishikura, T.Yamato
- 雑誌名
  
  PROTEINS : Structure, Function and Bioinformatics 55(4)
  
  ページ: 1070-1077
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[産業財産権] 化合物の立体構造探索プログラム、立体構造探索装置、及び立体構造探索方法2003
- 発明者名
  目黒俊幸, 山登一郎
- 公開番号
  2003-206246
- 出願年月日
  2003-07-22
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005
[産業財産権] クラスIコラーゲナーゼ遺伝子2000
- 発明者名
  保坂俊彰, 山登一郎
- 権利者名
  山登一郎
- 取得年月日
  2000-05-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12208005

1. 村田武士 (80415322)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 7件
2. 目黒俊幸 (20287478)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
3. 水谷健二 (10525570)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
4. 西條慎也 (80419001)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
5. 柿沼善己 (80134394)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 美宅成樹 (10107542)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 園山正史 (40242242)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 倭剛久 (90251587)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
9. 安楽泰宏 (20012643)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 大隅良典 (30114416)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 溝口文雄 (50084463)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 大和田勇人 (30203954)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 野地博行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
14. 宗行英朗

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

山登 一郎 YAMATO Ichiro

研究課題

研究成果

共同研究者

Ｖ１モーターの構造形成と機能制御の分子機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

Ｖ１―ＡＴＰａｓｅモーターにおけるＡＴＰ加水分解機構の立体構造基盤

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

腸内連鎖球菌ナトリウム輸送性V型ATPアーゼの分子機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

膜タンパク質の構造と機能の予測・解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

エージェント型データマイニングに基づく知識発見法の開発と応用

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

Na^+輸送性液胞型ATPアーゼの構造と機能研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

二次性能動輸送タンパク質の共役イオン結合部位の構造研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

チャンネルタンパク質内イオン透過機構の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

二次性能動輸送タンパク質の共役イオン結合部位の構造の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

能動輸送タンパク質のエネルギー共役機構研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

二次性能動輸送系の遂次結合型エネルギー共役機構の熱力学研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

二次性能動輸送蛋白の反応機構の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

酵田液胞膜のH^+-輸送性ATPaseとCa^<2+>/H^+異方共役輸送蛋白の遺伝生化学

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Function and Regulation of Mammalian V-ATPase Isoforms, Regulation of Ca2+-ATPase, V-ATPases and F-ATPases, Advances in Biochemistry in Health and Disease 142016

著者名/発表者名

山登一郎 YAMATO Ichiro