別所義隆 Bessho Yoshitaka

研究者番号	70242815
その他のID
所属 (現在)	2021年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 放射光科学研究センター, 客員研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2019年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 放射光科学研究センター, 客員研究員 2016年度 – 2017年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 放射光科学総合研究センター, 客員研究員 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, 機能解析第2研究チーム, 研究員 2009年度 – 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, 機能解析第2研究チーム, チームリーダー 1998年度: 名大, 理学(系)研究科, 助手 1996年度 – 1997年度: 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 1993年度 – 1995年度: 名古屋大学, 理学部, 助手
審査区分/研究分野	研究代表者系統・分類 / 遺伝 / ケミカルバイオロジー / ケミカルバイオロジー研究代表者以外遺伝 / ナノ材料・ナノバイオサイエンス / 分子生物学
キーワード	研究代表者ミトコンドリアDNA / 遺伝暗号 / COI遺伝子 / 中生動物 / 二胚虫 / 始原多細胞動物 / ゲノム変異圧 / ミニサークルDNA / 生物・生体工学 / バイオテクノロジー … もっと見る研究代表者以外メダカ / トランスポゾン / 遺伝子導入 / Oryzias latipes / transgenic fish / Tol2 / コヒーレントX線 / フェムト秒 / 生体分子 / 放射線・X線・粒子線 / X線自由電子レーザー / コヒーレントＸ線 / 放射線、Ｘ線、粒子線 / Ｘ線自由電子レーザー / 主要組織適合抗原 / 多型 / 系統樹 / 主要組織適合抗原系 / MHC / HLA / 分子進化 / クラスII / Major Histocompatibility Complex / class II beta / transposable element / phylogenetic tree / アルビノ変異 / チロシナーゼ / アルビノ / medaka / tyrosinase gene / albino / 転移因子 / 転移機構 / 自然集団 / 変異 / 戻し交配 / 突然変異 / Medaka Fish / Transposable element / Transposon / Transposition / Natural population / Genetic variation 隠す

非天然官能基ポスト標識技術による微小マイクロ結晶構造解析法の開発と応用研究代表者継続中
- 研究代表者
  
  別所義隆
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ケミカルバイオロジー
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
フェムト秒コヒーレントX線を活用した複雑系生体高分子の溶液構造可視化法の構築
- 研究代表者
  
  西野吉則
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2012
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  ナノ材料・ナノバイオサイエンス
- 研究機関
  北海道大学
RNAメチル基転移酵素による非天然官能基ポスト標識技術の開発と応用研究代表者
- 研究代表者
  
  別所義隆
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ケミカルバイオロジー
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
中生動物の小環状ミトコンドリアDNAによる分子系統位置と暗号進化に関する研究研究代表者
- 研究代表者
  
  別所義隆
- 研究期間 (年度)
  1997 – 1998
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  系統・分類
- 研究機関
  名古屋大学
メダカのDNA型転移因子の転移機構
- 研究代表者
  
  古賀章彦
- 研究期間 (年度)
  1997 – 1998
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  分子生物学
- 研究機関
  名古屋大学
ミトコンドリアの遺伝暗号とゲノム変異圧による中生動物の系統的位置の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  別所義隆
- 研究期間 (年度)
  1996
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  系統・分類
- 研究機関
  名古屋大学
メダカ・アルビノ変異遺伝子導入系によるチロシナーゼ遺伝子の発現調節機構解析
- 研究代表者
  
  掘寛 (堀寛)
- 研究期間 (年度)
  1996 – 1997
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  名古屋大学
二胚虫ミトコンドリアDNAによる中生動物の系統的位置と遺伝暗号の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  別所義隆
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  系統・分類
- 研究機関
  名古屋大学
プラナリアのミトコンドリアDNAによる遺伝暗号の進化とゲノムの多型現象の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  別所義隆
- 研究期間 (年度)
  1993
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  名古屋大学
遺伝子導入メダカによる主要組織適合抗原系の解析:その分子進化と遺伝的多型機構
- 研究代表者
  
  堀寛
- 研究期間 (年度)
  1993 – 1994
- 研究種目
  
  一般研究(A)
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  名古屋大学

すべて 2020 2019 2018 2017 2016 2012 2011 2010 2009

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Design of a liquid cell toward three-dimensional imaging of unidirectionally-aligned particles in solution using X-ray free-electron lasers2020
- 著者名/発表者名
  Suzuki Akihiro、Kimura Takashi、Yang Ying、Niida Yoshiya、Nishioka Akiko、Tachibana Tatsuro、Takei Masashi、Tono Kensuke、Yabashi Makina、Ishikawa Tetsuya、Oshima Tairo、Bessho Yoshitaka、Joti Yasumasa、Nishino Yoshinori
- 雑誌名
  
  Physical Chemistry Chemical Physics
  
  巻: 22 ページ: 2622-2628
- DOI
  10.1039/c9cp03658j
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942, KAKENHI-PROJECT-15H05737, KAKENHI-PROJECT-16H05989, KAKENHI-PROJECT-17H04819
[雑誌論文] Ribosomal protein L31 in Escherichia coli contributes to ribosome subunit association and translation, whereas short L31 cleaved by protease 7 reduces both activities2017
- 著者名/発表者名
  Masami Ueta, Chieko Wada, Yoshitaka Bessho, Maki Maeda, Akira Wada
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: 22 ページ: 452-471
- DOI
  10.1111/gtc.12488
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[雑誌論文] Crystal structure of the bifunctional tRNA modification enzyme MnmC from Escherichia coli2011
- 著者名/発表者名
  Kitamura A, Sengoku T, Nishimoto M, Yokoyama S, and Bessho Y
- 雑誌名
  
  Protein Sci
  
  巻: 20(7) ページ: 1105-1113
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[雑誌論文] Substrate tRNA recognition mechanism of a multi-site-specific tRNA methyltransferase, Aquifex aeolicus Trm1, based on the X-ray crystal structure2011
- 著者名/発表者名
  Awai T, Ochi A, Ihsanawati I, Sengoku T, Hirata A, Bessho Y, Yokoyama S, and Hori H.
- 雑誌名
  
  J Biol Chem
  
  巻: 286(40) ページ: 35236-35246
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[雑誌論文] Crystal structure of Methanocaldococcus jannaschii Trm4 complexed with sinefungin2010
- 著者名/発表者名
  Kuratani M, Hirano M, Goto-Ito S, Itoh Y, Hikida Y, Nishimoto M, Sekine S, Bessho Y, Ito T, Grosjean H, and Yokoyama S
- 雑誌名
  
  J Mol Biol
  
  巻: 401(3) ページ: 323-333
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[雑誌論文] Structure of an archaeal homologue of the bacterial Fmu/RsmB/RrmB rRNA cytosine5-methyltransferase2010
- 著者名/発表者名
  Hikida Y, Kuratani M, Bessho Y, Sekine SI, and Yokoyama S
- 雑誌名
  
  Acta Crystallogr Sect D
  
  巻: 66(Pt12) ページ: 1301-1307
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] ThermusDB: Renewal to a Comprehensive Knowledge Simulator for the Biological Information of Thermus thermophilus2019
- 著者名/発表者名
  Kei Yura, Yoshitaka Bessho, Kohsuke Honda, Gota Kawai, Toshiyuki Moriya, Naoki Nemoto, Makoto Nishiyama, Gen-ichi Sampei, Tairo Oshima
- 学会等名
  15th International Congress on Thermophiles
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] 高度好熱菌 Thermus thermophilus HB27のミニセルの作製2019
- 著者名/発表者名
  楊影、森屋利幸、別所義隆、西野吉則、大島泰郎
- 学会等名
  第92回日本生化学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] XFEL Coherent Diffractive Bio-Imaging at SACLA/SPring-82019
- 著者名/発表者名
  Yoshitaka Bessho, Toshiyuki Moriya, Ying Yang, Akihiro Suzuki, Yasumasa Joti, Yoshinori Nishino, Tairo Oshima
- 学会等名
  15th International Congress on Thermophiles
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] XFEL Diffractive Bio-Imaging at SACLA/SPring-82018
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  International workshop on “50th anniversary of Thermus thermophilus discovery”
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] XFEL analysis of light-mediated pyrimidine dimer repair by DNA photolyase2018
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] SACLAでの生体溶液試料XFEL回折イメージング手法の開発2018
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第5回RIBOSOME MEETING
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] 光修復酵素ＤＮＡフォトリアーゼのＸＦＥＬ結晶構造解析2018
- 著者名/発表者名
  別所義隆、山元淳平、田中里枝、南後恵理子、岩田想、Ming-Daw Tsai、Lars-Oliver Essen、Manuel Maestre-Reyna
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] 大腸菌リボソーム蛋白 L31 と L36 およびそれらのパラログ(YkgM, YkgO)の機能解析2018
- 著者名/発表者名
  上田雅美、和田千惠子、別所義隆、和田明
- 学会等名
  第5回RIBOSOME MEETING
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] Advanced X-ray bioimaging technology for structural genomics2017
- 著者名/発表者名
  Yoshitaka Bessho
- 学会等名
  8th International Conference on Proteomics and Bioinformatics
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] 遺伝暗号の初期進化とtRNA修飾酵素の役割2017
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  2017年度生命科学系学会合同年次大会 (ConBio2017)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] 大腸菌リボソーム蛋白L31, L36パラログはzur変異によって恒常的に発現する2017
- 著者名/発表者名
  上田雅美、和田千惠子、別所義隆、和田明
- 学会等名
  2017年度生命科学系学会合同年次大会 (ConBio2017)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] 大腸菌リボソームの翻訳活性は従来の測定値より40％高い：L31蛋白損傷の影響を排除する2016
- 著者名/発表者名
  上田雅美、和田千惠子、別所義隆、和田明
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
- 年月日
  2016-12-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] タンパク質生合成系遺伝子群の成立と進化2016
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
- 年月日
  2016-12-02
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K01942
[学会発表] tRNA修飾酵素が主導する遺伝暗号の進化2012
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  日本進化学会第１４回東京大会
- 発表場所
  首都大学東京（東京）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651126
[学会発表] SPring-8/XFELの新しい光に期待される生体分子イメージング手法の開発2012
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  日本宇宙生物科学会第26回大会
- 発表場所
  阿波観光ホテル（徳島県徳島市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651126
[学会発表] SPring-8/SACLAでのXFEL:生体試料イメージング手法の開発2012
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡県福岡市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651126
[学会発表] Research and development of bio-molecular imaging technology at SPring-8/SACLA. 「SPring-8/SACLAのＸ線利用技術: 生体試料イメージング手法の開発」2012
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第2回モデル生物丸ごと一匹学会
- 発表場所
  SPring-8（兵庫県佐用郡佐用町）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651126
[学会発表] SPring-8/XFEL の新しい光に期待する生体試料イメージング手法の開発2012
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第5回アストロバイオロジー・ワークショップ
- 発表場所
  国立天文台（東京都三鷹市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651126
[学会発表] SPring-8/XFELの新しい光に期待する古細菌RNA/RNP分子イメージング手法の開発2011
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第24回日本Archaea研究会講演会
- 発表場所
  鶴岡
- 年月日
  2011-09-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] Multisite specific tRNA methyltransferase Trm1 from a hyper-thermophilic eubacterium, Aquifex aeolicus2011
- 著者名/発表者名
  Takako Awai, Anna Ochi, Ihsanawati, Toru Sengoku, Satoshi Kimura, Takashi Yokogawa, Akira Hirata, Yoshitaka Bessho, Tsutomu Suzuki, Shigeyuki Yokoyama, Hiroyuki Hori
- 学会等名
  Thermophiles 2011
- 発表場所
  Montana USA
- 年月日
  2011-09-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] SPring-8/XFELの新しい光に期待するタンパク質生合成システム・分子イメージング手法の開発2011
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第4回アストロバイオロジーワークショップ
- 発表場所
  神戸大学(神戸市)
- 年月日
  2011-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] 原始生命における核酸修飾と遺伝暗号2011
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第84回日本生化学会大会、シンポジウム1S2p「生命システム原材料の起源と進化」
- 発表場所
  国立京都国際会館(京都市)(招待)
- 年月日
  2011-09-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] 原始生命における核酸修飾と遺伝暗号2011
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第84回日本生化学会大会
- 発表場所
  京都
- 年月日
  2011-09-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] SPring-8/XFELの新しい光に期待する古細菌RNA/RNP分子イメージング手法の開発2011
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第24回日本Archaea研究会講演会
- 発表場所
  慶應義塾大学先端生命科学研究所(鶴岡市)
- 年月日
  2011-09-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] Crystal structure of the bifunctional tRNA modification enzyme MnmC2011
- 著者名/発表者名
  Aya Kitamura, Toru Sengoku, Madoka Nishimoto, Shigeyuki Yokoyama, Yoshitaka Bessho
- 学会等名
  16th Annual meeting of the RNA society(RNA2011)
- 発表場所
  Kyoto Japan
- 年月日
  2011-06-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] SPring-8/XFELの新しい光に期待するタンパク質生合成システム・分子イメージング手法の開発2011
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第4回アストロバイオロジーワークショップ
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2011-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] 核酸化学修飾の役割と基本原材料2010
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  BMB2010(第83回日本分子生物学会年会第88回日本生化学会大会合同大会)
- 発表場所
  神戸市
- 年月日
  2010-12-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] The system-biological whole-cell project of a model organism, Thermus thermophilus HB8.2010
- 著者名/発表者名
  Bessho Y., et al.
- 学会等名
  8th International Congress on Extremophiles (Extremophiles 2010)
- 発表場所
  Portugal
- 年月日
  2010-09-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] 核酸化学修飾の役割と基本原材料2010
- 著者名/発表者名
  別所義隆
- 学会等名
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2010-12-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] The system-biological whole-cell project of a model organism, Thermus thermophilus HB82010
- 著者名/発表者名
  Yoshitaka Bessho, Akeo Shinkai, and Seiki Kuramitsu
- 学会等名
  8th International Congress on Extremophiles(Extremophiles 2010)
- 発表場所
  Portugal
- 年月日
  2010-09-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] ヒスチジルtRNA合成酵素のG(-1)塩基認識機構2009
- 著者名/発表者名
  別所義隆、東島今日子、柴田理恵、西本まどか、倉光成紀、横山茂之
- 学会等名
  第11回R N Aミーティング
- 発表場所
  新潟
- 年月日
  2009-07-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018
[学会発表] ヒスチジルtRNA合成酵素のG(-1)塩基認識機構2009
- 著者名/発表者名
  別所義隆、東島今日子、柴田理恵、西本まどか、倉光成紀、横山茂之
- 学会等名
  第11回RNAミーティング
- 発表場所
  新潟コンベンションセンター(新潟市)
- 年月日
  2009-07-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21603018

1. 堀寛 (60116663)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
2. 河野能顕 (70321750)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 西野吉則 (40392063)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
4. 城地保昌 (30360415)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 竹内昌治 (90343110)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 古賀章彦 (80192574)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. SAULIUS Klimasauskas

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 木村隆志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
9. 鈴木明大

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
10. 大島泰郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

別所 義隆 Bessho Yoshitaka

研究課題

研究成果

共同研究者

非天然官能基ポスト標識技術による微小マイクロ結晶構造解析法の開発と応用研究代表者継続中

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

フェムト秒コヒーレントX線を活用した複雑系生体高分子の溶液構造可視化法の構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

RNAメチル基転移酵素による非天然官能基ポスト標識技術の開発と応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

中生動物の小環状ミトコンドリアDNAによる分子系統位置と暗号進化に関する研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

メダカのDNA型転移因子の転移機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ミトコンドリアの遺伝暗号とゲノム変異圧による中生動物の系統的位置の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

メダカ・アルビノ変異遺伝子導入系によるチロシナーゼ遺伝子の発現調節機構解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

二胚虫ミトコンドリアDNAによる中生動物の系統的位置と遺伝暗号の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

プラナリアのミトコンドリアDNAによる遺伝暗号の進化とゲノムの多型現象の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

遺伝子導入メダカによる主要組織適合抗原系の解析:その分子進化と遺伝的多型機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Design of a liquid cell toward three-dimensional imaging of unidirectionally-aligned particles in solution using X-ray free-electron lasers2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Ribosomal protein L31 in Escherichia coli contributes to ribosome subunit association and translation, whereas short L31 cleaved by protease 7 reduces both activities2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Crystal structure of the bifunctional tRNA modification enzyme MnmC from Escherichia coli2011

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Substrate tRNA recognition mechanism of a multi-site-specific tRNA methyltransferase, Aquifex aeolicus Trm1, based on the X-ray crystal structure2011

著者名/発表者名

別所義隆 Bessho Yoshitaka