加藤和貴 Katoh Kazutaka

研究者番号	70378868
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2017年度 – 2023年度: 大阪大学, 微生物病研究所, 准教授 2016年度: 大阪大学, 免疫学フロンティア研究センター, 特任准教授(常勤) 2010年度 – 2011年度: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生命情報工学研究センター, 招聘研究員 2009年度: 九州大学, デジタルメディシンイニシアティブ, 准教授 2009年度: 九州大学, デジタルメディシン・イニシアティブ, 准教授
審査区分/研究分野	研究代表者小区分45020:進化生物学関連 / 進化生物学 / 生体生命情報学研究代表者以外生物系
キーワード	研究代表者巨大アラインメント / ウイルスゲノム / 多重配列アラインメント / タンパク質立体構造 / タンパク質 / 配列アラインメント / 新型シークエンサー / ロングリードシークエンサ / 分子進化 / 正の淘汰 … もっと見る / データベース / 文字列の比較 / ゲノム比較 / T細胞受容体 / 行動分析 / ゲノムアラインメント / 相同性検索 / 立体構造 / SARS-CoV-2 / FFT / ロングリードシーケンサー / 塩基配列 / 配列解析 / 計算プログラム / 多重アラインメント / 最尤法 / 最節約法 / 生態生命情報学 / 分子系統樹 / 構造アラインメント / 生体生命情報学 / 配列アライメント / バイオインフォマティクス / 並列計算 / 構造アライメント … もっと見る研究代表者以外データベース / シグナル伝達系 / 生物多様性 / 分子系統樹 / ゲノム / 立襟鞭毛虫 / 多細胞化 / 分子進化隠す

MAFFT多重配列アラインメントプログラムの機能拡張研究代表者
- 研究代表者
  
  加藤和貴
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分45020:進化生物学関連
- 研究機関
  大阪大学
MAFFT多重アラインメントプログラムの大量配列データへの対応と機能拡張研究代表者
- 研究代表者
  
  加藤和貴
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  進化生物学
- 研究機関
  大阪大学
MAFFTアルゴリズムの拡張によるRNAおよびタンパク質の構造多重アラインメント研究代表者
- 研究代表者
  
  加藤和貴
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  独立行政法人産業技術総合研究所
   九州大学
多細胞生物起源の研究
- 研究代表者
  
  岩部直之
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  京都大学

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すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology)2021
- 著者名/発表者名
  Katoh, Kazutaka (Ed.)
- 総ページ数
  321
- 出版者
  Springer
- ISBN
  9781071610350
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[図書] Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology)2021
- 著者名/発表者名
  Kazutaka Katoh ed.
- 総ページ数
  321
- 出版者
  Springer
- ISBN
  9781071610350
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[図書] Multiple Alignment of DNA Sequences with MAFFT.'Bioinformatics for DNA Sequence Analysis' edited by D. Posada2009
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Asimenos G, Toh H
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[図書] Multiple Alignment of DNA Sequences with MAFFT.'Bioinformatics for DNA Sequence Analysis'(Chapter 3, Methods in Molecular Biology, 537)2009
- 著者名/発表者名
  Katoh, K., Asimenos, G., Toh, H.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] An engineered ACE2 decoy neutralizes the SARS-CoV-2 Omicron variant and confers protection against infection in vivo2022
- 著者名/発表者名
  Ikemura Nariko、Taminishi Shunta、Inaba Tohru、Arimori Takao、Motooka Daisuke、Katoh Kazutaka、Kirita Yuhei、Higuchi Yusuke、Li Songling、Suzuki Tatsuya、Itoh Yumi、Ozaki Yuki、Nakamura Shota、Matoba Satoaki、Standley Daron M.、Okamoto Toru、Takagi Junichi、Hoshino Atsushi
- 雑誌名
  
  Science Translational Medicine
  
  巻: 14 号: 650
- DOI
  10.1126/scitranslmed.abn7737
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767, KAKENHI-PROJECT-20H00455
[雑誌論文] Amino Acid Specificity of Ancestral Aminoacyl-tRNA Synthetase Prior to the Last Universal Common Ancestor Commonote commonote2022
- 著者名/発表者名
  Furukawa Ryutaro、Yokobori Shin-ichi、Sato Riku、Kumagawa Taimu、Nakagawa Mizuho、Katoh Kazutaka、Yamagishi Akihiko
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Evolution
  
  巻: 90 号: 1 ページ: 73-94
- DOI
  10.1007/s00239-021-10043-z
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02018, KAKENHI-PROJECT-20K06767
[雑誌論文] The evolution of structural genomics2022
- 著者名/発表者名
  Standley Daron M.、Nakanishi Tokuichiro、Xu Zichang、Haruna Soichiro、Li Songling、Nazlica Sedat Aybars、Katoh Kazutaka
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: 14 号: 6 ページ: 1247-1253
- DOI
  10.1007/s12551-022-01031-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[雑誌論文] Deciphering the origin of Aspergillus flavus NRRL21882, the active biocontrol agent of Afla‐Guard(R)2021
- 著者名/発表者名
  Chang P.‐K.、Chang T.D.、Katoh K.
- 雑誌名
  
  Letters in Applied Microbiology
  
  巻: 722231 号: 5 ページ: 509-516
- DOI
  10.1111/lam.13433
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[雑誌論文] Emerging SARS-CoV-2 variants follow a historical pattern recorded in outgroups infecting non-human hosts2021
- 著者名/発表者名
  Katoh Kazutaka、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 1134-1134
- DOI
  10.1038/s42003-021-02663-4
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[雑誌論文] Long-read Sequencing Identifies the Pathogenic Nucleotide Repeat Expansion in RFC1 in a Japanese Case of CANVAS2020
- 著者名/発表者名
  Haruko Nakamura, Hiroshi Doi, Satomi Mitsuhashi, Satoko Miyatake, Kazutaka Katoh, Martin C Frith, Tetsuya Asano, Yosuke Kudo, Takuya Ikeda, Shun Kubota, Misako Kunii, Yu Kitazawa, Mikiko Tada, Mitsuo Okamoto, Hideto Joki, Hideyuki Takeuchi, Naomichi Matsumoto, Fumiaki Tanaka
- 雑誌名
  
  Journal of Human Genetics
  
  巻: 65 号: 5 ページ: 475-480
- DOI
  10.1038/s10038-020-0733-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07977, KAKENHI-PROJECT-19K17014, KAKENHI-PROJECT-17K10080, KAKENHI-PROJECT-20K06767, KAKENHI-PROJECT-20K07907, KAKENHI-PROJECT-18K07503
[雑誌論文] A pipeline for complete characterization of complex germline rearrangements from long DNA reads2020
- 著者名/発表者名
  Mitsuhashi Satomi、Ohori Sachiko、Katoh Kazutaka、Frith Martin C.、Matsumoto Naomichi
- 雑誌名
  
  Genome Medicine
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 67-67
- DOI
  10.1186/s13073-020-00762-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07977, KAKENHI-PROJECT-20K06767, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Long-read DNA sequencing fully characterized chromothripsis in a patient with Langer?Giedion syndrome and Cornelia de Lange syndrome-42020
- 著者名/発表者名
  Lei Ming、Liang Desheng、Yang Yifeng、Mitsuhashi Satomi、Katoh Kazutaka、Miyake Noriko、Frith Martin C.、Wu Lingqian、Matsumoto Naomichi
- 雑誌名
  
  Journal of Human Genetics
  
  巻: - 号: 8 ページ: 667-674
- DOI
  10.1038/s10038-020-0754-6
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464, KAKENHI-PROJECT-19K07977, KAKENHI-PROJECT-19H03621, KAKENHI-PROJECT-20K06767
[雑誌論文] Flexible, Functional, and Familiar: Characteristics of SARS-CoV-2 Spike Protein Evolution2020
- 著者名/発表者名
  Saputri Dianita S.、Li Songling、van Eerden Floris J.、Rozewicki John、Xu Zichang、Ismanto Hendra S.、Davila Ana、Teraguchi Shunsuke、Katoh Kazutaka、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Frontiers in Microbiology
  
  巻: 11 ページ: 2112-2112
- DOI
  10.3389/fmicb.2020.02112
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[雑誌論文] lamassemble: Multiple Alignment and Consensus Sequence of Long Reads2020
- 著者名/発表者名
  Frith Martin C.、Mitsuhashi Satomi、Katoh Kazutaka
- 雑誌名
  
  Methods Mol Biol.
  
  巻: 2231 ページ: 135-145
- DOI
  10.1007/978-1-0716-1036-7_9
- ISBN
  9781071610350, 9781071610367
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07977, KAKENHI-PROJECT-20K06767, KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Analysis of Protein Intermolecular Interactions with MAFFT-DASH2020
- 著者名/発表者名
  Rozewicki John、Li Songling、Katoh Kazutaka、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology)
  
  巻: 2232 ページ: 163-177
- DOI
  10.1007/978-1-0716-1036-7_11
- ISBN
  9781071610350, 9781071610367
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767, KAKENHI-PROJECT-18H02430, KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Repertoire Builder: high-throughput structural modeling of B and T cell receptors2019
- 著者名/発表者名
  Schritt Dimitri、Li Songling、Rozewicki John、Katoh Kazutaka、Yamashita Kazuo、Volkmuth Wayne、Cavet Guy、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Molecular Systems Design & Engineering
  
  巻: 4 号: 4 ページ: 761-768
- DOI
  10.1039/c9me00020h
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464, KAKENHI-PROJECT-18H02430
[雑誌論文] MAFFT-DASH: integrated protein sequence and structural alignment2019
- 著者名/発表者名
  Rozewicki John、Li Songling、Amada Karlou Mar、Standley Daron M、Katoh Kazutaka
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 47
- DOI
  10.1093/nar/gkz342
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464, KAKENHI-PROJECT-18H02430
[雑誌論文] Structural Modeling of Lymphocyte Receptors and Their Antigens2019
- 著者名/発表者名
  Li Songling、Wilamowski Jan、Teraguchi Shunsuke、van Eerden Floris J.、Rozewicki John、Davila Ana、Xu Zichang、Katoh Kazutaka、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Methods in Molecular Biology
  
  巻: 2048 ページ: 207-229
- DOI
  10.1007/978-1-4939-9728-2_17
- ISBN
  9781493997275, 9781493997282
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Parallelization of MAFFT for large-scale multiple sequence alignments2018
- 著者名/発表者名
  Nakamura Tsukasa、Yamada Kazunori D、Tomii Kentaro、Katoh Kazutaka
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 印刷中号: 14 ページ: 2490-2492
- DOI
  10.1093/bioinformatics/bty121
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464, KAKENHI-PROJECT-17J06457
[雑誌論文] MAFFT online service: multiple sequence alignment, interactive sequence choice and visualization2017
- 著者名/発表者名
  Katoh Kazutaka、Rozewicki John、Yamada Kazunori D.
- 雑誌名
  
  Briefings in Bioinformatics
  
  巻: 印刷中号: 4 ページ: 1160-1166
- DOI
  10.1093/bib/bbx108
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Modeling Biocatalysts2017
- 著者名/発表者名
  Schritt Dimitri、Katoh Kazutaka、Li Songling、Standley Daron M.
- 雑誌名
  
  Future Directions in Biocatalysis (Second Edition), edited by T. Matsuda
  
  巻: - ページ: 385-398
- DOI
  10.1016/b978-0-444-63743-7.00019-6
- ISBN
  9780444637437
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] A simple method to control over-alignment in the MAFFT multiple sequence alignment program2016
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Standley DM
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 32 号: 13 ページ: 1933-1942
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btw108
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Application of the MAFFT sequence alignment program to large data―reexamination of the usefulness of chained guide trees2016
- 著者名/発表者名
  Yamada KD, Tomii K, Katoh K
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 32 号: 21 ページ: 3246-3251
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btw412
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[雑誌論文] Parallelization of the MAFFT multiple sequence alignment program2010
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Toh H
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 26 号: 15 ページ: 1899-1900
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btq224
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[雑誌論文] Multiple Alignment of DNA Sequences with MAFFT2009
- 著者名/発表者名
  Kazutaka Katohl, George Asimenos2, Hiroyuki Toh
- 雑誌名
  
  Methods in Molecular Biology 537
  
  ページ: 39-64
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[雑誌論文] Improved accuracy of multiple ncRNA alignment by incorporating structural information into a MAFFT-based framework.2008
- 著者名/発表者名
  Katoh, K., Toh, H.
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics 9,212
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] Recent developments in the MAFFT multiple sequence alignment program2008
- 著者名/発表者名
  Katoh, K. and Toh, H.
- 雑誌名
  
  Briefings in Bioinformatics 9
  
  ページ: 286-298
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] Recent developments in the MAFFT multiple sequence alignment program.2008
- 著者名/発表者名
  Katoh, K., Toh, H.
- 雑誌名
  
  Briefings in Bioinformatics 9(4)
  
  ページ: 286-298
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] Improved accuracy of multiple ncRNA alignment by-incorporating structural information into a MAFFT-based framework2008
- 著者名/発表者名
  Katoh, K. and Toh, H
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics 9
  
  ページ: 212-212
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] PartTree : an algorithm to build an approximate tree from a large number of unaligned sequences.2007
- 著者名/発表者名
  Katoh K., et al.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 23 (3)
  
  ページ: 372-374
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] PartTree: an algorithm to build an approximate tree from a large number of unaligned sequences.2007
- 著者名/発表者名
  Katoh, K., Toh, H.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 23
  
  ページ: 372-374
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] Improvement in the accuracy of multiple sequence alignment program MAFFT.2005
- 著者名/発表者名
  Katoh, K., Kuma, K., Miyata, T., Toh, H.
- 雑誌名
  
  Genome Inform. Ser. Workshop Genome Inform. 16(1)
  
  ページ: 22-33
- NAID
  130003997390
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] Improvement in the accuracy of multiple sequence alignment program MAFFT.2005
- 著者名/発表者名
  Katoh K. et al.
- 雑誌名
  
  Genome Imform.Ser.Workshop Genome Inform. 16(1)
  
  ページ: 22-33
- NAID
  130003997390
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] MAFFT version 5 : improvement in accuracy of multiple sequence alignment.2005
- 著者名/発表者名
  Katoh K. et al.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res. 33(2)
  
  ページ: 511-518
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[雑誌論文] MAFFT version 5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment.2005
- 著者名/発表者名
  Katoh, K., Kuma, K., Toh, H., Miyata, T.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res. 33(2)
  
  ページ: 511-518
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] Annotation of VDJ genes in TCR loci on eutherian genome2023
- 著者名/発表者名
  加藤和貴, Zhou Hao, Daron M Standley
- 学会等名
  日本進化学会第２５回年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[学会発表] Multiple sequence alignments for predicting antigen-antibody interactions2022
- 著者名/発表者名
  Kazutaka Katoh
- 学会等名
  Simons Institute Workshop "Computational Challenges in Very Large-Scale 'Omics'"
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[学会発表] Off-plan use of technology2022
- 著者名/発表者名
  Kazutaka Katoh
- 学会等名
  日本進化学会第 24 回年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[学会発表] 抗原抗体複合体予測における多重配列アラインメントの利用について2022
- 著者名/発表者名
  加藤和貴
- 学会等名
  遺伝研研究会「生命科学を支える分子系統学」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06767
[学会発表] 多重配列アラインメントプログラムMAFFTの新機能について2019
- 著者名/発表者名
  加藤和貴
- 学会等名
  日本進化学会第21回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[学会発表] 多重配列アラインメントの並列計算2018
- 著者名/発表者名
  加藤和貴
- 学会等名
  配列解析シンポジウム ~36 years since Smith-Waterman-Gotoh~
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[学会発表] アラインメント2017
- 著者名/発表者名
  加藤和貴
- 学会等名
  木村資生記念進化学セミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07464
[学会発表] Effect of adding homologs in phylogenetic analysis2011
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Ledergerber C, Dessimoz, C, Gil, M
- 学会等名
  ISMB/ECCB2011
- 発表場所
  Austria Center Vienna, Vienna, Austria
- 年月日
  2011-07-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] Effect of adding homologs in phylogenetic analysis. GCOEバイオインフォマティクス公開セミナー2011
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Ledergerber C, Dessimoz C, Gil M
- 学会等名
  日本バイオインフォマティクス学会北海道地域部会セミナー
- 発表場所
  北海道大学,札幌
- 年月日
  2011-08-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] Effect of adding homologs in phylogenetic analysis2011
- 著者名/発表者名
  Kazutaka Katoh
- 学会等名
  SMBE2011
- 発表場所
  Kyoto University, Kyoto, Japan(招待講演)
- 年月日
  2011-07-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] Effect of adding homologs in phylogenetic analysis2011
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Ledergerber C, Dessimoz, C, Gil, M
- 学会等名
  SMBE2011
- 発表場所
  Kyoto University, Kyoto, Japan
- 年月日
  2011-07-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] Effect of adding homologs in phylogenetic analysis2011
- 著者名/発表者名
  Katoh K
- 学会等名
  Zurich Colloquium for Computational Molecular Evolution
- 発表場所
  ETH Zurich, Zurich, Switzerland
- 年月日
  2011-07-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] Effect of adding homologs in phylogenetic analysis2011
- 著者名/発表者名
  Kazutaka Katoh
- 学会等名
  Zurich Colloquium for Computational Molecular Evolution
- 発表場所
  ETH Zurich, Zurich, Switzerland(招待講演)
- 年月日
  2011-07-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] TWO EXTENSIONS OF MAFFT : PROTEIN STRUCTURE-SEQUENCE ALIGNMENT AND LARGE-SCALE SEQUENCE ALIGNMENT2010
- 著者名/発表者名
  Katoh K
- 学会等名
  CBRC2010
- 発表場所
  Tokyo
- 年月日
  2010-07-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] Two extensions of MAFFT : protein structure-sequence alignment and large-scale sequence alignment2010
- 著者名/発表者名
  Katoh K, Standley D M, Dinh H, Nakamura H, Toh H
- 学会等名
  CBRC2010
- 発表場所
  AIST Tokyo Waterfront Center, Tokyo, Japan
- 年月日
  2010-07-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノム計画:II. 動物初期進化における遺伝子の多様化2009
- 著者名/発表者名
  岩部直之、隈啓一、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、村田友輔、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- 学会等名
  日本遺伝学会第81回大会
- 発表場所
  信州大学理学部(松本市)(一般講演(口頭発表:3B-13))
- 年月日
  2009-09-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] MAFFTash-a structure-sequence multiple alignment program for proteins2009
- 著者名/発表者名
  加藤和貴, Daron M. Standley,中村春木,藤博幸
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜,横浜
- 年月日
  2009-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノム計画:I. ゲノム概観2009
- 著者名/発表者名
  隈啓一、岩部直之、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- 学会等名
  日本遺伝学会第81回大会
- 発表場所
  信州大学理学部(松本市)(一般講演(口頭発表:3B-12))
- 年月日
  2009-09-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] MAFFTash-a structure-sequence multiple alignment program for proteins2009
- 著者名/発表者名
  加藤和貴, Daron M., Standley, 中村春木, 藤博幸
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜, 横浜
- 年月日
  2009-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700326
[学会発表] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノムプロジェクト:I. ゲノムの概観2008
- 著者名/発表者名
  隈啓一、岩部直之、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド(神戸市)(一般講演(ポスター発表:1P-0692))
- 年月日
  2008-12-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] Genome sequencing project of a unicellular choanoflagellate, Monosiga ovata: Extensive molecular phylogenetic analysis with choanoflagellate genes reveals divergence patterns of gene family members in the early evolution of metazoans.2008
- 著者名/発表者名
  Iwabe, N., Kuma, K., Katoh, K., Suga, H., Hirose, N., Toh, H., Miyata, T., Suzuki, Y., Kasahara, M., Narita, T., Shin-i, T., Kuroki, Y., Toyoda, A., Sugano, S., Morishita, S., Kohara, Y., Fujiyama, A.
- 学会等名
  XX International Congress of Genetics
- 発表場所
  Berlin, Germany(一般講演(ポスター発表:P121/18/B))
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノムプロジェクト:II. 動物初期進化における遺伝子の多様化2008
- 著者名/発表者名
  岩部直之、隈啓一、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- 学会等名
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド(神戸市)(一般講演(ポスター発表:1P-0693))
- 年月日
  2008-12-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] 立襟鞭毛虫遺伝子から探る動物初期進化における遺伝子多様化:(2)細胞接着、アポトーシス、転写調節関連遺伝子の進化2007
- 著者名/発表者名
  隈啓一、岩部直之、廣瀬希、菅裕、加藤和貴、藤博幸、宮田隆
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜(横浜市)(一般講演(ポスター発表:4P-1240))
- 年月日
  2007-12-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] 立襟鞭毛虫遺伝子から探る動物初期進化における遺伝子多様化:(1)シグナル伝達系関連遺伝子の進化2007
- 著者名/発表者名
  岩部直之、隈啓一、廣瀬希、菅裕、加藤和貴、藤博幸、宮田隆
- 学会等名
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜(横浜市)(一般講演(ポスター発表:4P-1239))
- 年月日
  2007-12-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] 細胞外カドヘリンドメインを持つタンパク質の進化2007
- 著者名/発表者名
  隈啓一、加藤和貴、藤博幸、宮田隆、岩部直之
- 学会等名
  日本進化学会第9回京都大会
- 発表場所
  京都大学理学部(京都市)(一般講演(口頭発表:A11))
- 年月日
  2007-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[学会発表] 立襟鞭毛虫・ゲノムと多細胞体制の進化, シンポジウムS4「動物進化のゲノム基盤」2007
- 著者名/発表者名
  岩部直之、隈啓一、加藤和貴、菅裕、廣瀬希、藤博幸、岡田雅人、笠原雅弘、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫、宮田隆
- 学会等名
  日本進化学会第9回京都大会
- 発表場所
  京都大学理学部(京都市)(口頭発表:S4-1)
- 年月日
  2007-09-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17018019

1. 岩部直之 (80263060)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
2. 藤博幸 (70192656)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 20件
3. 隈啓一 (10221938)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 11件
4. 岡田雅人 (10177058)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
5. 宮田隆 (20022692)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 11件
6. 山田和範 (20756217)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
7. 富井健太郎 (40357570)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
8. フリスマーティン

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
9. 三橋里美

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
10. 横堀伸一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

加藤 和貴 Katoh Kazutaka

研究課題

研究成果

共同研究者

MAFFT多重配列アラインメントプログラムの機能拡張研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

MAFFT多重アラインメントプログラムの大量配列データへの対応と機能拡張研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

MAFFTアルゴリズムの拡張によるRNAおよびタンパク質の構造多重アラインメント研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

多細胞生物起源の研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology)2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] Multiple Sequence Alignment (Methods in Molecular Biology)2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] Multiple Alignment of DNA Sequences with MAFFT.'Bioinformatics for DNA Sequence Analysis' edited by D. Posada2009

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] Multiple Alignment of DNA Sequences with MAFFT.'Bioinformatics for DNA Sequence Analysis'(Chapter 3, Methods in Molecular Biology, 537)2009

著者名/発表者名

データソース

[雑誌論文] An engineered ACE2 decoy neutralizes the SARS-CoV-2 Omicron variant and confers protection against infection in vivo2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Amino Acid Specificity of Ancestral Aminoacyl-tRNA Synthetase Prior to the Last Universal Common Ancestor Commonote commonote2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The evolution of structural genomics2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Deciphering the origin of Aspergillus flavus NRRL21882, the active biocontrol agent of Afla‐Guard(R)2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Emerging SARS-CoV-2 variants follow a historical pattern recorded in outgroups infecting non-human hosts2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Long-read Sequencing Identifies the Pathogenic Nucleotide Repeat Expansion in RFC1 in a Japanese Case of CANVAS2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A pipeline for complete characterization of complex germline rearrangements from long DNA reads2020

著者名/発表者名

雑誌名

加藤和貴 Katoh Kazutaka