高坂智之 Kosaka Tomoyuki

研究者番号	70500453
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-8181-9127
所属 (現在)	2025年度: 山口大学, 大学研究推進機構 , 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 山口大学, 大学研究推進機構, 准教授 2020年度: 山口大学, 大学院創成科学研究科, 准教授 2017年度 – 2018年度: 山口大学, 大学院創成科学研究科, 助教 2016年度: 山口大学, 創成科学研究科, 助教 2015年度: 山口大学, 農学部, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分38020:応用微生物学関連 / 応用微生物学研究代表者以外小区分61030:知能情報学関連 / システムゲノム科学
キーワード	研究代表者コハク酸デヒドロゲナーゼ / プロピオン酸酸化細菌 / コハク酸脱水素酵素 / 酵素成熟化遺伝子 / プロピオン酸代謝 / 補酵素 / 成熟化遺伝子 / 膜タンパク質 / ヒドロゲナーゼ / 異種発現 … もっと見る / 大腸菌 / 成熟化因子 / ゲノム情報 / 高温メタン発酵 / コハク酸酸化 / 微生物代謝 / 水素放出 / サブユニット構造 / 大腸菌異種発現 / プロピオン酸酸化 / 膜電位 / 水素生成 / フマル酸還元酵素 / メタン発酵 / 共生的プロピオン酸酸化 … もっと見る研究代表者以外生育結合 / 流束均衡解析 / 増殖連動型生産 / 線形計画問題 / 遺伝子削除問題 / 反応削除問題 / 制約モデル / ゲノムスケールモデル / 遺伝子削除 / 微生物 / GPRルール / 遺伝子削除戦略 / 代謝ネットワーク設計 / ゲノムスケール代謝モデル / 混合整数線形計画法 / アルゴリズム / 増殖連動生産 / 有用物質生産 / 代謝ネットワーク / 細胞内ネットワーク / 遺伝的ネットワーク / 二重欠失株 / Chemical Genomics / Multiplex解析 / population変動 / 貞コピー可動型発現プラスミド / deep sequence / 一遺伝子欠失株 / 分子バーコード / 大腸菌 / ケミカルバイオロジー / 長期定常期 / 大腸菌population変動解析 / バーコード解析 / deep sequencing / stationary phase / chemical genomics / population dynamics / deletion collection / bar-code / E. coli 隠す

ゲノム情報を利用した共生的プロピオン酸代謝系酵素の成熟化遺伝子の探索と機能解析研究代表者
- 研究代表者
  
  高坂智之
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分38020:応用微生物学関連
- 研究機関
  山口大学
有用物質を効率的に生産する代謝ネットワークの設計アルゴリズム
- 研究代表者
  
  田村武幸
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分61030:知能情報学関連
- 研究機関
  京都大学
高温性プロピオン酸酸化細菌におけるコハク酸酸化からの水素生成機構の生化学的解明研究代表者
- 研究代表者
  
  高坂智之
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  応用微生物学
- 研究機関
  山口大学
長期定常期から分裂再開までの細胞の生存戦略
- 研究代表者
  
  森浩禎
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2019 2018 2017 2016

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Membrane Potential-requiring Succinate Dehydrogenase Constitutes the Key to Propionate Oxidation and Is Unique to Syntrophic Propionate-oxidizing Bacteria2023
- 著者名/発表者名
  Kosaka Tomoyuki、Tsushima Yuka、Shiota Yusuke、Ishiguchi Takayuki、Matsushita Kazuo、Matsutani Minenosuke、Yamada Mamoru
- 雑誌名
  
  Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ
  
  巻: 38 号: 2 ページ: n/a
- DOI
  10.1264/jsme2.ME22111
- ISSN
  1342-6311, 1347-4405
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05343
[雑誌論文] Gene Deletion Algorithms for Minimum Reaction Network Design by Mixed-Integer Linear Programming for Metabolite Production in Constraint-Based Models: gDel_minRN2023
- 著者名/発表者名
  Tamura Takeyuki、Muto-fujita Ai、Tohsato Yukako、Kosaka Tomoyuki
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Biology
  
  巻: 30 号: 5 ページ: 553-568
- DOI
  10.1089/cmb.2022.0352
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20386
[雑誌論文] An aggregation-defective mutant of Methanothermobacter sp. CaT2 reveals a unique protein-dependent aggregation2019
- 著者名/発表者名
  Kana Sumikawa, Tomoyuki Kosaka, Noriaki Mayahara, Minenosuke Matsutani, Koichi Udo and Mamoru Yamada
- 雑誌名
  
  Microbes and Environments
  
  巻: ー
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07666
[雑誌論文] Flagellum-mediated motility in Pelotomaculum thermopropionicum SI2019
- 著者名/発表者名
  Kosaka Tomoyuki、Goda Mutsumi、Inoue Manami、Yakushi Toshiharu、Yamada Mamoru
- 雑誌名
  
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
  
  巻: - 号: 7 ページ: 1-10
- DOI
  10.1080/09168451.2019.1597618
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07666
[学会発表] 大腸菌での異種ギ酸トランスポーターのギ酸取り込み能の機能解析法の検討とその適応2024
- 著者名/発表者名
  矢原拓弥, 高坂智之
- 学会等名
  日本農芸化学会2024年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05343
[学会発表] ゲノム情報解析による遺伝子の機能に関与する遺伝子群の抽出と可視化2023
- 著者名/発表者名
  高坂智之, 松谷峰之介
- 学会等名
  日本微生物生態学会第36回浜松大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05343
[学会発表] 異種発現によるグラム陽性細菌コハク酸脱水素酵素のFAD共有結合機構の解析2023
- 著者名/発表者名
  塩田悠介, 高坂智之
- 学会等名
  日本微生物生態学会第36回浜松大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05343
[学会発表] 大腸菌における異種コハク酸脱水素酵素の発現と機能化の比較2022
- 著者名/発表者名
  塩田悠介, 高坂智之
- 学会等名
  第74回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05343
[学会発表] Gene deletion algorithms for minimum reaction network design by mixed-integer linear programming for metabolite production in constraint-based models: gDel_minRN2021
- 著者名/発表者名
  Takeyuki Tamura, Ai Muto-Fujita, Yukako Tohsato and Tomoyuki Kosaka
- 学会等名
  第10回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20386
[学会発表] 高温性プロピオン酸酸化細菌のプロピオン酸代謝におけるコハク酸脱水素酵素の生理的役割2018
- 著者名/発表者名
  津島由佳、石口貴之、高坂智之、山田守
- 学会等名
  日本農芸化学会2018年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07666
[学会発表] プロピオン酸酸化細菌のプロピオン酸酸化からの水素生成に関与する因子の探索2017
- 著者名/発表者名
  高坂智之、津島由佳、石口貴之、山田守
- 学会等名
  日本農芸化学会2017年度(平成29年度)大会
- 発表場所
  京都府京都市、京都女子大
- 年月日
  2017-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07666
[学会発表] 高温性プロピオン酸酸化細菌のコハク酸酸化に関与する酵素の機能的特徴2017
- 著者名/発表者名
  津島由佳、石口貴之、高坂智之、山田守
- 学会等名
  日本農芸化学会中四国支部第47回講演会（例会）
- 発表場所
  島根県松江市、島根大学
- 年月日
  2017-01-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07666
[学会発表] 大腸菌が耐熱性向上のために獲得した変異の解析2016
- 著者名/発表者名
  加藤薫平石井あやな村田正之高坂智之山田守
- 学会等名
  日本農芸化学会中四国支部第44回講演会（例会）
- 発表場所
  東京工業大学, 東京
- 年月日
  2016-01-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25250028

1. 遠里由香理 (80346171)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
2. 田村武幸 (00437261)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
3. 森浩禎 (90182203)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 山田守 (30174741)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
5. 松野浩嗣 (10181744)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 牧泰史 (60401733)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 中東憲治 (70322740)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 斉藤菜摘 (50287546)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 片岡正和 (90332676)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 松谷峰之介 (70380558)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 武藤愛 (80730506)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件

高坂 智之 Kosaka Tomoyuki

研究課題

研究成果

共同研究者

ゲノム情報を利用した共生的プロピオン酸代謝系酵素の成熟化遺伝子の探索と機能解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

有用物質を効率的に生産する代謝ネットワークの設計アルゴリズム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

高温性プロピオン酸酸化細菌におけるコハク酸酸化からの水素生成機構の生化学的解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

長期定常期から分裂再開までの細胞の生存戦略

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Membrane Potential-requiring Succinate Dehydrogenase Constitutes the Key to Propionate Oxidation and Is Unique to Syntrophic Propionate-oxidizing Bacteria2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] Gene Deletion Algorithms for Minimum Reaction Network Design by Mixed-Integer Linear Programming for Metabolite Production in Constraint-Based Models: gDel_minRN2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] An aggregation-defective mutant of Methanothermobacter sp. CaT2 reveals a unique protein-dependent aggregation2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Flagellum-mediated motility in Pelotomaculum thermopropionicum SI2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] 大腸菌での異種ギ酸トランスポーターのギ酸取り込み能の機能解析法の検討とその適応2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] ゲノム情報解析による遺伝子の機能に関与する遺伝子群の抽出と可視化2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 異種発現によるグラム陽性細菌コハク酸脱水素酵素のFAD共有結合機構の解析2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 大腸菌における異種コハク酸脱水素酵素の発現と機能化の比較2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Gene deletion algorithms for minimum reaction network design by mixed-integer linear programming for metabolite production in constraint-based models: gDel_minRN2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 高温性プロピオン酸酸化細菌のプロピオン酸代謝におけるコハク酸脱水素酵素の生理的役割2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] プロピオン酸酸化細菌のプロピオン酸酸化からの水素生成に関与する因子の探索2017

著者名/発表者名

学会等名

発表場所

年月日

データソース

[学会発表] 高温性プロピオン酸酸化細菌のコハク酸酸化に関与する酵素の機能的特徴2017

高坂智之 Kosaka Tomoyuki