清水秀幸 Shimizu Hideyuki

研究者番号	70826263
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京科学大学, 総合研究院, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 東京科学大学, M&Dデータ科学センター, 教授 2021年度 – 2024年度: 東京医科歯科大学, M&Dデータ科学センター, 教授 2019年度 – 2020年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 学術研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 中区分62:応用情報学およびその関連分野研究代表者以外小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
キーワード	研究代表者人工知能 / 層別化 / 個別化医療 / 創薬 / 深層学習 / 量子化学 / 抗がん剤 / システム生物学 / がん / 抗がん剤予測モデル … もっと見る / バイオインフォマティクス / がん併用療法 / ケモインフォマティクス / 薬力学 / 薬物動態学 / 治療法 / データ科学 / 免疫チェックポイント阻害薬 / 肺がん / 大規模データ / 予後予測 / 予後 / 胃がん / 大腸がん / 消化器がん … もっと見る研究代表者以外臓器連関 / シングルセル解析 / 代謝 / 深層学習隠す

メタゲノムに隠された抗菌ペプチドの予知と進化創出研究代表者
- 研究代表者
  
  清水秀幸
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2026
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅱ)
- 研究機関
  東京科学大学
深層学習によるヒト全身代謝と臓器間相互作用の解明
- 研究代表者
  
  大野聡
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京医科歯科大学
医薬品としての出口を目指した潜在空間探索のための化合物マルチパラメーター精密推定研究代表者
- 研究代表者
  
  清水秀幸
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅱ)
- 研究機関
  東京医科歯科大学
システム生物学・人工知能で迫るがんの個別化治療戦略研究代表者
- 研究代表者
  
  清水秀幸
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京医科歯科大学
人工知能と理論化学の融合による中分子創薬プラットフォーム研究代表者
- 研究代表者
  
  清水秀幸
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  東京医科歯科大学
データ駆動アプローチによる肺がん予後規定因子と治療標的の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  清水秀幸
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京医科歯科大学
胃がん・大腸がんのユニバーサル予後予測法の開発とその治療応用研究代表者
- 研究代表者
  
  清水秀幸
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  九州大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Modulation of host glutamine anabolism enhances the sensitivity of small cell lung cancer to chemotherapy.2023
- 著者名/発表者名
  Kodama M, Toyokawa G, Sugahara O, Sugiyama S, Haratake N, Yamada Y, Wada R, Takamori S, Shimokawa M, Takenaka T, Tagawa T, Kittaka H, Tsuruda T, Tanaka K, Komatsu Y, Nakata K, Imado Y, Yamazaki K, Okamoto I, Oda Y, Takahashi M, Izumi Y, Bamba T, Shimizu H, Yoshizumi T, Nakayama KI*.
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 42(8) 号: 8 ページ: 112899-112899
- DOI
  10.1016/j.celrep.2023.112899
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K18924, KAKENHI-PROJECT-23K18502, KAKENHI-PLANNED-22H05185, KAKENHI-PROJECT-23K23151
[雑誌論文] Bayesian network enables interpretable and state-of-the-art prediction of immunotherapy responses in cancer patients2023
- 著者名/発表者名
  Hozumi Hideki、Shimizu Hideyuki
- 雑誌名
  
  PNAS Nexus
  
  巻: 2 号: 5
- DOI
  10.1093/pnasnexus/pgad133
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K17856, KAKENHI-PROJECT-23K18502, KAKENHI-PROJECT-23K28184
[雑誌論文] Kastor and Polluks polypeptides encoded by a single gene locus cooperatively regulate VDAC and spermatogenesis.2022
- 著者名/発表者名
  Mise S#, Matsumoto A#*, Shimada K, Hosaka T, Takahashi M, Ichihara K, Shimizu H, Shiraishi C, Saito D, Suyama M, Yasuda T, Ide T, Izumi Y, Bamba T, Kimura-Someya T, Shirouzu M, Miyata H, Ikawa M, Nakayama KI*.
- 雑誌名
  
  Nat. Commun.
  
  巻: 13(1) 号: 1 ページ: 1071-1071
- DOI
  10.1038/s41467-022-28677-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05167, KAKENHI-PROJECT-20K21397, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PLANNED-17H06304, KAKENHI-PROJECT-20J11940, KAKENHI-PROJECT-18K06157, KAKENHI-PROJECT-20K16107, KAKENHI-PROJECT-21K17856, KAKENHI-PROJECT-21H02751, KAKENHI-PROJECT-20K15101, KAKENHI-PLANNED-20H05928
[雑誌論文] LIGHTHOUSE illuminates therapeutics for a variety of diseases including COVID-192022
- 著者名/発表者名
  Shimizu Hideyuki、Kodama Manabu、Matsumoto Masaki、Orba Yasuko、Sasaki Michihito、Sato Akihiko、Sawa Hirofumi、Nakayama Keiichi I.
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 25 号: 11 ページ: 105314-105314
- DOI
  10.1016/j.isci.2022.105314
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19288, KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-21K17856, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-23K23870, KAKENHI-PROJECT-18H05215
[雑誌論文] Combinatorial analysis of translation dynamics reveals eIF2 dependence of translation initiation at near-cognate codons2021
- 著者名/発表者名
  Ichihara Kazuya、Matsumoto Akinobu、Nishida Hiroshi、Kito Yuki、Shimizu Hideyuki、Shichino Yuichi、Iwasaki Shintaro、Imami Koshi、Ishihama Yasushi、Nakayama Keiichi I
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 49 号: 13 ページ: 7298-7317
- DOI
  10.1093/nar/gkab549
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-20H04844, KAKENHI-PROJECT-20H03241, KAKENHI-PROJECT-21H02404, KAKENHI-PROJECT-20J20906, KAKENHI-PROJECT-21J15131, KAKENHI-PROJECT-21K15023, KAKENHI-PROJECT-21K17856, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-19K22406
[雑誌論文] A universal molecular prognostic score for gastrointestinal tumors2021
- 著者名/発表者名
  Shimizu Hideyuki、Nakayama Keiichi I.
- 雑誌名
  
  npj Genomic Medicine
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 6-6
- DOI
  10.1038/s41525-021-00172-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PROJECT-19K20403
[雑誌論文] Loss of Fbxw7 impairs development of and induces heterogeneous tumor formation in the mouse mammary gland2020
- 著者名/発表者名
  Onoyama Ichiro、Nakayama Shogo、Shimizu Hideyuki、Nakayama Keiichi I.
- 雑誌名
  
  Cancer Research
  
  巻: 80 号: 24 ページ: 5515-5530
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-20-0271
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K09646, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PROJECT-19J10033, KAKENHI-PROJECT-19K20403
[雑誌論文] A shift in glutamine nitrogen metabolism contributes to malignant progression of cancer.2020
- 著者名/発表者名
  Kodama M, Oshikawa K, Shimizu H, Yoshioka S, Takahashi M, Izumi Y, Bamba T, Tateishi C, Tomonaga T, Matsumoto M*, Nakayama KI*.
- 雑誌名
  
  Nat. Commun.
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 1320-1320
- DOI
  10.1038/s41467-020-15136-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05167, KAKENHI-PROJECT-19K20403, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PLANNED-17H06304, KAKENHI-PUBLICLY-18H04903, KAKENHI-PUBLICLY-19H04969, KAKENHI-PUBLICLY-19H05243, KAKENHI-PROJECT-19K06543
[雑誌論文] A Fail-Safe System to Prevent Oncogenesis by Senescence Is Targeted by SV40 Small T Antigen2020
- 著者名/発表者名
  Kiyotaka Oshikawa, Masaki Matsumoto, Manabu Kodama, Hideyuki Shimizu, Keiichi I Nakayama
- 雑誌名
  
  Oncogene
  
  巻: 39 号: 10 ページ: 2170-2186
- DOI
  10.1038/s41388-019-1139-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K06543, KAKENHI-PROJECT-19K20403, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-18H04903, KAKENHI-PUBLICLY-19H04969, KAKENHI-PUBLICLY-19H05243
[雑誌論文] Disruption of FBXL5-mediated cellular iron homeostasis promotes liver carcinogenesis2019
- 著者名/発表者名
  Muto Yoshiharu*、Moroishi Toshiro*、Ichihara Kazuya、Nishiyama Masaaki、Shimizu Hideyuki、Eguchi Hidetoshi、Moriya Kyoji、Koike Kazuhiko、Mimori Koshi、Mori Masaki、Katayama Yuta、Nakayama Keiichi I. (*Equal contribution)
- 雑誌名
  
  The Journal of Experimental Medicine
  
  巻: 216 号: 4 ページ: 950-965
- DOI
  10.1084/jem.20180900
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19433, KAKENHI-PROJECT-18K19509, KAKENHI-PUBLICLY-17H05953, KAKENHI-PROJECT-18H02747, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-19K20403, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-19H03715
[雑誌論文] A 23 gene-based molecular prognostic score precisely predicts overall survival of breast cancer patients2019
- 著者名/発表者名
  Shimizu H, Nakayama KI
- 雑誌名
  
  EBioMedicine
  
  巻: 46 ページ: 150-159
- DOI
  10.1016/j.ebiom.2019.07.046
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20403, KAKENHI-PROJECT-18H05215
[学会発表] Toward ultra-fast drug discovery for hundreds of pathogens2023
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  日米先端工学シンポジウム (JAFOE) シンポジウム
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K18502
[学会発表] Toward personalized cancer treatment through AI drug discovery2023
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  第82回日本癌学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K28184
[学会発表] Toward personalized cancer treatment through AI drug discovery2023
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  第82回日本癌学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K18502
[学会発表] ネクストパンデミックを数理情報科学との融合知で防ぐ2023
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  TMDU感染症センター記念シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K18502
[学会発表] Future challenges of AI in oncology2023
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  Chugai Cancer Summit
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K18502
[学会発表] Future challenges of AI in oncology2023
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  Chugai Cancer Summit
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K28184
[学会発表] 抗がん剤の多剤併用療法の効果予測モデルの開発2023
- 著者名/発表者名
  大田航平, 古賀大介, 麻生啓文, 清水秀幸
- 学会等名
  第46回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K28184
[学会発表] Machine learning-guided drug discovery: Beyond protein structures2022
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K17856
[学会発表] An AI-based Scoring System Precisely Predicts Overall Survival of Breast Cancer Patients2019
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  第14回研究所ネットワーク国際シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20403
[学会発表] Machine learning uncovers novel aspects in healthcare and life science2019
- 著者名/発表者名
  清水秀幸
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K20403

1. 大野聡 (60755734)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 小野山一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 和泉自泰

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
4. 諸石寿朗

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
5. 松本雅記

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
6. 押川清孝

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 中山啓子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
8. 中山敬一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

清水 秀幸 Shimizu Hideyuki

研究課題

研究成果

共同研究者

メタゲノムに隠された抗菌ペプチドの予知と進化創出研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

深層学習によるヒト全身代謝と臓器間相互作用の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

医薬品としての出口を目指した潜在空間探索のための化合物マルチパラメーター精密推定研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

システム生物学・人工知能で迫るがんの個別化治療戦略研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

人工知能と理論化学の融合による中分子創薬プラットフォーム研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

データ駆動アプローチによる肺がん予後規定因子と治療標的の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

胃がん・大腸がんのユニバーサル予後予測法の開発とその治療応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Modulation of host glutamine anabolism enhances the sensitivity of small cell lung cancer to chemotherapy.2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Bayesian network enables interpretable and state-of-the-art prediction of immunotherapy responses in cancer patients2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Kastor and Polluks polypeptides encoded by a single gene locus cooperatively regulate VDAC and spermatogenesis.2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] LIGHTHOUSE illuminates therapeutics for a variety of diseases including COVID-192022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Combinatorial analysis of translation dynamics reveals eIF2 dependence of translation initiation at near-cognate codons2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A universal molecular prognostic score for gastrointestinal tumors2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Loss of Fbxw7 impairs development of and induces heterogeneous tumor formation in the mouse mammary gland2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

清水秀幸 Shimizu Hideyuki