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土屋 貴穂  Tsuchiya Takaho

研究者番号 70853167
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0001-7540-5115
所属 (現在) 2025年度: 筑波大学, 医学医療系, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2025年度: 筑波大学, 医学医療系, 助教
2019年度 – 2023年度: 筑波大学, 医学医療系, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 1002:人間情報学、応用情報学およびその関連分野
研究代表者以外
生物系
キーワード
研究代表者
バイオインフォマティクス / 1細胞空間トランスクリプトーム / 解析ツール開発 / 数理モデリング / 1細胞空間トランスクプリプトーム / システムバイオロジー / 回帰モデル / シングルセル / PLS回帰モデル / Highly variable genes … もっと見る / 空間トランスクリプトーム / 細胞間相互作用 / ゲノム編集 / 遺伝子治療 / 創薬 / 集団ゲノム解析 / 一塩基多型 / 細胞型 / 転写因子認識配列 / データベース / エピジェネティクス … もっと見る
研究代表者以外
マルチオミクス / システム生物学 / 代謝アダプテーション / 2型糖尿病 / 2型糖尿病 / トランスオミクス 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (27件)
  • 共同研究者

    (8人)
  •  細胞間相互作用に基づく細胞間と細胞内の統合ネットワーク推定手法開発研究代表者

    • 研究代表者
      土屋 貴穂
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2029
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      筑波大学
  •  1細胞空間トランスクリプトームによる細胞内と細胞間の統合ネットワーク推定手法開発研究代表者

    • 研究代表者
      土屋 貴穂
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2023
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      筑波大学
  •  集団ゲノムデータに基づき変異を避けることによる遺伝子治療用gRNA設計法の確立研究代表者

    • 研究代表者
      土屋 貴穂
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2020
    • 研究種目
      研究活動スタート支援
    • 審査区分
      1002:人間情報学、応用情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      筑波大学
  •  2型糖尿病の代謝アダプテーション

    • 研究代表者
      黒田 真也
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] The RNA-binding protein Msi2 regulates autophagy during myogenic differentiation2024

    • 著者名/発表者名
      Wang R, Kato F, Watson RY, Beedle AM, Call JA, Tsunoda Y, Noda T, Tsuchiya T, Kashima M, Hattori A, Ito T.
    • 雑誌名

      Life Sci Alliance .

      巻: 7 号: 5 ページ: e202302016-e202302016

    • DOI

      10.26508/lsa.202302016

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K19431, KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [雑誌論文] Transcription factor-binding k-mer analysis clarifies the cell type dependency of binding specificities and cis-regulatory SNPs in humans2023

    • 著者名/発表者名
      Tahara Saeko、Tsuchiya Takaho、Matsumoto Hirotaka、Ozaki Haruka
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 24 号: 1

    • DOI

      10.1186/s12864-023-09692-9

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K17992, KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [雑誌論文] DNA hypomethylation characterizes genes encoding tissue-dominant functional proteins in liver and skeletal muscle2023

    • 著者名/発表者名
      Maehara H.、Kokaji T.、Hatano A.、Suzuki Y.、Matsumoto M.、Nakayama K. I.、Egami R.、Tsuchiya T.、Ozaki H.、Morita K.、Shirai M.、Li D.、Terakawa A.、Uematsu S.、Hironaka K.、Ohno S.、Kubota H.、Araki H.、Miura F.、Ito T.、Kuroda S.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1 ページ: 19118-19118

    • DOI

      10.1038/s41598-023-46393-5

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K17992, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-21K16349, KAKENHI-PROJECT-21H04759, KAKENHI-PROJECT-23K23870
  • [雑誌論文] CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cells2022

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya Takaho、Hori Hiroki、Ozaki Haruka
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 号: 21 ページ: 4868-4877

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac599

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-19K20394
  • [雑誌論文] In vivo transomic analyses of glucose-responsive metabolism in skeletal muscle reveal core differences between the healthy and obese states.2022

    • 著者名/発表者名
      Kokaji T, Eto M, Hatano A, Yugi K, Morita K, Ohno S, Fujii M, Hironaka KI, Ito Y, Egami R, Uematsu S, Terakawa A, Pan Y, Maehara H, Li D, Bai Y, Tsuchiya T, Ozaki H, Inoue H, Kubota H, Suzuki Y, Hirayama A, Soga T, Kuroda S.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 12 号: 1 ページ: 13719-13719

    • DOI

      10.1038/s41598-022-17964-9

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K19545, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-21K14467, KAKENHI-PROJECT-21K16349, KAKENHI-PROJECT-20H03237, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-17H06300
  • [雑誌論文] Identifying potential regulators of JAGGED1 expression in portal mesenchymal cells2022

    • 著者名/発表者名
      Nishino Teppei、Yoshihara Masaharu、Nakayama Takahiro、Tsuchiya Takaho、Tahara Saeko、Ozaki Haruka、Takahashi Satoru
    • 雑誌名

      BMC Research Notes

      巻: 15 号: 1

    • DOI

      10.1186/s13104-022-06058-4

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [雑誌論文] ゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに基づく遺伝子治療2021

    • 著者名/発表者名
      土屋 貴穂
    • 雑誌名

      BIO Clinica

      巻: Vol.36(5) ページ: 448-452

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [雑誌論文] Trans-omic analysis reveals obesity-associated dysregulation of inter-organ metabolic cycles between the liver and skeletal muscle2021

    • 著者名/発表者名
      Egami Riku、Kokaji Toshiya、Hatano Atsushi、et al.
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 3 ページ: 102217-102217

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102217

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-20H04943, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19J10234, KAKENHI-PROJECT-19J22134, KAKENHI-PROJECT-19K24361, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-18KT0020, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-PROJECT-20H03237
  • [雑誌論文] ゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに基づいた遺伝子治療の展望2021

    • 著者名/発表者名
      土屋 貴穂
    • 雑誌名

      Precision Medicine

      巻: Vol.4(2) ページ: 167-171

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [雑誌論文] ゲノム編集技術と大規模ゲノムデータに基づく遺伝子治療2021

    • 著者名/発表者名
      土屋貴穂
    • 雑誌名

      BIO Clinica

      巻: Vol.36(5) ページ: 448-452

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [雑誌論文] Transomics analysis reveals allosteric and gene regulation axes for altered hepatic glucose-responsive metabolism in obesity2020

    • 著者名/発表者名
      Kokaji Toshiya、Hatano Atsushi、Ito Yuki、et al.
    • 雑誌名

      Science Signaling

      巻: 13 号: 660 ページ: 1236-1236

    • DOI

      10.1126/scisignal.aaz1236

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-19H04969, KAKENHI-PUBLICLY-19H05243, KAKENHI-PUBLICLY-20H04847, KAKENHI-PUBLICLY-20H04943, KAKENHI-PROJECT-18H02431, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19K24361, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-18KT0020, KAKENHI-PROJECT-20H03237
  • [雑誌論文] 集団ゲノムデータから展望する遺伝子治療とプレシジョンメディシンの動向2020

    • 著者名/発表者名
      土屋 貴穂
    • 雑誌名

      Precision Medicine

      巻: Vol.3(10) ページ: 630-634

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [雑誌論文] Stability of RNA sequences derived from the coronavirus genome in human cells2020

    • 著者名/発表者名
      Wakida Hiroyasu、Kawata Kentaro、Yamaji Yuta、Hattori Emi、Tsuchiya Takaho、Wada Youichiro、Ozaki Haruka、Akimitsu Nobuyoshi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 527 号: 4 ページ: 993-999

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.05.008

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PROJECT-19K22679, KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [雑誌論文] 遺伝子治療のためのゲノム編集技術と集団ゲノムデータ2020

    • 著者名/発表者名
      土屋 貴穂
    • 雑誌名

      Medical Science Digest

      巻: Vol.46(12) ページ: 766-770

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [雑誌論文] 集団ゲノムデータに基づくことによる遺伝子治療の展望2020

    • 著者名/発表者名
      土屋 貴穂
    • 雑誌名

      Precision Medicine

      巻: Vol.3(6) ページ: 581-585

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [雑誌論文] ゲノム編集技術を用いた遺伝子治療の開発動向2019

    • 著者名/発表者名
      内田恵理子, 平松直人, 犬飼直人, 岩井謙一, 渡辺武志, 川崎秀吉, 田村幸太朗, 土屋貴穂, 吉見英治, 高橋則彦, 伊原辰哉, 藤本和則, 山下晃人, 小野貴士, 高木観, 小野竜一, 内藤雄樹, 井上貴雄
    • 雑誌名

      医薬品医療機器レギュラトリーサイエンス

      巻: Vol.50(8)

    • NAID

      40021992942

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [学会発表] Predicting SNPs' effects on transcriptional factor binding and cell-type specificity using a crowd of ChIP-seq data2022

    • 著者名/発表者名
      田原沙絵子, 土屋貴穂, 松本拡高, 尾崎遼
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第67回大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] MOCCS-DB: ヒト転写因子認識配列の多様性データベース2022

    • 著者名/発表者名
      田原 沙絵子,土屋 貴穂,松澤 亮輔,尾崎 遼
    • 学会等名
      トーゴーの日シンポジウム2022
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] MOCCSプロファイルで明らかにする、転写因子認識配列の細胞型特異性とヒト一塩基多型が 転写因子結合へ与える影響2022

    • 著者名/発表者名
      Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya, Hirotaka Matsumoto and Haruka Ozaki
    • 学会等名
      2022年日本バイオインフォマティクス学会年会・第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] k-mer profile analysis clarifies cell-type specific TF binding landscape in human2021

    • 著者名/発表者名
      Saeko Tahara, Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会(IBMP2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] CCPLS reveals cell-type specific spatial dependence of transcriptome in single cells2021

    • 著者名/発表者名
      Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
    • 学会等名
      CREST BioDX Symposium 2021
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] Cell-Cell PLS regression analysis reveals cell-type specific spatial dependency of transcriptome in single cells2021

    • 著者名/発表者名
      Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会 2021年年会 第10回生命医薬情報学連合大会(IBMP2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] CellCellTopic:cell-cell interaction analysis by Dirichlet multinomial regression topic modeling2020

    • 著者名/発表者名
      Takaho Tsuchiya and Haruka Ozaki
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IBMP2020)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K19915
  • [学会発表] ChIP-Atlasの二次解析による多彩な転写因子認識配列の解明および更なるデータベース化2020

    • 著者名/発表者名
      田原 沙絵子、土屋 貴穂、尾崎 遼
    • 学会等名
      トーゴーの日 シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [学会発表] ChIP-seqデータベースの大規模解析で解明する細胞型ごとに多彩な転写因子認識配列2020

    • 著者名/発表者名
      田原 沙絵子、土屋 貴穂、尾崎 遼
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会 2020年年会 第9回生命医薬情報学連合大会(IBMP2020)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [学会発表] System Identification of Signaling Dependent Gene Expression with Different Time-Scale Data2020

    • 著者名/発表者名
      土屋貴穂
    • 学会等名
      Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University, Seminar Series of Cell Fate Dynamics & Therapeutics
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • [学会発表] シングルセル空間トランスクリプトームデータを用いた遺伝子制御ネットワークの空間分布解析2019

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya, T. and Ozaki, H.
    • 学会等名
      第8回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2019)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K24361
  • 1.  黒田 真也 (50273850)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  稲葉 有香 (20571970)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  小林 大樹 (20448517)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  幡野 敦 (30755533)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  尾崎 遼 (10743346)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 6.  川田 健太郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  井上 啓
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 8.  野田 岳志
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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