土生芳樹 Habu Yoshiki

研究者番号	80266915
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, 研究領域長
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2015年度: 国立研究開発法人農業生物資源研究所, ゲノム機能改変研究ユニット, 上級研究員 2015年度: 国立研究開発法人農業生物資源研究所, ゲノム機能改変研究ユニット, 主任研究員 2014年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, ゲノム機能改変研究ユニット, 主任研究員 2014年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, 農業先端ゲノム研究センター, 主任研究員 2013年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, ゲノム機能改変研究ユニット, 研究員 … もっと見る 2012年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, その他部局等, 研究員 2011年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, ゲノム機能改変研究ユニット, 主任研究員 2009年度 – 2010年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, 遺伝子組換え技術研究ユニット, 主任研究員 1998年度: 岡崎共同研究機構, 基礎生物学研究所, 助手 1996年度 – 1997年度: 岡崎国立共同研究機構, 基礎生物学研究所, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者遺伝 / 遺伝育種科学 / 育種学 / 遺伝・ゲノム動態研究代表者以外植物生理 / 植物分子生物・生理学
キーワード	研究代表者トランスポゾン / エピゲノム / イネ / 減数分裂期組み換え / メチル化 / ゲノム改変 / 環境ストレス / Morpheus'Molecule 1 / 小分子RNA / Morpheus' Molecule 1 … もっと見る / ヒストンメチル化 / DNAメチル化 / エピジェネティクス / MORPHEUS' MOLECULE1 / シロイヌナズナ / シトシンメチル化 / 反復配列 / サイレンシング / AFLP / マルバアサガオ / キメラ斑 … もっと見る研究代表者以外アサガオ / 色素生合成系遺伝子 / アントシアニン / 花の絞り模様 / トランスポゾン / transgenic rice plant / the common moring glory / the Japanese morning glory / anthocyanin biosynthesis gene / anthocyanin pigmentation / flower variegation / mutable allele / transposable element / トランスジェニックイネ / 転移 / 高等植物 / イネ / マルバアサガオ / 易変性変異 / RNA干渉 / 栄養欠乏ストレス / DCL4 / DCL3 / 基質特異性 / 小分子ＲＮＡ / ２本鎖ＲＮＡ / ＤＣＬ４ / ＤＣＬ３ / シロイヌナズナ / ダイサー / 吹掛け絞り変異 / 不安定変異 / 可動遺伝因子隠す

ゲノム・エピゲノム情報の統合を通した作物の減数分裂期組み換え位置の特徴解明研究代表者
- 研究代表者
  
  土生芳樹
- 研究期間 (年度)
  2015
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  遺伝育種科学
- 研究機関
  国立研究開発法人農業生物資源研究所
植物のダイサーの酵素活性と機能分化
- 研究代表者
  
  福原敏行
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  植物分子生物・生理学
- 研究機関
  東京農工大学
ゲノム情報を書き換えてストレスに対抗する植物のしくみの解明研究代表者
- 研究代表者
  
  土生芳樹
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  育種学
- 研究機関
  独立行政法人農業生物資源研究所
植物ヘテロクロマチン領域のサイレンシング機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  土生芳樹
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  遺伝・ゲノム動態
- 研究機関
  独立行政法人農業生物資源研究所
高等植物におけるDNA型トランスポゾンの転移機構研究代表者
- 研究代表者
  
  土生芳樹
- 研究期間 (年度)
  1998
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  岡崎国立共同研究機構
可動遺伝因子による高等植物の不安定変異の解析
- 研究代表者
  
  飯田滋
- 研究期間 (年度)
  1997
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  岡崎国立共同研究機構
マルバアサガオの花と葉におけるキメラ斑の形成機構研究代表者
- 研究代表者
  
  土生芳樹
- 研究期間 (年度)
  1996
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  遺伝
- 研究機関
  岡崎国立共同研究機構
植物の新トランスポゾンの単離と既知トランスポゾンの異種植物での転移
- 研究代表者
  
  飯田滋
- 研究期間 (年度)
  1996 – 1997
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  植物生理
- 研究機関
  岡崎国立共同研究機構

すべて 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 その他

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Mechanisms linking cytosine methylation to histone modification in Arabidopsis thaliana. In : Noncoding RNAs in plants2011
- 著者名/発表者名
  Arita K, Kanno T, Yoshikawa M, Habu Y
- 出版者
  Springer
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] Gene Body CG and CHG Methylation and Suppression of Centromeric CHH Methylation are Mediated by DECREASE IN DNA METHYLATION1 in Rice.2015
- 著者名/発表者名
  Numa H, Yamaguchi K, Shigenobu S, Habu Y
- 雑誌名
  
  Molecular Plant
  
  巻: 8 号: 10 ページ: 1560-1562
- DOI
  10.1016/j.molp.2015.08.002
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14633
[雑誌論文] Epigenomic modification in rice controls meiotic recombination and segregation distortion2015
- 著者名/発表者名
  Habu Y, Ando T, Ito S, Nagaki K, Kishimoto N, Taguchi-Shiobara F, Numa H, Yamaguchi K, Shigenobu S, Murata M, Meshi T, Yano M
- 雑誌名
  
  Molecular Breeding
  
  巻: 35 号: 4 ページ: 103-103
- DOI
  10.1007/s11032-015-0299-0
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[雑誌論文] Does the upstream region possessing MULE-like sequence in rice upregulate PsbS1 gene expression?2014
- 著者名/発表者名
  Nuruzzaman M, Kanno T, Amada R, Habu Y, Kasajima I, Ishikawa T, Kawai-Yamada M, Uchimiya H
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 9 号: 9 ページ: e102742-e102742
- DOI
  10.1371/journal.pone.0102742
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[雑誌論文] 3’ fragment of miR173-programmed RISC-cleaved RNA is protected from degradation in a complex with RISC and SGS32013
- 著者名/発表者名
  Manabu Yoshikawa
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  
  巻: 110 号: 10 ページ: 4117-4122
- DOI
  10.1073/pnas.1217050110
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24248010, KAKENHI-PROJECT-24580016, KAKENHI-PUBLICLY-24114506
[雑誌論文] Locus-specific requirements of DDR complexes for gene-body methylation of TAS genes in Arabidopsis thaliana2013
- 著者名/発表者名
  Kanno T, Yoshikawa M, Habu Y
- 雑誌名
  
  Plant Molecular Biology Reporter
  
  巻: 31 号: 4 ページ: 1048-1052
- DOI
  10.1007/s11105-012-0554-z
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[雑誌論文] RICE SALT SENSITIVE3 forms a ternary complex with JAZ and class-C bHLH factors and regulates jasmonate-induced gene expression and root cell elongation2013
- 著者名/発表者名
  Toda Y, Tanaka M, Ogawa D, Kurata K, Kurotani K, Habu Y, Ando T, Sugimoto K, Mitsuda N, Katoh E, Abe K, Miyao A, Hirochika H, Hattori T, Takeda S
- 雑誌名
  
  The Plant Cell
  
  巻: 25 号: 5 ページ: 1709-1725
- DOI
  10.1105/tpc.113.112052
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016, KAKENHI-PROJECT-24580493
[雑誌論文] エピミュータジェネシスと次世代育種への展開2013
- 著者名/発表者名
  前川雅彦, 金澤章, 堤伸浩, 木下哲, 土生芳樹, 柴博史, 江面浩
- 雑誌名
  
  育種学研究
  
  巻: 15 ページ: 42-50
- NAID
  10031173700
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[雑誌論文] Tandemly arranged chalcone synthase A genes contribute to the spatially regulated expression of siRNA and the natural bicolor phenotype in Petunia hybrida2012
- 著者名/発表者名
  Morita Y, Saito R, Ban Y, Tanikawa N, Kuchitsu K, Ando T, Yoshikawa Ma, Habu Y, Ozeki Y, Nakayama M
- 雑誌名
  
  Plant J
  
  巻: 70 ページ: 739-749
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] DDM1 (Decrease in DNA Methylation) genes in rice (Oryza sativa).2012
- 著者名/発表者名
  Higo H, Tahir M, Takashima K, Miura A, Watanabe K, Tagiri A, Ugaki M, Ishikawa R, Eiguchi M, Kurata N, Sasaki T, Richards E, Takano M, Kishimoto N, Kakutani T, Habu Y
- 雑誌名
  
  Molecular Genetics and Genomics
  
  巻: 287(20) 号: 10 ページ: 785-792
- DOI
  10.1007/s00438-012-0717-5
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[雑誌論文] siRNA-mediated chromatin maintenance and its function in Arabidopsis thaliana2011
- 著者名/発表者名
  Kanno T, Habu Y
- 雑誌名
  
  Biochim Biophys Acta-Gene Regulatory Mechanisms
  
  巻: 1809 ページ: 444-451
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] 植物におけるRNAサイレンシング機構:転写後型ジーンサイレンシング(PTGS)と転写型ジーンサイレンシング(TGS)2011
- 著者名/発表者名
  吉川学,菅野達夫,土生芳樹
- 雑誌名
  
  細胞工学
  
  ページ: 706-711
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] siRNA-mediated chromatin maintenance and its function in Arabidopsis thaliana2011
- 著者名/発表者名
  Tatsuo Kanno, Yoshki Habu
- 雑誌名
  
  Biochim Biophys Acta
  
  巻: 1809 号: 8 ページ: 444-451
- DOI
  10.1016/j.bbagrm.2011.05.002
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] Transduction of RNA-directed DNA methylation signals to repressive histone marks in Arabidopsis thaliana2010
- 著者名/発表者名
  Numa H, Kim J-M, Matsui A, Kurihara Y, Morosawa T, Ishida J, Mochizuki Y, Kimura H, Shinozaki K, Toyoda T, Seki M, Yoshikawa M, Habu Y
- 雑誌名
  
  EMBO J
  
  巻: 29 ページ: 352-362
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] Epigenetic silencing of endogenous repetitive sequences by MORPHEUS' MOLECULE1 in Arabidopsis thaliana.2010
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 雑誌名
  
  Epigenetics
  
  巻: 5 ページ: 562-565
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] Locus-specific dependency of endogenous silent loci on MOM1 and non-CG methylation in Arabidopsis thaliana.2010
- 著者名/発表者名
  土生芳樹, 他
- 雑誌名
  
  Plant Signaling & Behavior
  
  巻: 5 ページ: 724-726
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] Locus-specific dependency of endogenous silent loci on MOM1 and non-CG methylation in Arabidopsis thaliana2010
- 著者名/発表者名
  Habu Y, Yoshikawa M
- 雑誌名
  
  Plant Signal Behav
  
  巻: 5 ページ: 724-726
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[雑誌論文] Epigenetic silencing of endogenous repetitive sequences by MORPHEUS' MOLECULE1 in Arabidopsis thaliana2010
- 著者名/発表者名
  Habu Y
- 雑誌名
  
  Epigenetics
  
  巻: 5 ページ: 562-565
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[学会発表] イネの脱分化・再分化過程におけるトランスポゾンの活性制御2015
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  国立遺伝学研究所研究集会「転移因子と宿主の相互作用による生命進化」
- 発表場所
  三島
- 年月日
  2015-02-27
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] TALEN による標的変異がDNA メチル化状態へ及ぼす影響の解析2015
- 著者名/発表者名
  賀屋秀隆，沼寿隆，横井彩子，小川大輔，土岐精一，土生芳樹
- 学会等名
  日本育種学会　第128回講演会
- 発表場所
  新潟大学
- 年月日
  2015-09-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14633
[学会発表] イネの脱分化・再分化過程および低メチル化系統における活性トランスポゾンの状態解析2014
- 著者名/発表者名
  土生芳樹, 雑賀啓明, 沼寿隆
- 学会等名
  日本育種学会第126回講演会
- 発表場所
  都城
- 年月日
  2014-09-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] 転移活性をもつトランスポゾンの探索法を考える2014
- 著者名/発表者名
  深井英吾, 土生芳樹
- 学会等名
  日本育種学会第126回講演会
- 発表場所
  都城
- 年月日
  2014-09-26
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] シロイヌナズナTAS遺伝子領域に見られるDNAのメチル化に関与するタンパク因子の解析2012
- 著者名/発表者名
  菅野達夫, 不動寺晶子, 保坂アエニ, 吉川学, 土生芳樹
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  福岡
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] 表現型変化に依らないイネの活性トランスポゾン探索2012
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2012
- 発表場所
  奈良
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] SGS3による切断RNA-RISC複合体の安定化2012
- 著者名/発表者名
  吉川学, 井木太一郎, 土生芳樹, 石川雅之
- 学会等名
  第14回日本RNA学会年会
- 発表場所
  仙台
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] エピゲノム操作の作物育種への応用2012
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  日本育種学会平成24年度秋季大会
- 発表場所
  京都
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] クロマチン修飾を介した植物のゲノム組成改変2011
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  第17回植物バイテクシンポジウム「エピゲノム研究の展開と植物科学」
- 発表場所
  京都府立大学
- 年月日
  2011-01-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[学会発表] クロマチン修飾を介した植物のゲノム組成改変2011
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  第17回京都府立大学植物バイテクシンポジウム「エピゲノム研究の展開と植物科学」
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[学会発表] 育種におけるクロマチン修飾:減数分裂期組み換えとのかかわり日本育種学会シンポジウム「RNAサイレンシング研究の新展開とその育種的利用に向けた展望」2009
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  日本育種学会2009年秋季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[学会発表] シロイヌナズナのサイレンシング因子Morpheus' Molecule 1 (MOM1)による内在性領域不活性化機構の解析2009
- 著者名/発表者名
  土生芳樹, 他
- 学会等名
  日本遺伝学会第81回大会
- 発表場所
  信州大学理学部
- 年月日
  2009-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[学会発表] ゲノムタイリングアレイが拓くヘテロクロマチンサイレンシングの新局面日本植物生理学会シンポジウム「植物科学におけるタイリングアレイと次世代シーケンサーの利用」2009
- 著者名/発表者名
  土生芳樹
- 学会等名
  第50回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21570008
[学会発表] Genome-wide methylation profile of DECREASE IN DNA METHYLATION1 (DDM1) knockdown in rice
- 著者名/発表者名
  Habu Y
- 学会等名
  Translational Cereal Genomics
- 発表場所
  ウイーン
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] イネ低メチル化系統における活性トランスポゾンの探索
- 著者名/発表者名
  沼寿隆, 山口勝司, 重信秀治, 土生芳樹
- 学会等名
  日本育種学会
- 発表場所
  鹿児島
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] A rice DDM1-deficient line: similarities and differences with ddm1 in Arabidopsis thaliana
- 著者名/発表者名
  Numa H, Yamaguchi K, Shigenobu S, Habu Y
- 学会等名
  第55回日本植物生理学会年会
- 発表場所
  富山
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] シロイヌナズナにおけるRNA scilencingを介した遺伝子発現抑制機構の解析
- 著者名/発表者名
  菅野達夫, 吉川学, 土生芳樹
- 学会等名
  第36回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016
[学会発表] Genome-wide methylation profile of DECREASE IN DNA METHYLATION1 (DDM1) knockdown in rice
- 著者名/発表者名
  Habu Y, Numa H, Yamaguchi K, Shigenobu S
- 学会等名
  11th International Symposium on Rice Functional Genomics
- 発表場所
  ニューデリー
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24580016

1. 飯田滋 (30012777)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 福原敏行 (90228924)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 吉川学 (80391564)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
4. 石井一夫 (60449238)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 石川英明 (80625715)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 泉川桂一 (60625713)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 古崎利紀 (60442828)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 長野秀昭

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 瀬田淳

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

土生 芳樹 Habu Yoshiki

研究課題

研究成果

共同研究者

ゲノム・エピゲノム情報の統合を通した作物の減数分裂期組み換え位置の特徴解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

植物のダイサーの酵素活性と機能分化

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ゲノム情報を書き換えてストレスに対抗する植物のしくみの解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

植物ヘテロクロマチン領域のサイレンシング機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

高等植物におけるDNA型トランスポゾンの転移機構研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

可動遺伝因子による高等植物の不安定変異の解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

マルバアサガオの花と葉におけるキメラ斑の形成機構研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

植物の新トランスポゾンの単離と既知トランスポゾンの異種植物での転移

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Mechanisms linking cytosine methylation to histone modification in Arabidopsis thaliana. In : Noncoding RNAs in plants2011

著者名/発表者名

出版者

データソース

[雑誌論文] Gene Body CG and CHG Methylation and Suppression of Centromeric CHH Methylation are Mediated by DECREASE IN DNA METHYLATION1 in Rice.2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Epigenomic modification in rice controls meiotic recombination and segregation distortion2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Does the upstream region possessing MULE-like sequence in rice upregulate PsbS1 gene expression?2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 3’ fragment of miR173-programmed RISC-cleaved RNA is protected from degradation in a complex with RISC and SGS32013

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Locus-specific requirements of DDR complexes for gene-body methylation of TAS genes in Arabidopsis thaliana2013

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

土生芳樹 Habu Yoshiki