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遠里 由佳子  Tohsato Yukako

ORCIDORCID連携する *注記
… 別表記

遠里 由香理  TOHSATO Yukari

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研究者番号 80346171
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 立命館大学, 情報理工学部, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2019年度 – 2024年度: 立命館大学, 情報理工学部, 教授
2017年度 – 2018年度: 大阪電気通信大学, 情報通信工学部, 准教授
2016年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員
2015年度: 理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員
2013年度 – 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, その他部局等, 研究員 … もっと見る
2013年度: 独立行政法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 研究員
2011年度 – 2012年度: 立命館大学, 生命科学部, 助教
2005年度 – 2007年度: 立命館大学, 情報理工学部, 講師 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生体生命情報学 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生命・健康・医療情報学
研究代表者以外
中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野 / 小区分61030:知能情報学関連 / 小区分10040:実験心理学関連 / システムゲノム科学
キーワード
研究代表者
バイオインフォマティクス / 時系列データ / システム生物学 / データ駆動型解析 / C. elegans / 表現型解析 / 時系列データ解析 / 数理モデル / データマイニング / 統計的因果推論 … もっと見る / 顕微鏡画像データ / 物体検出 / バイオイメージインフォマティクス / 因果推論 / 解析・評価 / 画像 / アルゴリズム / 統計数学 / 発生・分化 / データ駆動解析 / 確率的生成モデル / ベイズ推定 / 隠れマルコフモデル / 2D-DIGE / Phenotype MicroArray / 線虫 / 大腸菌 / オミックスデータ解析 / 頑強性 / 国際情報交流 / 代謝 / 感度解析 / 統計解析 / 表現型 / マイクロアレイ / 類似構造検索 / ネットワーク比較 / 代謝ネットワーク / 分子系統樹最短経路間題 / MACCS key / グラフ比較 / アライメント / 類似構造比較 / Tanimoto係数 / データベース / 代謝反応パスウェイ … もっと見る
研究代表者以外
行動表現型 / 神経 / マウス / 脳機能 / 因果推論 / 情報処理 / 大規模データ / 誕生日タグづけ / 生育結合 / 流束均衡解析 / 増殖連動型生産 / 線形計画問題 / 遺伝子削除問題 / 反応削除問題 / 制約モデル / ゲノムスケールモデル / 遺伝子削除 / 微生物 / GPRルール / 遺伝子削除戦略 / 代謝ネットワーク設計 / ゲノムスケール代謝モデル / 混合整数線形計画法 / アルゴリズム / 増殖連動生産 / 有用物質生産 / 代謝ネットワーク / 実験計画法 / 心理物理関数 / 顔認知 / 心理物理学 / ベイズ最適化 / 顔知覚 / 効用関数 / ガウス過程回帰 / ガウス過程選好学習 / 細胞内ネットワーク / 遺伝的ネットワーク / 二重欠失株 / Chemical Genomics / Multiplex解析 / population変動 / 貞コピー可動型発現プラスミド / deep sequence / 一遺伝子欠失株 / 分子バーコード / 大腸菌 / ケミカルバイオロジー / 長期定常期 / 大腸菌population変動解析 / バーコード解析 / deep sequencing / stationary phase / chemical genomics / population dynamics / deletion collection / bar-code / E. coli 隠す
  • 研究課題

    (8件)
  • 研究成果

    (64件)
  • 共同研究者

    (15人)
  •  誕生日タグづけ法による大規模データを利用した神経細胞群と行動表現型との因果推論

    • 研究代表者
      平田 たつみ
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
  •  有用物質を効率的に生産する代謝ネットワークの設計アルゴリズム

    • 研究代表者
      田村 武幸
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分61030:知能情報学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  ベイズ最適化による未知の多次元心理物理関数の推定手法の構築と応用分野の開拓

    • 研究代表者
      小森 政嗣
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分10040:実験心理学関連
    • 研究機関
      大阪電気通信大学
  •  顕微鏡画像データに基づく因果構造マイニング法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      遠里 由佳子
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      立命館大学
  •  細胞の状態を表現する確率モデルの構築と細胞核の動態解析への応用研究代表者

    • 研究代表者
      遠里 由佳子
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      立命館大学
      大阪電気通信大学
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  長期定常期から分裂再開までの細胞の生存戦略

    • 研究代表者
      森 浩禎
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      システムゲノム科学
    • 研究機関
      奈良先端科学技術大学院大学
  •  遺伝子機能の環境依存性に着目した代謝ネットワークのロバスト性機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      遠里 由佳子
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2013
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      独立行政法人理化学研究所
      立命館大学
  •  異種生物間の代謝ネットワークの構造比較に関する研究研究代表者

    • 研究代表者
      遠里 由佳子
    • 研究期間 (年度)
      2005 – 2007
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      立命館大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 特集号 生物学のデータと可視化 生命現象の時空間動態情報の可視化2020

    • 著者名/発表者名
      京田 耕司,ホー ケネス,糸賀 裕弥, 遠里 由佳子,大浪 修一
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      可視化情報学会誌
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K00414
  • [図書] 生命現象の時空間動態情報の可視化2020

    • 著者名/発表者名
      京田 耕司,ホー ケネス,糸賀 裕弥, 遠里 由佳子,大浪 修一
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      可視化情報学会論文誌 特集号 生物学のデータと可視化
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226
  • [図書] Protein Function Prediction for Omics Era: 15. Towards elucidation of the Escherichia coli K-12 unknowneome2011

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato, Natsuko Yamamoto, Toru Nakayshiki, Rikiya Takeuchi, Barry L. Wanner, Hirotada Mori, Daisuke Kihara (Ed.)
    • 出版者
      Springer
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [図書] Springer2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Tohsato, et al.
    • 出版者
      Towards elucidation of the E. coli unknowneome
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] Segmentation of Mouse Brain Slices with Unsupervised Domain Adaptation Considering Cross-sectional Locations2024

    • 著者名/発表者名
      Shimojo Yuki、Suehara Kazuki、Hirata Tatsumi、Tohsato Yukako
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Bioinformatics

      巻: 17 号: 0 ページ: 33-39

    • DOI

      10.2197/ipsjtbio.17.33

    • ISSN
      1882-6679
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281, KAKENHI-PROJECT-20H03345
  • [雑誌論文] Large-scale Image Processing and Three-Dimensional Reconstruction of Mouse Brains with Neurogenic-Tagged Neurons2023

    • 著者名/発表者名
      Kawabata Hiroto、Shimojo Yuki、Hirata Tatsumi、Tohsato Yukako
    • 雑誌名

      Proceedings of the 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology

      巻: ー ページ: 1-7

    • DOI

      10.1145/3620679.3620680

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281, KAKENHI-PROJECT-20H03345
  • [雑誌論文] Gene Deletion Algorithms for Minimum Reaction Network Design by Mixed-Integer Linear Programming for Metabolite Production in Constraint-Based Models: gDel_minRN2023

    • 著者名/発表者名
      Tamura Takeyuki、Muto-fujita Ai、Tohsato Yukako、Kosaka Tomoyuki
    • 雑誌名

      Journal of Computational Biology

      巻: 30 号: 5 ページ: 553-568

    • DOI

      10.1089/cmb.2022.0352

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K20386
  • [雑誌論文] Metabolic Network Analysis by Time-series Causal Inference Using the Multi-dimensional Space of Prediction Errors2023

    • 著者名/発表者名
      Ohyama Takashi、Tohsato Yukako
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Bioinformatics

      巻: 16 号: 0 ページ: 13-19

    • DOI

      10.2197/ipsjtbio.16.13

    • ISSN
      1882-6679
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K20386
  • [雑誌論文] NeuroGT: A brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons2021

    • 著者名/発表者名
      Hirata Tatsumi、Tohsato Yukako、Itoga Hiroya、Shioi Go、Kiyonari Hiroshi、Oka Sanae、Fujimori Toshihiko、Onami Shuichi
    • 雑誌名

      Cell Reports Methods

      巻: 1 号: 3 ページ: 100012-100012

    • DOI

      10.1016/j.crmeth.2021.100012

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-18H05412, KAKENHI-PROJECT-20H03345, KAKENHI-PROJECT-16H06280, KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [雑誌論文] BD5: An open HDF5-based data format to represent quantitative biological dynamics data2020

    • 著者名/発表者名
      Koji Kyoda, Kenneth H. L. Ho, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Shuichi Onami
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 15 号: 8 ページ: e0237468-e0237468

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0237468

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226, KAKENHI-PLANNED-18H05412
  • [雑誌論文] Parameter optimization and sensitivity analysis forlarge kinetic models using a real-coded genetic algorithm2013

    • 著者名/発表者名
      Y.Tohsato, K.Ikuta, A.Shionoya, Y.Mazaki, M .I t o
    • 雑誌名

      Genes

      巻: 518 号: 1 ページ: 84-90

    • DOI

      10.1016/j.gene.2012.11.080

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22500276, KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] ECOH: An Enzyme Commission number predictor using mutual information and a support vector machine2013

    • 著者名/発表者名
      Y.Matsuta, M. I to , Y. Tohsato
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 29 号: 3 ページ: 365-372

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bts700

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22500276, KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] 無限関係モデルを用いた大腸菌の表現型マイクロアレイ解析2013

    • 著者名/発表者名
      杉澤仁,福田一,森浩禎,谷口忠大,伊藤將弘,遠里由佳子
    • 雑誌名

      立命館大学理工学研究所紀要

      巻: 71 ページ: 49-58

    • NAID

      110009595156

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] Biochemical studies on sphingolipids of Artemia franciscana:complex neutral glycosphingolipids2013

    • 著者名/発表者名
      H.Kojima, Y.Tohsato, K.Kobayama, S.Itonori, M.Ito
    • 雑誌名

      Glycoconjugate Journal

      巻: 30 号: 3 ページ: 257-268

    • DOI

      10.1007/s10719-012-9436-8

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22500276, KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] 相互情報量とSVMを用いた酵素反応におけるEC番号の推定法の開発2012

    • 著者名/発表者名
      松田祥彦, 伊藤將弘, 遠里由佳子
    • 雑誌名

      立命館大学理工学研究所紀要

      巻: 70 ページ: 21-28

    • NAID

      110009461549

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] Intrinsically disordered proteins in Human mitochondria2012

    • 著者名/発表者名
      M.Ito, Y.Tohsato, H.Sugisawa, S.Kohara, S.Fukuchi, I.Nishikawa, K. Nishikawa
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 17 号: 10 ページ: 817-825

    • DOI

      10.1111/gtc.12000

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22500276, KAKENHI-PROJECT-23500372, KAKENHI-PROJECT-23700353, KAKENHI-PLANNED-21113007
  • [雑誌論文] 無限関係モデルを用いた大腸菌の表現型マイクロアレイ解析2012

    • 著者名/発表者名
      杉澤仁,福田一,森浩禎,谷口忠大,伊藤將弘,遠里由佳子
    • 巻
      Vol.71
    • ページ
      49-58
    • NAID

      110009595156

    • URL

      http://ci.nii.ac.jp/naid/110009595156

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] 線虫Caenorhabditis elegansの発生ステージにおける定量プロテオーム解析2012

    • 著者名/発表者名
      物部香奈美, 遠里由佳子, 早野俊哉, 伊藤將弘
    • 雑誌名

      立命館大学理工学研究所紀要

      巻: 70 ページ: 13-20

    • NAID

      110009461548

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] Comparative proteomic analysis reveals differentially expressed proteins in Caenorhabditis eleganspgl-1 mutants grown at 20°C and 25°C2012

    • 著者名/発表者名
      Y.Tohsato, K.Monobe, K. Suzuki, T.Hayano, I.Kawasaki, M .I t o
    • 雑誌名

      Journal of Proteomics

      巻: 75 号: 15 ページ: 4792-4801

    • DOI

      10.1016/j.jprot.2012.04.038

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22500276, KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] Comparative proteomic analysis reveals differentially expressed proteins igrown at 20°C and 25°Cn Caenorhabditis elegans pgl-1 mutants2012

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato, Kanami Monobe, Kenji Suzuki, Toshiya Hayano
    • 雑誌名

      Journal of Proteomics

      巻: 印刷中(掲載確定)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] 相互情報量とSVMを用いた酵素反応におけるEC番号の推定手法の開発2011

    • 著者名/発表者名
      松田祥彦, 伊藤將弘, 遠里由佳子
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告

      巻: 7 ページ: 1-6

    • NAID

      110008605711

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] 機械学習によるEP2受容体を標的とした化合物の探索手法の開発2011

    • 著者名/発表者名
      小原祥平, 遠里由佳子, 伊藤將弘
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告

      巻: 8 ページ: 1-2

    • NAID

      110008605712

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [雑誌論文] 反応プロファイルに基づく異種生物種間の代謝ネットワークの比較2007

    • 著者名/発表者名
      遠里由佳子, 西村悠
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告 バイオ情報学 2007-BIO-05

      ページ: 97-101

    • NAID

      110004823191

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [雑誌論文] Metabolic pathway alignment based on similarity between chemical structures2007

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato, Yu Nishimura
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Bioinformatics Vol.48

      ページ: 9-18

    • NAID

      110006249442

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [雑誌論文] 代謝反応パスウェイのアラインメントにおけるZ値を用いたスコア補正法2007

    • 著者名/発表者名
      西村悠, 遠里由佳子
    • 雑誌名

      情報処理学会研究報告バイオ情報学 2007-BIO-08

      ページ: 33-40

    • NAID

      110006595428

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [雑誌論文] A method for Species Comparison of Metabolic Networks using ReactionProfile2006

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Bioinformatics(情報処理学会論文誌「バイオ情報学」) Vol. 47,No.SIG17

      ページ: 42-47

    • NAID

      110004823191

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [雑誌論文] An OGSA-based integration of life scientific resources for drug discovery2005

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Kosaka, Yukako Tohsato, Susumu Date, Hideo Matsuda, Shinji Shimojo
    • 雑誌名

      Methods of Information in Medicine 44・2

      ページ: 480-489

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [雑誌論文] Biological Receptor for the External Synchronization of Mutually Coupled Oscillator Systems

    • 著者名/発表者名
      Seido Nagano, Atsushi Yokoyama, Yukako Tohsato, Takuya Takahashi
    • 雑誌名

      (投稿中)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [学会発表] 高解像度なマウス脳画像の領域検出にむけた 画像の前後処理法の提案2022

    • 著者名/発表者名
      下條 優季  平田 たつみ  遠里 由佳子
    • 学会等名
      第25回 画像の認識・理解シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] NeuroGTのマウス全脳画像の三次元再構築2022

    • 著者名/発表者名
      川端 宏知、下條 優貴、平田 たつみ、遠里 由佳子
    • 学会等名
      第11回生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] 深層学習による高解像度なマウス脳切片画像の領域検出に向けた画像処理法の提案2022

    • 著者名/発表者名
      下條優季、平田 たつみ、遠里 由佳子
    • 学会等名
      第11回生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] 大規模なマウスの脳切片画像の画像処理と三次元再構築2022

    • 著者名/発表者名
      川端 宏知 下條 優貴 平田たつみ 遠里 由佳子
    • 学会等名
      第25回 画像の認識・理解シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] 非線形な時系列に対するガウス過程回帰を用いた因果推論2021

    • 著者名/発表者名
      大山 鷹志、遠里 由佳子
    • 学会等名
      第10回生命医薬情報連合大会(IIBMP2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226
  • [学会発表] NeuroGT: A brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsumi Hirata, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Go Shioi, Hiroshi Kiyonari, Sanae Oka, Toshihiko Fujimori and Shuichi Onami
    • 学会等名
      第54回日本発生学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] Gene deletion algorithms for minimum reaction network design by mixed-integer linear programming for metabolite production in constraint-based models: gDel_minRN2021

    • 著者名/発表者名
      Takeyuki Tamura, Ai Muto-Fujita, Yukako Tohsato and Tomoyuki Kosaka
    • 学会等名
      第10回生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K20386
  • [学会発表] NeuroGT:神経細胞の誕生日タグづけ用CreERドライバーマウスの脳アトラス2021

    • 著者名/発表者名
      平田たつみ、遠里由佳子、糸賀裕弥、塩井剛、清成寛、岡早苗、藤森俊彦、大浪修一
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会、ワークショップ
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] 領域検出における時系列を用いたドメイン適用適応と細胞画像への応用2021

    • 著者名/発表者名
      野崎 弘晃, 遠里 由佳子
    • 学会等名
      第24回画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2021)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226
  • [学会発表] NeuroGT:神経細胞の誕生日タグづけ用CreERドライバーマウスの脳アトラス2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsumi Hirata, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Go Shioi, Hiroshi Kiyonari, Sanae Oka, Toshihiko Fujimori and Shuichi Onami
    • 学会等名
      第44回日本神経科学大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] Launching NeuroGT: a brain atlas of neurogenic tagging CreER drivers for birthdate-based classification and manipulation of mouse neurons2021

    • 著者名/発表者名
      Tatsumi Hirata, Yukako Tohsato, Hiroya Itoga, Go Shioi, Hiroshi Kiyonari, Sanae Oka, Toshihiko Fujimori and Shuichi Onami
    • 学会等名
      北米神経科学学会2021
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19281
  • [学会発表] 確率的生成モデルを用いた線虫初期発生の分節化2020

    • 著者名/発表者名
      中谷 圭志, 遠里 由佳子
    • 学会等名
      生命医薬情報連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226
  • [学会発表] 線虫の細胞核の時系列データの HDP-HSMM を用いた分節化2020

    • 著者名/発表者名
      中谷 圭志, 遠里 由佳子
    • 学会等名
      情報処理学会研究報告
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226
  • [学会発表] 撮影条件の異なる細胞画像の領域検出におけるデータ拡張の有効性2020

    • 著者名/発表者名
      野崎 弘晃, 遠里 由佳子
    • 学会等名
      生命医薬情報連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12226
  • [学会発表] Data-driven analysis of female pronuclear migration by image-processing embryonic movies in Phenobank2019

    • 著者名/発表者名
      Y. Tohsato, H. Okada, K. Kyoda, S, Onami
    • 学会等名
      22nd International C. elegans Conference
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K00414
  • [学会発表] 公共データベースの顕微鏡画像を用いた細胞核分裂の定量計測と表現型解析2018

    • 著者名/発表者名
      遠里 由佳子, 岡田 初美, 京田 耕司, 大浪 修一
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K00414
  • [学会発表] Large-Scale Kinetic Modeling for the Central Metabolism in Escherichia coli Grown on Glucose or Glycerol2013

    • 著者名/発表者名
      Akitaka Shionoya, Kunihiko Ikuta, Shuichi Onami, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      Genome Informatics
    • 発表場所
      Biopolis, Singapore
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Large-Scale Kinetic Modeling for the Central Metabolism in Escherichia coli Grown on Glucose or Glycerol2013

    • 著者名/発表者名
      Akitaka Shionoya, Kunihiko Ikuta, Shuichi Onami, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      Genome Informatics
    • 発表場所
      Singapore, Biopolis
    • 年月日
      2013-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Modeling of central metabolism with regulation of rpoS gene in Escherichia coli2012

    • 著者名/発表者名
      Akitaka Shionoya, Kunihiko Ikuta, Hitomi Dose, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      Genome Informatics
    • 発表場所
      China, Hangzhou
    • 年月日
      2012-12-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] 代謝ネットワークの頑強性に着目した数理解析2012

    • 著者名/発表者名
      遠里由佳子
    • 学会等名
      電子情報通信学会2012年総合大会(招待講演)
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] 遺伝子の環境依存性に着目したPhenotype MicroArray 解析2012

    • 著者名/発表者名
      遠里由佳子
    • 学会等名
      第3回BKCバイオインフォマティクス研究会(招待講演)
    • 発表場所
      立命館大学(滋賀県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Parameter optimization and correlation analysis for a large kinetic model using a real-coded genetic algorithm2012

    • 著者名/発表者名
      Kunihiko Ikuta, Akitaka Shionoya, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      Genome Informatics
    • 発表場所
      China, Hangzhou
    • 年月日
      2012-12-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Phenotype microarray analysis of Escherichia coli using infinite relational model2012

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Sugisawa, Hajime Fukuda, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Tadahiro Taniguchi, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      Genome Informatics
    • 発表場所
      China, Hangzhou
    • 年月日
      2012-12-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis of C. briggsae2011

    • 著者名/発表者名
      A. Terasawa, Y. Tohsato, et al.
    • 学会等名
      18th International C. elegans Meeting
    • 発表場所
      America/University of California (Los Angeles)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Quantitative Proteomic Analysis in C. elegans2011

    • 著者名/発表者名
      K. Monobe, Y. Ishido, Y. Tohsato, et al.
    • 学会等名
      18th International C. elegans Meeting
    • 発表場所
      America/University of California (Los Angeles)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Proteomic Analysis of C. elegans Mutants2011

    • 著者名/発表者名
      Y. Tohsato, et al.
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川都)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] An Alignment Method Based on Compound Similarity to Analysis of Metabolic Pathway Duplications2007

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato, Yu Nishimura
    • 学会等名
      Genome informatics 2007 Poster Book
    • 発表場所
      Singapore
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [学会発表] Comparison and evaluation of methods for generating phylophenetic trees by reaction profiles of metabolic networks2007

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato
    • 学会等名
      Proceedings of the 6th Annual International Conference on Computational Systems Bioinformatics, Genome informatics 2007 Poster Book
    • 発表場所
      California
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [学会発表] 大腸菌のフェノーム情報に基づく代謝反応ネットワーク解析2007

    • 著者名/発表者名
      遠里由佳子
    • 学会等名
      第17回システムバイオロジー研究会
    • 発表場所
      奈良先端大学院大学
    • 年月日
      2007-11-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17700297
  • [学会発表] Analysis of the phylogenetic profile of human glycosyltransferases

    • 著者名/発表者名
      Takayoshi Tomono, Yukako Tohsato, Masahiro Ito
    • 学会等名
      The 23nd International Conference on Genome Informatic
    • 発表場所
      Tainan, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Quantitative analysis of mRNA expression profiles of ceramide-related genes using qRT-PCR

    • 著者名/発表者名
      Haruka Yamaji, Kousuke Hori, Emiko Watase, Yukako Tohsato, Kenji Suzuki, Masahiro Ito
    • 学会等名
      5th East Asia C. elegans Meeting
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Parameter optimization and correlation analysis for a large kinetic model using a real-coded genetic algorithm

    • 著者名/発表者名
      Kunihiko Ikuta, Akitaka Shionoya, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      The 23nd International Conference on Genome Informatic
    • 発表場所
      Tainan, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Phenotype microarray analysis of Escherichia coli using infinite relational model

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Sugisawa, Hajime Fukuda, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Tadahiro Taniguchi, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      The 23nd International Conference on Genome Informatic
    • 発表場所
      Tainan, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Modeling of central metabolism with regulation of rpoS gene in Escherichia coli

    • 著者名/発表者名
      Akitaka Shionoya, Kunihiko Ikuta, Hitomi Dose, Hirotada Mori, Masahiro Ito, Yukako Tohsato
    • 学会等名
      The 23nd International Conference on Genome Informatic
    • 発表場所
      Tainan, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] 大腸菌における表現型マイクロアレイデータ解析と数理モデルの構築

    • 著者名/発表者名
      遠里由佳子
    • 学会等名
      第4回次世代創薬プロジェクトワークショップ
    • 発表場所
      立命館大学, 滋賀
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • [学会発表] Comparative proteomic analysis for Caenorhabditis elegans pgl-1 mutants grown at 20°C and 25°C using 2D-DIGE

    • 著者名/発表者名
      Yukako Tohsato, Kanami Monobe, Kenji Suzuki, Toshiya Hayano, Ichiro Kawasaki, Masahiro Ito
    • 学会等名
      5th East Asia C. elegans Meeting
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23700353
  • 1.  田村 武幸 (00437261)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 2.  高坂 智之 (70500453)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 3.  森 浩禎 (90182203)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  山田 守 (30174741)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  松野 浩嗣 (10181744)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  牧 泰史 (60401733)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  中東 憲治 (70322740)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  斉藤 菜摘 (50287546)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  小森 政嗣 (60352019)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  平田 たつみ (80260587)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 9件
  • 11.  片岡 正和 (90332676)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  武藤 愛 (80730506)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 13.  大浪 修一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 14.  伊藤 將弘
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 15.  糸乗 前
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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