小段篤史 Kodan Atsushi

研究者番号	80360543
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 高等研究院, 特定准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2024年度: 京都大学, 高等研究院, 特定助教 2022年度 – 2023年度: 京都大学, 高等研究院, 特定准教授 2017年度: 京都大学, 農学研究科, 特任助教 2014年度: 京都大学, 物質ー細胞統合システム拠点, 助教 2013年度: 京都大学, 物質‐細胞統合システム拠点, 助教 … もっと見る 2012年度: 京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 特定拠点助教 2011年度: 京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 研究員 2011年度: 京都大学, 物質.細胞統合システム拠点, 研究員 2010年度: 京都大学, 物質-細胞統合システム拠点, 特定研究員 2006年度 – 2007年度: 京都大学, 医学研究科, 研究員(科学研究) 2004年度 – 2005年度: 独立行政法人理化学研究所, 速度論的結晶学研究チーム, 連携研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者応用薬理学 / 小区分38030:応用生物化学関連 / 構造生物化学研究代表者以外中区分38:農芸化学およびその関連分野 / 応用生物化学 / 物理系薬学
キーワード	研究代表者生体分子 / 膜タンパク質 / 癌 / 蛋白質 / 機能 / 立体構造 / ATP / 分子メカニズム / 膜蛋白質 / X線結晶構造解析 … もっと見る / ABC蛋白質 / 薬学 / 構造 / 細胞膜 / トランスポーター / 脂質 / コレステロール / 機能ー構造相関 / 分子機構 / 脂質輸送 / ATP加水分解活性 / アポA-I / 脂質代謝 / 脂質輸送型ABCタンパク質 / 輸送体 / 動脈硬化 / 善玉コレステロール / 新生HDL / 脂質輸送型ABC蛋白質 / 薬理学 / バイオテクノロジー / 構造変化 / タンパク質 / 機能-構造相関 / P糖蛋白質 / ABC輸送体 / P糖タンパク質 / ABCタンパク質 / 立体構造解析 / 多剤耐性 / 創薬 … もっと見る研究代表者以外 X線結晶解析 / 膜タンパク質 / 構造生物学 / 多剤耐性 / P糖タンパク質 / 細胞接着 / コラーゲン / メカノバイオロジー / 細胞分化 / 細胞外マトリックス / 接着斑 / membrane proteins / Single Particle Analysis / X-ray crystalloqraphy / P-glycoprotein / ABC transporter / 糖尿病 / 胆汁排出 / 電子顕微鏡 / トランスポーター / 単粒子構造解析 / ABCトランスポーター / 昆虫細胞 / 結晶化 / MDR1 / バキュロウイルス / 構造薬理学 / X線結晶学 / 抗ガン剤隠す

細胞外基質による細胞機能制御機構の包括的理解とその応用基盤の研究
- 研究代表者
  
  木岡紀幸
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分38:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  京都大学
脂質輸送型ABC蛋白質の分子構造と役割の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  小段篤史
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分38030:応用生物化学関連
- 研究機関
  京都大学
ABC輸送体の動作原理の解明と創薬への展開研究代表者
- 研究代表者
  
  小段篤史
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  構造生物化学
- 研究機関
  京都大学
ＡＢＣ輸送体の分子機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  小段篤史
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  応用薬理学
- 研究機関
  京都大学
ABC輸送体のX線結晶構造解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小段篤史
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2011
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  応用薬理学
- 研究機関
  京都大学
トランスポーター膜タンパク質の構造生物学的研究
- 研究代表者
  
  加藤博章
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2007
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用生物化学
- 研究機関
  京都大学
X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化
- 研究代表者
  
  加藤博章
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2005
- 研究種目
  
  萌芽研究
- 研究分野
  
  物理系薬学
- 研究機関
  京都大学

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すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 「膜タンパク質工学ハンドブック」第2編　膜タンパク質 ― 医学・薬学への展開、第3章　トランスポーター、第1節　多剤輸送体MDR1（ABCB1）p. 211-2162020
- 著者名/発表者名
  木村泰久、小段篤史、植田和光
- 総ページ数
  624
- 出版者
  （株）エヌ・ティー・エス
- ISBN
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07306
[図書] 「膜タンパク質工学ハンドブック」執筆担当：第2編膜タンパク質　医学・薬学への展開、第3章トランスポーター、第1節　多剤輸送体MDR1(ABCB1)2020
- 著者名/発表者名
  木村泰久、小段篤史、植田和光
- 総ページ数
  624
- 出版者
  株式会社エヌ・ティー・エス
- ISBN
  9784860435370
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02912
[雑誌論文] 脂溶性化合物を“絞り出す”多剤排出ポンプMDR1の分子機構2021
- 著者名/発表者名
  小段篤史、植田和光
- 雑誌名
  
  B&I バイオサイエンスとインダストリー
  
  巻: 74(4) ページ: 280-283
- NAID
  40022656793
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02912
[雑誌論文] In vivo FRET analyses reveal a role of ATP hydrolysis?associated conformational changes in human P-glycoprotein2020
- 著者名/発表者名
  Futamata Ryota、Ogasawara Fumihiko、Ichikawa Takafumi、Kodan Atsushi、Kimura Yasuhisa、Kioka Noriyuki、Ueda Kazumitsu
- 雑誌名
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  巻: in press 号: 15 ページ: 5002-5011
- DOI
  10.1074/jbc.ra119.012042
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22279, KAKENHI-PROJECT-18H05269, KAKENHI-PROJECT-17K07306, KAKENHI-PROJECT-18K19176
[雑誌論文] ABCB1/MDR1/P‐gp employs an ATP‐dependent twist‐and‐squeeze mechanism to export hydrophobic drugs2020
- 著者名/発表者名
  Kodan Atsushi、Futamata Ryota、Kimura Yasuhisa、Kioka Noriyuki、Nakatsu Toru、Kato Hiroaki、Ueda Kazumitsu
- 雑誌名
  
  FEBS Letters
  
  巻: 595 号: 6 ページ: 707-716
- DOI
  10.1002/1873-3468.14018
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H05269, KAKENHI-PROJECT-20H02912, KAKENHI-PLANNED-19H05780
[雑誌論文] 多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出し機構2020
- 著者名/発表者名
  小段篤史、木村泰久、植田和光
- 雑誌名
  
  ファルマシア
  
  巻: 56 号: 6 ページ: 519-523
- DOI
  10.14894/faruawpsj.56.6_519
- NAID
  130007850173
- ISSN
  0014-8601, 2189-7026
- 言語
  日本語
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02912
[雑誌論文] ABC proteins in evolution2020
- 著者名/発表者名
  Ogasawara Fumihiko、Kodan Atsushi、Ueda Kazumitsu
- 雑誌名
  
  FEBS Letters
  
  巻: 594 号: 23 ページ: 3876-3881
- DOI
  10.1002/1873-3468.13945
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H05269, KAKENHI-PROJECT-20H02912
[雑誌論文] Inward- and outward-facing X-ray crystal structures of homodimeric P-glycoprotein CmABCB12019
- 著者名/発表者名
  Kodan Atsushi、Yamaguchi Tomohiro、Nakatsu Toru、Matsuoka Keita、Kimura Yasuhisa、Ueda Kazumitsu、Kato Hiroaki
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 1-12
- DOI
  10.1038/s41467-018-08007-x
- NAID
  120006547405
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07306, KAKENHI-PROJECT-18H05269, KAKENHI-PROJECT-17H03664, KAKENHI-PROJECT-16K07320
[雑誌論文] Structural basis for gating mechanisms of a eukaryotic P-glycoprotein homolog2014
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Keiji Ikeguchi, Bunta Watanabe, Jun Hiratake, Yasuhisa Kimura, Hiroaki Suga, Kazumitsu Ueda, Hiroaki Kato
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  
  巻: 111 号: 11 ページ: 4049-4054
- DOI
  10.1073/pnas.1321562111
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24659018, KAKENHI-PROJECT-24689029, KAKENHI-PROJECT-25221203, KAKENHI-PROJECT-25251006
[雑誌論文] Deleting two C-terminalα-helices is effective to crystallize the bacterial ABC transporter Escherichia coli MsbA complexed with AMP-PNP2010
- 著者名/発表者名
  Kanako Terakado, Atsushi Kodan, Hiroaki Nakano, Yasuhisa Kimura, Kazumitsu Ueda, Toru Nakatsu, and Hiroaki Kato
- 雑誌名
  
  Acta Crystallographica Section D. Biological Crystallography
  
  巻: D66 号: 3 ページ: 319-323
- DOI
  10.1107/s0907444909055504
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[雑誌論文] Deleting two C-terminal α-helices is effective to crystallize the bacterial ABC transporter Escherichia coli MsbA complexed with AMP-PNP.2010
- 著者名/発表者名
  Terakado, K., Kodan, A., Nakano, H., Kimura, Y., Ueda, K., Nakatsu, T., Kato, H.
- 雑誌名
  
  Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography
  
  巻: D66 ページ: 319-323
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 脂質膜パッチに再構成されたコレステロールトランスポーターABCA1の高速AFM観察2023
- 著者名/発表者名
  中本佳歩; 小段篤史; Romain Amyot; 坂田和樹; 木村泰久; 梅田健一; 植田和光; 古寺哲幸
- 学会等名
  第61回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02912
[学会発表] 哺乳類細胞における接着斑タンパク質CAPの精製系構築2022
- 著者名/発表者名
  松山大輝、小段篤史、木村泰久、木岡紀幸
- 学会等名
  日本農芸化学会2022年度京都大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H04713
[学会発表] Cryo-EM解析を目指した脂質輸送型ABC蛋白質の生産・調製基盤の構築2021
- 著者名/発表者名
  小段篤史、光岡薫、木村泰久、木岡紀幸、植田和光
- 学会等名
  日本農芸化学大会2021年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H02912
[学会発表] ABC多剤排出トランスポーターにおける基質取込の立体構造基盤2014
- 著者名/発表者名
  山口知宏、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  日本薬学会第134年会
- 発表場所
  熊本市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029
[学会発表] Structure-based functional aspects of the ABC multidrug transporter, CmABCB1 from a thermophilic eukaryote.2014
- 著者名/発表者名
  Tomohiro Yamaguchi, Atsushi Kodan, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Yasuhisa Kimura, Hiroaki Suga, Kazumitsu Ueda, Hiroaki Kato
- 学会等名
  ABC2014, the 5th FEBS Special Meeting “ ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”
- 発表場所
  Innsbruck, Austria
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029
[学会発表] High-resolution crystal structure of an ABC multidrug exporter from Cyanidioschyzon merolae, a thermophilic unicellular eukaryote.2014
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Christopher J. Hipolito, Akane Fujioka, Ryo Hirokane, Yasuhisa Kimura, Hiroaki Suga, Kazumitsu Ueda, Hiroaki Kato
- 学会等名
  ABC2014, the 5th FEBS Special Meeting “ ATP-Binding Cassette Proteins: From Multidrug Resistance to Genetic Disease”
- 発表場所
  Innsbruck, Austria
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029
[学会発表] 好熱性真核生物の ABC 多剤排出トランスポーターの X 線結晶構造解析 / Crystal structure of a eukaryotic ABC multi-drug transporter2013
- 著者名/発表者名
  廣兼諒、小段篤史、中津亨、山口知宏、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第13回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  鳥取市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029
[学会発表] X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter2012
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kodan
- 学会等名
  ABC2012, the 4th FEBS Special Meeting
- 発表場所
  オーストリア(インスブルク)
- 年月日
  2012-02-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 結晶構造に基づく多剤排出型ABCトランスポーターメカニズムの解明2012
- 著者名/発表者名
  藤岡あかね、山口知宏、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第日回次世代を担う若手ファーマ・バイオフォーラム
- 発表場所
  九州大学病院キャンパスコラボI(福岡県)
- 年月日
  2012-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029
[学会発表] X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter2012
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Akane Fujioka, Kazumitsu Ueda, and Hiroaki Kato
- 学会等名
  the 4th FEBSSpecial Meeting"ATP-Binding Cassette Proteins : From Multidrug Resistance to Genetic Disease
- 発表場所
  Innsuburuck, Austria
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの輸送基質特異性の検討2012
- 著者名/発表者名
  山口知宏、木村泰久、小段篤史、池口圭司、渡辺文太、平竹潤、中津亨、
- 学会等名
  第34回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
- 発表場所
  京都大学薬学部(京都府)
- 年月日
  2012-11-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029
[学会発表] 好熱性紅藻由来の基質排出型ABCトランスポーターの基質特異性の解析/Substrate specificity analysis of an exporter type ABC transporter from athermophilic eukaryote2011
- 著者名/発表者名
  山口知宏、崎山慶太、佐藤友美、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第11回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  吹田
- 年月日
  2011-06-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] Characterization of multi-drugexporter activity of an ABC transporter from a thermophiliceukaryote2011
- 著者名/発表者名
  山口知宏、崎山慶太、地主遼平、佐藤友美、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  Cyanidioschyzon merolae日本薬学会第131年会
- 発表場所
  静岡
- 年月日
  2011-03-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] X-ray crystallographic analysis of an exporter-type ABC transporter2011
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kodan, Tomohiro Yamaguchi, Toru Nakatsu, Keita Sakiyama, Akane Fujioka, Kazumitsu Ueda, and Hiroaki Kato
- 学会等名
  Joint International Symposium"ABC2011 in Kyoto-ABC Proteins/Membrane Meso-domains/ES-iPS cells"
- 発表場所
  Kyoto, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの多剤排出活性の特徴2010
- 著者名/発表者名
  山口知宏、崎山慶太、池口圭司、地主遼平、佐藤友美、渡辺文太、小段篤史、中津亨、平竹潤、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第32回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
- 発表場所
  富山、富山国際会議場
- 年月日
  2010-11-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] Functional role of the linker region in the mechanism of human multidrug efflux transporter P-glycoprotein2010
- 著者名/発表者名
  Tomomi Sato, Atsushi Kodan, YasuhisaKimura, Kazumitsu Ueda, Toru Nakatsu, and Hiroaki Kato
- 学会等名
  The 5th Seoul-Kyoto-Osaka(SKO) Joint Symposium on Pharmaceutical Sciences for Young Scientist
- 発表場所
  Osaka, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 好熱性紅藻由来ABCトランスポーターの多剤排出活性の特徴2010
- 著者名/発表者名
  山口知宏、崎山慶太、池口圭司、地主遼平、佐藤友美、渡辺文太、小段篤史、中津亨、平竹潤、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第32回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
- 発表場所
  富山
- 年月日
  2010-11-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 好熱性紅藻Cyanidioschyzon merolae由来のABCトランスポーターの発現、精製、及び機能解析2010
- 著者名/発表者名
  崎山慶太、山口知宏、小段篤史、中津亨、佐藤友美、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第10回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  札幌、札幌コンベンションセンター
- 年月日
  2010-06-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] 好熱性紅藻Cyanidioschyzonmerolae由来のABCトランスポーターの発現、精製、及び機能解析2010
- 著者名/発表者名
  崎山慶太、山口知宏、小段篤史、中津亨、佐藤友美、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第10回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  札幌
- 年月日
  2010-06-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22790512
[学会発表] ABC多剤排出トランスポーターの立体構造の特徴
- 著者名/発表者名
  山口知宏、小段篤史、中津亨、植田和光、加藤博章
- 学会等名
  第87回日本生化学会大会
- 発表場所
  国立京都国際会館（京都府京都市）
- 年月日
  2014-10-15 – 2014-10-18
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24689029

1. 加藤博章 (90204487)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
2. 中津亨 (50293949)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
3. 中野博明 (10378789)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 光岡薫 (60301230)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. HIPOLITO CHRIS (20759914)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 木岡紀幸 (90234179)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
7. 阿部雄一 (30731632)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 長尾耕治郎 (40587325)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 植田和光

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
10. 木村泰久

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

小段 篤史 Kodan Atsushi

研究課題

研究成果

共同研究者

細胞外基質による細胞機能制御機構の包括的理解とその応用基盤の研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

脂質輸送型ABC蛋白質の分子構造と役割の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ABC輸送体の動作原理の解明と創薬への展開研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ＡＢＣ輸送体の分子機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ABC輸送体のX線結晶構造解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

トランスポーター膜タンパク質の構造生物学的研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

X線解析を目指した多剤耐性ポンプMDR1の大量発現系の構築と結晶化

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] 「膜タンパク質工学ハンドブック」第2編 膜タンパク質 ― 医学・薬学への展開、第3章 トランスポーター 、第1節 多剤輸送体MDR1（ABCB1）p. 211-2162020

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] 「膜タンパク質工学ハンドブック」執筆担当：第2編膜タンパク質 医学・薬学への展開、第3章トランスポーター、第1節 多剤輸送体MDR1(ABCB1)2020

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] 脂溶性化合物を“絞り出す”多剤排出ポンプMDR1の分子機構2021

著者名/発表者名

雑誌名

NAID

データソース

[雑誌論文] In vivo FRET analyses reveal a role of ATP hydrolysis?associated conformational changes in human P-glycoprotein2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] ABCB1/MDR1/P‐gp employs an ATP‐dependent twist‐and‐squeeze mechanism to export hydrophobic drugs2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 多剤排出ポンプMDR1の薬剤絞り出し機構2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

言語

小段篤史 Kodan Atsushi

[図書] 「膜タンパク質工学ハンドブック」第2編　膜タンパク質 ― 医学・薬学への展開、第3章　トランスポーター、第1節　多剤輸送体MDR1（ABCB1）p. 211-2162020

[図書] 「膜タンパク質工学ハンドブック」執筆担当：第2編膜タンパク質　医学・薬学への展開、第3章トランスポーター、第1節　多剤輸送体MDR1(ABCB1)2020