丸山豊 Maruyama Yutaka

研究者番号	80390665
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 明治大学, 研究・知財戦略機構, 研究推進員(客員研究員)
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2024年度: 明治大学, 研究・知財戦略機構, 研究推進員(客員研究員)
審査区分/研究分野	研究代表者以外小区分43040:生物物理学関連
キーワード	研究代表者以外ペプチド / 環状ペプチド / 3D-RISM / 蛋白質 / 膜蛋白質 / 溶媒効果 / 安定性 / フォールディング / 化学物理 / タンパク質 … もっと見る / 計算物理学 / 計算化学 / 生体高分子 / 生物物理学 / 分子シミュレーション隠す

アミノ酸置換による安定性・機能変化評価計算システムの構築と応用
- 研究代表者
  
  光武亜代理
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43040:生物物理学関連
- 研究機関
  明治大学

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Effect of Main and Side Chains on the Folding Mechanism of the Trp-Cage Miniprotein2023
- 著者名/発表者名
  Maruyama Yutaka、Mitsutake Ayori
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 8 号: 46 ページ: 43827-43835
- DOI
  10.1021/acsomega.3c05809
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04756, KAKENHI-PROJECT-23K20301
[雑誌論文] Analysis of Protein Folding Simulation with Moving Root Mean Square Deviation2023
- 著者名/発表者名
  Y. Maruyama, R. Igarashi, Y. Ushiku, A. Mitsutake
- 雑誌名
  
  J. Chem. Inf. Model.
  
  巻: 63 号: 5 ページ: 1529-1541
- DOI
  10.1021/acs.jcim.2c01444
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H04756, KAKENHI-PROJECT-23K20301
[雑誌論文] Computational Analysis of the SARS-CoV-2 RBD?ACE2-Binding Process Based on MD and the 3D-RISM Theory2022
- 著者名/発表者名
  Yoshida Norio、Maruyama Yutaka、Mitsutake Ayori、Kuroda Akiyoshi、Fujiki Ryo、Kanemaru Kodai、Okamoto Daisuke、Kobryn Alexander E.、Gusarov Sergey、Nakano Haruyuki
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 62 号: 11 ページ: 2889-2898
- DOI
  10.1021/acs.jcim.2c00192
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K04980, KAKENHI-PUBLICLY-22H04756, KAKENHI-PROJECT-23K20301
[雑誌論文] Structural Stability Analysis of Proteins Using End-to-End Distance: A 3D-RISM Approach2022
- 著者名/発表者名
  Yutaka Maruyama and Ayori Mitsutake
- 雑誌名
  
  J
  
  巻: J 号: 1 ページ: 114-125
- DOI
  10.3390/j5010009
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[雑誌論文] Mutation-induced change in chignolin stability from pi-turn to alpha-turn2020
- 著者名/発表者名
  Yutaka Maruyama, Shunpei Koroku, Misaki Imai, Koh Takeuchi, Ayori Mitsutake
- 雑誌名
  
  RSC Advances
  
  巻: 10 号: 38 ページ: 22797-22808
- DOI
  10.1039/d0ra01148g
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[学会発表] Analysis on Protein Folding Simulations with Relaxation Mode Analysis and 3D-RISM Theory2023
- 著者名/発表者名
  Yutaka Maruyama and Ayori Mitsutake（発表者）
- 学会等名
  The 21st KIAS Conference on Protein Structure and Function,2023,2023,1,1
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[学会発表] MD と 3D-RISM 理論による SARS-CoV-2 スパイク蛋白質と ACE2 タンパク質間相互作用の研究2022
- 著者名/発表者名
  Yutaka Maruyama, Ayori Mitsutake, Norio Yoshida
- 学会等名
  日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[学会発表] NMRを用いたシニョリンとその変異体の立体構造解析2021
- 著者名/発表者名
  小六隼平, 今井美咲, 丸山豊, 竹内恒, 光武亜代理
- 学会等名
  分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[学会発表] Structure analysis of chignolin and its mutants by NMR2021
- 著者名/発表者名
  S. Koroku, M. Imai, Y. Maruyama K. Takeuchi, A. Mitsutake
- 学会等名
  生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[学会発表] NMR解析を用いたシニョリンとその変異体の立体構造の決定2020
- 著者名/発表者名
  小六隼平, 丸山豊, 今井美咲, 竹内恒, 光武亜代理
- 学会等名
  分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301
[学会発表] Analysis of simulation data of 18-residue thioether-bonded cyclic peptides P6 and P72020
- 著者名/発表者名
  S. Koroku, A. Mitsutake, Y. Maruyama, K. Takeuchi
- 学会等名
  日本生物物理学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K20301

1. 光武亜代理 (00338253)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 10件
2. 中野晴之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

丸山 豊 Maruyama Yutaka

研究課題

研究成果

共同研究者

アミノ酸置換による安定性・機能変化評価計算システムの構築と応用

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Effect of Main and Side Chains on the Folding Mechanism of the Trp-Cage Miniprotein2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Analysis of Protein Folding Simulation with Moving Root Mean Square Deviation2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Computational Analysis of the SARS-CoV-2 RBD?ACE2-Binding Process Based on MD and the 3D-RISM Theory2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Structural Stability Analysis of Proteins Using End-to-End Distance: A 3D-RISM Approach2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Mutation-induced change in chignolin stability from pi-turn to alpha-turn2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Analysis on Protein Folding Simulations with Relaxation Mode Analysis and 3D-RISM Theory2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] MD と 3D-RISM 理論による SARS-CoV-2 スパイク蛋白質と ACE2 タンパク質間相互作用の研究2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] NMRを用いたシニョリンとその変異体の立体構造解析2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Structure analysis of chignolin and its mutants by NMR2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] NMR解析を用いたシニョリンとその変異体の立体構造の決定2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Analysis of simulation data of 18-residue thioether-bonded cyclic peptides P6 and P72020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

丸山豊 Maruyama Yutaka