土方敦司 HIJIKATA ATSUSHI

研究者番号	80415273
その他のID	https://orcid.org/0000-0003-4297-8368
所属 (現在)	2025年度: 東京薬科大学, 生命科学部, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 東京薬科大学, 生命科学部, 准教授 2015年度 – 2021年度: 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, プロジェクト特任講師 2013年度: 長浜バイオ大学, 公私立大学の部局等, 講師 2011年度 – 2013年度: 独立行政法人理化学研究所, 免疫ゲノミクス研究グループ, リサーチアソシエイト
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / ゲノム医科学研究代表者以外小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 生命・健康・医療情報学 / 小児科学
キーワード	研究代表者タンパク質立体構造 / レアバリアント / 構造バイオインフォマティクス / ミスセンス変異 / バイオインフォマティクス / 立体構造 / 結合親和性 / タンパク質複合体 / エピトープバリアント / 抗原 … もっと見る / 抗体医薬品 / 遺伝子性疾患 / 遺伝子疾患 / 構造環境 / 疾患関連変異 / 分子機能 / 疾患関連ゲノム変異 / タンパク質局所構造 / 局所構造 / アミノ酸残基 / ゲノムバリアント / 疾患変異解析 / ヒト遺伝子疾患 / 機能獲得 / 優性阻害 / 超分子複合体 / 機能獲得変異 / ドミナントネガティブ / ハプロ不全 / データベース / 遺伝性疾患 … もっと見る研究代表者以外機械学習 / 相互作用ダイナミクス / 薬剤応答 / 近位依存性ビオチン標識 / インタラクトーム / EGFR / 祖先型遺伝子 / 分子進化 / 光合成 / 生命分子計算 / アロステリックサイト / クリプティックサイト / 疾患関連変異 / アロステリック制御 / クリプトサイト / タンパク質機能推定 / タンパク質構造 / 疾患関連変異分布 / 低分子結合予測 / ピリドキサールリン酸 / 出芽酵母 / 酵素 / 機能予測 / データベース / SNV / 低分子化合物 / 機能部位予測 / 機能未知タンパク質 / 選択的スプライシング / ナイーブT細胞 / 骨髄異形成症候群 / GATA2 / NK細胞分化 / B細胞分化 / 樹状細胞分化 / 原発性免疫不全症隠す

近位依存性ビオチン標識酵素を用いたEGFRの細胞膜上相互作用ダイナミクスの解析
- 研究代表者
  
  澤崎達也
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分43:分子レベルから細胞レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  愛媛大学
祖先型超分子の機械学習による光合成環境適応戦略の解読
- 研究代表者
  
  白井剛
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  長浜バイオ大学
抗体医薬標的におけるミスセンスレアバリアントの結合親和性変化を評価する手法の確立研究代表者
- 研究代表者
  
  土方敦司
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京薬科大学
疾患関連変異のタンパク質構造上の三次元分布を基点とした未知の機能部位探索法の確立
- 研究代表者
  
  今井賢一郎
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
実験的検証のフィードバックを活用した結合補酵素予測法の開発
- 研究代表者
  
  塩生真史
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  長浜バイオ大学
タンパク質高次構造に基づくヒト意義不明バリアントを評価する手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  土方敦司
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  長浜バイオ大学
機能未知スプライシングアイソフォームの機能部位予測法の開発
- 研究代表者
  
  塩生真史
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  長浜バイオ大学
ミスセンス変異の分子機能及び表現型への影響を予測する手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  土方敦司
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム医科学
- 研究機関
  長浜バイオ大学
Ｂ細胞、ＮＫ細胞、樹状細胞欠損を伴う原発性免疫不全症の病態解析と原因遺伝子の同定
- 研究代表者
  
  今井耕輔
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  小児科学
- 研究機関
  東京医科歯科大学

すべて 2023 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2012 2011

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Involvement of mTOR pathway in neurodegeneration in NSF-related developmental and epileptic encephalopathy2023
- 著者名/発表者名
  Hayashi Takahiro、Yano Naoko、Kora Kengo、Yokoyama Atsushi、Maizuru Kanako、Kayaki Taisei、Nishikawa Kinuko、Osawa Mitsujiro、Niwa Akira、Takenouchi Toshiki、Hijikata Atsushi、Shirai Tsuyoshi、Suzuki Hisato、Kosaki Kenjiro、Saito Megumu K、Takita Junko、Yoshida Takeshi
- 雑誌名
  
  Human Molecular Genetics
  
  巻: 32 号: 10 ページ: 1683-1697
- DOI
  10.1093/hmg/ddad008
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12250, KAKENHI-PROJECT-21K15863, KAKENHI-PROJECT-20H03642, KAKENHI-PROJECT-23K21721
[雑誌論文] A novel variant of NR5A1, p.R350W implicates potential interactions with unknown co-factors or ligands2023
- 著者名/発表者名
  Gau Maki、Suga Ryota、Hijikata Atsushi、Kashimada Ayako、Takagi Masatoshi、Nakagawa Ryuichi、Takasawa Kei、Shirai Tsuyoshi、Kashimada Kenichi、Morio Tomohiro
- 雑誌名
  
  Frontiers in Endocrinology
  
  巻: 13 ページ: 1033074-1033074
- DOI
  10.3389/fendo.2022.1033074
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12250, KAKENHI-PROJECT-23K21721
[雑誌論文] Current status of structure-based drug repurposing against COVID-19 by targeting SARS-CoV-2 proteins2021
- 著者名/発表者名
  Hijikata Atsushi、Shionyu Clara、Nakae Setsu、Shionyu Masafumi、Ota Motonori、Kanaya Shigehiko、Shirai Tsuyoshi
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 18 号: 0 ページ: 226-240
- DOI
  10.2142/biophysico.bppb-v18.025
- NAID
  130008106407
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211, KAKENHI-PROJECT-18H03331, KAKENHI-PLANNED-20H05932, KAKENHI-PROJECT-23K21721
[雑誌論文] Evaluating cepharanthine analogues as natural drugs against SARS‐CoV‐22021
- 著者名/発表者名
  Hijikata Atsushi、Shionyu‐Mitsuyama Clara、Nakae Setsu、Shionyu Masafumi、Ota Motonori、Kanaya Shigehiko、Hirokawa Takatsugu、Nakajima Shogo、Watashi Koichi、Shirai Tsuyoshi
- 雑誌名
  
  FEBS Open Bio
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 285-294
- DOI
  10.1002/2211-5463.13337
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211, KAKENHI-PROJECT-18H03331, KAKENHI-PROJECT-21K15458, KAKENHI-PLANNED-20H05932, KAKENHI-PROJECT-23K21721
[雑誌論文] Detailed analysis of Japanese patients with adenosine deaminase 2 deficiency reveals characteristic elevation of type II interferon signature and STAT1 hyperactivation.2021
- 著者名/発表者名
  Nihira H, Izawa K, Ito M, Umebayashi H, Okano T, Kajikawa S, ...Yasumi T.
- 雑誌名
  
  J Allergy Clin Immunol
  
  巻: 印刷中号: 2 ページ: 00157-3
- DOI
  10.1016/j.jaci.2021.01.018
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16355, KAKENHI-PROJECT-19H03613, KAKENHI-PROJECT-18K18154, KAKENHI-PROJECT-19K08299, KAKENHI-PROJECT-20H00528, KAKENHI-PROJECT-21K19405
[雑誌論文] WDR11 is another causative gene for coloboma, cardiac anomaly and growth retardation in 10q26 deletion syndrome2019
- 著者名/発表者名
  Sutani Akito、Shima Hirohito、Hijikata Atsushi、Hosokawa Susumu、Katoh-Fukui Yuko、Takasawa Kei、Suzuki Erina、Doi Shozaburo、Shirai Tsuyoshi、Morio Tomohiro、Fukami Maki、Kashimada Kenichi
- 雑誌名
  
  European Journal of Medical Genetics
  
  巻: 印刷中号: 1 ページ: 103626-103626
- DOI
  10.1016/j.ejmg.2019.01.016
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06926, KAKENHI-PROJECT-18K18154, KAKENHI-PLANNED-17H06428
[雑誌論文] Developing a new method to predict the effect of the missense mutations on the protein function and phenotypes2018
- 著者名/発表者名
  Hijikata Atsushi
- 雑誌名
  
  Impact
  
  巻: 2018 号: 12 ページ: 35-37
- DOI
  10.21820/23987073.2018.12.35
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18154
[雑誌論文] Clinical characteristics of adolescent cases with Type A insulin resistance syndrome caused by heterozygous mutations in the β-subunit of the insulin receptor (INSR) gene2018
- 著者名/発表者名
  Takasawa Kei、Tsuji-Hosokawa Atsumi、Takishima Shigeru、Wada Yasunori、Nagasaki Keisuke、Dateki Sumito、Numakura Chikahiko、Hijikata Atsushi、Shirai Tsuyoshi、Kashimada Kenichi、Morio Tomohiro
- 雑誌名
  
  Journal of Diabetes
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 46-54
- DOI
  10.1111/1753-0407.12797
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K15660, KAKENHI-PROJECT-18K18154, KAKENHI-PROJECT-17H01818
[雑誌論文] Molecular mechanisms of insulin resistance in 2 cases of primary insulin receptor defect-associated diseases.2017
- 著者名/発表者名
  Tsuji-Hosokawa, A., Takasawa, K., Nomura, R., Miyakawa, Y., Numakura, C., Hijikata, A., Shirai, T., Ogawa, Y., Kashimada, K. & Morio, T.
- 雑誌名
  
  Pediatr Diabetes
  
  巻: Feb 9 号: 8 ページ: 917-924
- DOI
  10.1111/pedi.12508
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-15K19602, KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] Decoding disease-causing mechanisms of missense mutations from supramolecular structures2017
- 著者名/発表者名
  Hijikata A, Tsuji T, Shionyu M, Shirai T
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 8541-8541
- DOI
  10.1038/s41598-017-08902-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H01818, KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] The role of the Prod1 membrane anchor in newt limb regeneration2017
- 著者名/発表者名
  Nomura, K., Tanimoto, Y., Hayashi, F., Harada, E., Shan, X.-Y., Shionyu, M., Hijikata, A., Shirai, T., Morigaki, K., Shimamoto, K.
- 雑誌名
  
  Angew. Chem. Int. Ed.
  
  巻: 56 号: 1 ページ: 270-274
- DOI
  10.1002/anie.201609703
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26291031, KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-15K14489, KAKENHI-PROJECT-15K21487, KAKENHI-PROJECT-17KT0024, KAKENHI-PROJECT-17H03666
[雑誌論文] Structural and Functional Analysis of the C-Terminal Region of FliG, an Essential Motor Component of Vibrio Na + -Driven Flagella2017
- 著者名/発表者名
  Miyanoiri Yohei、Hijikata Atsushi、Nishino Yuuki、Gohara Mizuki、Onoue Yasuhiro、Kojima Seiji、Kojima Chojiro、Shirai Tsuyoshi、Kainosho Masatsune、Homma Michio
- 雑誌名
  
  Structure
  
  巻: 25 号: 10 ページ: 1540-1548
- DOI
  10.1016/j.str.2017.08.010
- NAID
  120006375873
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26291013, KAKENHI-PUBLICLY-17H05836, KAKENHI-PLANNED-26119005, KAKENHI-PROJECT-16J03916, KAKENHI-PROJECT-15K06966, KAKENHI-PROJECT-16K14681, KAKENHI-PROJECT-15K21487, KAKENHI-PUBLICLY-17H05873, KAKENHI-PROJECT-17H03641
[雑誌論文] Molecular Mechanism and Structural Basis of Gain of Function of STAT1 Caused by Pathogenic R274Q Mutation2017
- 著者名/発表者名
  Fujiki R, Hijikata A, Shirai T, Okada S, Kobayashi M, Ohara O
- 雑誌名
  
  J Biol Chem.
  
  巻: 292 号: 15 ページ: 6240-6254
- DOI
  10.1074/jbc.m116.753848
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H05355, KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-16K15528, KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] Identification of a High-Frequency Somatic NLRC4 Mutation as a Cause of Autoinflammation by Pluripotent Cell-Based Phenotype Dissection.2017
- 著者名/発表者名
  Kawasaki Y, Oda H, Ito J, Niwa A, Tanaka T, Hijikata A, Seki R, Nagahashi A, Osawa M, Asaka I, Watanabe A, Nishimata S, Shirai T, Kawashima H, Ohara O, Nakahata T, Nishikomori R, Heike T, Saito MK.
- 雑誌名
  
  Arthritis Rheumatol.
  
  巻: 69 号: 2 ページ: 447-459
- DOI
  10.1002/art.39960
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26253062, KAKENHI-PROJECT-15H04876, KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-15K06921, KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] Novel AVPR2 mutation causing partial nephrogenic diabetes insipidus in a Japanese family2016
- 著者名/発表者名
  Yamashita S, Hata A, Usui T, Oda H, Hijikata A, Shirai T, Kaneko N, Hata D
- 雑誌名
  
  J. Pediatr. Endocrinol. Metab.
  
  巻: 5 号: 5 ページ: 591-596
- DOI
  10.1515/jpem-2015-0323
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24370046, KAKENHI-PROJECT-25280109, KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] Classification of ligand molecules in PDB with graph match-based structural superposition.2016
- 著者名/発表者名
  Shionyu-Mitsuyama, C., Hijikata, A., Tsuji, T. & Shirai, T.
- 雑誌名
  
  J Struct Funct Genomics.
  
  巻: 17 ページ: 135-146
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] Classification of ligand molecules in PDB with graph match-based structural superposition.2016
- 著者名/発表者名
  Shionyu-Mitsuyama, C., Hijikata, A., Tsuji, T. & Shirai, T.
- 雑誌名
  
  J Struct Funct Genomics.
  
  巻: 17 号: 4 ページ: 135-146
- DOI
  10.1007/s10969-016-9209-x
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[雑誌論文] Structural and functional analyses of Barth syndrome-causing mutations and alternative splicing in the tafazzin acyltransferase domain.2015
- 著者名/発表者名
  Hijikata A., Yura K., Ohara O., Go M.
- 雑誌名
  
  Meta Gene
  
  巻: 4 ページ: 92-106
- DOI
  10.1016/j.mgene.2015.04.001
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411, KAKENHI-PROJECT-15K21487
[雑誌論文] Detection of base substitution-type somatic mosaicism of the NLRP3 gene with > 99.9% statistical confidence by massively parallel sequencing2012
- 著者名/発表者名
  Izawa, K., Hijikata A., Tanaka, N., Kawai, T.,Saito, K.M.,Goldbach-Mansky, R.,Aksentijevich,I., Yasumi, T., Nakahata, T., Heike, T.,Nishikomori, R. & Ohara, O.
- 雑誌名
  
  DNA Res
  
  巻: 19 ページ: 143-152
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[雑誌論文] Membrane-bound human SCF/KL promotes in vivo human hematopoietic engraftment and myeloiddifferentiation2012
- 著者名/発表者名
  Takagi, S., Saito, Y., Hijikata A., anaka S, Watanabe T, Hasegawa T, Mochizuki S, Kunisawa J, Kiyono H, Koseki H, Ohara O, Saito T, Taniguchi S, Shultz LD, Ishikawa F.
- 雑誌名
  
  Blood
  
  巻: 119 ページ: 2768-2777
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[雑誌論文] Membrane-bound human SCF/KL promotes in vivo human hematopoietic engraftment and myeloid differentiation.2012
- 著者名/発表者名
  Takagi, S
- 雑誌名
  
  Blood
  
  巻: 119 号: 12 ページ: 2768-2777
- DOI
  10.1182/blood-2011-05-353201
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23229004, KAKENHI-PROJECT-23591561, KAKENHI-PROJECT-24229004, KAKENHI-ORGANIZER-24111001
[雑誌論文] Revisiting gap locations in amino acid sequence alignments and a proposal for a method to improvethem by introducing solvent accessibility2011
- 著者名/発表者名
  Hijikata A., Yura K., Noguti T. & Go M.
- 雑誌名
  
  Proteins
  
  巻: 79 ページ: 1868-77
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[雑誌論文] Revisiting gap locations in amino acid sequence alignments and a proposal for a method to improve them by introducing solvent accessibility2011
- 著者名/発表者名
  Hijikata, A., Yura, K., Noguti, T. & Go, M.
- 雑誌名
  
  Proteins
  
  巻: 79 号: 6 ページ: 1868-77
- DOI
  10.1002/prot.23011
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[雑誌論文] The transcription factor E4BP4 regulates the production of IL-10 and IL-13 in CD4(+) T cells2011
- 著者名/発表者名
  Motomura Y., Kitamura H., Hijikata A.,Matsunaga, Y., Matsumoto, K., Inoue, H.,Atarashi, K., Hori, S., Watarai, H., Zhu, J.,Taniguchi, M. & Kubo, M.
- 雑誌名
  
  Nat Immunol
  
  巻: 12 ページ: 450-9
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[雑誌論文] The RIKEN integrated database of mammals2011
- 著者名/発表者名
  Masuya H, Makita Y, Kobayashi N, Nishikata K, Yoshida Y, Mochizuki Y, Doi K, Takatsuki T, Waki K, Tanaka N, Ishii M, Matsushima A, Takahashi S, Hijikata A, Kozaki K, Furuichi T, Kawaji H, Wakana S, Nakamura Y, Yoshiki A, Murata T, Fukami-Kobayashi K, Mohan S, Ohara O, Hayashizaki Y, Mizoguchi R, Obata Y, Toyoda T.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[雑誌論文] Plasmacytoid dendritic cells are crucial for the initiation of inflammation and T cell immunity in vivo2011
- 著者名/発表者名
  Takagi, H., Fukaya, T., Eizumi, K., Sato, Y.,Sato, K., Shibazaki, A., Otsuka, H., Hijikata A.,Watanabe, T., Ohara, O., Kaisho, T. & Malissen, B.
- 雑誌名
  
  Immunity
  
  巻: 35 ページ: 958-71
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591561
[学会発表] Searchfor novel protein functional sites based on the spatial distribution of disease-associated missense variants2023
- 著者名/発表者名
  本野千恵、土方敦司、広川貴次、今井賢一郎
- 学会等名
  第51回構造活性相関シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H03551
[学会発表] A search method for novel protein functional site based on the spatial distribution of disease-associated missense variants2023
- 著者名/発表者名
  本野千恵、土方敦司、広川貴次、今井賢一郎
- 学会等名
  CBI学会2023年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H03551
[学会発表] A search method for novel protein functional site based on the spatial distribution of disease-associated missense variants2023
- 著者名/発表者名
  本野千恵、土方敦司、広川貴次、今井賢一郎
- 学会等名
  8th Autumn School of Chemoinformatics in Nara
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H03551
[学会発表] タンパク質複合体構造情報に基づく抗体医薬品標的ヒトタンパク質におけるゲノムバリアントの網羅的解析2023
- 著者名/発表者名
  小野幹太、土方敦司
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12250
[学会発表] 光合成ユビキティー：植物はどうして様々な環境で光合成できるようになったのか？2023
- 著者名/発表者名
  土方敦司, 白井剛, 坂本亘, 皆川純, 吉田啓亮, 日原由香子, 斉藤圭亮, 栗栖源嗣
- 学会等名
  日本科学振興協会(JAAS)年次総会2023 「会いに行ける科学者フェス」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23H04964
[学会発表] Protein-cofactor binding prediction with graph neural networks2021
- 著者名/発表者名
  Masafumi Shionyu, Atsushi Hijikata
- 学会等名
  第59回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211
[学会発表] グラフニューラルネットワークを用いたタンパク質の低分子リガンド結合予測2021
- 著者名/発表者名
  塩生真史, 土方敦司
- 学会等名
  第21回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211
[学会発表] Prediction of PLP-binding proteins by using machine learning-based methods2020
- 著者名/発表者名
  Masafumi Shionyu, Tomohiro Hatta, Atsushi Hijikata
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211
[学会発表] 結合傾向値を特徴量とした機械学習による低分子リガンド結合残基予測2019
- 著者名/発表者名
  塩生真史, 山崎まど香, 土方敦司
- 学会等名
  第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211
[学会発表] A local structural environment descriptor towards evaluating impact of rare variants in humans on protein structures and functions2019
- 著者名/発表者名
  Atsushi Hijikata, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18154
[学会発表] タンパク質高次構造に基づくヒトミスセンスバリアントの分子機能への影響を予測する手法の開発2019
- 著者名/発表者名
  土方敦司、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18154
[学会発表] Machine learning models for predicting ligand-binding sites using residue-wise features2019
- 著者名/発表者名
  Masafumi Shionyu, Atsushi Hijikata
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211
[学会発表] タンパク質高次構造情報に基づくヒトミスセンス変異の分子機能への影響を予測する手法の開発2019
- 著者名/発表者名
  土方敦司、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第19回日本蛋白質科学会年会第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18154
[学会発表] A local structural environment descriptor towards evaluating impact of rare variants in humans on protein structures and functions.2019
- 著者名/発表者名
  Atsushi Hijikata, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K12211
[学会発表] たんぱく質の高次構造から読み解くゲノム変異と疾患表現型との関係2019
- 著者名/発表者名
  土方敦司
- 学会等名
  第17回ゲノム・オミックス連携推進セミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18154
[学会発表] Development of a method for predicting pathogenicity of missense variants incorporating supramolecular structural information2018
- 著者名/発表者名
  土方敦司、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18154
[学会発表] Towards predicting functional consequences of genetic variants in humans through supramolecular complex structures2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第５５回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] タンパク質超分子複合体構造から読み解くミスセンス変異と疾患表現型との関係2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第5回NGS現場の会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] 分子動力学とNMRで迫るべん毛モーターの回転方向制御機構2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司
- 学会等名
  平成29年度日本分光学会NMR分光部会講習会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] Mutation@A Glance: ヒトにおける意義不明バリアントの解明を目指した統合解析ツール2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、白井剛
- 学会等名
  2017年度生命科学系合同年次大会(ConBio2017)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] 超分子複合体から読み解くミスセンス変異と疾患表現型の関係2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第17回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] Mutation@A Glance: ヒト遺伝子バリアント統合可視化ツール2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、白井剛
- 学会等名
  トーゴーの日2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] 超分子複合体から読み解くミスセンス変異と疾患表現型の関係2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第17回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] Mutation@A Glance: ヒトにおける意義不明バリアントの解明を目指した統合解析ツール2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、白井剛
- 学会等名
  2017年度生命科学系合同年次大会(ConBio2017)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] Decoding disease-causing mechanisms of missense mutations from supramolecular structures2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第6回生命医薬情報連合大会(IIBMP2017)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] Decoding disease-causing mechanisms of missense mutations from supramolecular structures2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第6回生命医薬情報連合大会(IIBMP2017)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] Towards predicting functional consequences of genetic variants in humans through supramolecular complex structures2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] Mutation@A Glance: ヒト遺伝子バリアント統合可視化ツール2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、白井剛
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] Structural and functional analysis of the C-terminal region of FliG, an essential motor component of Vibrio Na+-driven flagellar by NMR spectroscopy and molecular dynamics simulation2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、宮ノ入洋平、西野優紀、郷原瑞樹、尾上靖宏、小嶋誠司、児嶋長次郎、白井剛、甲斐荘正恒、本間道夫
- 学会等名
  公開シンポジウム「運動超分子マシナリーが織りなす調和と多様性」
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] タンパク質超分子複合体構造から読み解くミスセンス変異と疾患表現型との関係2017
- 著者名/発表者名
  土方敦司、辻敏之、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第５回NGS現場の会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] A new approach for protein-ligand binding predictions based on matching of vector-presented amino acid residues2016
- 著者名/発表者名
  Hijikata A, Shionyu M, Shirai T
- 学会等名
  第５回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都江東区）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] タンパク質の高次構造から読み解く遺伝性疾患多様性メカニズム2016
- 著者名/発表者名
  土方敦司, 辻敏之, 塩生真史, 白井剛
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] タンパク質の高次構造から読み解く遺伝性疾患多様性メカニズム2016
- 著者名/発表者名
  土方敦司, 辻敏之, 塩生真史, 白井剛
- 学会等名
  第39回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜国際平和会議場（神奈川県横浜市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] アミノ酸残基相互作用ベクトルマッチに基づくタンパク質―低分子ドッキング法2016
- 著者名/発表者名
  土方敦司、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第16回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場（福岡県福岡市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] A new approach for protein-ligand binding predictions based on matching of vector-represented amino acid residues2016
- 著者名/発表者名
  Atsushi Hijikata, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai
- 学会等名
  第５回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都江東区）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] ベクトル表現化したアミノ酸残基のマッチングによるタンパク質-リガンド結合予測2016
- 著者名/発表者名
  Atsushi Hijikata, Masafumi Shionyu, Tsuyoshi Shirai
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（茨城県つくば市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] アミノ酸残基相互作用ベクトルマッチに基づくタンパク質―低分子ドッキング法2016
- 著者名/発表者名
  土方敦司, 塩生真史, 白井剛
- 学会等名
  第16回日本蛋白質科学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場（福岡市博多区）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] ベクトル表現化したアミノ酸残基のマッチングによるタンパク質―リガンド結合予測2016
- 著者名/発表者名
  土方敦司、塩生真史、白井剛
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（茨城県つくば市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487
[学会発表] TafazzinトランスアシラーゼドメインにおけるBarth症候群関連変異と選択的スプライシングの構造および機能に関する影響2015
- 著者名/発表者名
  土方敦司、由良敬、小原收、郷通子
- 学会等名
  第３８回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2015-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00411
[学会発表] TafazzinトランスアシラーゼドメインにおけるBarth症候群関連変異と選択的スプライシングの構造および機能に関する影響2015
- 著者名/発表者名
  土方敦司、由良敬、小原收、郷通子
- 学会等名
  第３８回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2015-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K21487

1. 塩生真史 (30345847)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 16件
2. 今井耕輔 (90332626)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 大嶋宏一 (60525377)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 向由起夫 (60252615)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 今井賢一郎 (80442573)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
6. 本野千恵 (80415752)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
7. 足達俊吾 (90783803)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 白井剛 (00262890)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
9. 嶺井隆平 (20872451)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 土屋裕子 (30557773)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 澤崎達也 (50314969)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 小迫英尊 (10291171)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 中田圭祐

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. TEERASETMANAKUL Pramote

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 福井由宇子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
16. 岡田賢

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
17. 小原収

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
18. 斎藤潤

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
19. 森垣憲一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
20. 林文夫

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
21. 伊藤萌子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
22. 高澤啓

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
23. 児嶋長次郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
24. 西小森隆太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
25. 平家俊男

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

土方 敦司 HIJIKATA ATSUSHI

研究課題

研究成果

共同研究者

近位依存性ビオチン標識酵素を用いたEGFRの細胞膜上相互作用ダイナミクスの解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

祖先型超分子の機械学習による光合成環境適応戦略の解読

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

抗体医薬標的におけるミスセンスレアバリアントの結合親和性変化を評価する手法の確立研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

疾患関連変異のタンパク質構造上の三次元分布を基点とした未知の機能部位探索法の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

実験的検証のフィードバックを活用した結合補酵素予測法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

タンパク質高次構造に基づくヒト意義不明バリアントを評価する手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

機能未知スプライシングアイソフォームの機能部位予測法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ミスセンス変異の分子機能及び表現型への影響を予測する手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

Ｂ細胞、ＮＫ細胞、樹状細胞欠損を伴う原発性免疫不全症の病態解析と原因遺伝子の同定

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Involvement of mTOR pathway in neurodegeneration in NSF-related developmental and epileptic encephalopathy2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A novel variant of NR5A1, p.R350W implicates potential interactions with unknown co-factors or ligands2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Current status of structure-based drug repurposing against COVID-19 by targeting SARS-CoV-2 proteins2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] Evaluating cepharanthine analogues as natural drugs against SARS‐CoV‐22021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

土方敦司 HIJIKATA ATSUSHI