蒔田由布子 Makita Yuko

研究者番号	80443026
その他のID	https://orcid.org/0000-0001-5745-6007
所属 (現在)	2025年度: 前橋工科大学, 工学部, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2025年度: 前橋工科大学, 工学部, 教授 2021年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級研究員 2017年度 – 2020年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 2010年度 – 2012年度: 独立行政法人理化学研究所, 生命情報基盤研究部門, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者システムゲノム科学 / システムゲノム科学研究代表者以外合同審査対象区分:小区分03060:文化財科学関連、小区分03070:博物館学関連 / 小区分03070:博物館学関連 / 小区分03060:文化財科学関連 / 小区分43050:ゲノム生物学関連 / 中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野 / 中区分38:農芸化学およびその関連分野
キーワード	研究代表者データベース / 発現量 / transcriptome / MOROKOSHI database / スィートソルガム / グレインソルガム / Sorghum bicolor Keller / Sorghum bicolor BTx623 / TSS / 転写開始点 … もっと見る / D gene / HY5 / 転写因子 / C4草本植物 / gDB-seq / CAGE / RNA-seq / ソルガム / トランスクリプトーム / Synecocystis / 光合成細菌 / マニュアルアノテーション / 放線菌 / Synochocystis / Streptomyces / ネットワークモチーフ解析 / プロモータ解析 / 比較ゲノム / 文献抽出 / 転写制御 / リファレンスデータベース … もっと見る研究代表者以外植物 / 起源 / 遺伝的多様性 / 生物系統地理 / 畳 / イグサ / 遺伝子発現 / NMD / 光受容 / リボソームプロファイリング / 翻訳開始点 / 転写開始点 / 翻訳変化 / 光応答 / 海洋メタゲノム / ゲノム解析 / 藻類 / クリプトクロム / フィトクロム / 光受容体 / プラズマ隠す

イグサの栽培化と畳の起源の解明；時空を超えたゲノム情報比較に基づく洞察
- 研究代表者
  
  木原久美子
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2028
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分03060:文化財科学関連
   小区分03070:博物館学関連
   合同審査対象区分:小区分03060:文化財科学関連、小区分03070:博物館学関連
- 研究機関
  熊本高等専門学校
植物の成長段階における転写・翻訳開始点に依存したmRNAの運命決定の解明
- 研究代表者
  
  栗原志夫
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43050:ゲノム生物学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
   東京大学
温度制御プラズマによる植物の生育促進機構解明及びソルガムの生育促進法の確立
- 研究代表者
  
  柳川由紀
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分38:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
海洋メタゲノム解析により単離された新型キメラ光受容体PHYCRYの機能解析
- 研究代表者
  
  嶋田勢津子
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
C4草本植物ソルガムの転写関連データベースの構築とその応用研究代表者
- 研究代表者
  
  蒔田由布子
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所
抗生物質生成菌と光合成細菌の転写関連データベースの構築とその応用研究代表者
- 研究代表者
  
  蒔田由布子
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所

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すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Bacterial Gene Regulation and Transcriptional Networks2013
- 著者名/発表者名
  Yuko Makita
- 出版者
  Caister Academic Press
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[図書] Chapter 10: Bacillus subtilis Transcriptional Network Bacterial Gene Regulation and Transcriptional Networks (M. Madan Babu Edit)
- 著者名/発表者名
  Yuko MAKITA and Kenta NAKAI
- 出版者
  Caister Academic Press
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[雑誌論文] The blue light signaling inhibitor 3-bromo-7-nitroindazole affects gene translation at the initial reception of blue light in young Arabidopsis seedlings2024
- 著者名/発表者名
  Yukio Kurihara, Chika Akagi, Yuko Makita, Masaharu Kawauchi, Emiko Okubo-Kurihara, Tomohiko Tsuge, Takashi Aoyama, Minami Matsui
- 雑誌名
  
  Plant Biotechnology
  
  巻: -
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23868
[雑誌論文] Transcriptional activation of ribosome-related genes at initial photoreception is dependent on signals derived from both the nucleus ans the chloroplants in Arabidopsis thaliana.2023
- 著者名/発表者名
  Akagi, C., Kurihara, Y., Makita, Y., Kawaguchi, M., Tsuge, T., Aoyama, T., Matsui, M.
- 雑誌名
  
  J. Plant Res.
  
  巻: 136 号: 2 ページ: 227-238
- DOI
  10.1007/s10265-022-01430-8
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02505, KAKENHI-PROJECT-23K23868, KAKENHI-PROJECT-22K06279
[雑誌論文] Intergenic splicing-stimulated transcriptional readthrough is suppressed by nonsense-mediated mRNA decay in Arabidopsis2022
- 著者名/発表者名
  Kurihara Yukio、Makita Yuko、Kawauchi Masaharu、Kageyama Ami、Kuriyama Tomoko、Matsui Minami
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 5 号: 1
- DOI
  10.1038/s42003-022-04348-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23868
[雑誌論文] Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton2021
- 著者名/発表者名
  Makita Yuko、Suzuki Shigekatsu、Fushimi Keiji、Shimada Setsuko、Suehisa Aya、Hirata Manami、Kuriyama Tomoko、Kurihara Yukio、Hamasaki Hidefumi、Okubo-Kurihara Emiko、Yoshitake Kazutoshi、Watanabe Tsuyoshi、Sakuta Masaaki、Gojobori Takashi、Sakami Tomoko、Narikawa Rei、Yamaguchi Haruyo、Kawachi Masanobu、Matsui Minami
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 3593-3593
- DOI
  10.1038/s41467-021-23741-5
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] Intergenic splicing-mediated readthrough transcripts are eliminated by NMD in Arabidopsis.2023
- 著者名/発表者名
  Kurihara Y, Makita Y, Kawauchi M, Kuriyama T, Matsui M.
- 学会等名
  第23回日本RNA学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23868
[学会発表] 遺伝子間スプライシングによるリードスルー転写物はNMDの標的となる2023
- 著者名/発表者名
  栗原志夫, 蒔田由布子, 河内正治, 蔭山杏実, 栗山朋子, 松井南
- 学会等名
  第64回日本植物生理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23868
[学会発表] 海洋藻類が保持する橙色光／遠赤色光と青色光を感知する新規光受容体・Dualchromeの単離と機能解析2022
- 著者名/発表者名
  嶋田勢津子, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 作田正明, 五條堀孝, 坂見知子, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
- 学会等名
  第22回　日本光生物学協会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] 新規光受容体・Dualchromeは橙色光／遠赤色光と青色光を感知する2021
- 著者名/発表者名
  成川礼、伏見圭司、蒔田由布子、鈴木重勝、嶋田勢津子、陶久あや、平田愛美、栗山朋子、栗原志夫、濱崎英史、栗原（大窪）恵美子、吉武和敏、渡辺剛、作田正明、五条堀孝、山口晴代、河地正伸、松井南
- 学会等名
  日本植物学会第85回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] Characterization of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton2021
- 著者名/発表者名
  Minami Matsui, Yuko Makita, Shigekatsu Suzuki, Keiji Fushimi, Setsuko Shimada, Haruyo Yamaguchi, Tomoko Sakami, Rei Narikawa, Masanobu Kawachi
- 学会等名
  International Symposium on Plant Photobiology (ISPP 2021)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] 海洋メタゲノムデータからの新規光受容体の発見2021
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛,坂見知子, 作田正明, 五條堀孝, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
- 学会等名
  日本植物学会第85回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] 新規光受容体・Dualchromeの生物的機能解析2021
- 著者名/発表者名
  嶋田勢津子, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 陶久あや, 平田愛実, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 作田正明, 五條堀孝, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
- 学会等名
  日本植物学会第85回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] 海洋メタゲノム配列からの新規光受容体の発見2020
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 陶久あや, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史,平田愛実, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南
- 学会等名
  生物多様性のDNA情報学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21438
[学会発表] ソルガムの転写制御解析とMOROKOSHI データベースの更新2019
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子, 栗山朋子, 下平春香, 嶋田勢津子, 松井南
- 学会等名
  第10 回ソルガムワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] Comparison of Expression profile of grain and sweet sorghum by using CAGE methods2019
- 著者名/発表者名
  Minami Matsui, Tomoko Kuriyama, Mika Kawashima, Haruka Shimohira, Yuko Makita
- 学会等名
  第397回生存圏シンポジウムクリーンエネルギー生産に向けたリグノセルロース分子育種の現状と展望
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] ソルガムのマルチトランスクリプトーム解析と遺伝子導入技術の応用2018
- 著者名/発表者名
  Tomoko Kuriyama, Yuko Makita, Mika Kawashima, Setsuko Shimada and Minami Matsui
- 学会等名
  ソルガム研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] バイオマス植物ソルガムにおけるマルチトランスクリプトーム解析2017
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子、川島美香、栗山（近藤）朋子、嶋田勢津子、松井南
- 学会等名
  第40回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] 組織別RNA-seqによるグレインソルガム(BTx623)とスイートソルガム(Keller)の比較2017
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子、川島美香、栗山朋子、嶋田勢津子、松井南
- 学会等名
  第8回ソルガムワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] MOROKOSHI: Transcriptome database in Sorghum bicolor and its updates2017
- 著者名/発表者名
  Yuko Makita, Mika Kawashima, Tomoko Kuriyama, Setsuko Shimada, Minami Matsui
- 学会等名
  The 16th International Conference on Bioinformatics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] C4草本植物ソルガムにおけるマルチトランスクリプトーム解析と MOROKOSHIデータベースの紹介2017
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子、川島美香、栗山朋子、嶋田勢津子、松井南
- 学会等名
  第35回日本植物細胞分子生物学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07265
[学会発表] Construction of transcriptional regulatory database in Streptomyces and comparative analysis of transcription factor binding sequences2012
- 著者名/発表者名
  Yuko MAKITA
- 学会等名
  2012年生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京都江戸川区タワーホール船堀
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[学会発表] 放線菌転写関連データベース(DBSCR)の構築とゲノムGC含量と転写因子認識配列の相関2012
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会
- 発表場所
  福岡国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[学会発表] 放線菌転写関連データベース(DBSCR)の構築とゲノムGC 含量と転写因子認識配列の相関2012
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子、石井崇洋、豊田哲郎、中井謙太
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会
- 発表場所
  福岡国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[学会発表] Construction of transcriptional regulatory database in Streptomyces and comparative analysis of transcription factor binding sequences2012
- 著者名/発表者名
  Yuko MAKITA, Takahiro ISHII, Tetsuro TOYODA, Kenta NAKAI
- 学会等名
  2012 年生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京都江戸川区タワーホール船堀
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[学会発表] 放線菌転写関連データベース(DBSCR)の構築と転写モチーフ解析2010
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子
- 学会等名
  グラム陽性菌ゲノム機能会議
- 発表場所
  ホテル木曽路
- 年月日
  2010-09-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199
[学会発表] 放線菌転写関連DB:DBSCR2010
- 著者名/発表者名
  蒔田由布子
- 学会等名
  グラム陽性菌ゲノム機能会議
- 発表場所
  長野
- 年月日
  2010-09-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22710199

1. 嶋田勢津子 (40432033)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 7件
2. 柳川由紀 (90432591)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 沖野晃俊 (60262276)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 鈴木重勝 (10785108)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
5. 栗原志夫 (60455342)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
6. 木原久美子 (50622916)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 副島顕子 (00244674)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 青山卓史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

蒔田 由布子 Makita Yuko

研究課題

研究成果

共同研究者

イグサの栽培化と畳の起源の解明；時空を超えたゲノム情報比較に基づく洞察

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

植物の成長段階における転写・翻訳開始点に依存したmRNAの運命決定の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

温度制御プラズマによる植物の生育促進機構解明及びソルガムの生育促進法の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

海洋メタゲノム解析により単離された新型キメラ光受容体PHYCRYの機能解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

C4草本植物ソルガムの転写関連データベースの構築とその応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

抗生物質生成菌と光合成細菌の転写関連データベースの構築とその応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] Bacterial Gene Regulation and Transcriptional Networks2013

著者名/発表者名

出版者

データソース

[図書] Chapter 10: Bacillus subtilis Transcriptional Network Bacterial Gene Regulation and Transcriptional Networks (M. Madan Babu Edit)

著者名/発表者名

出版者

データソース

[雑誌論文] The blue light signaling inhibitor 3-bromo-7-nitroindazole affects gene translation at the initial reception of blue light in young Arabidopsis seedlings2024

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Transcriptional activation of ribosome-related genes at initial photoreception is dependent on signals derived from both the nucleus ans the chloroplants in Arabidopsis thaliana.2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Intergenic splicing-stimulated transcriptional readthrough is suppressed by nonsense-mediated mRNA decay in Arabidopsis2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Intergenic splicing-mediated readthrough transcripts are eliminated by NMD in Arabidopsis.2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 遺伝子間スプライシングによるリードスルー転写物はNMDの標的となる2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 海洋藻類が保持する橙色光／遠赤色光と青色光を感知する新規光受容体・Dualchromeの単離と機能解析2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 新規光受容体・Dualchromeは橙色光／遠赤色光と青色光を感知する2021

蒔田由布子 Makita Yuko