安藤嘉倫 andoh yoshimichi

研究者番号	80509076
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人物質・材料研究機構, 技術開発・共用部門, 主任エンジニア
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2023年度: 国立研究開発法人物質・材料研究機構, 技術開発・共用部門, 主任エンジニア 2018年度 – 2019年度: 名古屋大学, 工学研究科, 特任准教授 2016年度 – 2017年度: 名古屋大学, 工学研究科, 特任講師
審査区分/研究分野	研究代表者小区分60100:計算科学関連 / 生物物理学
キーワード	研究代表者分子動力学計算 / 長距離相互作用 / 計算スケールの拡大 / 古典分子動力学計算 / 回帰モデル / GPGPU / 機械学習ポテンシャル / 計算の高速化 / 長距離静電相互作用 / 表面・界面物性 … もっと見る / 統計力学 / 生物物理 / 化学物理 / 非対称な脂質組成 / 脂質ラフト / 膜物性 / スフィンゴ脂質 / グリセロリン脂質 / 非対称性な脂質組成 / 脂質二重層膜 / 膜流動性 / 非対称な脂質分布 / ミクロドメイン / コレステロール / スフィンゴミエリン / リン脂質 / 脂質組成の非対称性 / 肝臓細胞 / 細胞膜隠す

機械学習ポテンシャル導入による古典分子動力学計算の飛躍的大規模化のための基礎研究研究代表者
- 研究代表者
  
  安藤嘉倫
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分60100:計算科学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人物質・材料研究機構
非対称な脂質組成をもった脂質二重層膜物性の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  安藤嘉倫
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2019
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生物物理学
- 研究機関
  名古屋大学

すべて 2023 2020 2019 2018 2017 2016

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] The Art of High Performance Computing for Computational Science: Advanced techniques and examples for materials science, vol. 2, 117-157. Acceleration of Classical Molecular Dynamics Simulations2019
- 著者名/発表者名
  M. Geshi (Ed.), Y Andoh, N Yoshii, J Jung, Y Sugita (Chapter 5)
- 総ページ数
  41
- 出版者
  Springer Singapore
- ISBN
  9789811398018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[図書] 月刊細胞 50巻 (3), 43-44. 分子シミュレーションによる非対称な脂質組成をもった脂質二重層膜物性の解明2018
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫
- 総ページ数
  2
- 出版者
  ニューサイエンス社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[図書] 計算科学のためのHPC技術22017
- 著者名/発表者名
  下司雅章(編)、安藤嘉倫(第6章分担)
- 総ページ数
  32
- 出版者
  大阪大学出版会
- ISBN
  9784872595871
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] An exa-scale high-performance molecular dynamics simulation program: MODYLAS2023
- 著者名/発表者名
  Yoshimichi Andoh, Shin-Ichi Ichikawa, Tatsuya Sakashita, Kazushi Fujimoto, Noriyuki Yoshii, Tetsuro Nagai, Zhiye Tang, Susumu Okazaki
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 158 号: 19 ページ: 194803-194803
- DOI
  10.1063/5.0144361
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12065, KAKENHI-PROJECT-22H00332
[雑誌論文] 分子動力学計算の大規模並列化のための技術 12023
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫
- 雑誌名
  
  アンサンブル
  
  巻: 25 ページ: 46-51
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12065
[雑誌論文] 「分子動力学計算の大規模並列化のための技術 2」2023
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫
- 雑誌名
  
  アンサンブル
  
  巻: 25 号: 2 ページ: 149-157
- DOI
  10.11436/mssj.25.149
- ISSN
  1884-5088, 1884-6750
- 年月日
  2023-04-30
- 言語
  日本語
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12065
[雑誌論文] 分子動力学計算の大規模並列化のための技術 32023
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫
- 雑誌名
  
  アンサンブル
  
  巻: 25 号: 3 ページ: 223-230
- DOI
  10.11436/mssj.25.223
- ISSN
  1884-5088, 1884-6750
- 年月日
  2023-07-31
- 言語
  日本語
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12065
[雑誌論文] Molecular dynamics study of lipid bilayers modeling outer and inner leaflets of plasma membranes of mouse hepatocytes. I: Differences in physicochemical properties between the two leaflets2020
- 著者名/発表者名
  Yoshimichi Andoh, Shiho Hayakawa, and Susumu Okazaki
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: -
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Extension of the fast multipole method for the rectangular cells with an anisotropic partition tree structure2020
- 著者名/発表者名
  Y. Andoh, N. Yoshii, S Okazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: - 号: 14 ページ: 1353-1367
- DOI
  10.1002/jcc.26180
- NAID
  120007127374
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05748, KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Fast multipole method for three dimensional systems with periodic boundary condition in two directions2020
- 著者名/発表者名
  N. Yoshii, Y. Andoh, S Okazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 41 号: 9 ページ: 940-948
- DOI
  10.1002/jcc.26141
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05748, KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] 水溶液中の両親媒性分子集団系の全原子分子動力学シミュレーション2019
- 著者名/発表者名
  ANDOH Yoshimichi、OKAZAKI Susumu
- 雑誌名
  
  オレオサイエンス
  
  巻: 19 号: 11 ページ: 447-453
- DOI
  10.5650/oleoscience.19.447
- NAID
  130007742439
- ISSN
  1345-8949, 2187-3461
- 言語
  日本語
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Molecular Behavior of Linear Alkylbenzene Sulfonate in Hydrated Crystal, Tilted Gel, and Liquid Crystal Phases Studied by Molecular Dynamics Simulation2019
- 著者名/発表者名
  Takeda Kosuke、Andoh Yoshimichi、Shinoda Wataru、Okazaki Susumu
- 雑誌名
  
  Langmuir
  
  巻: 35 号: 33 ページ: 10877-10884
- DOI
  10.1021/acs.langmuir.9b01607
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Structure of Hydrated Crystal (Lc), Tilted Gel (Lβ′), and Liquid Crystal (Lα) Phases of Linear Alkylbenzene Sulfonate (LAS) Studied by X-ray Diffraction and Molecular Dynamics Simulation2019
- 著者名/発表者名
  Takeda Kosuke、Andoh Yoshimichi、Shinoda Wataru、Okazaki Susumu
- 雑誌名
  
  Langmuir
  
  巻: 35 号: 27 ページ: 9011-9019
- DOI
  10.1021/acs.langmuir.9b01199
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Pressure tensor for electrostatic interaction calculated by fast multipole method with periodic boundary condition2018
- 著者名/発表者名
  Noriyuki Yoshii, Yoshimichi Andoh, Susumu Okazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 印刷中号: 19 ページ: 1192-1199
- DOI
  10.1002/jcc.25179
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05748, KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Difference in molecular mechanisms governing changes in membrane properties of phospholipid bilayers induced by addition of nonionic and zwitterionic surfactants2018
- 著者名/発表者名
  Yoshimichi Andoh, Sakiho Kitou, Susumu Okazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Liquids
  
  巻: 271 ページ: 933-941
- DOI
  10.1016/j.molliq.2018.09.018
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] A thread-level parallelization of pairwise additive potential and force calculations suitable for current many-core architectures2018
- 著者名/発表者名
  Y. Andoh, S. Suzuki, S. Ohshima, T. Sakashita, M. Ogino, T. Katagiri, N. Yoshii, S. Okazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Supercomputing
  
  巻: 印刷中号: 6 ページ: 2449-2469
- DOI
  10.1007/s11227-018-2272-2
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K05748, KAKENHI-PROJECT-16K21094, KAKENHI-PROJECT-17H02829
[雑誌論文] Structural ordering of lipid bilayers induced by surfactant molecules with small hydrophilic head group2017
- 著者名/発表者名
  Andoh Yoshimichi、Mohamed Siti Nor Syafawani、Kitou Sakiho、Okazaki Susumu
- 雑誌名
  
  Molecular Simulation
  
  巻: 43 号: 13-16 ページ: 1247-1255
- DOI
  10.1080/08927022.2017.1319061
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[雑誌論文] Evaluation of atomic pressure in the multiple time-step integration algorithm2017
- 著者名/発表者名
  Y Andoh, A. Yamada, N. Yoshii, S Okazaki
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  巻: 38 号: 10 ページ: 704-713
- DOI
  10.1002/jcc.24731
- NAID
  120006305599
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26410012, KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 分子動力学計算と機械学習による機能性分子液体材料の特異な粘性挙動の解明2023
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 名倉和彦, 中西尚志, 袖山慶太郎
- 学会等名
  第37回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12065
[学会発表] 細胞膜内でのコレステロール分子側方凝集に関する理論的研究2019
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫、早川志保、岡崎進
- 学会等名
  第42回溶液化学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 汎用分子動力学計算ソフトウェアMODYLASへの自動チューニング技術適用の展望2019
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫
- 学会等名
  第10回自動チューニング技術の現状と応用に関するシンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 非対称な脂質組成を持った脂質二重層膜モデル内での脂質分子側方凝集に関する理論的研究2019
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 早川志保, 岡崎進
- 学会等名
  第10回生体界面研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 次期スパコン「富岳」での大規模・長時間分子動力学計算実現のためのソフトウェアMODYLASの性能向上2019
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫、坂下達哉、張家超、朱喆、浦野諒、藤本和士、吉井範行、岡崎進
- 学会等名
  第33回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 非対称な脂質組成を持った脂質二重層膜内での脂質分子側方凝集に関する理論的研究2019
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫、早川志保、岡崎進
- 学会等名
  第13回分子科学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] Molecular dynamics study on correlation of membrane properties between outer and inner leaflets of cell plasma membranes2019
- 著者名/発表者名
  Andoh Yoshimichi, Hayakawa Shiho, Okazaki Susumu
- 学会等名
  The 5th International Conference on Molecular Simulation
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] Recent developments of molecular dynamics calculation software MODYLAS2018
- 著者名/発表者名
  Andoh Yoshimichi
- 学会等名
  5th ADAC workshop
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 大規模分子動力学計算高速化のための新規MPI通信方法の開発2018
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 坂下達哉, 吉井範行, 岡崎進
- 学会等名
  第32回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 脂質二重層膜中のコレステロール二分子間側方相互作用にリン脂質および水が果たす役割の解明2018
- 著者名/発表者名
  松岡漢斗, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第32回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 脂質組成に非対称性をもつモデル脂質二重膜の分子動力学計算2018
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 早川志保, 岡崎進
- 学会等名
  第12回分子科学討論会2018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 脂質組成の非対称性を考慮したモデル脂質二重膜の分子動力学計算2017
- 著者名/発表者名
  早川志保, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第11回分子科学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] Molecular dynamics study of differences in membrane properties between outer and inner leaflets of cell plasma membranes2017
- 著者名/発表者名
  Andoh Yoshimichi, Hayakawa Shiho, Okazaki Suzumu
- 学会等名
  Joint EMLG/JMLG Meeting 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 脂質組成の非対称性を考慮したモデル脂質二重膜の分子動力学計算2017
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 早川志保, 岡崎進
- 学会等名
  第40回溶液化学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 脂質二重膜中のコレステロール2分子間側方相互作用への溶媒効果の解明2017
- 著者名/発表者名
  松岡漢斗,安藤嘉倫,岡崎進
- 学会等名
  第31回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 細胞膜の外単層膜と内単層膜間での膜物性の違いに関する研究2017
- 著者名/発表者名
  早川志保, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第11回分子科学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 細胞膜の外単層膜と内単層膜間での膜物性の違いに関する研究2017
- 著者名/発表者名
  早川志保, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第31回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] マルチタイムステップ数値積分法(RESPA) に基づく分子動力学計算での圧力値算出における問題2016
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 吉井範行, 山田篤志, 岡崎進
- 学会等名
  第30 回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 親水性および疎水性の異なる直鎖界面活性剤分子添加によるDMPC 脂質二重層膜の物性変化2016
- 著者名/発表者名
  鬼頭咲帆, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第39回溶液化学シンポジウム
- 発表場所
  筑波
- 年月日
  2016-11-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] リン脂質二重層膜中でのコレステロール間側方相互作用のリン脂質種依存性2016
- 著者名/発表者名
  松岡漢斗, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第39回溶液化学シンポジウム
- 発表場所
  筑波
- 年月日
  2016-11-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] 肝臓細胞膜を模した脂質二重層膜の全原子分子動力学計算2016
- 著者名/発表者名
  安藤嘉倫, 青木則之, 岡崎進
- 学会等名
  第10回分子科学討論会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2016-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] リン脂質二重層膜中でのコレステロール間側方相互作用のリン脂質種依存性2016
- 著者名/発表者名
  松岡漢斗, 安藤嘉倫, 岡崎進
- 学会等名
  第30 回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094
[学会発表] An attempt to estimate correct atomic pressure in the multiple time-step integration algorithm2016
- 著者名/発表者名
  Y. Andoh, N. Yoshii, A. Yamada, S. Okazaki
- 学会等名
  The 4th International Conference on Molecular Simulation
- 発表場所
  Shanghai
- 年月日
  2016-10-23
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K21094

1. 吉井範行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 5件

安藤 嘉倫 andoh yoshimichi

研究課題

研究成果

共同研究者

機械学習ポテンシャル導入による古典分子動力学計算の飛躍的大規模化のための基礎研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

非対称な脂質組成をもった脂質二重層膜物性の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] The Art of High Performance Computing for Computational Science: Advanced techniques and examples for materials science, vol. 2, 117-157. Acceleration of Classical Molecular Dynamics Simulations2019

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] 月刊細胞 50巻 (3), 43-44. 分子シミュレーションによる非対称な脂質組成をもった脂質二重層膜物性の解明2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 計算科学のためのHPC技術22017

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] An exa-scale high-performance molecular dynamics simulation program: MODYLAS2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 分子動力学計算の大規模並列化のための技術 12023

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] 「分子動力学計算の大規模並列化のための技術 2」2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] 分子動力学計算の大規模並列化のための技術 32023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] Molecular dynamics study of lipid bilayers modeling outer and inner leaflets of plasma membranes of mouse hepatocytes. I: Differences in physicochemical properties between the two leaflets2020

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Extension of the fast multipole method for the rectangular cells with an anisotropic partition tree structure2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Fast multipole method for three dimensional systems with periodic boundary condition in two directions2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 水溶液中の両親媒性分子集団系の全原子分子動力学シミュレーション2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

言語

安藤嘉倫 andoh yoshimichi