ＬｙｓｅｎｋｏＡｒｔｅｍ Lysenko Artem

… 別表記

Lysenko Artem ルイセンコアルテム

研究者番号	80753805
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-1441-0604
所属 (現在)	2024年度: 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 2024年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 客員研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2024年度: 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 2019年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 研究員 2018年度: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 特別研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
キーワード	研究代表者 deep learning / spatial transcriptomics / cancer immunology / Artificial Intelligence / Subtype Discovery / multiomics / meta-learning / cancer / Multiomics / Cancer / Precision Medicine / Deep Learning

研究課題
(2件)
研究成果
(12件)

From data to discovery in cancer immunology: AI-driven spatial transcriptomic.研究代表者
- 研究代表者
  
  Lysenko Artem
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  東京大学
A Deep Learning framework for cancer precision medicine研究代表者
- 研究代表者
  
  Lysenko Artem
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人理化学研究所

すべて 2020 2019 2018

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] Genotyping and Statistical Analysis (in Genome-Wide Association Studies)2019
- 著者名/発表者名
  Lysenko Artem, Boroevich, A Keith, Tsunoda Tatsuhiko
- 総ページ数
  20
- 出版者
  Springer
- ISBN
  9789811381775
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[図書] "Genotyping and Statistical Analysis" in Genome-Wide Association Studies (book chapter)2018
- 著者名/発表者名
  Lysenko, Artem, Keith A. Boroevich, Tatsuhiko Tsunoda
- 総ページ数
  16
- 出版者
  Springer Nature
- ISBN
  9789811381768
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[雑誌論文] Multiple Myeloma DREAM Challenge reveals epigenetic regulator PHF19 as marker of aggressive disease2020
- 著者名/発表者名
  Mason Mike J.、Multiple Myeloma DREAM Consortium (including Lysenko, Artem)、et al.
- 雑誌名
  
  Leukemia
  
  巻: - 号: 7 ページ: 1866-1874
- DOI
  10.1038/s41375-020-0742-z
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156, KAKENHI-PLANNED-17H06307
[雑誌論文] Assessment of network module identification across complex diseases2019
- 著者名/発表者名
  Choobdar Sarvenaz、The DREAM Module Identification Challenge Consortium (including Lysenko, Artem)、et al.
- 雑誌名
  
  Nature Methods
  
  巻: 16 号: 9 ページ: 843-852
- DOI
  10.1038/s41592-019-0509-5
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[雑誌論文] HseSUMO: Sumoylation site prediction using half-sphere exposures of amino acids residues2019
- 著者名/発表者名
  Sharma Alok、Lysenko Artem、L?pez Yosvany、Dehzangi Abdollah、Sharma Ronesh、Reddy Hamendra、Sattar Abdul、Tsunoda Tatsuhiko
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 19 号: S9 ページ: 1-7
- DOI
  10.1186/s12864-018-5206-8
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156, KAKENHI-PROJECT-16H06299
[雑誌論文] PHI-Nets: A Network Resource for Ascomycete Fungal Pathogens to Annotate and Identify Putative Virulence Interacting Proteins and siRNA Targets2019
- 著者名/発表者名
  Janowska-Sejda Elzbieta I.、Lysenko Artem、Urban Martin、Rawlings Chris、Tsoka Sophia、Hammond-Kosack Kim E.
- 雑誌名
  
  Frontiers in Microbiology
  
  巻: 10
- DOI
  10.3389/fmicb.2019.02721
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[雑誌論文] Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen2019
- 著者名/発表者名
  Menden Michael P. AstraZeneca-Sanger Drug Combination DREAM Consortium (including Lysenko, Artem)、et al.
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 10 号: 1
- DOI
  10.1038/s41467-019-09799-2
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[雑誌論文] Navigating the disease landscape: knowledge representations for contextualizing molecular signatures2018
- 著者名/発表者名
  Mansoor Saqi、 Artem Lysenko、 Yi-Ke Guo 、 Tatsuhiko Tsunoda 、Charles Auffray
- 雑誌名
  
  Briefings In Bioinformatics
  
  巻: bby025 ページ: 1-15
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[雑誌論文] An integrative machine learning approach for prediction of toxicity-related drug safety2018
- 著者名/発表者名
  Lysenko Artem、Sharma Alok、Boroevich Keith A、Tsunoda Tatsuhiko
- 雑誌名
  
  Life Science Alliance
  
  巻: 1 号: 6 ページ: 1-14
- DOI
  10.26508/lsa.201800098
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156, KAKENHI-PLANNED-17H06307, KAKENHI-PROJECT-16H06299
[学会発表] Towards discovery of human disease mechanisms by graph-based contextual integration of ‘omics signatures (poster)2019
- 著者名/発表者名
  Artem Lysenko, Keith A. Boroevich and Tatsuhiko Tsunoda
- 学会等名
  ISCB, OIST, Okinawa
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[学会発表] Towards computational drug screening: profiling drug toxicity in the context of a biological network (poster)2019
- 著者名/発表者名
  Artem Lysenko, Keith A. Boroevich and Tatsuhiko Tsunoda
- 学会等名
  ISMB/ECCB, Basel, Switzerland
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156
[学会発表] Machine learning-driven analysis of biological networks for predictive modelling of drug toxicity2018
- 著者名/発表者名
  Artem Lysenko
- 学会等名
  IB-2018, Harpenden, UK
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18156

Ｌｙｓｅｎｋｏ Ａｒｔｅｍ Lysenko Artem

Lysenko Artem ルイセンコ アルテム

研究課題

研究成果

From data to discovery in cancer immunology: AI-driven spatial transcriptomic.研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

A Deep Learning framework for cancer precision medicine研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] Genotyping and Statistical Analysis (in Genome-Wide Association Studies)2019

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] "Genotyping and Statistical Analysis" in Genome-Wide Association Studies (book chapter)2018

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] Multiple Myeloma DREAM Challenge reveals epigenetic regulator PHF19 as marker of aggressive disease2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Assessment of network module identification across complex diseases2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] HseSUMO: Sumoylation site prediction using half-sphere exposures of amino acids residues2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] PHI-Nets: A Network Resource for Ascomycete Fungal Pathogens to Annotate and Identify Putative Virulence Interacting Proteins and siRNA Targets2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Navigating the disease landscape: knowledge representations for contextualizing molecular signatures2018

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] An integrative machine learning approach for prediction of toxicity-related drug safety2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Towards discovery of human disease mechanisms by graph-based contextual integration of ‘omics signatures (poster)2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Towards computational drug screening: profiling drug toxicity in the context of a biological network (poster)2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Machine learning-driven analysis of biological networks for predictive modelling of drug toxicity2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

ＬｙｓｅｎｋｏＡｒｔｅｍ Lysenko Artem

Lysenko Artem ルイセンコアルテム