小形公亮 Ogata Kosuke

研究者番号	80866781
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 京都大学, 薬学研究科, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 京都大学, 薬学研究科, 助教 2022年度 – 2023年度: 京都大学, 薬学研究科, 助教 2020年度 – 2021年度: 京都大学, 薬学研究科, 特定助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分47020:薬系分析および物理化学関連研究代表者以外小区分90120:生体材料学関連 / 中区分47:薬学およびその関連分野
キーワード	研究代表者以外血中滞留性 / ホスファチジルセリン / エキソソーム / 細胞外小胞 / リン酸化修飾 / 化学修飾 / タンパク質構造 / プロテオミクス / 質量分析

リン酸化修飾ストイキオメトリー計測に基づく相互作用制御リン酸化部位の包括的解析研究代表者
- 研究代表者
  
  小形公亮
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2026
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分47020:薬系分析および物理化学関連
- 研究機関
  京都大学
MSサイレンシングによる時空間プロテオミクス
- 研究代表者
  
  石濱泰
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2021
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分47:薬学およびその関連分野
- 研究機関
  京都大学
天然ステルスエキソソームの解析とデリバリーキャリア開発への応用
- 研究代表者
  
  高橋有己
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分90120:生体材料学関連
- 研究機関
  京都大学

すべて 2022 2021 2020

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Motif-centric phosphoproteomics to target kinase-mediated signaling pathways2022
- 著者名/発表者名
  Chia-Feng Tsai, Kosuke Ogata, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama
- 雑誌名
  
  Cell Reports Methods
  
  巻: 2 号: 1 ページ: 100138-100138
- DOI
  10.1016/j.crmeth.2021.100138
- NAID
  120007187415
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478, KAKENHI-PUBLICLY-20H04845, KAKENHI-PROJECT-21H02459, KAKENHI-PROJECT-21H02466
[雑誌論文] Nano-scale solid-phase isobaric labeling for multiplexed quantitative phosphoproteomics2021
- 著者名/発表者名
  Ogata K, Tsai CF, Ishihama Y.
- 雑誌名
  
  J Proteome Res
  
  巻: 20 号: 8 ページ: 4193-4202
- DOI
  10.1021/acs.jproteome.1c00444
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478, KAKENHI-PROJECT-21H02459
[雑誌論文] CoolTip: Low-Temperature Solid-Phase Extraction Microcolumn for Capturing Hydrophilic Peptides and Phosphopeptides2021
- 著者名/発表者名
  Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama
- 雑誌名
  
  Mol Cell Proteomics
  
  巻: 20 ページ: 100170-100170
- DOI
  10.1016/j.mcpro.2021.100170
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478, KAKENHI-PROJECT-21H02459
[雑誌論文] Phosphatidylserine-deficient small extracellular vesicle is a major somatic cell-derived sEV subpopulation in blood2021
- 著者名/発表者名
  Matsumoto Akihiro、Takahashi Yuki、Ogata Kosuke、Kitamura Shimpei、Nakagawa Naoki、Yamamoto Aki、Ishihama Yasushi、Takakura Yoshinobu
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 24 号: 8 ページ: 102839-102839
- DOI
  10.1016/j.isci.2021.102839
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H04533, KAKENHI-PROJECT-21H02616
[雑誌論文] Effect of Phosphorylation on the Collision Cross Sections of Peptide Ions in Ion Mobility Spectrometry2021
- 著者名/発表者名
  Kosuke Ogata, Chih-Hsiang Chang and Yasushi Ishihama
- 雑誌名
  
  Mass Spectrometry
  
  巻: 10 号: 1 ページ: A0093-A0093
- DOI
  10.5702/massspectrometry.A0093
- NAID
  130007977764
- ISSN
  2186-5116, 2187-137X
- 年月日
  2021-01-30
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] キナーゼ基質モチーフ標的型リン酸化プロテオミクス2022
- 著者名/発表者名
  小形公亮
- 学会等名
  第19回北里疾患プロテオーム研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] In vitroリン酸化タグを用いたタンパク質の構造変化検出法の開発2022
- 著者名/発表者名
  前田朝登、小形公亮、杉山直幸、石濱泰
- 学会等名
  日本薬学会第142年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] In vitroリン酸化タグを用いたタンパク質の構造変化検出法の開発2022
- 著者名/発表者名
  前田朝登、小形公亮、杉山直幸、石濱泰
- 学会等名
  第3回生体分子分析ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] Proteome-wide profiling of the position specific amino acid contributions to the peptide collision cross-sections2021
- 著者名/発表者名
  Kosuke Ogata, Chih-Hsiang Chang, Darien Yeung, Victor Spicer, Oleg Krokhin, Yasushi Ishihama
- 学会等名
  PBA2021 31st International Symposium on Pharmaceutical and Biomedical Analysis
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] プロテオミクスLC/MS/MSにおける感度向上を目的とした移動相添加剤の検討2021
- 著者名/発表者名
  小形公亮, Taylor Battellino, Victor Spicer, Oleg Krokhin, 石濱泰
- 学会等名
  第32回クロマトグラフィー科学会議
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] 配列特異的なアミノ酸の相対衝突断面積に基づくペプチドイオンモビリティ予測2021
- 著者名/発表者名
  小形公亮, Chih-Hsiang Chang, Darien Yeung, Victor Spicer, Oleg Krokhin, 石濱泰
- 学会等名
  BMAS2021 第33回バイオメディカル分析科学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] シグナル伝達経路解明に向けたキナーゼ基質モチーフ標的型リン酸化プロテオミクス2021
- 著者名/発表者名
  小形公亮、Chia-Feng Tsai、杉山直幸、石濱泰
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] Proteomic profiling of peptide collision cross-sections with trapped ion mobility spectrometry2021
- 著者名/発表者名
  Kosuke Ogata, Chih-Hsiang Chang, Darien Yeung, Victor Spicer, Oleg Krokhin, Yasushi Ishihama
- 学会等名
  10th Asia-Oceania Human Proteome Organization Congress
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478
[学会発表] Trypsin Limited Proteolysis Strategy towards in-depth Structural Proteomics2020
- 著者名/発表者名
  Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama
- 学会等名
  第68回アメリカ質量分析学会（ASMS2020Reboot）
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21478

1. 石濱泰 (30439244)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 11件
2. 高橋有己 (00547870)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
3. 高倉喜信 (30171432)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件

小形 公亮 Ogata Kosuke

研究課題

研究成果

共同研究者

リン酸化修飾ストイキオメトリー計測に基づく相互作用制御リン酸化部位の包括的解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

MSサイレンシングによる時空間プロテオミクス

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

天然ステルスエキソソームの解析とデリバリーキャリア開発への応用

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Motif-centric phosphoproteomics to target kinase-mediated signaling pathways2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Nano-scale solid-phase isobaric labeling for multiplexed quantitative phosphoproteomics2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] CoolTip: Low-Temperature Solid-Phase Extraction Microcolumn for Capturing Hydrophilic Peptides and Phosphopeptides2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Phosphatidylserine-deficient small extracellular vesicle is a major somatic cell-derived sEV subpopulation in blood2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Effect of Phosphorylation on the Collision Cross Sections of Peptide Ions in Ion Mobility Spectrometry2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

年月日

言語

データソース

[学会発表] キナーゼ基質モチーフ標的型リン酸化プロテオミクス2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] In vitroリン酸化タグを用いたタンパク質の構造変化検出法の開発2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] In vitroリン酸化タグを用いたタンパク質の構造変化検出法の開発2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Proteome-wide profiling of the position specific amino acid contributions to the peptide collision cross-sections2021

著者名/発表者名

学会等名

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[学会発表] プロテオミクスLC/MS/MSにおける感度向上を目的とした移動相添加剤の検討2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 配列特異的なアミノ酸の相対衝突断面積に基づくペプチドイオンモビリティ予測2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] シグナル伝達経路解明に向けたキナーゼ基質モチーフ標的型リン酸化プロテオミクス2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

小形公亮 Ogata Kosuke