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倉田 博之  Kurata Hiroyuki

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 90251371
その他のID
外部サイト
所属 (現在) 2025年度: 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2014年度 – 2024年度: 九州工業大学, 大学院情報工学研究院, 教授
2012年度 – 2013年度: 九州工業大学, 情報工学研究院, 教授
2008年度 – 2011年度: 九州工業大学, 大学院・情報工学研究院, 教授
2007年度: 九州工業大学, 情報工学部, 教授
2000年度 – 2006年度: 九州工業大学, 情報工学部, 助教授 … もっと見る
1998年度: 東京大学, 大学院・工学学科, 助手
1997年度 – 1998年度: 東京大学, 大学院・工学系研究科, 助手
1996年度: 東京大学, 工学系研究科・化学生命工学専攻, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生物系 / 生体生命情報学 / 生物・生体工学 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生命・健康・医療情報学 / 複合領域 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 人間情報学およびその関連分野
研究代表者以外
生物・生体工学
キーワード
研究代表者
シミュレーション / システム生物学 / 生体生命情報学 / ネットワーク / ロバストネス / バイオインフォマティクス / コンピュータシミュレーション / インスリン / 動力学 / 合成生物学 … もっと見る / 大腸菌 / 予測 / 臓器 / ヒト代謝 / 創薬 / ダイナミックモデル / 糖尿病 / 全身代謝 / 肝臓 / 薬物動態学 / 数理モデリング / 代謝ネットワーク / 数学モデル / ダイナミクス / 代謝 / バイオインフォマティク / 微生物 / ゲノム / シミュレーション工学 / システム / リボザイム / 熱ショック応答 / 植物細胞 / 光 / 脂肪症 / エピジェネティクス / エピジェネティック / 配列解析 / ペプチド / タンパク質 / 機械学習 / メカニズム / コンピュータ / 神経ネットワーク / 統計学 / 臨床 / せき損 / 重回帰解析 / 臨床データ / バイオ統計 / 運動機能回復 / 脊髄損傷 / 人工知能 / データサインエス / 臨床統計 / 数理モデル / ヒト生理学 / システム解析 / 全細胞シミュレーション / Image analysis / Bioinformatics / Systems biology / Dynamic simulation / Stochastic process / Diffusion equation / ファイブブラスト / 細胞運動 / 共焦点顕微鏡 / 統計 / ファイブロブラスト / 画像処理 / 画像解析 / 時空間シミュレーション / 確率過程 / 拡散方程式 / 生体分子ネットワーク / Gillespie / Fokker-Planck / 相互抑制モデル / 相互活性化モデル / 確率モデル / 遺伝子 / 物質生産 / 生物プロセス / 情報科学 / 流束 / 制御 / 遺伝子発現 / 代謝システム / 複雑性 / 設計原理 / 生物回路 / 生体生命システム情報学 / ロバスシネス / システムバイオロジ / アンモニア同化 / CADLIVE / 酵母 / 生命分子ネットワーク / RNA工学 / 遺伝子機能解析 / 形質転換 / BY2 / 生命 / 情報 / 生産 / アントシアニン / 遺伝子組換 / バイオリアクター / 植物培養 / 遺伝子組換え / 二次代謝物 / 制御因子 / RbcS / gus / 植物培養細胞 / フィトクロム … もっと見る
研究代表者以外
Metastasis / Alzheimer Disease / apoptosis / Gene Discovery / Ribozyme / 遺伝子破壊 / RNA工学 / 慢性骨髄性白血病 / ハンマーヘッドリボザイム / ジーン・ディスカバリー / 遺伝子治療 / RNAヘリカーゼ / アポトーシス / poly A / RNAヘリケース / がん転移 / アルツハイマー病 / アポトシス / ジーンディスカバリー / リボザイム / 植物 / 生物素子 / 光 / RbcS3A プロモーター / Ca MV35S プロモーター / gus 遺伝子 / レポーター遺伝子 / タバコ培養細胞 / フィトクロム / 二次代謝物生産 / 植物細胞 隠す
  • 研究課題

    (20件)
  • 研究成果

    (178件)
  • 共同研究者

    (14人)
  •  オミックスを統合するヒト全身代謝マルチスケール動力学モデルの開発研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  臓器連関システムのマルチスケール数理モデルの開発と糖尿病の病態解析研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  深層ニューラルネットワークによる構造情報に基づくコンピュータ支援創薬研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      特別研究員奨励費
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  脊損患者の再生治療の有効性を予測する神経ネットワークモデルの開発研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 研究分野
      人間情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  ゲノムスケールヒト代謝のdFBAモデル開発と多剤併用療法への応用研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  ノイズが引き起こす確率的挙動を考慮した生体分子ネットワークの実用的設計研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2015
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  バーチャルメタボリズム:代謝システムの標準ダイナミックモデル開発研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  メタボロームを代謝ネットワークへ統合する数理モデルの開発研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  生物回路の設計原理に基づく合成生物学研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  分子ネットワークのコンピュータ支援設計法の開発とグルコース同化システムへの応用研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  大規模代謝・遺伝子ネットワークのダイナミックシミュレーションとシステム解析研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2008
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  ネットワークマップに基づく大規模生命分子ネットワークのロバスト解析研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  ファイブロブラスト運動制御の画像解析とシミュレーション研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2005
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  2相分離計算法を用いた生命分子ネットワーク解析により生命の設計原理の解明研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2001
    • 研究種目
      特定領域研究(C)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  植物遺伝子機能解析のためのハイブリッド型リボザイムの開発研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2001 – 2002
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  数学モデリングとリボザイムの共同による生命システム設計原理の解明研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      2000
    • 研究種目
      特定領域研究(C)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  機能性核酸を用いた生体における遺伝子機能解析プロセスの開発

    • 研究代表者
      多比良 和誠
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2003
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      東京大学
  •  制御遺伝子導入による有用二次代謝物生産に関わる構造遺伝子群の発現誘導システム研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      1997 – 1998
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      東京大学
  •  光レセプター遺伝子の機能解析と光素子の展開

    • 研究代表者
      古崎 新太郎
    • 研究期間 (年度)
      1997 – 1998
    • 研究種目
      萌芽的研究
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      九州大学
      東京大学
  •  フィトクロム遺伝子を導入した組換え植物培養細胞を用いた光バイオリアクター研究代表者

    • 研究代表者
      倉田 博之
    • 研究期間 (年度)
      1996
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      東京大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] 抗体医薬における細胞構築・培養・ダウンストリームのすべて2015

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 総ページ数
      273
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [図書] システム工学的アプローチを用いた細胞モデリング,In 抗体医薬における細胞構築・培養・ダウンストリームのすべて(ファインケミカルシリーズ)2015

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 総ページ数
      200
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [図書] Biomedical Engineering and Cognitive Neuroscience for Healthcare: Interdisciplinary Applications2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 総ページ数
      200
    • 出版者
      IGI Global
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [図書] Biomedical Engineering and Cognitive Neuroscience for Healthcare: Interdisciplinary Applications2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 総ページ数
      200
    • 出版者
      IGI Global
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [図書] Modularity of biochemical networks In : Biomedical Engineering and Cognitive Neuroscience for Healthcare : Interdisciplinary Applications2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 総ページ数
      20
    • 出版者
      IGI Global
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [図書] In: Biomedical Engineering and Cognitive Neuroscience for Healthcare: Interdisciplinary Applications2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Modularity of biochemical networks
    • 出版者
      IGI Global, Hershey, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [図書] システム工学的アプローチを用いた細胞設計,In抗体医薬のための細胞構築と培養技術(ファインケミカルシリーズ)2010

    • 著者名/発表者名
      倉田博之, 監修:大政健史
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Stack-DHUpred: Advancing the accuracy of dihydrouridine modification sites detection via stacking approach2024

    • 著者名/発表者名
      Harun-Or-Roshid Md.、Maeda Kazuhiro、Phan Le Thi、Manavalan Balachandran、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Computers in Biology and Medicine

      巻: 169 ページ: 107848-107848

    • DOI

      10.1016/j.compbiomed.2023.107848

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] CNN6mA: Interpretable neural network model based on position-specific CNN and cross-interactive network for 6mA site prediction2023

    • 著者名/発表者名
      Tsukiyama Sho、Hasan Md Mehedi、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 21 ページ: 644-654

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2022.12.043

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] Automatic Generation of SBML Kinetic Models from Natural Language Texts Using GPT2023

    • 著者名/発表者名
      Maeda Kazuhiro、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 24 号: 8 ページ: 7296-7296

    • DOI

      10.3390/ijms24087296

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K12247, KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] Cross-attention PHV: Prediction of human and virus protein-protein interactions using cross-attention-based neural networks2022

    • 著者名/発表者名
      Sho Tsukiyama and Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 20 ページ: 5564-5573

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2022.10.012

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22KJ2495, KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] BERT6mA: prediction of DNA N6-methyladenine site using deep learning-based approaches2022

    • 著者名/発表者名
      Tsukiyama Sho、Hasan Md Mehedi、Deng Hong-Wen、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 23 号: 2 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1093/bib/bbac053

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] MLAGO: machine learning-aided global optimization for Michaelis constant estimation of kinetic modeling2022

    • 著者名/発表者名
      Maeda Kazuhiro、Hatae Aoi、Sakai Yukie、Boogerd Fred C.、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 23 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1186/s12859-022-05009-x

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K12247, KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] iACVP: markedly enhanced identification of anti-coronavirus peptides using a dataset-specific word2vec model2022

    • 著者名/発表者名
      Kurata Hiroyuki、Tsukiyama Sho、Manavalan Balachandran
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 23 号: 4 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1093/bib/bbac265

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] ICAN: interpretable cross-attention network for identifying drug and target protein interactions2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata and Sho Tsukiyama.
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 17(10) 号: 10 ページ: 0276609-0276609

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0276609

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22KJ2495, KAKENHI-PROJECT-23K24943
  • [雑誌論文] Critical evaluation of web-based DNA N6-methyladenine site prediction tools2021

    • 著者名/発表者名
      Hasan Md Mehedi、Shoombuatong Watshara、Kurata Hiroyuki、Manavalan Balachandran
    • 雑誌名

      Briefings in Functional Genomics

      巻: 20 号: 4 ページ: 258-272

    • DOI

      10.1093/bfgp/elaa028

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] Virtual metabolic human dynamic model for pathological analysis and therapy design for diabetes. iScience2021

    • 著者名/発表者名
      H. Kurata
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 2 ページ: 102101-102101

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102101

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] NeuroPred-FRL: An Interpretable Prediction Model for Identifying Neuropeptide using Feature Representation Learning2021

    • 著者名/発表者名
      Md Mehedi Hasan, Md Ashad Alam, Watshara Shoombuatong, Balachandran Manavalan, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: NA 号: 6

    • DOI

      10.1093/bib/bbab167

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19F19377, KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] Computer-aided rational design of efficient NADPH production system by Escherichia coli pgi mutant using a mixture of glucose and xylose2020

    • 著者名/発表者名
      Yu Matsuoka, Hiroyuki Kurata.
    • 雑誌名

      Front. Bioeng. Biotech.

      巻: 8 ページ: 277-277

    • DOI

      10.3389/fbioe.2020.00277

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] A prediction model of functional outcome at 6 months using clinical findings of a person with traumatic spinal cord injury at 1 month after injury2020

    • 著者名/発表者名
      Yuto Ariji, Tesuo Hayashi, Ryuichiro Koga, Satoshi Murai, Fumihiro Towatari, Hiroaki Sakai, Hiroyuki Kurata, Takeshi Maeda
    • 雑誌名

      Spinal Cord

      巻: 58 号: 11 ページ: 1158-1165

    • DOI

      10.1038/s41393-020-0488-5

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009
  • [雑誌論文] ヒト全身代謝システムの数理モデル2020

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 雑誌名

      細胞

      巻: 52 ページ: 376-379

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] Prediction of S-nitrosylation Sites by Integrating Support Vector Machine and Random Forest.2019

    • 著者名/発表者名
      Md. Mehedi Hasan, Balachandran Manavalan, Mst. Shamima Khatuna, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Molecular Omics

      巻: 15 号: 6 ページ: 451-451

    • DOI

      10.1039/c9mo00098d

    • NAID

      120007006245

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19F19377
  • [雑誌論文] Computational identification of microbial phosphorylation sites by the enhanced characteristics of sequence information2019

    • 著者名/発表者名
      Md. Mehedi Hasan, Md. Mamunur Rashid, Mst. Shamima Khatun, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Sci. Rep

      巻: 9 号: 1 ページ: 8258-8258

    • DOI

      10.1038/s41598-019-44548-x

    • NAID

      120006715307

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19F19377
  • [雑誌論文] PreAIP: Computational Prediction of Anti-inflammatory Peptides by Integrating Multiple Complementary Features2019

    • 著者名/発表者名
      Khatun Mst. Shamima、Hasan Md. Mehedi、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Frontiers in Genetics

      巻: 10 ページ: 1-10

    • DOI

      10.3389/fgene.2019.00129

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009, KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Self-replenishment cycles generate a threshold response2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 9 号: 1 ページ: 17139-17139

    • DOI

      10.1038/s41598-019-53589-1

    • NAID

      120006773074

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] Ranking network mechanisms by how they fit diverse experiments and deciding on E. coli's ammonium transport and assimilation network2019

    • 著者名/発表者名
      Maeda Kazuhiro、Westerhoff Hans V.、Kurata Hiroyuki、Boogerd Fred C.
    • 雑誌名

      npj Systems Biology and Applications

      巻: 5 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1038/s41540-019-0091-6

    • NAID

      120006778226

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K18153, KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [雑誌論文] Large-Scale Assessment of Bioinformatics Tools for Lysine Succinylation Sites2019

    • 著者名/発表者名
      Hasan Md. Mehedi、Khatun Mst. Shamima、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Cells

      巻: 8 号: 2 ページ: 95-95

    • DOI

      10.3390/cells8020095

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009, KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Computational modeling of lysine post-translational modification: an overview2018

    • 著者名/発表者名
      Md. Mehedi Hasan, Mst. Shamima Khatun, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Current Synthetic and Systems Biology

      巻: 6 号: 01 ページ: 1-6

    • DOI

      10.4172/2332-0737.1000137

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009
  • [雑誌論文] Long negative feedback loop enhances period tunability of biological oscillators2018

    • 著者名/発表者名
      Maeda Kazuhiro、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Journal of Theoretical Biology

      巻: 440 ページ: 21-31

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2017.12.014

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Improved kinetic model of Escherichia coli central carbon metabolism in batch and continuous cultures2018

    • 著者名/発表者名
      Kurata Hiroyuki、Sugimoto Yurie
    • 雑誌名

      J Bioscie Bioeng

      巻: 125 号: 2 ページ: 251-257

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2017.09.005

    • NAID

      40021471336

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] iLMS, Computational Identification of Lysine-Malonylation Sites by Combining Multiple Sequence Features2018

    • 著者名/発表者名
      Hasan Md. Mehedi、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Proceedings of IEEE 18th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering

      巻: 1 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1109/bibe.2018.00077

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] A Comprehensive Review of In silico Analysis for Protein S-sulfenylation Sites2018

    • 著者名/発表者名
      Hasan Md Mehedi、Khatun Mst Shamima、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Protein & Peptide Letters

      巻: 25 号: 9 ページ: 815-821

    • DOI

      10.2174/0929866525666180905110619

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009
  • [雑誌論文] libRCGA: a C library for real-coded genetic algorithms for rapid parameter estimation of kinetic models2018

    • 著者名/発表者名
      Maeda Kazuhiro、Boogerd Fred C.、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Bioinformatics

      巻: 11 号: 0 ページ: 31-40

    • DOI

      10.2197/ipsjtbio.11.31

    • NAID

      130007483197

    • ISSN
      1882-6679
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K18153, KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] A novel isolation method for cancer prognostic factors via the p53 pathway by a combination of in vitro and in silico analyses2018

    • 著者名/発表者名
      Kamijo Y, Kawahara K, Yoshinaga T, Kurata H, Arima K, Furukawa T.
    • 雑誌名

      Oncoscience

      巻: 5 号: 3-4 ページ: 88-98

    • DOI

      10.18632/oncoscience.411

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K07221, KAKENHI-PROJECT-16H02898, KAKENHI-PROJECT-16H06276
  • [雑誌論文] SIPMA: A Systematic Identification of Protein-Protein Interactions in Zea mays Using Autocorrelation Features in a Machine-Learning Framework2018

    • 著者名/発表者名
      Khatun Mst. Shamima、Hasan Md. Mehedi、Mollah Md. Nurul Haque、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Proceedings of IEEE 18th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering

      巻: 1 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1109/bibe.2018.00030

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009, KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Computational identification of protein S-sulfenylation sites by incorporating the multiple sequence features information2017

    • 著者名/発表者名
      Md. Mehedi Hasan, Guo Dianjing, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Mol Biosys

      巻: 13 号: 12 ページ: 2545-2550

    • DOI

      10.1039/c7mb00491e

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K20009
  • [雑誌論文] Modeling and simulation of the redox regulation of the metabolism in Escherichia coli at different oxygen concentrations2017

    • 著者名/発表者名
      Matsuoka Yu、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      Biotechnol Biofules

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1186/s13068-017-0867-0

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Mathematical comparison of memory functions between mutual activation and repression networks in a stochastic environment2017

    • 著者名/発表者名
      Hasan A.B.M. Shamim Ul、Kurata Hiroyuki
    • 雑誌名

      J Theor Biol

      巻: 427 ページ: 28-40

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2017.05.036

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] S-system-based Analysis of the Robust Properties Common to Many Biochemical Network Models2016

    • 著者名/発表者名
      Yu Matsuoka, Nusrat Jahan, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioprocess Biosyst Eng

      巻: 39 号: 5 ページ: 735-746

    • DOI

      10.1007/s00449-016-1554-4

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107, KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Web application for Genetic Modification Flux with database to estimate metabolic fluxes of genetic mutants2016

    • 著者名/発表者名
      Noorlin Mohd Ali, Ryo Tsuboi, Yuta Matsumoto, Daisuke Koishi, Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, and Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 印刷中 号: 1 ページ: 111-116

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2015.12.001

    • NAID

      40020886002

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26870432, KAKENHI-PROJECT-25280107, KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [雑誌論文] Metabolic analysis of antibody producing CHO cell culture under different stresses conditions2016

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Hiroyuki Kurata, Masayoshi Onitsuka, Takushi Oga, Takeshi Omasa
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: - 号: 1 ページ: 117-124

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2015.12.013

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Development of an accurate kinetic model for the central carbon metabolism of Escherichia coli.2016

    • 著者名/発表者名
      Nusrat Jahan, Kazuhiro Maeda, Yu Matsuoka, Yurie Sugimoto, Hiroyuki Kurata.
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factories

      巻: 15 号: 1 ページ: 112-112

    • DOI

      10.1186/s12934-016-0511-x

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898, KAKENHI-PROJECT-26870432
  • [雑誌論文] Dynamic Modeling of Metabolic and Gene Regulatory Systems toward Developing Virtual Microbes2014

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Kazuhiro Maeda, Yu Matsuoka
    • 雑誌名

      JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING OF JAPAN

      巻: 47 号: 1 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1252/jcej.13we152

    • NAID

      130003361309

    • ISSN
      0021-9592, 1881-1299
    • 言語
      英語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24800050, KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] CADLIVE toolbox for MATLAB: automatic dynamic modeling of biochemical networks with comprehensive system analysis2014

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Takaaki Miyabe, Yu Matsuoka, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioprocess and Biosystems Engineering

      巻: Epub 号: 9 ページ: 19251927-19251927

    • DOI

      10.1007/s00449-014-1167-8

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24800050, KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Analytical study of robustness of a negative feedback oscillator by multiparameter sensitivity2014

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      BMC Syst. Biol.

      巻: 8 号: S5 ページ: 112-112

    • DOI

      10.1186/1752-0509-8-s5-s1

    • NAID

      120005698506

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107, KAKENHI-PUBLICLY-26119716
  • [雑誌論文] Complementary elementary modes for fast and efficient analysis of metabolic networks2014

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Ryo Tsuboi, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Biochem Eng J.

      巻: 90 ページ: 121130-121130

    • DOI

      10.1016/j.bej.2014.05.022

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] S-systemを用いた代謝反応モデルの感度解析2014

    • 著者名/発表者名
      松岡結, Nusrat Jahan, 倉田博之
    • 雑誌名

      IPSJ SIG technical reports

      巻: BIO-37(1) ページ: 1-2

    • NAID

      110009675848

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Fluxmodule decomposition fbr parameterestimation in a multiple-fbedback loopmodel of biochemical networks2013

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Keisuke Ybshida,Keisuke Ybshida, Hirovuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioprocess Biosyst. Eng

      巻: 36 ページ: 333-344

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Database for predicting a metabolic flux distribution within a cell2013

    • 著者名/発表者名
      Noorlin MohdAli , Kentaro Inoue , Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      IPSJ SIG technical reports

      巻: BIO-35(6) ページ: 1-2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Effect of cra gene mutation on the metabolism of Escherichia coli for a mixture of multiple carbon sources2013

    • 著者名/発表者名
      Ruilian Yao, Hiroyuki Kurata, Kazuyuki Shimizu
    • 雑誌名

      Advances in Bioscience and Biotechnology

      巻: 4 号: 03 ページ: 477-486

    • DOI

      10.4236/abb.2013.43a063

    • NAID

      120005698503

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Flux module decomposition for parameter estimation in a multiple-feedback loop model of biochemical networks2013

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Keisuke Yoshida, Keisuke Yoshida, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioprocess Biosyst. Eng.

      巻: 36

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] BioFNet: Biological functional network database for analysis and synthesis of biological systems2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Kazuhiro Maeda, Toshikazu Onaka, Takenori Takata
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: Epub 号: 5 ページ: 699-709

    • DOI

      10.1093/bib/bbt048

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24800050, KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] 大腸菌アンモニア同化制御機構のダイナミックモデルの構築2013

    • 著者名/発表者名
      前田和勲, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, 倉田博之
    • 雑誌名

      IPSJ SIG technical reports

      巻: BIO-35(7) ページ: 1-6

    • NAID

      110009605329

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Complementary elementary mode analysis for large-scale metabolic networks,2013

    • 著者名/発表者名
      Md. BahadurBadsha , Ryo Tsuboi , Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      IPSJ SIG technical reports

      巻: BIO-35(5) ページ: 1-2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [雑誌論文] Application of Approximate PatternMatching in Two Dimensional Spaces toGrid Layout fbr Biochemical NetworkMaps2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Shinichi Shimozono,Hideaki Ybshida, .Hirovuki Kurata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Biological design principles of complex feedback modules in the E.coli ammonia assimilation system2012

    • 著者名/発表者名
      Koichi Masaki, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Artificial Life

      巻: 18 ページ: 19-603

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [雑誌論文] Application of Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Spaces to Grid Layout for Biochemical Network Maps2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Shinichi Shimozono, Hideaki Yoshida, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7

    • NAID

      120005698507

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [雑誌論文] CADLIVE Optimizer: Web-based Parameter Estimation for Dynamic Models2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Yuki Kato, Shinpei Tonami, Shogo Takagi, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Source Code for Biology and Medicine

      巻: 7 ページ: 9-9

    • NAID

      120005698504

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Web-based Parameter Estimation fbrDynamic Models2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, YukiKato, Shinpei Tonami, Shogo Takagi,Hirovuki Kurata, CADLIVE Optimizer
    • 雑誌名

      Source Code fbr Biologyand Medicine

      巻: 7 ページ: 9-9

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] A Symmetric Dual Feedback System Provides a Robust and Entrainable Oscillator.2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7

    • NAID

      120005698510

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Application of Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Spaces to Grid Layout for Biochemical Network Maps2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Shinichi Shimozono, Hideaki Yoshida, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7

    • NAID

      120005698507

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] A Symmetric Dual Feedback System Provides a Robust and Entrainable Oscillator2012

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7:

    • NAID

      120005698510

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Biological design principles of complex feedback modules in the E. coli ammonia assimilation system2012

    • 著者名/発表者名
      Koichi Masaki, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Artificial Life

      巻: 18 ページ: 53-90

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [雑誌論文] Biological design principles of complex feedback modules in the E. coli ammonia assimilation system2012

    • 著者名/発表者名
      Koichi Masaki, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Artificial Life

      巻: 18 ページ: 53-90

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Biological design principles of complex feedback Modules in the E.coli ammonia assimilation system2012

    • 著者名/発表者名
      Koichi Masaki, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Artificial Life

      巻: 18 ページ: 53-90

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] An integrative and practical evolutionary optimization for a complex, dynamic model of biological networks2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Yuya Fukano, Shunsuke Yamamichi, Daichi Nitta, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioproc Biosys Eng

      巻: 34 号: 4 ページ: 433-446

    • DOI

      10.1007/s00449-010-0486-7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [雑誌論文] CADLIVE Converter for constructing a biochemical network map2011

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Sayaka Tomeda, Shinpei Tonami, Yuki Shimokawa, Masayo Ono, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Biochem Eng J

      巻: 54 ページ: 200-206

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Quasi-multiparametersensitivity measure for robustness analysis of complex biochemical networks2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      J Theor Biol

      巻: 272 ページ: 174-186

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] An integrative and practical evolutionary optimization for a complex, dynamic model of biological networks.2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Yuya Fukano, Shunsuke Yamamichi, Daichi Nitta, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioproc Biosys Eng

      巻: 34 ページ: 433-446

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Quasi-multiparameter sensitivity measure for robustness analysis of complex biochemical networks2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      J Theor Biol

      巻: 272 ページ: 174-186

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Use of maximum entropy principle with Lagrange multipliers extends the feasibility of elementary mode analysis.2010

    • 著者名/発表者名
      Quanyu Zhao, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng

      巻: 110 ページ: 254-261

    • NAID

      110007700578

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Diffusion Model Based Spectral Clustering For Protein-Protein Interaction Networks2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Weijiang Li, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 5

    • NAID

      120005698511

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Use of maximum entropy principle with Lagrange multipliers extends the feasibility of elementary mode analysis2010

    • 著者名/発表者名
      Quanyu Zhao, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng

      巻: 110 ページ: 254-261

    • NAID

      110007700578

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] Diffusion Model Based Spectral Clustering For Protein-Protein Interaction Networks2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Weijiang Li and Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 5

    • NAID

      120005698511

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [雑誌論文] A gradual update method for simulating the steady-state solution of stiff differential equations in metabolic circuits2009

    • 著者名/発表者名
      Emi Shiraishi Kazuhiro Maed a Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioprocess Biosyst. Eng. 32

      ページ: 283-288

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Two-phase search (TPS) method : Nonbiased and high-speed parameter search for dynamic models of biochemical networks2009

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Bioinformatics 2

      ページ: 1-13

    • NAID

      110007990334

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016021
  • [雑誌論文] A gradual update method for simulating the steady-state solution of stiff differential equations in metabolic circuits2009

    • 著者名/発表者名
      Emi Shiraishi Kazuhiro Maeda Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioprocess Biosyst. Eng 32

      ページ: 283-288

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Genetic modification of flux for flux prediction of mutants2009

    • 著者名/発表者名
      Quauyu Zhao, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioinformatics 37

      ページ: 1702-1708

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016021
  • [雑誌論文] Maximum entropy decomposition of flux distribution at steady state to elementary modes2009

    • 著者名/発表者名
      Quanyu Zhao, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng 107

      ページ: 84-89

    • NAID

      110007042031

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016021
  • [雑誌論文] Visualizing Global Properties of Large Complex Networks2008

    • 著者名/発表者名
      Li W., Kurata H.
    • 雑誌名

      PLoS ONE 3

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Computer-aided rational design of the phosphotransferase system for enhanced glucose uptake in Escherichia coli2008

    • 著者名/発表者名
      Yousuke Nishio, Yoshihiro Usuda, Kazuhiko Matsui, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology 4

      ページ: 160-160

    • NAID

      120006366982

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Computer-aided rational design of the phosphotransferase system for enhanced glucose uptake in Escherichia coli2008

    • 著者名/発表者名
      Yousuke Nishio, Yoshihiro U suda, Kazuhiko Matsui, Hiro yuki Kurata
    • 雑誌名

      Molecular Systems Biology 4

      ページ: 140-150

    • NAID

      120006366982

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Mathematical identification of critical reactions in the interlocked feedback model2007

    • 著者名/発表者名
      H. Kurata, T. Tanaka, F. Ohnishi
    • 雑誌名

      PLoS One 2

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] A simple model of positive feedback of the nitrogen assimilation system in E. coli2007

    • 著者名/発表者名
      Kouichi Masaki, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      IPSJ Transactions on Mathematical Modeling and Its Applications 48

      ページ: 104-109

    • NAID

      110006242974

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Extended CADLIVE: a novel graphical notation for designing a biochemical network map that enables computational pathway analysis2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Koichi Masaki, Yuki Shimokawa, Quanyu Zhao
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 35

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Extended CADLIVE : a novel graphical notation for designing a biochemical network map that enables computational pathway analysis2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Koichi Masaki, Yuki Shimokawa, Quanyu Zhao
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 35

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Mathematical identification of critical reactions in the interlocked feedback model2007

    • 著者名/発表者名
      H.Kurata, T.Tanaka, F.Ohnishi
    • 雑誌名

      PLoS One 2

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] システムバイオロジーの現状と未来2006

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 雑誌名

      生物物理 (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Module-Based Analysis of Robustness Tradeoffs in the Heat Shock Response System2006

    • 著者名/発表者名
      H.Kurata, H.El Samad, R.Iwasaki, H.Othake, J.C.Doyle, I.Grigorova, C.Gross, M.Khammash
    • 雑誌名

      PLoS Computational Biology 2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] 大腸菌窒素同化システムのポジティブフィードバック制御シンプルモデル2006

    • 著者名/発表者名
      真崎浩一, 倉田博之
    • 雑誌名

      数理モデル化と問題解決研究報告 MPS-59

      ページ: 61-64

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Module-Based Analysis of Robustness Tradeoffs in the Heat Shock Response System2006

    • 著者名/発表者名
      H. Kurata, H. El Samad, R. Iwasaki, H. Othake, J.C. Doyle, I. Grigorova, C. Gross, and M. Khammash
    • 雑誌名

      PLoS Computational Biology 2

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] The present status and future of systems biology2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Seibutsubutsuri (in press)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Effective and fast optimization for a dynamic model of the Drosophila circadian oscillator2006

    • 著者名/発表者名
      Shin Tanaka, Hiroyuki Kurata, akeshi Ohashi
    • 雑誌名

      IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics

      ページ: 3596-3601

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Sensitivity analysis for the E. coli nitrogen assimilation system2006

    • 著者名/発表者名
      Koichi Masaki, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      The 16th International Conference on Genome Informatics 16

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] Effective and fast optimization for a dynamic model of the Drosophila circadian oscillator2006

    • 著者名/発表者名
      Shin Tanaka, Hiroyuki Kurata, Takeshi Ohashi
    • 雑誌名

      IEEE International Conference on Systems, Man, and Cybernetics(Taipei, Taiwan)

      ページ: 3596-3601

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [雑誌論文] CADLIVE : Computer-Aided Design of Living Systems2005

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Marie Kajiwara, Yuki Shimokawa
    • 雑誌名

      The 16th International Conference on Genome Informatics 16(CD-ROM)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] A Grid Layout Algorithm for Automatic Drawing of Biochemical Networks2005

    • 著者名/発表者名
      Weijiang Li, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      Bioinformatics (in press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014220
  • [雑誌論文] CADLIVE Dynamic Simulator : Direct Link of Biochemical Networks to Dynamic Models2005

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Kouichi Masaki, Yoshiyuki Sumida, Rei Iwasaki
    • 雑誌名

      Genome Res (in press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014220
  • [雑誌論文] A large-scale dynamic simulation of the cell cycle network2005

    • 著者名/発表者名
      Yamamichi, S., Kurata, H.
    • 雑誌名

      Proceedings of 7th Asia-Pacific Biochemical Engineering Conference 7,SY2-05(CD-ROM)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Surviving heat shock : Control strategy for robustness and performance2005

    • 著者名/発表者名
      H.El-Samad^*, H.Kurata^*, J.C.Doyle, C.A.Gross, M.Khammash
    • 雑誌名

      Proc Nail Acad Sci U S A 102

      ページ: 2736-2741

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014220
  • [雑誌論文] A large-scale dynamic simulation of the cell cycle network2005

    • 著者名/発表者名
      Yamamichi, S., Kurata, H
    • 雑誌名

      Proceedings of 7th Asia-Pacific Biochemical Engineering Conference 7(CD-ROM)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Interlocked Feedback is not the Best Choice for PER Oscillators2005

    • 著者名/発表者名
      Fumitaka Ohnishi, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      The 16th International Conference on Genome Informatics 16(CD-ROM)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Decomposition and Integration of Functional Modules Optimizes a Dynamic Model of Large-Scale Biochemical Networks2004

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Yoshida, Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      ISPJ Symposium Series 12

      ページ: 97-102

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Statistical And Integrative Approach For Constructing Biological Network Maps2004

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Natsumi Shimizu, Kanako Misumi
    • 雑誌名

      Genome Informatics 15

      ページ: 161-170

    • NAID

      130003997360

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014220
  • [雑誌論文] Computer-Aided Design of Metabolic and Gene Regulatory Networks2004

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      The 10th APCChE Congress (CD-ROM)

    • NAID

      130005052462

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] Computer-Aided Design of Metabolic and Gene Regulatory Networks2004

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 雑誌名

      The 10th APCChE Congress 2L-06(CD-ROM)

    • NAID

      130005052462

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [雑誌論文] モジュール分割統合法による大規模生命分子ネットワークの最適化2004

    • 著者名/発表者名
      吉田圭介, 倉田博之
    • 雑誌名

      数理モデル化と問題解決シンポジウム論文集

      ページ: 97-102

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15500198
  • [学会発表] ヒト全身代謝のコンピューターモデル開発と糖尿病治療への応用2021

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      The future of diabetes 2021 online conference
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [学会発表] ヒト全身代謝のコンピュータモデルの開発2020

    • 著者名/発表者名
      倉田博之,那須 拡生,吉森 瑠菜
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04208
  • [学会発表] 代謝均等分解サイクルのReLU応答の解析2019

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第84回年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] 嫌気好気条件下での回分培養大腸菌の代謝動力学モデル2018

    • 著者名/発表者名
      松岡結, 倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第83回年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] 細胞の全代謝動力学モデルの開発2018

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      電子情報通信学会2018年総合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] 酵素濃度や複数炭素源が代謝に及ぼす影響を考慮した大腸菌の中心代謝モデルの開発2018

    • 著者名/発表者名
      松岡結,倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第50回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] Virtual cell metabolism for systems and synthetic biology2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      International Conference on Bioinformatics and Biostatistics for Agriculture, Health and Environment
    • 発表場所
      Rajshahi (Bangladesh)
    • 年月日
      2017-01-20
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] 細胞工場のコンピュータ支援設計2017

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] スマートセルインダストリーを指向した中心代謝系の定量的モデル2017

    • 著者名/発表者名
      松岡結, 倉田博之
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] A Large-Scale Dynamic Model of Central Carbon Metabolism for Rational Design of Cell Factories.2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      5th International Conference on Biological and Medical Sciences
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] バーチャルメタボリズムの開発と医療への応用2016

    • 著者名/発表者名
      倉田 博之
    • 学会等名
      化学工学会第48回秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学 徳島大学
    • 年月日
      2016-09-06
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02898
  • [学会発表] 増永拓之、倉田博之、動的感度を用いたErbBシグナル伝達ネットワークのロバストネス解析2016

    • 著者名/発表者名
      増永拓之、倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第81回年会
    • 発表場所
      関西大学
    • 年月日
      2016-03-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] 情報工学を基盤としたバイオメディカルインフォマティクスおよびコンピュータ支援による診断予防治療介護医薬品開発システム2015

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      第2回シンポジウムYUBECS2 「次世代治療・診断技術の開発のための医工学」
    • 発表場所
      東京田町
    • 年月日
      2015-03-10
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Dynamic modeling of the E. coli ammonium assimilation network2015

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Fred Boogerd, Hans Westerhoff, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of GIW/InCoB
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-09-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] For mutual repression: Noise induced bimodality, even multimodality in deterministically monostable description without cooperative binding2015

    • 著者名/発表者名
      A.B.M. Shamim Ul Hasan, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of GIW/InCoB, Odaiba
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-09-09
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Dynamic sensitivity analysis of ErbB signaling network2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Masunaga, Ryunosuke Itasaki, Kentaro Inoue, Mariko Okada, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of GIW/InCoB
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-09-09
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Developing a kinetic model of the E. coli ammonium assimilation network2015

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of the 16th International Conference on Systems Biology
    • 発表場所
      Singapore
    • 年月日
      2015-11-23
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Metabolome analysis of CHO cell culture under different stresses2015

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Hiroyuki Kurata, Masayuki Onitsuka, Takushi Oga, Takeshi Omasa
    • 学会等名
      Proceedings of GIW/InCoB
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-09-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Effect of NaCl and Trehalose Condition on Antibody Producing CHO Cell Culture.2015

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Hiroyuki Kurata, Masayoshi Onitsuka, Takushi Oga, Takeshi Omasa
    • 学会等名
      Proceedings of Asian Congress on Biotechnology 2015 (ACB2015)
    • 発表場所
      Kuala Lumpur, Malaysia
    • 年月日
      2015-11-15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Construction of a dynamic model for the central metabolism of Escherichia coli2015

    • 著者名/発表者名
      Nusrat Jahan, Kazuhiro Maeda, Yu Matsuoka, Yurie Sugimoto, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of GIW/InCoB
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2015-09-09
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] A detailed kinetic model of E. coli central metabolism in a batch culture2015

    • 著者名/発表者名
      Nusrat Jahan, Kazuhiro Maeda, Yu Matsuoka, Yurie Sugimoto, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of Asian Congress on Biotechnology 2015 (ACB2015)
    • 発表場所
      Kuala Lumpur, Malaysia
    • 年月日
      2015-11-15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] For mutual repression: Noise induced bimodality, even multimodality in deterministically monostable description without cooperative binding2015

    • 著者名/発表者名
      A.B.M. Shamim Ul Hasan, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of GIW/InCoB
    • 発表場所
      Odaiba, Tokyo
    • 年月日
      2015-09-09
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26119716
  • [学会発表] 抗体生産強化のためのCHO細胞メタボロームの統計解析2015

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第47回秋季大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2015-09-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] 代謝とシステムバイオロジー2014

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • 年月日
      2014-10-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] 生物学的基本ネットワークの組み立てによるダイナミックモデルの合理的設計2014

    • 著者名/発表者名
      倉田博之,前田和勲
    • 学会等名
      化学工学会第79年会
    • 発表場所
      岐阜大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] 設計原理に基づく生物システムの合理的合成2014

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      平成26年度JSBi生命システム理論研究会
    • 発表場所
      京都大学iPS細胞研究所
    • 年月日
      2014-11-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] 設計原理に基づく生物システムの合理的合成2014

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      平成26年度JSBi生命システム理論研究会
    • 発表場所
      京都大学iPS細胞研究所
    • 年月日
      2014-11-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26119716
  • [学会発表] ゲノムスケールヒト代謝ネットワークの高速エレメンタリモード解析2013

    • 著者名/発表者名
      倉田博之、Badsha Md. Bahadur, 坪井遼
    • 学会等名
      化学工学会第45回秋季大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Computational framework for integration of metabolic flux analysis with its associated omics data2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Soma Tabata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Proceedings of the 8th Asia-Pacific Conference on Algal Biotechnology and 1st International Conference on Coastal Biotechnology
    • 発表場所
      Adelaide, Australia
    • 年月日
      2012-07-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Efficient Grid Graph Layout by Approximate Point-set Matching on the Plane2012

    • 著者名/発表者名
      Shinichi Shimozono, Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      IPSJ SIG Technical Report, 2012-BIO-30
    • 発表場所
      Iizuka(Oralpresentation)
    • 年月日
      2012-08-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Computational framework for integration of metabolic flux analysis with its associated omics data2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Soma Tabata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Proceedings of the 14th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012)
    • 発表場所
      Deagu, Korea
    • 年月日
      2012-09-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Computational framework for integration of metabolic flux analysis with its associated omics data.2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Soma Tabata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Proceedings of the14th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012)
    • 発表場所
      Deagu, Korea
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] アンモニア同化システムのダイナミックモデルの開発2012

    • 著者名/発表者名
      前田和勲, 倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第77年会
    • 発表場所
      工学院大学,東京
    • 年月日
      2012-03-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Metabolic Engineering for Systematic Organization and Analysis of Complex Metabolic Networks2012

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Nusrat Jahan, Md. Nurul Haque Mollah, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of the International Conference on Statistical Data Mining for Bioinformatics Health Agriculture and Environment
    • 発表場所
      University of Rajshahi, Bangladesh
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Computational framework for integration of metabolic flux analysis with its associated omics data.2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Soma Tabata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Proceedings of the 8th Asia-Pacific Conference on Algal Biotechnology and 1st International Conference on Coastal Biotechnology
    • 発表場所
      Adelaide, Australia
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] 大腸菌アンモニア同化システムのダイナミックモデルの構築2012

    • 著者名/発表者名
      前田和勲,倉田博之
    • 学会等名
      情報処理学会研究報告,2012-BIO-30
    • 発表場所
      飯塚(Oralpresentation)
    • 年月日
      2012-08-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] The effect of implementing objective functions in analyzing the changes of enzyme activity profiles2012

    • 著者名/発表者名
      Noorlin Mohd Ali, Kentaro Inoue, Soma Tabata, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      IPSJ SIG Technical Report, 2012-BIO-30
    • 発表場所
      Iizuka(Oralpresentation)
    • 年月日
      2012-08-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Computational framework for integration of metabolic flux analysis with its associated omics data.2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Soma Tabata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Proceedings of the14th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012)
    • 発表場所
      Deagu, Korea
    • 年月日
      2012-09-18
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [学会発表] Sequential Extraction of Several Gene-sets with Proper Groups of Individuals for Gene Expression Data Analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Nusrat Jahan, Md. Nurul Haque Mollah, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of the International Conference on StatisticalData Mining for Bioinformatics Health Agriculture and Environment
    • 発表場所
      University of Rajshahi, Bangladesh
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Computational framework for integration of metabolic flux analysis with its associated omics data.2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Soma Tabata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Proceedings of the 8th Asia-Pacific Conference on Algal Biotechnology and 1st International Conference on Coastal Biotechnology
    • 発表場所
      Adelaide, Australia
    • 年月日
      2012-07-09
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [学会発表] Sequential Extraction of Several Gene-sets with Proper Groups of Individuals for Gene Expression Data Analysis2012

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Nusrat Jahan, Md. Nurul Haque Mollah, Hiroyuki Kurata, , University of Rajshahi, Bangladesh, 22-24 December 2012.
    • 学会等名
      Proceedings of the International Conference on Statistical Data Mining for Bioinformatics Health Agriculture and Environment
    • 発表場所
      Bangladesh
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Metabolic Engineering for Systematic Organization and Analysis of Complex Metabolic Networks,2012

    • 著者名/発表者名
      Md. Bahadur Badsha, Nusrat Jahan, Md. Nurul Haque Mollah, Hiroyuki Kurata,
    • 学会等名
      Proceedings of the International Conference on Statistical Data Mining for Bioinformatics Health Agriculture and Environment
    • 発表場所
      Bangladesh
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Maximum entropy principle optimizes the large-scale elementary modes for a broad raqgne of genetic mutants2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      Asian Congress on Biotechnology
    • 発表場所
      Shanghai
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] オミックスデータを代謝システムへ統合するためのパスウエイ解析モデル2011

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      2011年度統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      九州大学伊都キャンパス
    • 年月日
      2011-09-06
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-23134506
  • [学会発表] Robustness Analysis of Feedback Systems of Circadian Rhythm2011

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      IPSJ SIG Technical Report, 2011-BIO-24
    • 発表場所
      Kyoto(Oral presentation)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Hybrid Layout Algorithm using Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Space for BiochemicalNetwork Layout2011

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Shinichi Shimozono, Hideaki Yoshida and Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      IPSJ SIG Technical Report, 2011-BIO-24
    • 発表場所
      Kyoto(Oral presentation)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] An optimization aiming for diverse parameter sets of a large-scale and dynamic model of biochemical networks.2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Minamida, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
    • 発表場所
      Tokyo
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] 多様な遺伝子組換え微生物における代謝流束分布の新規な予測法2010

    • 著者名/発表者名
      倉田博之, 田畑総真
    • 学会等名
      化学工学会第41回秋季大会
    • 発表場所
      同志社大学
    • 年月日
      2010-09-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] CADLIVE: Data Integrator with Network Layout Module2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Shin Shimozono, Hideaki Yoshida, Sayaka Tomeda, Kazuya Fukami, Shinpei Tonami, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 11-th international Conference on Systems biology
    • 発表場所
      Edinburgh
    • 年月日
      2010-10-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Quasi-Multiparameter Sensitivity Analysis reveals Remarkable Robustness of Dual Feedback Circadian Oscillators.2010

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 11-th international Conference on Systems biology
    • 発表場所
      Edinburgh
    • 年月日
      2010-10-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] Development of elementary mode-based algorithms for designing a metabolic system.2010

    • 著者名/発表者名
      Souma Tabata, Quanyu Zhao, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
    • 発表場所
      Tokyo
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] A Novel Spectral Clustering of Protein Interaction Networks.2010

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
    • 発表場所
      Tokyo(InCoB2010 Best Poster Award)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] An integrative and practical strategy for optimizing a large-scale dynamic model of biochemical systems2010

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Yuya Fukano, Daichi Nitta, Shunsuke Yamamichi, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 9-th International Conference on Bioinformatics (InCoB2010)
    • 発表場所
      Tokyo(Oral presentation)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22300101
  • [学会発表] 生物学と工学の統合にむけて2009

    • 著者名/発表者名
      倉田博之, Quanyu Zhao
    • 学会等名
      化学工学会第41回秋季大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2009-09-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016021
  • [学会発表] Extended CADLIVE : Computer-aided rational design of living systems(S02-1-2)2008

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Inoue, Tetsuya Shimabara, Toshikazu Onaka, Erika Fujiura, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The proceedings of the 2th annual conference of the Japanese Society for Bioinformatics
    • 発表場所
      Osaka
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] Computer-aided rational design of the phosphotransferase system for enhanced glucose uptake in Escherichia coli(Oral Presentation)2008

    • 著者名/発表者名
      Yousuke Nishio, Yoshihiro Usuda, Kazuhiko Matsui, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Supplement of Journal of Biotechnology : 13 th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2008)
    • 発表場所
      Dailen, China
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] Prediction of flux distribution of mutants by enzyme control fluxes with maximum entropy principal(Oral Presentation)2008

    • 著者名/発表者名
      Quanyu Zhao, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Supplement of Journal of Biotechnology : 13 th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2008)
    • 発表場所
      Dailen, China
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] Searching multiple sets of kinetic parameters values reproducing target experimental data in dynamic biochemical models2008

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The proceedings of the 2008th annual conference of the Japanese Society for Bioinfor matics
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2008-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016021
  • [学会発表] Searching multiple sets of kinetic parameters values reproducing target experimental data in dynamic biochemical models(S063-1-2)2008

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The proceedings of the 2008th annual conference of the Japanese Society for Bioinformatics
    • 発表場所
      Osaka
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] CADLIVE : Computer aided design of biochemical systems(Oral Presentation)2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Supplement of Journal of Biotechnology : 13 th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2008)
    • 発表場所
      Dailen, China
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] CADLIVE : Computer aided design of biochemical systems. Supp lement of Journal of Biotechnology2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      13 th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2008)
    • 発表場所
      Dailen, China
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] CADLIVE for Construction and Dynamic Simulation of Biochemical Networks2007

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Proceedings of Asia Pacific Biochemical Engineering Conference
    • 発表場所
      Taipei
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] Sensitivity analysis for the E. coli nitrogen assimilation system(16 : P010-1-2)2006

    • 著者名/発表者名
      Koichi Masaki, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      The 16th International Conference on Genome Informatics
    • 発表場所
      Yokohama
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] 大腸菌窒素同化システムのポジティブフィードバック制御シンプルモデル2006

    • 著者名/発表者名
      真崎浩一, 倉田博之
    • 学会等名
      数理モデル化と問題解決研究報告
    • 発表場所
      名古屋大学(MPS-59 : 61-64)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18300098
  • [学会発表] Synthesis and decomposition approach for rational design of a biochemical network

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Third BMIRC International Symposium for Virtual Physiological Human
    • 発表場所
      Fukuoka
    • 年月日
      2015-03-05 – 2015-03-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] A Study of Genetic Noise in Biochemical Network

    • 著者名/発表者名
      A.B.M. Shamim Ul Hasan, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      GIW / ISCB-Asia 2014
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2014-12-15 – 2014-12-17
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26119716
  • [学会発表] 生物システムの合理的設計を支援するBioFNetデータベース

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      化学工学会第46回秋季大会
    • 発表場所
      九州大学
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Toward a quantitative in silico model for the E. coli ammonium assimilation system

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Fred C. Boogerd, Frank J. Bruggeman, Hans V. Westerhoff, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      Third BMIRC International Symposium for Virtual Physiological Human
    • 発表場所
      Fukuoka
    • 年月日
      2015-03-05 – 2015-03-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] アンモニア同化システムの詳細なダイナミックモデル

    • 著者名/発表者名
      倉田博之
    • 学会等名
      化学工学第80回年会
    • 発表場所
      芝浦工業大学
    • 年月日
      2015-03-19 – 2015-03-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • [学会発表] Stochastic Simulation of Dynamical Behavior in Gene Regulatory Network

    • 著者名/発表者名
      A.B.M. Shamim Ul Hasan, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      the Third BMIRC International Symposium for Virtual Physiological Human
    • 発表場所
      Fukuoka
    • 年月日
      2015-03-05 – 2015-03-06
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26119716
  • [学会発表] Analytical study of robustness of a negative feedback oscillator by multiparameter sensitivity

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata
    • 学会等名
      GIW/ISCB-Asia 2014
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2014-12-15 – 2014-12-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25280107
  • 1.  清水 和幸 (00150318)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 2.  川崎 広明 (60332623)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  森 浩禎 (90182203)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  多比良 和誠 (10261778)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  岩井 成憲 (10168544)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  宮岸 真 (30323538)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  宮本 茂昭 (40219811)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  中川 裕之 (80274562)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 6件
  • 9.  古崎 新太郎 (40011209)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  坂井 宏旭 (10707037)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 11.  酒井 康行
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  HASAN MD MEHEDI
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 9件
  • 13.  前田 和勲
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 6件
  • 14.  河原 康一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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