神沼英里 Kaminuma Eli

… 別表記

山本英里ヤマモトエリ

研究者番号	90314559
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 名古屋市立大学, 大学院芸術工学研究科, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2025年度: 名古屋市立大学, 大学院芸術工学研究科, 准教授 2012年度 – 2014年度: 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 助教 2008年度: 独立行政法人理化学研究所, 生命情報基盤研究部門, 研究員 2007年度: 理化学研究所, オミックス情報統合化研究チーム, 研究員 2005年度 – 2006年度: 独立行政法人理化学研究所, ゲノム変異機能情報研究チーム, 研究員 … もっと見る 2004年度: 独立行政法人理化学研究所, ゲノム知識ベース研究開発チーム, 研究員 2001年度: 和歌山大, システム工学部, 助手 2000年度: 和歌山大学, システム工学部, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者生体生命情報学 / 小区分90010:デザイン学関連 / 計算機科学研究代表者以外合同審査対象区分:小区分03060:文化財科学関連、小区分03070:博物館学関連 / 小区分03070:博物館学関連 / 小区分03060:文化財科学関連 / ゲノム生物学
キーワード	研究代表者トライコーム / μX線CT / 3次元形状計測 / シロイヌナズナ / デザイン / 道路網 / 街路樹 / 深層学習 / デジタルツイン / ゲノム多様性 … もっと見る / 遺伝的多様性 / DNA多型 / WGS / 一塩基多型 / 解析ワークフロー / データベース / 多様性指標 / Sequence Read Archive / 次世代シークエンサ / SNP / 変異体スクリーニング / 形態形質 / in silico / bioluminescence / Luciferase reporter / digital in situ hybridization / time-lapse images / 標準形状モデル / スクリーニング / 変異体 / バイオインフォマティクス / 葉片 / 葉面特異的分化器官 / 形質 / 個人性 / 形状 / 発話 / 構音 / 顔 / CG … もっと見る研究代表者以外機械学習・深層学習 / モニタリング / 構造安全性 / 組積造 / 文化財 / denovo アセンブル / クラウドコンピューティング / de novoアセンブリ / SNP / リシーケンス / HLA / ChIP-Seq / RNA-Seq / クラウド / 解析パイプライン / 次世代シーケンサー / ゲノム隠す

人間と生成AIエージェントの協働によるものづくりDX機器人材育成の効率化の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  神沼英里
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分90010:デザイン学関連
- 研究機関
  名古屋市立大学
文化財組積造建造物の構造安全性に関するモニタリング技術
- 研究代表者
  
  青木孝義
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分03060:文化財科学関連
   小区分03070:博物館学関連
   合同審査対象区分:小区分03060:文化財科学関連、小区分03070:博物館学関連
- 研究機関
  名古屋市立大学
深層学習を用いた都市街路樹のデジタルツイン構築と道路網上配置デザイン研究代表者
- 研究代表者
  
  神沼英里
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分90010:デザイン学関連
- 研究機関
  名古屋市立大学
新型シーケンサ・アーカイブ配列を用いた植物系統ＳＮＰ統合と多様性指標解析研究代表者
- 研究代表者
  
  神沼英里
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
クラウド型高速シーケンシングアノテーションシステムの開発研究
- 研究代表者
  
  長崎英樹
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
変異体スクリーニングのためのシロイヌナズナ野生型3次元標準形状モデルの作成研究代表者
- 研究代表者
  
  神沼英里
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
シロイヌナズナの葉面特異的分化器官の3次元形状計測と形質定量化研究代表者
- 研究代表者
  
  神沼英里
- 研究期間 (年度)
  2004 – 2005
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
CG顔の構音に個人性を反映する身体形状パラメータの研究研究代表者
- 研究代表者
  
  山本英里
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2001
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  計算機科学
- 研究機関
  和歌山大学

すべて 2015 2014 2013 2012 2009 2008 2005 2004 その他

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 実験医学別冊　「次世代シークエンス解析スタンダード」2014
- 著者名/発表者名
  長崎英樹、望月孝子、谷沢靖洋、神沼英里、中村保一
- 総ページ数
  8
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24510273
[図書] 実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」:Ⅵ-4 DDBJ Read Annotation Pipeline 解析パイプラインによるRNA-Seq de novo assemblyとイネ多型解析2014
- 著者名/発表者名
  長崎英樹,望月孝子,谷沢靖洋,神沼英里,中村保一
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[雑誌論文] DDBJ read annotation pipeline: a cloud computing-based pipeline for high-throughput analysis of next-generation sequencing data.2013
- 著者名/発表者名
  Nagasaki H, Mochizuki T, Kodama Y, Saruhashi S, Morizaki S, Sugawara H, Ohyanagi H, Kurata N, Okubo K, Takagi T, Kaminuma E, Nakamura Y.
- 雑誌名
  
  DNA Res.
  
  巻: 20 ページ: 383-390
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24510273
[雑誌論文] Quantitative analysis of heterogeneous spatial distribution of Arabidopsis leaf trichomes using micro X-ray computed tomography2008
- 著者名/発表者名
  Kaminuma E, Yoshizumi T, Wada T, Matsui M, Toyoda T.
- 雑誌名
  
  The Plant Journal 56
  
  ページ: 470-482
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[雑誌論文] Three-dimensional definition of leaf morphological traits of Arabidopsis in silico phenotypic analysis2005
- 著者名/発表者名
  E.Kaminuma, et al.
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformaitcs and Computational Biology 3・2
  
  ページ: 401-414
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16700278
[雑誌論文] In silico phenotypic screening method of mutants based on statistical modeling of genetically mixed samples2005
- 著者名/発表者名
  E.Kaminuma, et al.
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformaitcs and Computational Biology 3.6
  
  ページ: 1281-1293
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16700278
[雑誌論文] Automatic quantification of morphological traits via three-dimensional measurement of Arabidopsis2004
- 著者名/発表者名
  E.Kaminuma, et al.
- 雑誌名
  
  The Plant Journal 38・2
  
  ページ: 358-365
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16700278
[雑誌論文] In silico phenotypic analysis of Arabidopsis based on shape model reconstruction from 3D images by microfocus X-ray computed tomography
- 著者名/発表者名
  E.Kaminuma, et al.
- 雑誌名
  
  (発表予定)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16700278
[学会発表] DNA Polymorphism Database from New-Generation Sequence Read Archive and Analytical Workflow2015
- 著者名/発表者名
  Mochizuki T, Tanizawa Y, Fujisawa T, Nikoh N, Toyoda A, Fujiyama A, Kurata N, Nagasaki H, Shimizu T, Kaminuma E, Nakamura Y
- 学会等名
  Plant & Animal Genome XXIII
- 発表場所
  San Diego (USA)
- 年月日
  2015-01-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[学会発表] Constructing an integrated DNA polymorphism database and an analytical workflow for plants and bacteria2014
- 著者名/発表者名
  Takako Mochizuki, Takatomo Fujisawa, Yasuhiro Tanizawa, Hideki Nagasaki, Eli Kaminuma, Tokurou Shimizu, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Nori Kurata, Naruo Nikoh and Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  Plant and Animal Genome XXII (PAG XXII) Conference
- 発表場所
  Town and Country Hotel, San Diego, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[学会発表] 遺伝研スパコン概要と、NGSアーカイブデータを用いたSNP解析2014
- 著者名/発表者名
  神沼英里、望月孝子、長崎英樹、谷沢靖洋、小笠原理、大久保公策、高木利久、中村保一
- 学会等名
  日本育種学会第126回講演会「NGS 使い倒し講座 - Breeding Informatics 研究 XIII」
- 発表場所
  南九州大学(都城市)
- 年月日
  2014-09-26
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[学会発表] Liverwort Genome Analysis using DDBJ Pipeline and Construction of the Genome Annotation Database2013
- 著者名/発表者名
  Hideki Nagasaki, Takatomo Fujisawa, Takako Mochizuki, Eli Kaminuma, Yasukazu Nakamura et al.
- 学会等名
  International Plant & Animal Genome XXI
- 発表場所
  San Diego, CA, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24510273
[学会発表] NGS由来ゲノムワイド多型マーカ構築とそのRDF注釈情報統合化2013
- 著者名/発表者名
  Eli Kaminuma, Takatomo Fujisawa, Takako Mochizuki, Yasuhiro Tanizawa, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Nori Kurata, Tokurou Shimizu, Yasukazu Nakamura
- 学会等名
  第36回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[学会発表] DNA多型統合データベースと解析ワークフローの構築 : 植物、微生物への取り組み2013
- 著者名/発表者名
  望月孝子, 藤澤貴智, 谷澤靖洋, 長崎英樹, 神沼英里, 大柳一, 清水徳朗, 豊田敦, 藤山秋佐夫, 倉田のり, 二河成男, 中村保一
- 学会等名
  第36回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[学会発表] 新型シークエンサのアーカイブ配列と解析パイプライン：系統間SNP解析を事例として2012
- 著者名/発表者名
  神沼英里
- 学会等名
  第122回日本育種学会講演会ワークショップ06 "育種のための情報解析ツール使い倒し塾"
- 発表場所
  京都産業大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500366
[学会発表] DDBJパイプラインによるゼニゴケゲノム解析とゲノムアノテーションデータベースの構築2012
- 著者名/発表者名
  長崎英樹, 藤澤貴智, 望月孝子, 神沼英里, 中村保一ら
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場・マリンメッセ福岡
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24510273
[学会発表] シロイヌナズナのオミックス総合データベース2009
- 著者名/発表者名
  豊田哲郎, 神沼英里
- 学会等名
  第50回日本植物生理学会年会シンポジウム
- 発表場所
  名古屋
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[学会発表] シロイヌナズナLucTagラインを用いた遺伝子発現定量解析2008
- 著者名/発表者名
  神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎
- 学会等名
  人工知能学会第36回分子生物情報研究会(SIG-MBI)
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[学会発表] シロイヌナズナLucTagラインを用いた遺伝子発現定量解析2008
- 著者名/発表者名
  神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 豊田哲郎, 松井南
- 学会等名
  人工知能学会第36回分子生物情報研究会(SIG-MBI)
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所中央研究棟2階
- 年月日
  2008-01-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[学会発表] 植物形状Template modelを用いたLucTagラインの時空間遺伝子発現定量解析2008
- 著者名/発表者名
  神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎
- 学会等名
  第72回日本植物学会大会シンポジウム「バイオイメージングと画像情報処理が拓くもの」
- 発表場所
  高知
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[学会発表] デジタルwhole mount in situ hybridizationに向けたシロイヌナズナLucTagラインの遺伝子発現時系列画像の定量化2008
- 著者名/発表者名
  神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 豊田哲郎, 松井南
- 学会等名
  植物生理学会第49回年会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター
- 年月日
  2008-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[学会発表] デジタルwhole mount in situ hybridizationに向けたシロイヌナズナLucTagラインの遺伝子発現時系列画像の定量化2008
- 著者名/発表者名
  神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎
- 学会等名
  第49回日本植物生理学会年会
- 発表場所
  札幌
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296
[学会発表] 植物形状Template Model を用いたLucTag Lineの時空間遺伝子発現定量解析2008
- 著者名/発表者名
  神沼英里, 吉積毅, 栗山朋子, 越智子, 武藤周, 松井南, 豊田哲郎,
- 学会等名
  植物学会第72回大会シンポジウム
- 発表場所
  高知大学
- 年月日
  2008-09-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18700296

1. 長崎英樹 (70624451)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 9件
2. 豊田哲郎 (20342818)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
3. 松井南 (80190396)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
4. 吉積毅 (80342872)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
5. 望月孝子 (40709284)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
6. 大野暁彦 (00758401)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 青木孝義 (10202467)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 張景耀 (50546736)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 木村俊明 (60816057)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

神沼 英里 Kaminuma Eli

山本 英里 ヤマモト エリ

研究課題

研究成果

共同研究者

人間と生成AIエージェントの協働によるものづくりDX機器人材育成の効率化の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

文化財組積造建造物の構造安全性に関するモニタリング技術

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

深層学習を用いた都市街路樹のデジタルツイン構築と道路網上配置デザイン研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

新型シーケンサ・アーカイブ配列を用いた植物系統ＳＮＰ統合と多様性指標解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

クラウド型高速シーケンシングアノテーションシステムの開発研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

変異体スクリーニングのためのシロイヌナズナ野生型3次元標準形状モデルの作成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

シロイヌナズナの葉面特異的分化器官の3次元形状計測と形質定量化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

CG顔の構音に個人性を反映する身体形状パラメータの研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] 実験医学別冊 「次世代シークエンス解析スタンダード」2014

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」:Ⅵ-4 DDBJ Read Annotation Pipeline 解析パイプラインによるRNA-Seq de novo assemblyとイネ多型解析2014

著者名/発表者名

出版者

データソース

[雑誌論文] DDBJ read annotation pipeline: a cloud computing-based pipeline for high-throughput analysis of next-generation sequencing data.2013

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Quantitative analysis of heterogeneous spatial distribution of Arabidopsis leaf trichomes using micro X-ray computed tomography2008

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Three-dimensional definition of leaf morphological traits of Arabidopsis in silico phenotypic analysis2005

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] In silico phenotypic screening method of mutants based on statistical modeling of genetically mixed samples2005

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Automatic quantification of morphological traits via three-dimensional measurement of Arabidopsis2004

著者名/発表者名

神沼英里 Kaminuma Eli

山本英里ヤマモトエリ

[図書] 実験医学別冊　「次世代シークエンス解析スタンダード」2014