川口一朋 Kawaguchi Kazutomo

研究者番号	90402429
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所属 (現在)	2025年度: 金沢大学, 数物科学系, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度: 金沢大学, 数物科学系, 准教授 2017年度: 金沢大学, 理工研究域数物科学系, 助教 2012年度: 金沢大学, 数物科学系, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連研究代表者以外生物物理・化学物理・ソフトマターの物理 / 高分子化学
キーワード	研究代表者自由エネルギー / 分子動力学シミュレーション / アミノ酸変異 / タンパク質複合体 / 結合自由エネルギー / 分子動力学研究代表者以外シトクロムb6/f / 酸化還元電位 / 光照射ストレス / 拡散過程 … もっと見る / シトクロムf / プラストシアニン / 会合解離過程 / 電子伝達体 / 光化学反応 / ミセル / 脂質 / 脂質ミセル / 高分子 / 自己組織化 / 分子動力学シミュレーション / 引き込み現象隠す

分子動力学計算によるアミノ酸変異タンパク質複合体の結合自由エネルギーシフトの予測研究代表者
- 研究代表者
  
  川口一朋
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
- 研究機関
  金沢大学
光化学反応に於ける光照射ストレス下の電子伝達体ダイナミックスに関する理論的研究
- 研究代表者
  
  長尾秀実
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物物理・化学物理・ソフトマターの物理
- 研究機関
  金沢大学
分子系の引き込み現象可能性に関する理論的研究
- 研究代表者
  
  長尾秀実
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2012
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  高分子化学
- 研究機関
  金沢大学

すべて 2024 2023 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Theoretical studies on association/dissociation process of plastocyanin and cytochrome f in photosynthesis2018
- 著者名/発表者名
  Isman Kurniawan, Takahiro Matsui, Satoshi Nakagawa, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Journal of Physics: Conference Series
  
  巻: 印刷中
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] A coarse-grained model of the effective interaction for charged amino acid residues and its application to formation of GCN4-pLI tetramer2018
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Satoshi Nakagawa, Isman Kurniawan, Koichi Kodama, Muhammad Saleh Arwansyah, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Molecular Physics
  
  巻: 印刷中
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Molecular dynamics study of binary POPC bilayers: molecular condensing effects on membrane structure and dynamics2018
- 著者名/発表者名
  Hiroaki Saito, Tetsuya Morishita, Taku Mizukami, Ken-ichi Nishiyama, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Journal of Physics: Conference Series
  
  巻: 印刷中
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Theoretical study on interaction of cytochrome f and plastocyanin complex by a simple coarse-grained model with molecular crowding effect2018
- 著者名/発表者名
  Satoshi Nakagawa, Isman Kurniawan, Koichi Kodama, Muhammad Saleh Arwansyah, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Molecular Physics
  
  巻: 印刷中
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] A simple coarse-grained model for interacting protein complex2017
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Satoshi Nakagawa, Shogo Kinoshita, Makoto Wada, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Molecular Physics
  
  巻: 115 号: 5 ページ: 587-597
- DOI
  10.1080/00268976.2016.1234652
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K05648, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Dual function of coronatine as a bacterial virulence factor against plants: possible COI1-JAZ- independent role2016
- 著者名/発表者名
  Syusuke Egoshi,Yousuke Takaoka, Hiroaki Saito, Yuuki Nukadzuka, Kengo Hayashi, Yasuhiro Ishimaru, Hiroyuki Yamakoshi, Kosuke Dodo, Mikiko Sodeoka and Minoru Ueda
- 雑誌名
  
  RSC Adv.
  
  巻: 6 号: 11 ページ: 19404-19412
- DOI
  10.1080/08927022.2015.1102249
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26102722, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Decomposition analysis of free energy profile for Hsp90-ADP association2016
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Molecular Simulation
  
  巻: 未定
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] A hybrid-type approach with MD and DFT calculations for evaluation of redox potential of molecules2015
- 著者名/発表者名
  Masashi Iwayama, Isman Kurniawan , Kazutomo Kawaguchi , Hiroaki Saito and Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  Molecular Simulation
  
  巻: 41 号: 10-12 ページ: 936-941
- DOI
  10.1080/08927022.2015.1012641
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-26102722, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Network of water molecules around guanine nucleotide in the Hras-GTP and -GDP complexes by MD simulations2014
- 著者名/発表者名
  Takeshi Miyakawa, Ryota Morikawa, Masako Takasu, Kimikazu Sugimori, Tomokazu Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao
- 雑誌名
  
  JPS Conf. Proc.
  
  巻: volume 1 ページ: 16006-16006
- DOI
  10.7566/jpscp.1.016006
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23750008, KAKENHI-PROJECT-24540442, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Analysis of water molecules around GTP in Hras-GTP complex and GDP in Hras-GDP complex by molecular dynamics simulations2014
- 著者名/発表者名
  T.　Miyakawa
- 雑誌名
  
  MOLECULAR PHYSICS
  
  巻: 112 号: 3-4 ページ: 526-532
- DOI
  10.1080/00268976.2013.852697
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23350064, KAKENHI-PROJECT-23750008, KAKENHI-PROJECT-24540442, KAKENHI-PUBLICLY-26102722, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Hsp90 and ADP: Hydrogen Bond Analysis for ADP Dissociation2014
- 著者名/発表者名
  Kazutomo KAWAGUCHI, Hiroaki SAITO, Hidemi NAGAO
- 雑誌名
  
  JPS Conf. Proc.
  
  巻: volume 1 ページ: 012056-012056
- DOI
  10.7566/jpscp.1.012056
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23750008, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Gramicidin A in Lipid Bilayer: Electrostatic Map and Ion Conduction2014
- 著者名/発表者名
  Hiroaki SAITO, Masashi IWAYAMA, Kazutomo KAWAGUCHI, Taku MIZUKAMI, Takeshi MIYAKAWA, Masako TAKASU, and Hidemi NAGAO
- 雑誌名
  
  JPS Conf. Proc
  
  巻: volume 1 ページ: 012053-012053
- DOI
  10.7566/jpscp.1.012053
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23750008, KAKENHI-PROJECT-25650050, KAKENHI-PROJECT-26400429
[雑誌論文] Theoretical Study on Entrainment Phenomenon in Model Molecular Systems2013
- 著者名/発表者名
  H. Nagao, S. Kawamoto, M. Rusmerryani, A. Purqon, K. Kawaguchi, H. Saito
- 雑誌名
  
  AIP Conference Proceedings
  
  巻: 1518 ページ: 729-732
- DOI
  10.1063/1.4794669
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101, KAKENHI-PROJECT-23750008
[雑誌論文] Molecular Dynamics Analyses of the Dissociation Process of ADP from Hsp902012
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Takagi, M. Iwayama, M.Nishimura, T. Miyakawa, H. Saito, M. Takasu, H.Nagao
- 雑誌名
  
  International Journal of Quantum Chemistry
  
  巻: 112 号: 24 ページ: 3791-3795
- DOI
  10.1002/qua.24229
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101, KAKENHI-PROJECT-23750008
[雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Gramicidin A in Lipid Bilayer: Structure and Lateral Pressure Profile2012
- 著者名/発表者名
  H. Saito, M. Iwayama, H. Takagi, M. Nishimura, T. Miyakawa, K. Kawaguchi, M. Takasu, T. Mizukami, H. Nagao
- 雑誌名
  
  International Journal of Quantum Chemistry
  
  巻: 112 号: 24 ページ: 3834-3839
- DOI
  10.1002/qua.24248
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101, KAKENHI-PROJECT-23750008
[学会発表] アミノ酸変異による結合自由エネルギー変化に関する理論的研究2024
- 著者名/発表者名
  川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  2023年度生物物理学会中部支部討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K03339
[学会発表] Binding free energy calculation for mutated protein complex system2023
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第61回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K03339
[学会発表] Molecular Dynamics Study of Ultra-long-chain Fatty Acids in Lipid Bilayer2023
- 著者名/発表者名
  [1]Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao, Hideo Shindou, and Hiroshi Noguchi
- 学会等名
  9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K03339
[学会発表] アミノ酸変異によるタンパク質複合体の結合自由エネルギー変化2023
- 著者名/発表者名
  川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  第37回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K03339
[学会発表] Theoretical study of a coarse-grained model for folding and association of a protein complex2018
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Satoshi Nakagawa, Hidemi Nagao
- 学会等名
  The 58th Sanibel Symposium
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Langevin 動力学を用いたチラコイドルーメン内腔のプラストシアニンの拡散現象に関する理論的研究2017
- 著者名/発表者名
  和田慎、高木晶平、中川聖、川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  第31 回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study of diffusion of plastocyanin with Langevin dynamics simulation2017
- 著者名/発表者名
  Makoto Wada, Satoshi Nakagawa, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  International Symposium on Computational Science 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical Studies on Stability and Dynamics of Protein by a Coarse-grained Model2017
- 著者名/発表者名
  Satoshi Nakagawa, Kazutomo Kawaguchi, Isman Kurniawan, Arwansyah Saleh, Koichi Kodama, Hidemi Nagao
- 学会等名
  XXIX IUPAP Conference on Computational Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Development of a coarse-grained model for charged amino acid residues2017
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, S. Nakagawa, H. Nagao
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] The Free Energy Profile for Dissociation of Ligand from Zn2+ Ion of CA I Activesite2017
- 著者名/発表者名
  Arwansyah Muhammad Saleh, Isman Kurniawan, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study on intermolecular interaction and structural stability of plastcyanin and cytochrom f complex by using Go-like model2017
- 著者名/発表者名
  S. Nakagawa, S. Kinoshita, K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  The 57th Sanibel Symposium
- 発表場所
  St. Simons Island, USA
- 年月日
  2017-02-19
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Goldman-Hodgkin-Katz 方程式から得られる静止膜電位の分子動力学シミュレーション2017
- 著者名/発表者名
  川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  第31 回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical Study of RA-VII as a Candidate for Anticancer Agent: Combination of Docking and Molecular Dynamics Simulation2017
- 著者名/発表者名
  M.S. Arwansyah, I. Kurniawan, Y. Noguchi, K. Kawaguchi, T. Miyakawa, Y. Hitotsuyanagi, S. Yokojima, R. Morikawa, M. Takasu, and H. Nagao
- 学会等名
  International Symposium on Computational Science 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study on the structural stability of vesicle consisting of mixed lipids by coarse-grained model2017
- 著者名/発表者名
  Tetsu Matsuura, Shohei Takagi, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study of a coarse grained model of electrostatic interaction between protein molecules2017
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, S. Nakagawa, I. Kurniawan, K. Kodama, M. Wada, H. Nagao
- 学会等名
  The 57th Sanibel Symposium
- 発表場所
  St. Simons Island, USA
- 年月日
  2017-02-19
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] The Exit Pathways of Water Molecule from Tri-Nuclear Copper Center of Multicopper Oxidase: A Steered Molecular Dynamics Study2017
- 著者名/発表者名
  I. Kurniawan, K. Kawaguchi, T. Sakurai, and H. Nagao
- 学会等名
  International Symposium on Computational Science 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical studies on dynamics of electron carriers in photosynthesis2017
- 著者名/発表者名
  Hidemi Nagao, Satoshi Nakagawa, Isman Kurniawan, Koichi Kodama, Muhammad Arwansyah, Kazutomo Kawaguchi
- 学会等名
  第55回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study on contribution of screened electrostatic intermolecular interaction to reaction process of Plastocyanin and Cytochrome f2017
- 著者名/発表者名
  Satoshi Nakagawa, Kazutomo Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  International Symposium on Computational Science 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical Study on Contribution of Long-Range Interaction to Electronic Structure of Type I Copper Center in Multicopper Oxidase2017
- 著者名/発表者名
  Isman Kurniawan, Koichi Kodama1, Makoto Wada1, Satoshi Nakagawa, Kimikazu Sugimori, Kazutomo Kawaguchi, Takeshi Sakurai, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第31 回分子シミュレーション討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical Studies on Dynamics of Electron Carriers in Photosynthesis by a Coarse-grained Model2017
- 著者名/発表者名
  Satoshi Nakagawa, Kazutomo Kawaguchi, Isman Kurniawan, Arwnsyah Saleh, Koichi Kodama, Hidemi Nagao
- 学会等名
  19th International Union for Pure and Applied Biophysics Congress, 11th European Biophysics Congress
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study of diffusion of plastocyanin with Langevin equation2016
- 著者名/発表者名
  M. Wada, S. Nakagawa, S. Kinoshita, I. Kurniawan, K. Kodama, K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（つくば）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical Study of a Coarse-grained Potential of Hydrophobic Interaction between Protein Molecules” (poster) International Symposium on Multi-scale Simulation of Condensed-phase Reacting Systems2016
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  MSCRS2016
- 発表場所
  Nagoya, Japan
- 年月日
  2016-10-10
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study of a conformational change in Hsp902016
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（つくば）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Hras-GTP/GDP系でのGTP/GDP周辺における水素結合の静的性質と動的性質の分子動力学法による研究2016
- 著者名/発表者名
  宮川毅、森河良太、高須昌子、杉森公一、川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  日本物理学会2016年秋季大会
- 発表場所
  金沢大学角間キャンパス（金沢）
- 年月日
  2016-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study on the process of the formation of lipid molecule cluster by coarse-grained model2016
- 著者名/発表者名
  S. Kinoshita, S. Nakagawa, M. Wada, S. Ito, K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（つくば）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] 疎水性アミノ酸残基間に働く有効相互作用に関する理論的研究2016
- 著者名/発表者名
  川口一朋、齋藤大明、長尾秀実
- 学会等名
  日本物理学会第71回年次大会
- 発表場所
  東北学院大学　仙台
- 年月日
  2016-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] POPC の膜電位に関する理論的研究2016
- 著者名/発表者名
  伊藤誠一朗、川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  第30回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  大阪大学基礎工学国際棟シグマホール（大阪）
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] タンパク質間相互作用の粗視化モデルに関する理論的研究2016
- 著者名/発表者名
  川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  第10回分子科学討論会
- 発表場所
  神戸ファッションマート（神戸）
- 年月日
  2016-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] 水溶液中のタンパク質間静電相互作用の粗視化モデル2016
- 著者名/発表者名
  川口一朋、長尾秀実
- 学会等名
  第30回分子シミュレーション討論会
- 発表場所
  大阪大学基礎工学国際棟シグマホール（大阪）
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Analysis of dynamics of hydrogen bond between the solvent water and the Hras-GTP/GDP complexes by molecular dynamics simulations2016
- 著者名/発表者名
  T. Miyakawa, R. Morikawa, M. Takasu, K. Sugimori, K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（つくば）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Theoretical study on the structural stability of plastocyanin and cytochrome f complex by using Go-like model2016
- 著者名/発表者名
  S. Nakagawa, S. Kinoshita, M. Wada, K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第54回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場（つくば）
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] プラストシアニンとシトクロムfの会合―解離過程における自由エネルギー地形に関する理論的研究2015
- 著者名/発表者名
  松井貴寛、中川聖、川口一朋、齋藤大明、長尾秀実
- 学会等名
  第9回分子科学討論会
- 発表場所
  東京工業大学　東京
- 年月日
  2015-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Goモデルを用いたプラストシアニン―シトクロムfにおけるタンパク質間相互作用に関する理論的研究2015
- 著者名/発表者名
  中川聖、木下翔吾、松井貴寛、川口一朋、齋藤大明、長尾秀実
- 学会等名
  第9回分子科学討論会
- 発表場所
  東京工業大学　東京
- 年月日
  2015-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Role of water molecules for association of Hsp90 and ADP2015
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第53回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  金沢大学　金沢
- 年月日
  2015-09-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] 水溶液中の溶質分子の親水性・疎水性に関する理論的研究2015
- 著者名/発表者名
  川口一朋、齋藤大明、長尾秀実
- 学会等名
  第9回分子科学討論会
- 発表場所
  東京工業大学　東京
- 年月日
  2015-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Molecular dynamics analyses of dissociation process of ADP from Hsp902013
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Takagi, M. Iwayama, H. Saito, H. Nagao
- 学会等名
  International Symposium On Computational Science 2013(招待講演
- 発表場所
  Kanazawa
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Theoretical studies on oxidation of molecules by combining MD and QM/MM calculations2013
- 著者名/発表者名
  Masashi Iwayama, Isman Kurniawan, Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao
- 学会等名
  The 53rd Sanibel Symposium
- 発表場所
  Florida, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Molecular dynamics analyses of dissociation process of ADP from Hsp902013
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Takagi, M. Iwayama, H. Saito, H. Nagao
- 学会等名
  International Symposium On Computational Science 2013
- 発表場所
  Kanazawa
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Hras-GTP内におけるGTP周辺にある水分子の分子動力学法による研究2013
- 著者名/発表者名
  宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 齋藤大明, 長尾秀実
- 学会等名
  第68回日本物理学会春季大会
- 発表場所
  広島
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Binding Free Energy of Azurin-Cytochrome c551 Complex by all-atom Molecular DynamicsSimulation2012
- 著者名/発表者名
  H. Saito, M. Iwayama, T. Mizukami, K.Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  Conference on Computational Physics (CCP2012)
- 発表場所
  Kobe
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Free energy profile for binding of ADP to Hsp90 with molecular dynamics simulation2012
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Takagi, M. Iwayama, M. Nishimura, H. Saito, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第50回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  名古屋
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Molecular dynamics study of gramicidin A in lipid bilayer: structure and lateral pressure profile2012
- 著者名/発表者名
  Hiroaki Saito, Masashi Iwayama, Hiroyuki Takagi,Kazutomo Kawaguchi, and Hidemi Nagao
- 学会等名
  The 5th International Symposium on Computational Sciences(ISCS) 2012(招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Free energy profile for binding of ADP to Hsp90 by molecular dynamics simulation2012
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Hiroyuki Takagi, Masashi Iwayama, Hiroaki Saito, and Hidemi Nagao
- 学会等名
  The 5th International Symposium on Computational Sciences (ISCS) 2012
- 発表場所
  Yogyakarta, Indonesia
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Structure and lateral pressure profile of lipid bilayer containing gramicidin A by molecular dynamics simulation2012
- 著者名/発表者名
  H. Saito, M. Iwayama, M. Nishimura, H. Takagi, K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第50回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  名古屋
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Binding Free Energy of Azurin-Cytochrome c551 Complex by all-atom Molecular Dynamics Simulation2012
- 著者名/発表者名
  H. Saito, M. Iwayama, T. Mizukami, K. Kawaguchi, Hidemi Nagao
- 学会等名
  Conference on Computational Physics (CCP2012)
- 発表場所
  Kobe
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Free energy profile for binding of ADP to Hsp90 by molecular dynamics simulation2012
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Hiroyuki Takagi, Masashi Iwayama, Hiroaki Saito, and Hidemi Nagao
- 学会等名
  The 5th International Symposium on Computational Sciences(ISCS) 2012(招待講演)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Molecular dynamics study of gramicidin A in lipid bilayer: structure and lateral pressure profile2012
- 著者名/発表者名
  Hiroaki Saito, Masashi Iwayama, Hiroyuki Takagi, Kazutomo Kawaguchi, and Hidemi Nagao
- 学会等名
  The 5th International Symposium on Computational Sciences (ISCS) 2012
- 発表場所
  Yogyakarta, Indonesia
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Theoretical study on entrainment phenomenon in model molecular systems2012
- 著者名/発表者名
  Hidemi Nagao, Michke Rusmerryani, Acep Pruqon, Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito
- 学会等名
  The 4th International Symposium on Slow Dynamics in Complex Systems
- 発表場所
  仙台
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Structure and lateral pressure profile of lipid bilayer containing gramicidin A by molecular dynamicssimulation2012
- 著者名/発表者名
  H. Saito, M. Iwayama, M. Nishimura, H. Takagi,K. Kawaguchi, H. Nagao
- 学会等名
  第50回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  名古屋
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Theoretical study on entrainment phenomenon in model molecular systems2012
- 著者名/発表者名
  Hidemi Nagao, Michke Rusmerryani, Acep Pruqon, Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito
- 学会等名
  The 4th International Symposium on Slow Dynamics in Complex Systems
- 発表場所
  Sendai
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Free energy profile of Hsp90-ADP binding by molecular dynamics simulations2012
- 著者名/発表者名
  K. Kawaguchi, H. Saito, Hidemi Nagao
- 学会等名
  Conference on Computational Physics (CCP2012)
- 発表場所
  Kobe
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23655101
[学会発表] Theoretical study of distribution of ADP in binding pocket of Hsp90
- 著者名/発表者名
  Kazutomo Kawaguchi, Hiroaki Saito, Hidemi Nagao
- 学会等名
  第５２回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  札幌
- 年月日
  2014-09-25 – 2014-09-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] Hras-GTP の GTP 周辺での溶媒水と複合体の水素結合の分子動力学法による研究
- 著者名/発表者名
  宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 杉森公一, 川口一朋, 齋藤大明, 長尾秀実
- 学会等名
  日本物理学会2014年秋季大会
- 発表場所
  中部大学
- 年月日
  2014-09-07 – 2014-09-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] MD法とQM/MM計算によるブルー銅タンパク質の酸化還元電位に関する理論的研究
- 著者名/発表者名
  岩山将士，齋藤大明，川口一朋，長尾秀実
- 学会等名
  第８回分子科学討論会
- 発表場所
  東広島
- 年月日
  2014-09-21 – 2014-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] フレキシブルモデルを用いた分子ドッキング法の開発
- 著者名/発表者名
  齋藤大明，川口一朋，長尾秀実
- 学会等名
  第８回分子科学討論会
- 発表場所
  東広島
- 年月日
  2014-09-21 – 2014-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429
[学会発表] タンパク質間の解離過程における自由エネルギー地形に関する理論的研究
- 著者名/発表者名
  松井貴寛, 齋藤大明, 川口一朋, 長尾秀実
- 学会等名
  第８回分子科学討論会
- 発表場所
  東広島
- 年月日
  2014-09-21 – 2014-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26400429

1. 長尾秀実 (30291892)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 60件
2. 齋藤大明 (40506820)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 37件
3. 長山雅晴 (20314289)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 岩崎宏 (30242514)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 中川聖

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 19件
6. 兒玉浩一

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 8件
7. Kurniawan Isman

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 12件
8. Saleh Arwansyah

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件

川口 一朋 Kawaguchi Kazutomo

研究課題

研究成果

共同研究者

分子動力学計算によるアミノ酸変異タンパク質複合体の結合自由エネルギーシフトの予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

光化学反応に於ける光照射ストレス下の電子伝達体ダイナミックスに関する理論的研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

分子系の引き込み現象可能性に関する理論的研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Theoretical studies on association/dissociation process of plastocyanin and cytochrome f in photosynthesis2018

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A coarse-grained model of the effective interaction for charged amino acid residues and its application to formation of GCN4-pLI tetramer2018

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Molecular dynamics study of binary POPC bilayers: molecular condensing effects on membrane structure and dynamics2018

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Theoretical study on interaction of cytochrome f and plastocyanin complex by a simple coarse-grained model with molecular crowding effect2018

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A simple coarse-grained model for interacting protein complex2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Dual function of coronatine as a bacterial virulence factor against plants: possible COI1-JAZ- independent role2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Decomposition analysis of free energy profile for Hsp90-ADP association2016

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A hybrid-type approach with MD and DFT calculations for evaluation of redox potential of molecules2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Network of water molecules around guanine nucleotide in the Hras-GTP and -GDP complexes by MD simulations2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Analysis of water molecules around GTP in Hras-GTP complex and GDP in Hras-GDP complex by molecular dynamics simulations2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Hsp90 and ADP: Hydrogen Bond Analysis for ADP Dissociation2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Molecular Dynamics Study of Gramicidin A in Lipid Bilayer: Electrostatic Map and Ion Conduction2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Theoretical Study on Entrainment Phenomenon in Model Molecular Systems2013

著者名/発表者名

雑誌名

川口一朋 Kawaguchi Kazutomo