坂田克己 Sakata Katsumi

研究者番号	90545419
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2014年度 – 2019年度: 前橋工科大学, 工学部, 教授
審査区分/研究分野	研究代表者生命・健康・医療情報学研究代表者以外作物生産科学
キーワード	研究代表者システムバイオロジー / 生物ネットワーク / 状態空間モデル / 生命現象の物理 / 生命系ネットワーク / 環境変動と生命秩序 / ネットワークトポロジー研究代表者以外湿害 / ダイズ / シミュレイション / オミクス

汎ネットワークな生命系の秩序形成研究代表者
- 研究代表者
  
  坂田克己
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  前橋工科大学
オミクス統合シミュレィションを基軸にしたダイズ出芽期に耐湿性を付与する技術の開発
- 研究代表者
  
  小松節子
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  作物生産科学
- 研究機関
  筑波大学
   国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構
汎ネットワーク初期化機構の探索研究研究代表者
- 研究代表者
  
  坂田克己
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  前橋工科大学

すべて 2020 2019 2018 2017 2016 2015 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] An Information-Theoretic Model for Managing Predator-Prey Ecosystems Facing Climate Changes2020
- 著者名/発表者名
  Katsumi Sakata, Ramesh Katam, Toshiyuki Saito, Hajime Ohyanagi, Setsuko Komatsu
- 雑誌名
  
  International Journal on Advances in Life Sciences
  
  巻: 12
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[雑誌論文] An Integrated Approach of Proteomics and Computational Genetic Modification Effectiveness Analysis to Uncover the Mechanisms of Flood Tolerance in Soybeans2018
- 著者名/発表者名
  Wang Xin、Sakata Katsumi、Komatsu Setsuko
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 19 号: 5 ページ: 1301-1301
- DOI
  10.3390/ijms19051301
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[雑誌論文] Integration of gel-based and gel-free proteomic data for functional analysis of proteins through Soybean Proteome Database2017
- 著者名/発表者名
  Komatsu Setsuko、Wang Xin、Yin Xiaojian、Nanjo Yohei、Ohyanagi Hajime、Sakata Katsumi
- 雑誌名
  
  J. Proteomics
  
  巻: 163 ページ: 52-66
- DOI
  10.1016/j.jprot.2017.05.009
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04445
[雑誌論文] Loss of variation of state detected in soybean metabolic and human myelomonocytic leukaemia cell transcriptional networks under external stimuli2016
- 著者名/発表者名
  坂田他
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 35946-35946
- DOI
  10.1038/srep35946
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26540157, KAKENHI-PROJECT-16K00399, KAKENHI-PROJECT-15H04445
[雑誌論文] Gel-free/label-free proteomic analysis of root tip of soybean over time under flooding and drought stresses.2016
- 著者名/発表者名
  Wang X, Oh M, Sakata K, Komatsu S.
- 雑誌名
  
  J Proteomics
  
  巻: 130 ページ: 42-55
- DOI
  10.1016/j.jprot.2015.09.007
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04445
[雑誌論文] Proteomic analysis of flooded soybean root2015
- 著者名/発表者名
  Mustafa G, Sakata K, Komatsu S.
- 雑誌名
  
  J Proteomics
  
  巻: 128 ページ: 280-297
- DOI
  10.1016/j.jprot.2015.08.010
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04445
[雑誌論文] System-wide analysis of the transcriptional network of human myelomonocytic leukemia cells predicts attractor structure and phorbol-ester-induced differentiation and dedifferentiation transitions2015
- 著者名/発表者名
  Katsumi Sakata, Hajime Ohyanagi, Toshiyuki Saito, et al.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 8283-8283
- DOI
  10.1038/srep08283
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26540157, KAKENHI-PROJECT-26293303
[学会発表] Mathematical Formulation of Environmental Responses of Life Systems2020
- 著者名/発表者名
  Katsumi Sakata, Ramesh Katam
- 学会等名
  International Conferences on STEM/STEAM and Education
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] 気候変動下の捕食者-被食者生態系の数理モデル構築とシミュレーション2019
- 著者名/発表者名
  坂田克己
- 学会等名
  日本応用数理学会 2019年研究部会連合発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] A mathematical model for predator-prey ecosystems facing climate changes2019
- 著者名/発表者名
  Katsumi Sakata, Toshiyuki Saito, Hajime Ohyanagi, Setsuko Komatsu
- 学会等名
  11th International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] Soybean Proteomics to Reveal the Flooding-Tolerant Mechanism2018
- 著者名/発表者名
  Setsuko Komatsu, Katsumi Sakata
- 学会等名
  植物動物ゲノム会議XXNI, サンデイゴ（米国）
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04445
[学会発表] ヒト転写とダイズ代謝反応の外部刺激に対する応答－デジタル物理学的モデルによる一般化2018
- 著者名/発表者名
  坂田克己、大柳一、齋藤俊行、小松節子
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] Information flow analysis of genetic regulatory systems2018
- 著者名/発表者名
  Sakata K, Saito T, Ohyanagi H, Asahi S, Sato D, Morikawa Y, Komatsu S
- 学会等名
  2018 SIAM Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] 生物相互作用ネットワークの動特性解析2017
- 著者名/発表者名
  坂田克己, 新堀航大, 大柳一, 朝日頌, 佐藤大輝, 森川雄太, 齋藤俊行
- 学会等名
  日本応用数理学会 2017年度年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] Information Transfer-Model Interprets Loss of Control Capability in Biological Systems under External Stimuli2017
- 著者名/発表者名
  K. Sakata, H. Ohyanagi, T. Saito
- 学会等名
  The IV International AMMCS Interdisciplinary Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] A Stability Analysis of the Biological Networks, Transcriptional Network, Neural Circuit and Ecosystem2016
- 著者名/発表者名
  Katsumi Sakata
- 学会等名
  2016 SIAM Annual Meeting SIAM Conference on the Life Sciences
- 発表場所
  Boston, MA, USA
- 年月日
  2016-07-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26540157
[学会発表] 生命系ネットワークの安定性に関する解析研究2016
- 著者名/発表者名
  山下祥平，藤枝舜祐，坂田克己
- 学会等名
  情報処理学会、第78回全国大会
- 発表場所
  慶應義塾大学矢上キャンパス
- 年月日
  2016-03-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26540157
[学会発表] A stability analysis of the biological networks, transcriptional network, neural circuit and ecosystem2016
- 著者名/発表者名
  坂田克己
- 学会等名
  SIAM Conferences on the Life Sciences
- 発表場所
  ボストン（米国）
- 年月日
  2016-07-11
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26540157
[学会発表] A stability analysis of the biological networks, transcriptional network, neural circuit and ecosystem2016
- 著者名/発表者名
  坂田克己
- 学会等名
  SIAM Conferences on the Life Sciences
- 発表場所
  ボストン（米国）
- 年月日
  2016-07-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00399
[学会発表] Temporal analysis of flooded soybean root exposed to silver nanoparticles using proteomic technique.2015
- 著者名/発表者名
  Ghazala MUSTAFA, Katsumi SAKATA, Setsuko KOMATSU
- 学会等名
  第３８回日本分子生物学会年会・第８８回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド、神戸
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04445
[学会発表] 汎生物ネットワーク的な動特性の解析
- 著者名/発表者名
  坂田克己, 大柳一, 齋藤俊行
- 学会等名
  日本応用数理学会2015年研究部会連合発表会
- 発表場所
  明治大学中野キャンパス
- 年月日
  2015-03-06 – 2015-03-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26540157

1. 小松節子 (90355751)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
2. 齋藤俊行 (90205667)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 大柳一

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
4. 奥村惇

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 石毛健太郎

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 山下祥平

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
7. 藤枝舜祐

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
8. 日高拓未

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. ラメシュカタム

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 斉藤俊行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件

坂田 克己 Sakata Katsumi

研究課題

研究成果

共同研究者

汎ネットワークな生命系の秩序形成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

オミクス統合シミュレィションを基軸にしたダイズ出芽期に耐湿性を付与する技術の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

汎ネットワーク初期化機構の探索研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] An Information-Theoretic Model for Managing Predator-Prey Ecosystems Facing Climate Changes2020

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] An Integrated Approach of Proteomics and Computational Genetic Modification Effectiveness Analysis to Uncover the Mechanisms of Flood Tolerance in Soybeans2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Integration of gel-based and gel-free proteomic data for functional analysis of proteins through Soybean Proteome Database2017

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Loss of variation of state detected in soybean metabolic and human myelomonocytic leukaemia cell transcriptional networks under external stimuli2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Gel-free/label-free proteomic analysis of root tip of soybean over time under flooding and drought stresses.2016

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Proteomic analysis of flooded soybean root2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] System-wide analysis of the transcriptional network of human myelomonocytic leukemia cells predicts attractor structure and phorbol-ester-induced differentiation and dedifferentiation transitions2015

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Mathematical Formulation of Environmental Responses of Life Systems2020

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 気候変動下の捕食者-被食者生態系の数理モデル構築とシミュレーション2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] A mathematical model for predator-prey ecosystems facing climate changes2019

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Soybean Proteomics to Reveal the Flooding-Tolerant Mechanism2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] ヒト転写とダイズ代謝反応の外部刺激に対する応答－デジタル物理学的モデルによる一般化2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Information flow analysis of genetic regulatory systems2018

著者名/発表者名

学会等名

データソース

坂田克己 Sakata Katsumi