本田信治 Honda Shinji

研究者番号	90632167
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-1584-4156
所属 (現在)	2025年度: 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授 2023年度: 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授 2016年度 – 2022年度: 福井大学, 学術研究院医学系部門, 助教 2012年度 – 2015年度: 福井大学, テニュアトラック推進本部, 助教 2013年度: 福井大学, 学内共同利用施設等, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者中区分38:農芸化学およびその関連分野 / 応用分子細胞生物学 / 生物系 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 小区分38060:応用分子細胞生物学関連 / 複合領域 / システムゲノム科学 / 遺伝・ゲノム動態研究代表者以外中区分38:農芸化学およびその関連分野
キーワード	研究代表者アカパンカビ / ウイルス / エピジェネティクス / 菌類 / 応用微生物学 / ゲノム防御 / 子嚢胞子 / DNAメチル化 / ライブイメージング / 染色体動態 … もっと見る / ゲノム編集 / 熱 / 応用微生物 / 熱耐性 / 休眠 / エピジェネティク / ヒストン修飾 / ストレス / ヘテロクロマチン … もっと見る研究代表者以外アカパン株 / RNA編集 / 転写制御 / RNAi / 抗ウイルス機構 / ウイルス-宿主相互作用 / モデル糸状菌 / アカパンカビ / ウイルス隠す

モデル糸状菌を用いた「遺伝子多型」と「症状差」の関係解析研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分38:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  福井大学
子嚢菌門の糸状菌に保存された生殖期特異的ウイルス除去機構を担う因子群の同定研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分38:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  福井大学
非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2023
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  福井大学
宿主アカパンカビの抗ウイルス免疫暴走化機序の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分38060:応用分子細胞生物学関連
- 研究機関
  福井大学
モデル糸状菌アカパンカビを用いたウイルス研究フロンティア
- 研究代表者
  
  近藤秀樹
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分38:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  岡山大学
モデル生物アカパンカビを利用したウイルス・宿主の相利共生と環境適応の関係解明研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  福井大学
山火事の熱と煙で目覚めるアカパンカビ子嚢胞子のシグナル伝達経路網研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2018
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  福井大学
アカパンカビゲノム防御機構RIP可視化システムの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  応用分子細胞生物学
- 研究機関
  福井大学
アカパンカビ子嚢胞子が山火事で目覚める分子機構の解明とその応用研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2018
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  応用分子細胞生物学
- 研究機関
  福井大学
アカパンカビの特殊能力を利用した染色体適応機構の研究研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  福井大学
エピジェネティクス修飾を暗号解読する蛋白質複合体の網羅的解析研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  福井大学
ヘテロクロマチンの境界を制御する新規蛋白質の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  本田信治
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2013
- 研究種目
  
  研究活動スタート支援
- 研究分野
  
  遺伝・ゲノム動態
- 研究機関
  福井大学

すべて 2024 2023 2022 2020 2019 2018 2016 2015 2014 2013 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Fungi2023
- 著者名/発表者名
  Honda Shinji、Yokoyama Ayumi、Suzuki Nobuhiro
- 雑誌名
  
  Sneak Peek
  
  巻: -
- DOI
  10.2139/ssrn.4425943
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02153, KAKENHI-PROJECT-22K19144, KAKENHI-PUBLICLY-22H05593
[雑誌論文] LSD1 prevents aberrant heterochromatin formation in Neurospora crassa2020
- 著者名/発表者名
  Storck William K、Bicocca Vincent T、Rountree Michael R、Honda Shinji、Ormsby Tereza、Selker Eric U
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 48 号: 18 ページ: 10199-10210
- DOI
  10.1093/nar/gkaa724
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04828
[雑誌論文] Establishment of Neurospora crassa as a model organism for fungal virology.2020
- 著者名/発表者名
  Honda S, Eusebio-Cope A, Miyashita S, Yokoyama A, Aulia A, Shahi S, Kondo H, Suzuki N
- 雑誌名
  
  Nature communications
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 5627-5627
- DOI
  10.1038/s41467-020-19355-y
- NAID
  120006939592
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21723, KAKENHI-PUBLICLY-19H04828, KAKENHI-PROJECT-16H06185, KAKENHI-ORGANIZER-16H06429, KAKENHI-PLANNED-16H06436, KAKENHI-PROJECT-17H01463
[雑誌論文] Normal Patterns of Histone H3K27 Methylation Require the Histone Variant H2A.Z in Neurospora crassa2020
- 著者名/発表者名
  Courtney Abigail J.、Kamei Masayuki、Ferraro Aileen R.、Gai Kexin、He Qun、Honda Shinji、Lewis Zachary A.
- 雑誌名
  
  Genetics
  
  巻: 216 号: 1 ページ: 51-66
- DOI
  10.1534/genetics.120.303442
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04828
[雑誌論文] Telomere repeats induce domains of H3K27 methylation in Neurospora2018
- 著者名/発表者名
  Jamieson Kirsty、McNaught Kevin J、Ormsby Tereza、Leggett Neena A、Honda Shinji、Selker Eric U
- 雑誌名
  
  eLife
  
  巻: 7
- DOI
  10.7554/elife.31216
- NAID
  120006488715
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029, KAKENHI-PUBLICLY-17H05998
[雑誌論文] ASH1-catalyzed H3K36 methylation drives gene repression and marks H3K27me2/3-competent chromatin2018
- 著者名/発表者名
  Bicocca Vincent T、Ormsby Tereza、Adhvaryu Keyur K、Honda Shinji、Selker Eric U
- 雑誌名
  
  eLife
  
  巻: 7
- DOI
  10.7554/elife.41497
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05998, KAKENHI-PROJECT-26712029
[雑誌論文] Nucleosome Positioning by an Evolutionarily Conserved Chromatin Remodeler Prevents Aberrant DNA Methylation in Neurospora2018
- 著者名/発表者名
  Klocko Andrew D.、Uesaka Miki、Ormsby Tereza、Rountree Michael R.、Wiles Elizabeth T.、Adhvaryu Keyur K.、Honda Shinji、Selker Eric U.
- 雑誌名
  
  Genetics
  
  巻: 211 号: 2 ページ: 563-578
- DOI
  10.1534/genetics.118.301711
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05998, KAKENHI-PROJECT-26712029
[雑誌論文] Normal chromosome conformation depends on subtelomeric facultative heterochromatin Neurospora crassa2016
- 著者名/発表者名
  Klocko AD, Ormsby T, Galazka JM, Leggett N, Uesaka M, Honda S, Freitag M, and Selker EU
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences
  
  巻: 113 号: 52 ページ: 15048-15053
- DOI
  10.1073/pnas.1615546113
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029, KAKENHI-PROJECT-15K14916
[雑誌論文] Dual chromatin recognition by the histone deacetylase complex HCHC is required for proper DNA methylation in Neurospora crassa2016
- 著者名/発表者名
  Honda S, Bicocca VT, Gessaman JD, Rountree MR, Yokoyama A, Yu EY, Selker JM, and Selker EU
- 雑誌名
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences
  
  巻: 113 号: 41
- DOI
  10.1073/pnas.1614279113
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029, KAKENHI-PROJECT-15K14916
[雑誌論文] Neurospora chromosomes are organized by blocks of importin alpha-dependent heterochromatin that are largely independent of H3K9me32016
- 著者名/発表者名
  Galazka JM, Klocko AD, Uesaka M, Honda S, Selker EU, Freitag M
- 雑誌名
  
  Genome Research
  
  巻: 26 号: 8 ページ: 1069-1080
- DOI
  10.1101/gr.203182.115
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029, KAKENHI-PROJECT-15K14916
[雑誌論文] The Cullin-4 complex DCDC does not require key E3 ubiquitin ligase elements2015
- 著者名/発表者名
  Adhvaryu KK, Gessaman JD, Honda S, Lewis ZA, Grisafi PL, and Selker EU
- 雑誌名
  
  Eukaryotic Cell
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 25-28
- DOI
  10.1128/ec.00212-14
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25125710, KAKENHI-PROJECT-25640111, KAKENHI-PROJECT-26712029
[学会発表] RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Neurospora crassa2024
- 著者名/発表者名
  Shinji Honda, Ayumi Yokoyama, and Nobuhiro Suzuki
- 学会等名
  32nd Fungal Genetics Conference
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H05593
[学会発表] RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Neurospora crassa2024
- 著者名/発表者名
  Shinji Honda, Ayumi Yokoyama, and Nobuhiro Suzuki
- 学会等名
  32nd Fungal Genetics Conference
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19144
[学会発表] モデル生物アカパンカビを用いた植物病原糸状菌とウイルスの相互作用の包括的解析2024
- 著者名/発表者名
  本田　信治
- 学会等名
  令和5年度岡山大学資源植物科学研究所拠点共同研究成果発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19144
[学会発表] 非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係2023
- 著者名/発表者名
  本田　信治
- 学会等名
  学術変革領域研究(A) 非ドメイン型バイオポリマーの生物学・第3回領域会議
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19144
[学会発表] モデル生物アカパンカビを用いた植物病原糸状菌とウイルスの相互作用の包括的解析2023
- 著者名/発表者名
  本田　信治
- 学会等名
  令和４年度岡山大学資源植物科学研究所拠点共同研究成果発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19144
[学会発表] モデル生物アカパンカビを用いた植物病原糸状菌とウイルスの相互作用の包括的解析2023
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  令和４年度岡山大学資源植物科学研究所拠点共同研究成果発表会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H05593
[学会発表] モデル生物アカパンカビを用いた植物病原糸状菌とウイルスの相互作用の包括的解析2023
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  令和４年度岡山大学資源植物科学研究所拠点共同研究成果発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02153
[学会発表] モデル生物アカパンカビを利用した植物病原糸状菌・ウイルス相互作用研究のフロンティア2022
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  令和3年度岡山大学資源植物科学研究所拠点共同研究成果発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02153
[学会発表] 非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係2022
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  学術変革領域研究(A) 非ドメイン型バイオポリマーの生物学・第2回領域会議
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-22H05593
[学会発表] 非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係2022
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  学術変革領域研究(A) 非ドメイン型バイオポリマーの生物学・第2回領域会議
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02153
[学会発表] 非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係2022
- 著者名/発表者名
  本田　信治
- 学会等名
  学術変革領域研究(A) 非ドメイン型バイオポリマーの生物学・第2回領域会議
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K19144
[学会発表] モデル生物アカパンカビを利用したウイルス・宿主の相利共生とそのエピジェネティクス制御2019
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  第6回北陸エピジェネティクス研究会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04828
[学会発表] Ascospore sleepless-1 and -2 are required for ascospore dormancy in Neurospora crassa2018
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A and Honda S
- 学会等名
  Neurospore meeting 2018
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029
[学会発表] Ascospore sleepless-1 and -2 are required for ascospore dormancy in Neurospora crassa2018
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A and Honda S
- 学会等名
  Neurospore meeting
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05998
[学会発表] Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa2016
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
- 学会等名
  EMBO conference
- 発表場所
  Liege, Belgium
- 年月日
  2016-04-26
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14916
[学会発表] Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa2016
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
- 学会等名
  Neurospora meeting 2016
- 発表場所
  California, USA
- 年月日
  2016-03-10
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029
[学会発表] Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa2016
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
- 学会等名
  EMBO conference
- 発表場所
  Liege, Belgium
- 年月日
  2016-04-26
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029
[学会発表] Shelterin is required for telomeric integrity in Neurospora crassa2016
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
- 学会等名
  Neurospora meeting 2016
- 発表場所
  California, USA
- 年月日
  2016-03-10
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14916
[学会発表] Heat break of ascospore dormancy in Neurospora crassa2014
- 著者名/発表者名
  Miki Uesaka and Shinji Honda
- 学会等名
  Neurospore meeting 2014 at Asilomar
- 発表場所
  California, USA
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25125710
[学会発表] アカパンカビの重複配列に対するエピジェネティクス制御2013
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  日本エピジェネティクス研究会
- 発表場所
  奈良
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24870012
[学会発表] アカパンカビの重複配列に対するエピジェネティクス制御2013
- 著者名/発表者名
  本田信治
- 学会等名
  第７回日本エピジェネティクス研究会年会
- 発表場所
  奈良県（奈良県新公会堂）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25640111
[学会発表] Four color imagining by fluorescent protein tagging system in Neurospora crassa
- 著者名/発表者名
  Yokoyama A, Uesaka M and Honda S
- 学会等名
  The 28th Fungal Genetics Conference at Asilomar
- 発表場所
  Monterey, USA
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-22
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25125710
[学会発表] Four color imagining by fluorescent protein tagging system in Neurospora crassa
- 著者名/発表者名
  Yokoyama A, Uesaka M and Honda S
- 学会等名
  The 28th Fungal Genetics Conference at Asilomar
- 発表場所
  Monterey, USA
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029
[学会発表] Identification and characterization of Neurospora Shelterin
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
- 学会等名
  The 9th Cold Spring Harbor meeting on Telomeres & Telomerase
- 発表場所
  Cold Spring Harbor, USA
- 年月日
  2015-04-28 – 2015-05-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25640111
[学会発表] Identification and of Neurospora Shelterin
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A and Honda S
- 学会等名
  The 28th Fungal Genetics Conference at Asilomar
- 発表場所
  Monterey, USA
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-22
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25125710
[学会発表] Identification and of Neurospora Shelterin
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A and Honda S
- 学会等名
  The 28th Fungal Genetics Conference at Asilomar
- 発表場所
  Monterey, USA
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26712029
[学会発表] Identification and of Neurospora Shelterin
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A and Honda S
- 学会等名
  The 28th Fungal Genetics Conference at Asilomar
- 発表場所
  Monterey, USA
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25640111
[学会発表] Four color imagining by fluorescent protein tagging system in Neurospora crassa
- 著者名/発表者名
  Yokoyama A, Uesaka M and Honda S
- 学会等名
  The 28th Fungal Genetics Conference at Asilomar
- 発表場所
  Monterey, USA
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25640111
[学会発表] Identification and characterization of Neurospora Shelterin
- 著者名/発表者名
  Uesaka M, Yokoyama A, Lewis ZA and Honda S
- 学会等名
  The 9th Cold Spring Harbor meeting on Telomeres & Telomerase
- 発表場所
  Cold Spring Harbor, USA
- 年月日
  2015-04-28 – 2015-05-02
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25125710

1. 鈴木信弘 (70206514)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
2. 近藤秀樹 (40263628)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

本田 信治 Honda Shinji

研究課題

研究成果

共同研究者

モデル糸状菌を用いた「遺伝子多型」と「症状差」の関係解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

子嚢菌門の糸状菌に保存された生殖期特異的ウイルス除去機構を担う因子群の同定研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

非ドメイン型バイオポリマーを介した菌類ウイルス・宿主間の特殊な共生関係研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

宿主アカパンカビの抗ウイルス免疫暴走化機序の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

モデル糸状菌アカパンカビを用いたウイルス研究フロンティア

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

モデル生物アカパンカビを利用したウイルス・宿主の相利共生と環境適応の関係解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

山火事の熱と煙で目覚めるアカパンカビ子嚢胞子のシグナル伝達経路網研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

アカパンカビゲノム防御機構RIP可視化システムの構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

アカパンカビ子嚢胞子が山火事で目覚める分子機構の解明とその応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

アカパンカビの特殊能力を利用した染色体適応機構の研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

エピジェネティクス修飾を暗号解読する蛋白質複合体の網羅的解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ヘテロクロマチンの境界を制御する新規蛋白質の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] RNA Editing of Genomic Neighbors Controls Antiviral Response in Fungi2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

本田信治 Honda Shinji